Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FC65

Protein Details
Accession A0A238FC65    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-70VVAAKSSKKASKKQPEPEPESSSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
34-59SKKDSKKAVAAAPVVAAKSSKKASKK
512-563DRGGGGRGGGRGGFGSDRGGRGGRGGGRGGFGGDRGGRGGGRGGGRGGRQGD
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MGKTNTVKASKSASKIEKVDSSKKTKSSTTAAASKKDSKKAVAAAPVVAAKSSKKASKKQPEPEPESSSSSSSSSSSSSSESEESDDDPSEEEEEAAPVVEKAKKGAAKVVAAVAPAKKDDSSSSESDSDDSSDEEDAVPMRSTSFSAPHPPLLPLLMTQTTHQPVKAVKNAAKKVVDTAIIAKKAVANGAAKVANVVAEETSSSEEDSSSEEEASAPKVKSNGKAVAAKAAEESDESSDDSDDSDDEEPAVKEEDTDSSDDSDDFDDSDDEEEEKPAAAASRKRAADTAEAPAKKAKTVDAPAPAAEASNGGEIVSSTVYVGGLSWNVDNEWLKSEFEVCGEVVSARVVTDRESGRSRGFGYVEFVKAESAQKALEMAGNEIDGRSIKVDLSQPRPNREQGAFGEKPKKAFNDTLSGPPTTTLFVGNLPFSCSEDSVWSVFADFGDVSSVRLPMDAESGRPKGFGYVEFSSLDGAEAAIKKGGPTADGEGVQVDGRTVRLDYSQARGERSDRGGGGRGGGRGGFGSDRGGRGGRGGGRGGFGGDRGGRGGGRGGGRGGRQGDSGWGARAGSARTGGAASFEGKKMKFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.59
4 0.59
5 0.59
6 0.63
7 0.62
8 0.65
9 0.64
10 0.66
11 0.65
12 0.62
13 0.6
14 0.58
15 0.57
16 0.56
17 0.57
18 0.56
19 0.58
20 0.59
21 0.63
22 0.64
23 0.64
24 0.6
25 0.55
26 0.56
27 0.56
28 0.55
29 0.52
30 0.47
31 0.4
32 0.38
33 0.36
34 0.3
35 0.25
36 0.2
37 0.15
38 0.19
39 0.24
40 0.28
41 0.34
42 0.44
43 0.54
44 0.64
45 0.73
46 0.78
47 0.82
48 0.86
49 0.86
50 0.85
51 0.81
52 0.73
53 0.69
54 0.61
55 0.52
56 0.43
57 0.35
58 0.29
59 0.23
60 0.21
61 0.16
62 0.16
63 0.15
64 0.16
65 0.16
66 0.18
67 0.18
68 0.17
69 0.18
70 0.18
71 0.18
72 0.18
73 0.17
74 0.15
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.12
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.06
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.19
91 0.21
92 0.22
93 0.28
94 0.29
95 0.27
96 0.29
97 0.3
98 0.25
99 0.23
100 0.25
101 0.2
102 0.17
103 0.16
104 0.16
105 0.13
106 0.14
107 0.16
108 0.19
109 0.23
110 0.24
111 0.27
112 0.27
113 0.27
114 0.27
115 0.25
116 0.21
117 0.16
118 0.14
119 0.11
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.13
133 0.14
134 0.21
135 0.23
136 0.25
137 0.26
138 0.25
139 0.24
140 0.22
141 0.2
142 0.14
143 0.15
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.19
148 0.21
149 0.22
150 0.21
151 0.2
152 0.22
153 0.28
154 0.33
155 0.34
156 0.35
157 0.44
158 0.47
159 0.51
160 0.48
161 0.42
162 0.39
163 0.35
164 0.31
165 0.22
166 0.25
167 0.25
168 0.24
169 0.23
170 0.21
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.15
175 0.11
176 0.11
177 0.14
178 0.14
179 0.13
180 0.12
181 0.12
182 0.1
183 0.09
184 0.08
185 0.05
186 0.04
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.12
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.17
207 0.2
208 0.23
209 0.28
210 0.29
211 0.29
212 0.33
213 0.32
214 0.34
215 0.32
216 0.28
217 0.23
218 0.19
219 0.15
220 0.12
221 0.12
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.09
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.07
266 0.09
267 0.11
268 0.15
269 0.21
270 0.22
271 0.22
272 0.23
273 0.23
274 0.24
275 0.23
276 0.24
277 0.24
278 0.24
279 0.24
280 0.26
281 0.24
282 0.21
283 0.2
284 0.16
285 0.15
286 0.17
287 0.2
288 0.21
289 0.22
290 0.21
291 0.21
292 0.19
293 0.14
294 0.12
295 0.08
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.03
306 0.03
307 0.04
308 0.03
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.06
317 0.07
318 0.07
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.12
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.08
328 0.06
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.05
334 0.04
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.11
339 0.11
340 0.15
341 0.18
342 0.2
343 0.2
344 0.21
345 0.21
346 0.19
347 0.19
348 0.16
349 0.17
350 0.18
351 0.18
352 0.17
353 0.15
354 0.13
355 0.13
356 0.14
357 0.11
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.06
376 0.09
377 0.14
378 0.2
379 0.27
380 0.34
381 0.38
382 0.43
383 0.47
384 0.47
385 0.46
386 0.41
387 0.39
388 0.35
389 0.4
390 0.36
391 0.38
392 0.44
393 0.4
394 0.42
395 0.4
396 0.39
397 0.35
398 0.36
399 0.34
400 0.32
401 0.34
402 0.37
403 0.36
404 0.34
405 0.3
406 0.26
407 0.24
408 0.18
409 0.16
410 0.1
411 0.09
412 0.1
413 0.11
414 0.12
415 0.11
416 0.12
417 0.12
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.12
422 0.13
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.07
432 0.06
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.09
440 0.09
441 0.08
442 0.13
443 0.12
444 0.14
445 0.19
446 0.22
447 0.22
448 0.22
449 0.21
450 0.19
451 0.2
452 0.19
453 0.21
454 0.2
455 0.22
456 0.22
457 0.22
458 0.2
459 0.18
460 0.16
461 0.09
462 0.07
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.12
470 0.12
471 0.1
472 0.12
473 0.15
474 0.17
475 0.18
476 0.18
477 0.16
478 0.16
479 0.16
480 0.13
481 0.09
482 0.07
483 0.07
484 0.08
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.14
489 0.16
490 0.2
491 0.27
492 0.28
493 0.3
494 0.31
495 0.32
496 0.34
497 0.36
498 0.35
499 0.29
500 0.3
501 0.32
502 0.3
503 0.31
504 0.28
505 0.25
506 0.22
507 0.2
508 0.18
509 0.14
510 0.15
511 0.12
512 0.1
513 0.14
514 0.15
515 0.16
516 0.18
517 0.19
518 0.17
519 0.18
520 0.23
521 0.22
522 0.23
523 0.24
524 0.22
525 0.23
526 0.23
527 0.23
528 0.17
529 0.14
530 0.16
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.15
535 0.14
536 0.14
537 0.16
538 0.17
539 0.17
540 0.18
541 0.19
542 0.22
543 0.23
544 0.28
545 0.29
546 0.25
547 0.24
548 0.24
549 0.25
550 0.25
551 0.26
552 0.22
553 0.2
554 0.19
555 0.19
556 0.21
557 0.19
558 0.17
559 0.17
560 0.16
561 0.15
562 0.16
563 0.15
564 0.14
565 0.13
566 0.14
567 0.16
568 0.2
569 0.25