FuNGI

A0A238FJ49

Protein Details

Accession

A0A238FJ49

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
209-229	LDSSDRRKRLHTRQRRAAKLM	Hydrophilic
358-381	DEQVLQKKIKKIKKKSLHVLFNYE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
364-372	KKIKKIKKK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 8.5, pero 6, cyto 4.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD

Amino Acid Sequences

MANIAIDFVGPLPTNKGFDCVLTITDRVSGYVRLLPTRFHEGWHRLFSLPQSIVSDCDKLFTSKFWATLHKCLNVKLQLSSAFHPEMDGRSKKTNKTAFQILRALINKEQSNWMECLAVCEYAINSSLNVATGKTPFELVLGYMPSLAPLARATDDKELPSVEELLSLRFQACEDARDQLAMSKVRQAVQSNKRRQDEPSWAVGDLVLLDSSDRRKRLHTRQRRAAKLMDRFDGPYRIVKAQPEISSYTLQLNGDNTAVPFFHTGKLKTYHENNATLFPNREPAWPGPVDVGGEPGYVTEDIVNERTRAGKRQYLVLWVSWPSDSDSWEPAEALDDTEALDWWEHRNEEGNRNWGQYDEQVLQKKIKKIKKKSLHVLFNYECTIADIYAQAPYPTAPTVPWTPEKNPPGNGSESSKLFQWKWDQVRAWIQVAGNCFILPQLPPDPILAHRPPIVRVAGAPQAWVGGPLEHILPRATPADMPDQKLPLPSVPSRADQWRMLRLDRPYTIARL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.22
4	0.2
5	0.2
6	0.23
7	0.19
8	0.19
9	0.19
10	0.2
11	0.17
12	0.2
13	0.2
14	0.17
15	0.18
16	0.17
17	0.17
18	0.21
19	0.22
20	0.24
21	0.25
22	0.26
23	0.29
24	0.37
25	0.34
26	0.33
27	0.4
28	0.42
29	0.48
30	0.51
31	0.48
32	0.4
33	0.42
34	0.42
35	0.41
36	0.34
37	0.3
38	0.27
39	0.25
40	0.27
41	0.28
42	0.28
43	0.2
44	0.21
45	0.2
46	0.2
47	0.2
48	0.19
49	0.23
50	0.23
51	0.26
52	0.26
53	0.35
54	0.37
55	0.45
56	0.49
57	0.49
58	0.48
59	0.48
60	0.54
61	0.5
62	0.47
63	0.4
64	0.38
65	0.36
66	0.37
67	0.36
68	0.33
69	0.28
70	0.26
71	0.25
72	0.23
73	0.22
74	0.27
75	0.29
76	0.29
77	0.37
78	0.43
79	0.47
80	0.55
81	0.59
82	0.56
83	0.59
84	0.65
85	0.6
86	0.6
87	0.6
88	0.51
89	0.49
90	0.46
91	0.43
92	0.36
93	0.37
94	0.32
95	0.29
96	0.34
97	0.29
98	0.3
99	0.27
100	0.25
101	0.21
102	0.2
103	0.22
104	0.18
105	0.16
106	0.13
107	0.12
108	0.11
109	0.1
110	0.12
111	0.08
112	0.07
113	0.08
114	0.08
115	0.08
116	0.09
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.11
121	0.1
122	0.11
123	0.1
124	0.1
125	0.1
126	0.08
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.08
134	0.07
135	0.06
136	0.05
137	0.07
138	0.08
139	0.09
140	0.12
141	0.16
142	0.18
143	0.18
144	0.19
145	0.17
146	0.17
147	0.17
148	0.15
149	0.1
150	0.12
151	0.11
152	0.12
153	0.12
154	0.12
155	0.11
156	0.1
157	0.1
158	0.11
159	0.11
160	0.11
161	0.12
162	0.14
163	0.14
164	0.14
165	0.14
166	0.13
167	0.16
168	0.17
169	0.16
170	0.19
171	0.21
172	0.22
173	0.25
174	0.26
175	0.32
176	0.4
177	0.5
178	0.54
179	0.6
180	0.61
181	0.6
182	0.6
183	0.57
184	0.57
185	0.5
186	0.46
187	0.4
188	0.37
189	0.35
190	0.31
191	0.24
192	0.14
193	0.11
194	0.05
195	0.03
196	0.03
197	0.05
198	0.1
199	0.14
200	0.15
201	0.16
202	0.22
203	0.31
204	0.42
205	0.52
206	0.59
207	0.66
208	0.74
209	0.82
210	0.82
211	0.77
212	0.73
213	0.69
214	0.66
215	0.59
216	0.51
217	0.42
218	0.39
219	0.37
220	0.32
221	0.26
222	0.21
223	0.2
224	0.2
225	0.2
226	0.19
227	0.2
228	0.22
229	0.22
230	0.21
231	0.2
232	0.2
233	0.19
234	0.19
235	0.17
236	0.14
237	0.14
238	0.12
239	0.11
240	0.09
241	0.09
242	0.08
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.06
247	0.07
248	0.07
249	0.1
250	0.13
251	0.13
252	0.17
253	0.22
254	0.23
255	0.25
256	0.28
257	0.32
258	0.33
259	0.35
260	0.32
261	0.32
262	0.31
263	0.29
264	0.26
265	0.19
266	0.2
267	0.18
268	0.19
269	0.18
270	0.17
271	0.2
272	0.19
273	0.19
274	0.16
275	0.15
276	0.15
277	0.11
278	0.12
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.06
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.06
289	0.09
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.14
294	0.15
295	0.2
296	0.24
297	0.26
298	0.26
299	0.31
300	0.32
301	0.32
302	0.32
303	0.27
304	0.24
305	0.21
306	0.22
307	0.16
308	0.16
309	0.13
310	0.12
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.14
315	0.15
316	0.14
317	0.11
318	0.12
319	0.1
320	0.09
321	0.08
322	0.06
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.05
327	0.05
328	0.05
329	0.07
330	0.1
331	0.1
332	0.1
333	0.18
334	0.21
335	0.28
336	0.31
337	0.35
338	0.34
339	0.35
340	0.35
341	0.28
342	0.26
343	0.21
344	0.21
345	0.18
346	0.22
347	0.26
348	0.27
349	0.33
350	0.37
351	0.42
352	0.47
353	0.53
354	0.58
355	0.64
356	0.73
357	0.77
358	0.82
359	0.86
360	0.87
361	0.88
362	0.8
363	0.78
364	0.69
365	0.61
366	0.52
367	0.42
368	0.32
369	0.24
370	0.21
371	0.13
372	0.12
373	0.09
374	0.08
375	0.1
376	0.1
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.08
384	0.12
385	0.15
386	0.19
387	0.25
388	0.28
389	0.31
390	0.4
391	0.47
392	0.47
393	0.48
394	0.47
395	0.45
396	0.44
397	0.43
398	0.4
399	0.37
400	0.34
401	0.32
402	0.31
403	0.32
404	0.29
405	0.31
406	0.33
407	0.38
408	0.42
409	0.49
410	0.48
411	0.49
412	0.57
413	0.55
414	0.49
415	0.43
416	0.38
417	0.32
418	0.34
419	0.3
420	0.22
421	0.18
422	0.16
423	0.13
424	0.13
425	0.11
426	0.12
427	0.13
428	0.14
429	0.15
430	0.16
431	0.18
432	0.19
433	0.27
434	0.25
435	0.26
436	0.3
437	0.31
438	0.31
439	0.33
440	0.33
441	0.25
442	0.24
443	0.25
444	0.26
445	0.25
446	0.23
447	0.19
448	0.18
449	0.18
450	0.18
451	0.14
452	0.08
453	0.09
454	0.09
455	0.11
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.12
460	0.14
461	0.15
462	0.15
463	0.14
464	0.16
465	0.26
466	0.3
467	0.34
468	0.35
469	0.36
470	0.36
471	0.38
472	0.38
473	0.31
474	0.33
475	0.31
476	0.35
477	0.35
478	0.37
479	0.39
480	0.44
481	0.46
482	0.46
483	0.49
484	0.5
485	0.51
486	0.52
487	0.53
488	0.53
489	0.55
490	0.51
491	0.5

A0A238FJ49

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer