FuNGI

A0A238F640

Protein Details

Accession

A0A238F640

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
857-880	VVSSLADKPKKKKRALPSPSNEAD	Hydrophilic
892-914	SASAKPIKPSPTKKTKREVLDVE	Hydrophilic
931-956	SVAALTQGKKGKKKQKETTGRAAKGF	Hydrophilic
958-980	VDTSEFRKEPRVNNAPKKGNFSR	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
864-871	KPKKKKRA
939-948	KKGKKKQKET

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto_nucl 13.833, cyto 6.5, cyto_mito 4.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR012588 Exosome-assoc_fac_Rrp6_N IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000176 C:nuclear exosome (RNase complex) GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF00570 HRDC PF08066 PMC2NT
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC

Amino Acid Sequences

MAPSSLGSSSSSFELSSSYLATLEHALVQTTQHADQLPLSSDLSFERTLSRALAKKLDAQSERVLGLVQNLLSWSTLNQDPKASSSSSSASQATLDADLLRDGVYTNVVDRIEPLLEAADDELEIYLGVSKNTQSKHAPRSDAPLSKGKAAWPPKDRLASHLLHDPNLVKPQLAFPKRLCLPRPSLEDQDVPLEGPIWRPLLRRKLNPLASSTSQDPSWLRVVQTQNIDRFTSITGTAPPSYPMYLHPYQLEIEQLSPPQHYSVRPEPPRKLQEDSFDTTPFEWVDNKDKFDAMLSHIREMGKQGKRELAIDLEHHDQRCWGGITCLIQLSTRTQDYVIDALDPVVRDLLEGLNEFTTDPEWIKVFHGAASDIIWLQRDFGVYIVGLFDTYHATRVLDYPHHSLASLLERYTDFVPDKRYQLADWRIRPLPEAMLHYARSDTHYLLDVYDHLRIALYNLELSSGEKEQGEGKNVVDSVEPSPLVRVFDFSKAVSLSTFSIPPYDSTTGHFENGWLGLLAKNGQLQKYASALRVPTLPIRSGWGPGELHFELLKALHRWRERVAREEDEGINWVLSNWALFNLAEQGPKEVGEVMRVVGATAGRNGGVGEVMRRRKGEVLDVILKVVKEVESKSAKSGGEVVVVSEAMKERGEAAKEPVVRPVVDSLWSDQIEDVAAVKVVANSSFFGGRGKPSTSTSSTQGSSNLVASKSAFFGSSSSSKIPAPTVRVASDATPQRVAAIARIHSSLLLGGGLASVRVDLRWVAPTCSRTELTPLLYLQSLQGAKVPKSQAITSSDEPIEPKEAAQDAVDAHVEALTGDHFFIPFGERATKEAPIPSTSTSAKPAAVPKRSDKDVIVVSSLADKPKKKKRALPSPSNEADSTQSAAPSASTSASAKPIKPSPTKKTKREVLDVEPHDYSTSKSILDADPSSVAALTQGKKGKKKQKETTGRAAKGFVVDTSEFRKEPRVNNAPKKGNFSRSFAK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.13
3	0.13
4	0.12
5	0.11
6	0.11
7	0.11
8	0.12
9	0.12
10	0.12
11	0.13
12	0.12
13	0.12
14	0.13
15	0.13
16	0.15
17	0.17
18	0.17
19	0.17
20	0.18
21	0.18
22	0.2
23	0.22
24	0.21
25	0.2
26	0.2
27	0.18
28	0.18
29	0.18
30	0.2
31	0.18
32	0.16
33	0.16
34	0.17
35	0.18
36	0.2
37	0.26
38	0.27
39	0.3
40	0.36
41	0.35
42	0.42
43	0.46
44	0.53
45	0.48
46	0.47
47	0.47
48	0.44
49	0.42
50	0.34
51	0.29
52	0.2
53	0.2
54	0.18
55	0.14
56	0.11
57	0.12
58	0.12
59	0.12
60	0.12
61	0.1
62	0.12
63	0.17
64	0.2
65	0.21
66	0.24
67	0.25
68	0.28
69	0.3
70	0.27
71	0.24
72	0.23
73	0.25
74	0.24
75	0.26
76	0.24
77	0.21
78	0.2
79	0.2
80	0.17
81	0.15
82	0.13
83	0.1
84	0.1
85	0.1
86	0.09
87	0.09
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.08
92	0.08
93	0.09
94	0.12
95	0.12
96	0.12
97	0.13
98	0.15
99	0.14
100	0.13
101	0.13
102	0.1
103	0.1
104	0.1
105	0.09
106	0.07
107	0.06
108	0.07
109	0.06
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.07
114	0.08
115	0.08
116	0.09
117	0.11
118	0.17
119	0.18
120	0.23
121	0.28
122	0.36
123	0.45
124	0.51
125	0.55
126	0.51
127	0.58
128	0.62
129	0.59
130	0.56
131	0.54
132	0.5
133	0.48
134	0.47
135	0.42
136	0.43
137	0.45
138	0.5
139	0.48
140	0.52
141	0.55
142	0.61
143	0.58
144	0.54
145	0.53
146	0.46
147	0.42
148	0.44
149	0.39
150	0.32
151	0.34
152	0.3
153	0.27
154	0.31
155	0.28
156	0.21
157	0.2
158	0.27
159	0.34
160	0.36
161	0.37
162	0.33
163	0.42
164	0.47
165	0.53
166	0.49
167	0.46
168	0.5
169	0.53
170	0.59
171	0.55
172	0.55
173	0.52
174	0.5
175	0.45
176	0.4
177	0.33
178	0.26
179	0.2
180	0.16
181	0.13
182	0.12
183	0.13
184	0.14
185	0.15
186	0.19
187	0.27
188	0.37
189	0.44
190	0.48
191	0.55
192	0.62
193	0.67
194	0.65
195	0.61
196	0.58
197	0.53
198	0.5
199	0.44
200	0.36
201	0.29
202	0.3
203	0.26
204	0.22
205	0.24
206	0.22
207	0.2
208	0.25
209	0.29
210	0.31
211	0.38
212	0.4
213	0.39
214	0.4
215	0.4
216	0.33
217	0.31
218	0.27
219	0.21
220	0.16
221	0.14
222	0.13
223	0.16
224	0.17
225	0.16
226	0.17
227	0.16
228	0.16
229	0.16
230	0.16
231	0.2
232	0.21
233	0.22
234	0.21
235	0.21
236	0.21
237	0.21
238	0.21
239	0.13
240	0.13
241	0.13
242	0.14
243	0.14
244	0.14
245	0.14
246	0.15
247	0.16
248	0.16
249	0.22
250	0.28
251	0.37
252	0.45
253	0.52
254	0.55
255	0.62
256	0.68
257	0.65
258	0.63
259	0.56
260	0.55
261	0.54
262	0.53
263	0.46
264	0.4
265	0.37
266	0.31
267	0.3
268	0.22
269	0.17
270	0.14
271	0.15
272	0.22
273	0.24
274	0.26
275	0.25
276	0.25
277	0.24
278	0.24
279	0.22
280	0.18
281	0.23
282	0.22
283	0.22
284	0.25
285	0.25
286	0.23
287	0.26
288	0.3
289	0.28
290	0.3
291	0.31
292	0.33
293	0.34
294	0.34
295	0.32
296	0.25
297	0.21
298	0.2
299	0.21
300	0.21
301	0.23
302	0.22
303	0.21
304	0.19
305	0.17
306	0.18
307	0.16
308	0.12
309	0.1
310	0.12
311	0.14
312	0.14
313	0.14
314	0.12
315	0.11
316	0.12
317	0.14
318	0.15
319	0.14
320	0.13
321	0.13
322	0.13
323	0.15
324	0.15
325	0.12
326	0.09
327	0.08
328	0.09
329	0.1
330	0.09
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.09
351	0.11
352	0.11
353	0.11
354	0.11
355	0.1
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.07
360	0.08
361	0.08
362	0.07
363	0.07
364	0.08
365	0.08
366	0.07
367	0.07
368	0.07
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.04
376	0.06
377	0.07
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.09
382	0.1
383	0.12
384	0.13
385	0.16
386	0.18
387	0.19
388	0.19
389	0.18
390	0.17
391	0.16
392	0.18
393	0.16
394	0.12
395	0.12
396	0.12
397	0.14
398	0.14
399	0.15
400	0.12
401	0.13
402	0.19
403	0.2
404	0.22
405	0.22
406	0.22
407	0.2
408	0.27
409	0.34
410	0.36
411	0.36
412	0.39
413	0.39
414	0.38
415	0.39
416	0.32
417	0.26
418	0.2
419	0.21
420	0.19
421	0.19
422	0.19
423	0.18
424	0.18
425	0.16
426	0.16
427	0.14
428	0.12
429	0.1
430	0.11
431	0.11
432	0.11
433	0.11
434	0.09
435	0.09
436	0.1
437	0.09
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.06
444	0.06
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.08
450	0.07
451	0.08
452	0.07
453	0.08
454	0.11
455	0.12
456	0.15
457	0.14
458	0.13
459	0.14
460	0.14
461	0.14
462	0.1
463	0.11
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.08
468	0.09
469	0.09
470	0.1
471	0.08
472	0.09
473	0.09
474	0.11
475	0.12
476	0.12
477	0.12
478	0.11
479	0.11
480	0.1
481	0.09
482	0.09
483	0.09
484	0.09
485	0.08
486	0.09
487	0.09
488	0.1
489	0.13
490	0.13
491	0.12
492	0.14
493	0.19
494	0.19
495	0.19
496	0.18
497	0.14
498	0.13
499	0.13
500	0.1
501	0.06
502	0.05
503	0.05
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.12
511	0.11
512	0.12
513	0.14
514	0.15
515	0.13
516	0.13
517	0.13
518	0.12
519	0.13
520	0.13
521	0.13
522	0.14
523	0.14
524	0.12
525	0.15
526	0.15
527	0.15
528	0.15
529	0.15
530	0.13
531	0.13
532	0.19
533	0.16
534	0.16
535	0.14
536	0.14
537	0.12
538	0.12
539	0.13
540	0.09
541	0.11
542	0.17
543	0.18
544	0.2
545	0.25
546	0.33
547	0.33
548	0.38
549	0.41
550	0.38
551	0.38
552	0.4
553	0.35
554	0.27
555	0.27
556	0.2
557	0.14
558	0.11
559	0.09
560	0.06
561	0.06
562	0.05
563	0.04
564	0.04
565	0.05
566	0.04
567	0.05
568	0.08
569	0.09
570	0.1
571	0.1
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.11
576	0.09
577	0.08
578	0.08
579	0.09
580	0.07
581	0.08
582	0.08
583	0.07
584	0.06
585	0.07
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.05
590	0.06
591	0.06
592	0.05
593	0.05
594	0.05
595	0.07
596	0.14
597	0.17
598	0.19
599	0.2
600	0.21
601	0.24
602	0.25
603	0.27
604	0.24
605	0.26
606	0.28
607	0.28
608	0.27
609	0.25
610	0.24
611	0.19
612	0.16
613	0.11
614	0.08
615	0.09
616	0.16
617	0.18
618	0.19
619	0.21
620	0.25
621	0.24
622	0.23
623	0.24
624	0.18
625	0.16
626	0.15
627	0.14
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.08
632	0.08
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.08
637	0.11
638	0.12
639	0.13
640	0.16
641	0.2
642	0.23
643	0.23
644	0.25
645	0.24
646	0.22
647	0.22
648	0.2
649	0.16
650	0.16
651	0.17
652	0.15
653	0.18
654	0.18
655	0.18
656	0.15
657	0.15
658	0.13
659	0.12
660	0.1
661	0.05
662	0.05
663	0.05
664	0.05
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.07
671	0.08
672	0.08
673	0.09
674	0.1
675	0.12
676	0.14
677	0.16
678	0.16
679	0.19
680	0.24
681	0.27
682	0.29
683	0.29
684	0.3
685	0.29
686	0.28
687	0.26
688	0.23
689	0.19
690	0.18
691	0.18
692	0.14
693	0.14
694	0.14
695	0.13
696	0.13
697	0.12
698	0.11
699	0.09
700	0.09
701	0.13
702	0.14
703	0.16
704	0.16
705	0.17
706	0.17
707	0.18
708	0.21
709	0.2
710	0.23
711	0.25
712	0.26
713	0.25
714	0.26
715	0.26
716	0.24
717	0.28
718	0.28
719	0.26
720	0.24
721	0.23
722	0.22
723	0.23
724	0.22
725	0.19
726	0.18
727	0.17
728	0.18
729	0.19
730	0.18
731	0.16
732	0.16
733	0.12
734	0.08
735	0.07
736	0.05
737	0.04
738	0.04
739	0.04
740	0.04
741	0.03
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.05
746	0.05
747	0.07
748	0.14
749	0.15
750	0.18
751	0.22
752	0.24
753	0.26
754	0.3
755	0.29
756	0.23
757	0.27
758	0.27
759	0.26
760	0.26
761	0.24
762	0.21
763	0.21
764	0.2
765	0.15
766	0.18
767	0.15
768	0.13
769	0.16
770	0.18
771	0.19
772	0.25
773	0.27
774	0.24
775	0.27
776	0.27
777	0.28
778	0.29
779	0.35
780	0.3
781	0.34
782	0.32
783	0.29
784	0.3
785	0.27
786	0.25
787	0.19
788	0.17
789	0.15
790	0.16
791	0.16
792	0.15
793	0.14
794	0.12
795	0.13
796	0.13
797	0.1
798	0.09
799	0.08
800	0.08
801	0.06
802	0.06
803	0.05
804	0.05
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.07
810	0.09
811	0.1
812	0.12
813	0.16
814	0.17
815	0.2
816	0.23
817	0.24
818	0.23
819	0.26
820	0.26
821	0.24
822	0.26
823	0.24
824	0.26
825	0.27
826	0.27
827	0.27
828	0.26
829	0.25
830	0.26
831	0.33
832	0.37
833	0.41
834	0.44
835	0.49
836	0.54
837	0.57
838	0.56
839	0.49
840	0.46
841	0.44
842	0.4
843	0.33
844	0.26
845	0.23
846	0.25
847	0.26
848	0.26
849	0.27
850	0.31
851	0.39
852	0.5
853	0.59
854	0.63
855	0.7
856	0.75
857	0.81
858	0.85
859	0.87
860	0.85
861	0.84
862	0.8
863	0.75
864	0.64
865	0.54
866	0.47
867	0.38
868	0.32
869	0.24
870	0.2
871	0.16
872	0.16
873	0.14
874	0.12
875	0.11
876	0.09
877	0.1
878	0.12
879	0.14
880	0.21
881	0.25
882	0.26
883	0.31
884	0.36
885	0.43
886	0.51
887	0.59
888	0.62
889	0.69
890	0.77
891	0.8
892	0.83
893	0.84
894	0.82
895	0.82
896	0.78
897	0.75
898	0.76
899	0.71
900	0.66
901	0.58
902	0.5
903	0.42
904	0.36
905	0.29
906	0.22
907	0.2
908	0.15
909	0.15
910	0.18
911	0.19
912	0.23
913	0.23
914	0.21
915	0.2
916	0.2
917	0.2
918	0.16
919	0.14
920	0.12
921	0.17
922	0.17
923	0.22
924	0.29
925	0.36
926	0.45
927	0.55
928	0.63
929	0.68
930	0.77
931	0.81
932	0.85
933	0.9
934	0.89
935	0.91
936	0.91
937	0.85
938	0.76
939	0.67
940	0.58
941	0.49
942	0.42
943	0.31
944	0.26
945	0.23
946	0.24
947	0.28
948	0.31
949	0.28
950	0.29
951	0.37
952	0.38
953	0.43
954	0.51
955	0.55
956	0.62
957	0.72
958	0.81
959	0.81
960	0.8
961	0.82
962	0.79
963	0.79
964	0.73

A0A238F640

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer