Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238F6L1

Protein Details
Accession A0A238F6L1    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-63QKPIVGARQPQKKQKNQADKRVINPDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
80-95VRGRGGRGGRGRGAGN
239-252KKAAKAPKEKKTKT
259-302RHQPPRRDGEDGVRGGRGGRGRGEGRGRGRGEGRGGGRGRGGRG
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MAQVRSANPFALLGDDGEDSAPVTAPKAAPAAAPAAQKPIVGARQPQKKQKNQADKRVINPDAPAAPGDLKEERAASFGVRGRGGRGGRGRGAGNPRSNAGTYLGGDRPRRENGGGRVFDRQSQTGHKDSDKAEAQGWGAEESQQELEAEKLGEADAQADGAATPAAVDGASTPVVSAAPVEEEDNSQTYAEYLAAQAARQLNIALPEARKIEDADEIKGRKAVKKGEQEEEEFLAQQKKAAKAPKEKKTKTFLEVEFRHQPPRRDGEDGVRGGRGGRGRGEGRGRGRGEGRGGGRGRGGRGGNANGVAQNGSSNAGVNLDDNTAFPTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.11
4 0.1
5 0.1
6 0.08
7 0.08
8 0.08
9 0.07
10 0.08
11 0.1
12 0.1
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.17
20 0.19
21 0.18
22 0.22
23 0.22
24 0.21
25 0.21
26 0.23
27 0.24
28 0.24
29 0.32
30 0.36
31 0.46
32 0.53
33 0.63
34 0.67
35 0.72
36 0.8
37 0.83
38 0.85
39 0.85
40 0.89
41 0.89
42 0.84
43 0.82
44 0.81
45 0.72
46 0.62
47 0.53
48 0.46
49 0.36
50 0.31
51 0.25
52 0.17
53 0.16
54 0.15
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.16
60 0.15
61 0.15
62 0.15
63 0.12
64 0.16
65 0.18
66 0.19
67 0.2
68 0.2
69 0.2
70 0.26
71 0.26
72 0.28
73 0.29
74 0.3
75 0.31
76 0.33
77 0.32
78 0.32
79 0.39
80 0.39
81 0.39
82 0.36
83 0.35
84 0.35
85 0.34
86 0.3
87 0.24
88 0.19
89 0.15
90 0.18
91 0.19
92 0.22
93 0.24
94 0.26
95 0.27
96 0.28
97 0.3
98 0.28
99 0.32
100 0.34
101 0.41
102 0.41
103 0.38
104 0.41
105 0.39
106 0.41
107 0.37
108 0.31
109 0.24
110 0.27
111 0.3
112 0.28
113 0.3
114 0.28
115 0.29
116 0.29
117 0.33
118 0.29
119 0.26
120 0.23
121 0.21
122 0.2
123 0.18
124 0.17
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.06
136 0.06
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.06
177 0.07
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.09
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.1
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.11
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.14
197 0.14
198 0.13
199 0.13
200 0.17
201 0.18
202 0.18
203 0.23
204 0.23
205 0.23
206 0.25
207 0.25
208 0.24
209 0.27
210 0.32
211 0.35
212 0.44
213 0.48
214 0.53
215 0.55
216 0.53
217 0.51
218 0.46
219 0.38
220 0.29
221 0.26
222 0.22
223 0.18
224 0.18
225 0.2
226 0.21
227 0.26
228 0.33
229 0.39
230 0.46
231 0.56
232 0.63
233 0.7
234 0.72
235 0.74
236 0.75
237 0.73
238 0.66
239 0.65
240 0.6
241 0.59
242 0.57
243 0.56
244 0.57
245 0.53
246 0.58
247 0.54
248 0.55
249 0.52
250 0.57
251 0.54
252 0.5
253 0.51
254 0.5
255 0.53
256 0.51
257 0.45
258 0.38
259 0.33
260 0.29
261 0.31
262 0.25
263 0.19
264 0.19
265 0.24
266 0.25
267 0.31
268 0.37
269 0.4
270 0.43
271 0.49
272 0.48
273 0.46
274 0.47
275 0.45
276 0.42
277 0.42
278 0.38
279 0.38
280 0.38
281 0.35
282 0.37
283 0.36
284 0.34
285 0.34
286 0.33
287 0.28
288 0.32
289 0.33
290 0.31
291 0.3
292 0.29
293 0.24
294 0.23
295 0.2
296 0.15
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.11