FuNGI

A0A238FI88

Protein Details

Accession

A0A238FI88

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
800-823	LTTIRTRHYSRRHLHCCRQKEKDI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 7.833, pero 7.5, cyto_pero 6.833, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MDTDPSIMPRWVNNYRILNAATVPDCTPLPLPDKIFFFQTKMAEEDIPKTMVATPWGLFEWVVMPMGLSNAPATHQRRVNEALSNLIGKSCFVYLNNITIFSNTIKEHQTHVREVLEALRWADLYCLPKKTELFMTSCDFLGHVISRNRITADQSKVDHIVEWPHPWTVTKLRGFLGLVQYLRKFINGLAQHTKPLLDLTSKNANVRLMWGVEQERRFNAIKAIVTLLPCLKPIDHTELADPLWVMTDASNVGIGAVLLQGQDWRKAHPVAYWSRQYISVEANYPTHEQELLAVVGALRQWRVNLMGVHFTVLTDHELLKYLKTQENLSKRQARWVKRLADYDFDITYIPGGENNVADAMSHYSFPQVESDSVQAVSEMDVDTQLSGRIVEGYESDPFCQQVKRNLDSLPGFSQVNNVLYFEGRMVVPVVPQLWEDILHNAHNALGHFGSCKTFHHLSQTFFWPRMRSSCDAYVLTCDVCQRTKAGTTGAVGTSHGLSVPNEPMKEVALDFVGPLPKSQGFDMLLTITDCLSGYTRLLPSRAADTAKDIAERFHEGWHRFFGPPTCLVSDRDKLFTSHFWRAYHNLMGTRLSMSMSFHPETDGRSERTNKTAIQALRAVVNRQQNDWVRHLANIEFTINASVNASTNKSPFEVVLGPYKVIATNAATSNYTLQLNEDDRSHPTFHVSKLCRYRPNNPVNFPNREPARPKPVLVNGQEEWVVQEILEEKARGKKCYRVWWEGYLQHEATMEPRENLVGTEALRRWELKKRTEGRVDINYYHFDPVYRFWSTAARGASNFFLTTIRTRHYSRRHLHCCRQKEKDINTDADKIDTIGQLLLDPELKVWYSSDSALHTQKMYRTFQCNLTLCTLPSDYMWQHYRRLDDLQQTGDYREFATTARDLQLELGVSLVSDTQFVRMLLLHMDEELSQQLQLSDVIKGTGLLPDKLDASILKDDVTPTQPDFNYQTFDAEARRIWQVISAMRASVKATAQALTRFGRPPPTTNTIKPPRTSTSLSTSLPSEIRPPPMTDRERAFLKSNRGCFKCRKINAGHMSDGCTNWATSAYQLASITNADANIEDEGEWLHCLDNDKYNNGTDDERCEPISLSVKLTTDDGPVLRALVDMGASASFIADKEVDKLRLTQRKLQVPTSVSVAIQNHKVLHPVTEFVCVPLCTSNGRWSTHHVVLKIAPLTSLRVVLGHPFLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.44
2	0.44
3	0.47
4	0.45
5	0.38
6	0.33
7	0.34
8	0.27
9	0.23
10	0.22
11	0.2
12	0.19
13	0.19
14	0.2
15	0.19
16	0.23
17	0.26
18	0.29
19	0.31
20	0.36
21	0.35
22	0.39
23	0.37
24	0.35
25	0.35
26	0.34
27	0.33
28	0.31
29	0.32
30	0.3
31	0.3
32	0.31
33	0.29
34	0.27
35	0.23
36	0.22
37	0.22
38	0.2
39	0.2
40	0.2
41	0.17
42	0.18
43	0.19
44	0.18
45	0.16
46	0.14
47	0.13
48	0.11
49	0.11
50	0.09
51	0.08
52	0.08
53	0.09
54	0.09
55	0.08
56	0.08
57	0.07
58	0.09
59	0.18
60	0.22
61	0.28
62	0.33
63	0.34
64	0.4
65	0.45
66	0.47
67	0.44
68	0.41
69	0.38
70	0.35
71	0.36
72	0.3
73	0.26
74	0.22
75	0.16
76	0.17
77	0.14
78	0.13
79	0.12
80	0.19
81	0.2
82	0.26
83	0.26
84	0.26
85	0.25
86	0.23
87	0.25
88	0.19
89	0.22
90	0.17
91	0.2
92	0.21
93	0.23
94	0.27
95	0.34
96	0.37
97	0.37
98	0.4
99	0.38
100	0.35
101	0.35
102	0.34
103	0.29
104	0.25
105	0.22
106	0.19
107	0.18
108	0.17
109	0.18
110	0.18
111	0.2
112	0.23
113	0.26
114	0.27
115	0.31
116	0.32
117	0.34
118	0.38
119	0.36
120	0.35
121	0.35
122	0.38
123	0.35
124	0.34
125	0.3
126	0.22
127	0.19
128	0.18
129	0.16
130	0.18
131	0.21
132	0.25
133	0.26
134	0.28
135	0.29
136	0.28
137	0.32
138	0.33
139	0.36
140	0.38
141	0.38
142	0.4
143	0.4
144	0.38
145	0.33
146	0.27
147	0.27
148	0.24
149	0.26
150	0.24
151	0.23
152	0.24
153	0.24
154	0.28
155	0.28
156	0.34
157	0.34
158	0.35
159	0.34
160	0.37
161	0.36
162	0.36
163	0.34
164	0.3
165	0.27
166	0.28
167	0.28
168	0.28
169	0.27
170	0.23
171	0.18
172	0.14
173	0.22
174	0.22
175	0.28
176	0.32
177	0.33
178	0.35
179	0.35
180	0.34
181	0.26
182	0.24
183	0.19
184	0.17
185	0.17
186	0.21
187	0.3
188	0.32
189	0.33
190	0.34
191	0.33
192	0.28
193	0.3
194	0.27
195	0.19
196	0.18
197	0.21
198	0.22
199	0.27
200	0.3
201	0.3
202	0.29
203	0.32
204	0.32
205	0.29
206	0.29
207	0.27
208	0.25
209	0.24
210	0.26
211	0.23
212	0.22
213	0.23
214	0.22
215	0.18
216	0.18
217	0.18
218	0.15
219	0.16
220	0.19
221	0.26
222	0.25
223	0.25
224	0.26
225	0.27
226	0.27
227	0.25
228	0.2
229	0.12
230	0.11
231	0.1
232	0.08
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.04
243	0.04
244	0.04
245	0.03
246	0.04
247	0.07
248	0.08
249	0.14
250	0.15
251	0.17
252	0.21
253	0.23
254	0.24
255	0.24
256	0.3
257	0.32
258	0.39
259	0.42
260	0.39
261	0.39
262	0.41
263	0.39
264	0.34
265	0.29
266	0.25
267	0.22
268	0.22
269	0.22
270	0.22
271	0.22
272	0.21
273	0.18
274	0.16
275	0.13
276	0.12
277	0.13
278	0.11
279	0.09
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.07
286	0.07
287	0.07
288	0.09
289	0.11
290	0.13
291	0.14
292	0.15
293	0.19
294	0.18
295	0.19
296	0.18
297	0.16
298	0.13
299	0.12
300	0.12
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.12
305	0.13
306	0.13
307	0.16
308	0.19
309	0.21
310	0.23
311	0.26
312	0.31
313	0.4
314	0.45
315	0.49
316	0.53
317	0.5
318	0.59
319	0.63
320	0.62
321	0.61
322	0.64
323	0.63
324	0.6
325	0.66
326	0.58
327	0.54
328	0.49
329	0.43
330	0.35
331	0.28
332	0.22
333	0.16
334	0.14
335	0.1
336	0.08
337	0.06
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.07
343	0.06
344	0.06
345	0.06
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.12
354	0.1
355	0.11
356	0.12
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.12
361	0.1
362	0.08
363	0.08
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.06
378	0.07
379	0.08
380	0.11
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.13
385	0.14
386	0.16
387	0.18
388	0.24
389	0.3
390	0.31
391	0.33
392	0.33
393	0.37
394	0.35
395	0.35
396	0.28
397	0.23
398	0.21
399	0.19
400	0.2
401	0.17
402	0.18
403	0.14
404	0.13
405	0.11
406	0.11
407	0.11
408	0.09
409	0.08
410	0.06
411	0.06
412	0.07
413	0.07
414	0.07
415	0.08
416	0.08
417	0.07
418	0.07
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.08
423	0.09
424	0.1
425	0.1
426	0.1
427	0.09
428	0.09
429	0.1
430	0.09
431	0.09
432	0.08
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.1
437	0.09
438	0.11
439	0.15
440	0.17
441	0.18
442	0.26
443	0.29
444	0.3
445	0.33
446	0.39
447	0.35
448	0.35
449	0.36
450	0.29
451	0.27
452	0.29
453	0.3
454	0.25
455	0.28
456	0.29
457	0.3
458	0.29
459	0.27
460	0.25
461	0.21
462	0.18
463	0.14
464	0.13
465	0.11
466	0.11
467	0.12
468	0.11
469	0.12
470	0.13
471	0.14
472	0.14
473	0.13
474	0.14
475	0.15
476	0.14
477	0.13
478	0.11
479	0.11
480	0.09
481	0.08
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.08
486	0.11
487	0.13
488	0.13
489	0.13
490	0.13
491	0.13
492	0.13
493	0.11
494	0.08
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.07
499	0.09
500	0.08
501	0.08
502	0.1
503	0.1
504	0.11
505	0.11
506	0.13
507	0.12
508	0.12
509	0.13
510	0.11
511	0.1
512	0.09
513	0.09
514	0.06
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.06
521	0.08
522	0.1
523	0.1
524	0.11
525	0.11
526	0.11
527	0.13
528	0.15
529	0.13
530	0.12
531	0.14
532	0.16
533	0.16
534	0.16
535	0.14
536	0.13
537	0.13
538	0.16
539	0.14
540	0.15
541	0.2
542	0.2
543	0.22
544	0.24
545	0.24
546	0.22
547	0.23
548	0.21
549	0.18
550	0.19
551	0.19
552	0.18
553	0.17
554	0.2
555	0.23
556	0.25
557	0.24
558	0.24
559	0.23
560	0.22
561	0.22
562	0.25
563	0.26
564	0.28
565	0.3
566	0.28
567	0.3
568	0.31
569	0.32
570	0.3
571	0.25
572	0.2
573	0.18
574	0.18
575	0.16
576	0.15
577	0.12
578	0.1
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.13
583	0.13
584	0.12
585	0.13
586	0.13
587	0.14
588	0.17
589	0.18
590	0.15
591	0.19
592	0.23
593	0.23
594	0.26
595	0.27
596	0.23
597	0.22
598	0.26
599	0.23
600	0.21
601	0.21
602	0.19
603	0.21
604	0.21
605	0.2
606	0.19
607	0.24
608	0.22
609	0.21
610	0.27
611	0.28
612	0.31
613	0.32
614	0.31
615	0.26
616	0.26
617	0.27
618	0.21
619	0.17
620	0.14
621	0.12
622	0.09
623	0.08
624	0.08
625	0.07
626	0.07
627	0.06
628	0.06
629	0.06
630	0.07
631	0.09
632	0.09
633	0.09
634	0.1
635	0.1
636	0.1
637	0.09
638	0.11
639	0.11
640	0.11
641	0.16
642	0.15
643	0.15
644	0.15
645	0.15
646	0.12
647	0.11
648	0.11
649	0.06
650	0.08
651	0.09
652	0.1
653	0.1
654	0.1
655	0.11
656	0.12
657	0.11
658	0.09
659	0.08
660	0.1
661	0.12
662	0.12
663	0.13
664	0.12
665	0.15
666	0.17
667	0.18
668	0.15
669	0.17
670	0.19
671	0.2
672	0.27
673	0.27
674	0.32
675	0.39
676	0.45
677	0.5
678	0.51
679	0.57
680	0.59
681	0.66
682	0.66
683	0.61
684	0.64
685	0.62
686	0.63
687	0.57
688	0.55
689	0.48
690	0.45
691	0.46
692	0.43
693	0.46
694	0.42
695	0.41
696	0.38
697	0.41
698	0.44
699	0.41
700	0.41
701	0.32
702	0.32
703	0.31
704	0.26
705	0.2
706	0.15
707	0.12
708	0.06
709	0.07
710	0.07
711	0.08
712	0.09
713	0.08
714	0.09
715	0.17
716	0.19
717	0.22
718	0.23
719	0.3
720	0.35
721	0.45
722	0.5
723	0.5
724	0.51
725	0.53
726	0.56
727	0.51
728	0.49
729	0.42
730	0.35
731	0.28
732	0.25
733	0.2
734	0.17
735	0.17
736	0.15
737	0.11
738	0.11
739	0.11
740	0.11
741	0.11
742	0.1
743	0.08
744	0.08
745	0.12
746	0.13
747	0.14
748	0.15
749	0.16
750	0.18
751	0.26
752	0.31
753	0.33
754	0.42
755	0.47
756	0.54
757	0.59
758	0.6
759	0.57
760	0.58
761	0.56
762	0.48
763	0.44
764	0.38
765	0.33
766	0.3
767	0.24
768	0.17
769	0.15
770	0.15
771	0.17
772	0.16
773	0.15
774	0.15
775	0.19
776	0.2
777	0.23
778	0.22
779	0.19
780	0.18
781	0.2
782	0.2
783	0.17
784	0.15
785	0.11
786	0.1
787	0.1
788	0.13
789	0.14
790	0.15
791	0.18
792	0.21
793	0.29
794	0.38
795	0.46
796	0.52
797	0.61
798	0.69
799	0.74
800	0.82
801	0.82
802	0.83
803	0.82
804	0.8
805	0.78
806	0.77
807	0.74
808	0.73
809	0.68
810	0.63
811	0.58
812	0.55
813	0.47
814	0.38
815	0.32
816	0.23
817	0.2
818	0.16
819	0.13
820	0.08
821	0.08
822	0.07
823	0.08
824	0.07
825	0.07
826	0.06
827	0.06
828	0.07
829	0.07
830	0.07
831	0.07
832	0.09
833	0.09
834	0.1
835	0.11
836	0.13
837	0.17
838	0.19
839	0.2
840	0.19
841	0.2
842	0.23
843	0.27
844	0.29
845	0.3
846	0.33
847	0.35
848	0.39
849	0.45
850	0.43
851	0.4
852	0.39
853	0.35
854	0.3
855	0.3
856	0.25
857	0.18
858	0.16
859	0.18
860	0.14
861	0.19
862	0.24
863	0.23
864	0.27
865	0.3
866	0.32
867	0.3
868	0.35
869	0.34
870	0.36
871	0.37
872	0.35
873	0.35
874	0.33
875	0.32
876	0.28
877	0.24
878	0.17
879	0.15
880	0.12
881	0.1
882	0.13
883	0.12
884	0.13
885	0.15
886	0.14
887	0.14
888	0.14
889	0.15
890	0.12
891	0.11
892	0.09
893	0.07
894	0.06
895	0.06
896	0.06
897	0.04
898	0.05
899	0.05
900	0.06
901	0.08
902	0.08
903	0.09
904	0.09
905	0.09
906	0.09
907	0.1
908	0.09
909	0.08
910	0.09
911	0.08
912	0.09
913	0.09
914	0.08
915	0.07
916	0.07
917	0.07
918	0.07
919	0.08
920	0.08
921	0.08
922	0.08
923	0.09
924	0.08
925	0.09
926	0.08
927	0.11
928	0.12
929	0.12
930	0.12
931	0.13
932	0.14
933	0.13
934	0.14
935	0.1
936	0.12
937	0.15
938	0.14
939	0.14
940	0.14
941	0.15
942	0.17
943	0.19
944	0.18
945	0.16
946	0.22
947	0.21
948	0.24
949	0.28
950	0.26
951	0.27
952	0.25
953	0.25
954	0.2
955	0.22
956	0.2
957	0.17
958	0.16
959	0.15
960	0.17
961	0.16
962	0.14
963	0.16
964	0.18
965	0.18
966	0.21
967	0.19
968	0.18
969	0.18
970	0.19
971	0.17
972	0.17
973	0.15
974	0.14
975	0.15
976	0.16
977	0.18
978	0.19
979	0.23
980	0.22
981	0.25
982	0.24
983	0.25
984	0.32
985	0.32
986	0.35
987	0.38
988	0.43
989	0.45
990	0.48
991	0.56
992	0.57
993	0.61
994	0.59
995	0.58
996	0.56
997	0.56
998	0.56
999	0.5
1000	0.47
1001	0.47
1002	0.45
1003	0.41
1004	0.36
1005	0.34
1006	0.3
1007	0.27
1008	0.25
1009	0.23
1010	0.28
1011	0.29
1012	0.31
1013	0.35
1014	0.44
1015	0.47
1016	0.47
1017	0.47
1018	0.46
1019	0.48
1020	0.48
1021	0.47
1022	0.44
1023	0.5
1024	0.52
1025	0.56
1026	0.6
1027	0.6
1028	0.62
1029	0.65
1030	0.69
1031	0.69
1032	0.67
1033	0.67
1034	0.64
1035	0.71
1036	0.75
1037	0.71
1038	0.66
1039	0.56
1040	0.56
1041	0.49
1042	0.43
1043	0.35
1044	0.26
1045	0.21
1046	0.16
1047	0.16
1048	0.12
1049	0.11
1050	0.15
1051	0.13
1052	0.14
1053	0.15
1054	0.14
1055	0.14
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.11
1059	0.11
1060	0.09
1061	0.09
1062	0.1
1063	0.09
1064	0.09
1065	0.08
1066	0.07
1067	0.08
1068	0.08
1069	0.09
1070	0.08
1071	0.08
1072	0.09
1073	0.13
1074	0.15
1075	0.23
1076	0.25
1077	0.28
1078	0.3
1079	0.31
1080	0.32
1081	0.3
1082	0.32
1083	0.26
1084	0.29
1085	0.29
1086	0.3
1087	0.29
1088	0.28
1089	0.26
1090	0.27
1091	0.32
1092	0.27
1093	0.26
1094	0.27
1095	0.27
1096	0.27
1097	0.28
1098	0.24
1099	0.19
1100	0.21
1101	0.18
1102	0.16
1103	0.16
1104	0.15
1105	0.13
1106	0.12
1107	0.1
1108	0.07
1109	0.07
1110	0.06
1111	0.06
1112	0.06
1113	0.06
1114	0.05
1115	0.05
1116	0.05
1117	0.05
1118	0.07
1119	0.07
1120	0.08
1121	0.13
1122	0.19
1123	0.21
1124	0.22
1125	0.28
1126	0.36
1127	0.44
1128	0.49
1129	0.54
1130	0.57
1131	0.64
1132	0.68
1133	0.66
1134	0.63
1135	0.58
1136	0.54
1137	0.5
1138	0.43
1139	0.33
1140	0.33
1141	0.32
1142	0.29
1143	0.3
1144	0.31
1145	0.28
1146	0.28
1147	0.31
1148	0.27
1149	0.28
1150	0.26
1151	0.26
1152	0.24
1153	0.26
1154	0.26
1155	0.24
1156	0.27
1157	0.22
1158	0.21
1159	0.21
1160	0.21
1161	0.19
1162	0.22
1163	0.29
1164	0.3
1165	0.34
1166	0.34
1167	0.4
1168	0.46
1169	0.51
1170	0.53
1171	0.45
1172	0.43
1173	0.42
1174	0.46
1175	0.41
1176	0.33
1177	0.26
1178	0.23
1179	0.26
1180	0.24
1181	0.23
1182	0.17
1183	0.16
1184	0.16
1185	0.19

A0A238FI88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer