FuNGI

A0A238FN95

Protein Details

Accession

A0A238FN95

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-100	SEFVRPLRLNRKDPRTVRRL	Hydrophilic
161-182	APQQQRQKKHGGRFEKKIKRVF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-180	KKHGGRFEKKIKR

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSHSSRPVIKSEPSPSASGSLADAASLKSAPSPTPPVSTPQGSYTDFILRASAPGSQTGWKYNVMKFAALANKSVDPLDESEFVRPLRLNRKDPRTVRRLTDQEREKIRNKAMGLLDEEGNLIDQSAADGVKKEGDAAQMEAGKETINPDLVGTGVTGALAPQQQRQKKHGGRFEKKIKRVFVSSEESRRLRREEWQPWVLEDDEGNERWIGRLEGGASERSMAIEQEKKKQELENKGKATMAGWRPASEGSATGGGGSSYVAFVFGPDGDEFQVVPIHRWYKFSQGPKYVTLGNDEAEAEYERQQKTHEAERWMMHKRNPNQVSSSIGQGSGPSSGAATPPIPLGDDGGLPPLPTDIKRRIKRETSAGPSTIRSRLLDRSELSGRRAGSEYRSAAAGRPKLKSVDTGSRVENDDDELYRRKRGDEGRGQEQDDDEFDYDEEFQDDEEGVAKIDDLADEQETKELDERIRKEMRAVERAASEPEEDDDDEQLTATGKDLKRLVKKQDQDGLYGSDDDDDLSSSDSSVAEDDDTKSVTSANGDPSTPRPASSSSQQQHNKPRPSADSMHRTHSSSSSSRPHSTQASRHPSRAASPSSGSALLAKRATSPTRSNPGSRATSPNPAGNGANGKRKRDDHDGSSKRLALSPSATSGAGGWDAPPDALIEDRHLIDFFKTKASEPNKSTTKDVLNYFRKQLKGNDKNKEAIKSALHNVAIMQDKHLVLKPGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.43
3	0.41
4	0.36
5	0.29
6	0.24
7	0.19
8	0.15
9	0.14
10	0.13
11	0.11
12	0.11
13	0.11
14	0.1
15	0.1
16	0.12
17	0.13
18	0.18
19	0.24
20	0.26
21	0.3
22	0.32
23	0.34
24	0.39
25	0.41
26	0.38
27	0.35
28	0.37
29	0.34
30	0.34
31	0.32
32	0.31
33	0.28
34	0.26
35	0.24
36	0.19
37	0.18
38	0.17
39	0.18
40	0.13
41	0.15
42	0.17
43	0.2
44	0.22
45	0.25
46	0.27
47	0.29
48	0.33
49	0.33
50	0.39
51	0.37
52	0.35
53	0.31
54	0.35
55	0.36
56	0.33
57	0.32
58	0.27
59	0.27
60	0.27
61	0.27
62	0.21
63	0.16
64	0.17
65	0.19
66	0.2
67	0.2
68	0.21
69	0.24
70	0.23
71	0.24
72	0.24
73	0.27
74	0.34
75	0.42
76	0.49
77	0.55
78	0.65
79	0.72
80	0.78
81	0.81
82	0.79
83	0.76
84	0.73
85	0.73
86	0.74
87	0.7
88	0.72
89	0.7
90	0.7
91	0.72
92	0.73
93	0.69
94	0.67
95	0.65
96	0.61
97	0.54
98	0.53
99	0.47
100	0.43
101	0.41
102	0.36
103	0.32
104	0.26
105	0.25
106	0.18
107	0.15
108	0.11
109	0.08
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.06
114	0.06
115	0.06
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.1
121	0.11
122	0.13
123	0.14
124	0.15
125	0.17
126	0.18
127	0.18
128	0.18
129	0.16
130	0.13
131	0.12
132	0.12
133	0.11
134	0.1
135	0.09
136	0.09
137	0.09
138	0.09
139	0.09
140	0.07
141	0.06
142	0.05
143	0.05
144	0.04
145	0.04
146	0.06
147	0.08
148	0.1
149	0.15
150	0.24
151	0.3
152	0.35
153	0.39
154	0.48
155	0.54
156	0.62
157	0.66
158	0.68
159	0.71
160	0.77
161	0.83
162	0.82
163	0.82
164	0.8
165	0.76
166	0.69
167	0.64
168	0.58
169	0.53
170	0.51
171	0.5
172	0.5
173	0.51
174	0.5
175	0.5
176	0.5
177	0.48
178	0.42
179	0.44
180	0.47
181	0.48
182	0.54
183	0.55
184	0.52
185	0.48
186	0.49
187	0.41
188	0.31
189	0.23
190	0.18
191	0.16
192	0.16
193	0.16
194	0.13
195	0.12
196	0.12
197	0.13
198	0.11
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.1
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.11
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.08
211	0.11
212	0.17
213	0.2
214	0.28
215	0.33
216	0.34
217	0.35
218	0.4
219	0.44
220	0.48
221	0.55
222	0.56
223	0.53
224	0.53
225	0.51
226	0.46
227	0.39
228	0.36
229	0.29
230	0.25
231	0.23
232	0.23
233	0.24
234	0.24
235	0.24
236	0.16
237	0.13
238	0.09
239	0.09
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.06
244	0.06
245	0.06
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.03
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.06
255	0.06
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.1
262	0.08
263	0.09
264	0.13
265	0.15
266	0.16
267	0.2
268	0.2
269	0.26
270	0.32
271	0.38
272	0.42
273	0.45
274	0.47
275	0.46
276	0.46
277	0.4
278	0.34
279	0.3
280	0.24
281	0.18
282	0.15
283	0.14
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.09
288	0.12
289	0.17
290	0.16
291	0.17
292	0.18
293	0.2
294	0.23
295	0.3
296	0.31
297	0.29
298	0.32
299	0.34
300	0.39
301	0.42
302	0.42
303	0.38
304	0.42
305	0.43
306	0.51
307	0.51
308	0.47
309	0.43
310	0.41
311	0.41
312	0.34
313	0.31
314	0.21
315	0.18
316	0.16
317	0.13
318	0.12
319	0.08
320	0.07
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.06
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.06
330	0.06
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.12
344	0.2
345	0.3
346	0.36
347	0.4
348	0.46
349	0.5
350	0.52
351	0.55
352	0.53
353	0.5
354	0.47
355	0.44
356	0.39
357	0.36
358	0.35
359	0.3
360	0.24
361	0.18
362	0.17
363	0.21
364	0.22
365	0.23
366	0.22
367	0.24
368	0.28
369	0.28
370	0.28
371	0.26
372	0.23
373	0.22
374	0.22
375	0.19
376	0.17
377	0.2
378	0.19
379	0.16
380	0.17
381	0.15
382	0.17
383	0.21
384	0.23
385	0.22
386	0.23
387	0.23
388	0.24
389	0.25
390	0.26
391	0.25
392	0.29
393	0.3
394	0.31
395	0.3
396	0.31
397	0.32
398	0.28
399	0.24
400	0.17
401	0.14
402	0.12
403	0.14
404	0.17
405	0.17
406	0.2
407	0.21
408	0.2
409	0.25
410	0.3
411	0.37
412	0.4
413	0.45
414	0.5
415	0.52
416	0.52
417	0.47
418	0.42
419	0.33
420	0.24
421	0.2
422	0.12
423	0.09
424	0.08
425	0.08
426	0.08
427	0.08
428	0.08
429	0.06
430	0.05
431	0.05
432	0.05
433	0.05
434	0.06
435	0.06
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.05
445	0.06
446	0.06
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.1
451	0.11
452	0.13
453	0.19
454	0.21
455	0.27
456	0.3
457	0.3
458	0.31
459	0.36
460	0.39
461	0.38
462	0.37
463	0.33
464	0.31
465	0.32
466	0.3
467	0.25
468	0.19
469	0.14
470	0.13
471	0.13
472	0.11
473	0.11
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.13
483	0.13
484	0.17
485	0.21
486	0.27
487	0.35
488	0.42
489	0.49
490	0.51
491	0.56
492	0.59
493	0.63
494	0.57
495	0.51
496	0.47
497	0.41
498	0.33
499	0.28
500	0.21
501	0.14
502	0.13
503	0.11
504	0.09
505	0.06
506	0.06
507	0.07
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.07
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.06
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.1
520	0.1
521	0.1
522	0.1
523	0.09
524	0.11
525	0.11
526	0.16
527	0.16
528	0.16
529	0.18
530	0.21
531	0.27
532	0.24
533	0.23
534	0.2
535	0.22
536	0.26
537	0.3
538	0.38
539	0.36
540	0.45
541	0.51
542	0.56
543	0.64
544	0.69
545	0.72
546	0.64
547	0.65
548	0.6
549	0.61
550	0.6
551	0.58
552	0.57
553	0.52
554	0.56
555	0.53
556	0.5
557	0.45
558	0.41
559	0.38
560	0.32
561	0.36
562	0.37
563	0.4
564	0.42
565	0.42
566	0.43
567	0.45
568	0.48
569	0.49
570	0.52
571	0.56
572	0.57
573	0.58
574	0.57
575	0.5
576	0.49
577	0.48
578	0.42
579	0.35
580	0.33
581	0.32
582	0.32
583	0.3
584	0.26
585	0.24
586	0.21
587	0.22
588	0.21
589	0.19
590	0.2
591	0.24
592	0.27
593	0.29
594	0.34
595	0.38
596	0.46
597	0.49
598	0.49
599	0.48
600	0.52
601	0.53
602	0.5
603	0.5
604	0.45
605	0.5
606	0.5
607	0.49
608	0.44
609	0.4
610	0.37
611	0.31
612	0.36
613	0.32
614	0.4
615	0.41
616	0.44
617	0.48
618	0.52
619	0.55
620	0.56
621	0.59
622	0.57
623	0.64
624	0.65
625	0.65
626	0.66
627	0.62
628	0.53
629	0.5
630	0.43
631	0.35
632	0.32
633	0.28
634	0.26
635	0.25
636	0.24
637	0.2
638	0.19
639	0.17
640	0.14
641	0.12
642	0.09
643	0.08
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.08
648	0.08
649	0.1
650	0.1
651	0.12
652	0.14
653	0.16
654	0.17
655	0.16
656	0.17
657	0.17
658	0.22
659	0.2
660	0.23
661	0.24
662	0.24
663	0.33
664	0.4
665	0.46
666	0.45
667	0.54
668	0.54
669	0.56
670	0.59
671	0.56
672	0.56
673	0.53
674	0.55
675	0.56
676	0.57
677	0.59
678	0.63
679	0.63
680	0.59
681	0.58
682	0.61
683	0.62
684	0.64
685	0.69
686	0.71
687	0.7
688	0.74
689	0.75
690	0.71
691	0.62
692	0.57
693	0.53
694	0.48
695	0.49
696	0.48
697	0.42
698	0.37
699	0.34
700	0.35
701	0.36
702	0.31
703	0.27
704	0.26
705	0.26
706	0.3
707	0.32

A0A238FN95

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer