Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A238FIU6

Protein Details
Accession A0A238FIU6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-96GGAVVFRRTKNKKTPAGRAGVLHydrophilic
865-885LQNAQKWRRYARSHRLPLSTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
581-599PRSGARVARRSARERRLDA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 8.5, mito 5, cyto 3.5, pero 2, plas 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MDPDEPLSTPIIKRRNLKGVRPSSSSSSLRSWSAQLDGGTTEAISSSTPSSTPGPVTPSTKNGTPNEGDDSVDDGGAVVFRRTKNKKTPAGRAGVLGASTATSGSGSTTKPKIKSRLSVGLSLHDEDEMDEGDSFVVTKRASSSSSSTPARKLLSLRDYDNNNNGASLPSNLDQADISPHKSALSTVYSTEYLDELKRGTLSTPPPPPPAAPVAMASTTGHDDLTMSKFASHFAASEGGSICARVKRRGSIVVSSLTKSAPNLHRLNPLVADAPVSHIPTTAAIASAKARRERIRTEGGGIGSDGFIALEVGPSRKAGSGSESRLVREDDDLGDGMDEMADFESSLPLGKKANRDAKREEKQGMMRSIDEAEEEMEDGEDEETKEWEERQMARANEKRAREEMQTLGQATYVPTPIPQTSTLPTLTNVQARLSAGLNTLESSRTLDVAALNHSGKERTELDAQENELRSEVMRIEEKHRWFNDFKTFIEDVAAFLDEKFPALEKIEKENLAIQKERYEIVSRRRFEDDSDDVALFTGMSVPSAFSLDPKVSEEEEEGQHGGEDEVDEMGRSTRRTEDRFGPRSGARVARRSARERRLDARRSAHQPNGVASTAEDDAAMWTDDDLGSADSADLADALSSLQELRRALFEDVRVDDFRDPNLGIRKKFEEWKTTYREDYENAFGGLALVGVWEFWARVEMALWNPFGIDQLAKTPSGLDSYHWHSSLTAFGHASHTYHIDDEDDDNHMDEDGAHSDESAEVVNALVTSVVIPRLIALARASYDPWSRKQTIKALALVDEVSYCVETTSPRFDSLIQAFLSRLQIGIIQSSTLILPHLTQLNLPSNAFDPSTFIARERFLLRQLKLLQNAQKWRRYARSHRLPLSTSSSIDPISETGSGATLDELLQRDLVAKVMLPVIEASWTTGGEDIARKVLGVLPSGEWIPALRRRLEGERR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.62
3 0.66
4 0.71
5 0.74
6 0.76
7 0.77
8 0.74
9 0.7
10 0.66
11 0.67
12 0.6
13 0.54
14 0.49
15 0.45
16 0.42
17 0.4
18 0.36
19 0.3
20 0.3
21 0.29
22 0.24
23 0.22
24 0.2
25 0.19
26 0.16
27 0.14
28 0.11
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.08
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.13
37 0.15
38 0.17
39 0.2
40 0.2
41 0.24
42 0.27
43 0.32
44 0.33
45 0.36
46 0.38
47 0.4
48 0.45
49 0.42
50 0.45
51 0.42
52 0.42
53 0.43
54 0.39
55 0.35
56 0.29
57 0.29
58 0.23
59 0.2
60 0.17
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.1
65 0.08
66 0.13
67 0.16
68 0.27
69 0.34
70 0.43
71 0.52
72 0.62
73 0.7
74 0.74
75 0.82
76 0.8
77 0.8
78 0.72
79 0.64
80 0.56
81 0.47
82 0.38
83 0.27
84 0.18
85 0.11
86 0.1
87 0.08
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.07
92 0.09
93 0.1
94 0.17
95 0.24
96 0.3
97 0.36
98 0.44
99 0.52
100 0.57
101 0.63
102 0.65
103 0.68
104 0.65
105 0.65
106 0.58
107 0.55
108 0.51
109 0.44
110 0.36
111 0.26
112 0.23
113 0.17
114 0.17
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.12
127 0.14
128 0.16
129 0.19
130 0.24
131 0.26
132 0.34
133 0.38
134 0.39
135 0.4
136 0.42
137 0.41
138 0.39
139 0.36
140 0.37
141 0.39
142 0.41
143 0.42
144 0.44
145 0.47
146 0.49
147 0.52
148 0.45
149 0.38
150 0.34
151 0.3
152 0.24
153 0.2
154 0.17
155 0.15
156 0.13
157 0.15
158 0.14
159 0.15
160 0.13
161 0.13
162 0.19
163 0.17
164 0.19
165 0.19
166 0.19
167 0.19
168 0.19
169 0.19
170 0.15
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.19
175 0.19
176 0.19
177 0.19
178 0.16
179 0.14
180 0.13
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.16
188 0.2
189 0.26
190 0.33
191 0.36
192 0.39
193 0.4
194 0.4
195 0.37
196 0.36
197 0.31
198 0.24
199 0.22
200 0.2
201 0.19
202 0.19
203 0.16
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.11
208 0.09
209 0.09
210 0.11
211 0.13
212 0.13
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.14
217 0.15
218 0.13
219 0.1
220 0.1
221 0.12
222 0.11
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.15
230 0.18
231 0.22
232 0.24
233 0.27
234 0.31
235 0.38
236 0.39
237 0.39
238 0.39
239 0.4
240 0.38
241 0.35
242 0.32
243 0.26
244 0.23
245 0.19
246 0.24
247 0.23
248 0.28
249 0.31
250 0.33
251 0.4
252 0.41
253 0.42
254 0.35
255 0.31
256 0.25
257 0.21
258 0.19
259 0.12
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.11
267 0.13
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.12
273 0.15
274 0.19
275 0.21
276 0.27
277 0.31
278 0.36
279 0.4
280 0.43
281 0.46
282 0.43
283 0.43
284 0.41
285 0.36
286 0.31
287 0.27
288 0.21
289 0.13
290 0.11
291 0.08
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.14
306 0.19
307 0.22
308 0.28
309 0.27
310 0.27
311 0.28
312 0.29
313 0.24
314 0.19
315 0.17
316 0.12
317 0.13
318 0.12
319 0.1
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.05
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.06
333 0.06
334 0.07
335 0.1
336 0.13
337 0.17
338 0.26
339 0.36
340 0.41
341 0.46
342 0.53
343 0.6
344 0.65
345 0.65
346 0.59
347 0.55
348 0.54
349 0.55
350 0.51
351 0.42
352 0.35
353 0.31
354 0.29
355 0.23
356 0.18
357 0.12
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.04
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.09
374 0.11
375 0.12
376 0.16
377 0.22
378 0.22
379 0.29
380 0.34
381 0.39
382 0.41
383 0.42
384 0.41
385 0.38
386 0.4
387 0.35
388 0.33
389 0.28
390 0.26
391 0.25
392 0.23
393 0.2
394 0.17
395 0.15
396 0.12
397 0.11
398 0.09
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.1
404 0.11
405 0.12
406 0.13
407 0.15
408 0.16
409 0.15
410 0.15
411 0.16
412 0.17
413 0.17
414 0.16
415 0.14
416 0.14
417 0.14
418 0.14
419 0.12
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.07
433 0.08
434 0.08
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.12
443 0.12
444 0.13
445 0.16
446 0.16
447 0.19
448 0.2
449 0.21
450 0.21
451 0.2
452 0.17
453 0.14
454 0.13
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.07
459 0.1
460 0.11
461 0.16
462 0.21
463 0.24
464 0.29
465 0.29
466 0.32
467 0.31
468 0.33
469 0.37
470 0.33
471 0.31
472 0.32
473 0.31
474 0.27
475 0.27
476 0.23
477 0.14
478 0.13
479 0.13
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.05
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.05
488 0.07
489 0.1
490 0.11
491 0.16
492 0.18
493 0.19
494 0.19
495 0.23
496 0.24
497 0.24
498 0.24
499 0.2
500 0.19
501 0.2
502 0.2
503 0.17
504 0.19
505 0.2
506 0.29
507 0.37
508 0.35
509 0.37
510 0.4
511 0.39
512 0.36
513 0.38
514 0.32
515 0.27
516 0.27
517 0.24
518 0.21
519 0.2
520 0.19
521 0.12
522 0.08
523 0.06
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.07
533 0.07
534 0.08
535 0.09
536 0.11
537 0.1
538 0.11
539 0.12
540 0.13
541 0.13
542 0.13
543 0.12
544 0.1
545 0.1
546 0.09
547 0.08
548 0.05
549 0.05
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.07
557 0.07
558 0.08
559 0.14
560 0.2
561 0.23
562 0.27
563 0.35
564 0.44
565 0.48
566 0.48
567 0.46
568 0.41
569 0.41
570 0.4
571 0.38
572 0.32
573 0.33
574 0.34
575 0.38
576 0.43
577 0.47
578 0.53
579 0.55
580 0.58
581 0.57
582 0.63
583 0.65
584 0.66
585 0.65
586 0.61
587 0.59
588 0.59
589 0.59
590 0.54
591 0.48
592 0.43
593 0.38
594 0.36
595 0.3
596 0.23
597 0.18
598 0.17
599 0.14
600 0.12
601 0.1
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.07
606 0.05
607 0.04
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.05
613 0.04
614 0.05
615 0.04
616 0.04
617 0.04
618 0.04
619 0.03
620 0.03
621 0.03
622 0.03
623 0.03
624 0.03
625 0.03
626 0.03
627 0.04
628 0.07
629 0.07
630 0.08
631 0.1
632 0.12
633 0.14
634 0.16
635 0.17
636 0.18
637 0.19
638 0.22
639 0.21
640 0.2
641 0.22
642 0.2
643 0.19
644 0.18
645 0.17
646 0.18
647 0.27
648 0.3
649 0.28
650 0.32
651 0.35
652 0.37
653 0.44
654 0.45
655 0.44
656 0.45
657 0.52
658 0.55
659 0.54
660 0.52
661 0.48
662 0.45
663 0.38
664 0.36
665 0.31
666 0.25
667 0.22
668 0.19
669 0.16
670 0.14
671 0.12
672 0.08
673 0.04
674 0.03
675 0.03
676 0.03
677 0.03
678 0.03
679 0.03
680 0.03
681 0.04
682 0.05
683 0.05
684 0.06
685 0.07
686 0.1
687 0.13
688 0.13
689 0.11
690 0.11
691 0.11
692 0.11
693 0.1
694 0.08
695 0.06
696 0.1
697 0.12
698 0.12
699 0.12
700 0.12
701 0.12
702 0.14
703 0.14
704 0.12
705 0.15
706 0.21
707 0.25
708 0.24
709 0.24
710 0.22
711 0.22
712 0.24
713 0.21
714 0.17
715 0.14
716 0.14
717 0.17
718 0.17
719 0.17
720 0.15
721 0.15
722 0.14
723 0.14
724 0.13
725 0.11
726 0.12
727 0.13
728 0.13
729 0.13
730 0.13
731 0.13
732 0.13
733 0.12
734 0.1
735 0.09
736 0.09
737 0.09
738 0.1
739 0.09
740 0.09
741 0.09
742 0.09
743 0.09
744 0.08
745 0.06
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.04
750 0.04
751 0.04
752 0.03
753 0.04
754 0.05
755 0.06
756 0.05
757 0.05
758 0.06
759 0.08
760 0.08
761 0.08
762 0.08
763 0.09
764 0.11
765 0.12
766 0.13
767 0.15
768 0.21
769 0.24
770 0.29
771 0.35
772 0.37
773 0.41
774 0.47
775 0.51
776 0.53
777 0.53
778 0.52
779 0.46
780 0.43
781 0.4
782 0.33
783 0.25
784 0.17
785 0.13
786 0.1
787 0.08
788 0.07
789 0.06
790 0.07
791 0.08
792 0.11
793 0.18
794 0.19
795 0.2
796 0.21
797 0.22
798 0.28
799 0.29
800 0.3
801 0.23
802 0.22
803 0.21
804 0.23
805 0.24
806 0.17
807 0.15
808 0.11
809 0.13
810 0.13
811 0.15
812 0.13
813 0.11
814 0.11
815 0.11
816 0.11
817 0.08
818 0.08
819 0.06
820 0.07
821 0.1
822 0.13
823 0.12
824 0.13
825 0.17
826 0.24
827 0.26
828 0.25
829 0.23
830 0.22
831 0.23
832 0.23
833 0.19
834 0.15
835 0.15
836 0.19
837 0.18
838 0.18
839 0.19
840 0.2
841 0.24
842 0.24
843 0.25
844 0.28
845 0.36
846 0.35
847 0.41
848 0.46
849 0.49
850 0.51
851 0.56
852 0.56
853 0.56
854 0.66
855 0.65
856 0.66
857 0.63
858 0.65
859 0.67
860 0.69
861 0.72
862 0.73
863 0.76
864 0.79
865 0.82
866 0.8
867 0.74
868 0.69
869 0.67
870 0.58
871 0.49
872 0.41
873 0.36
874 0.3
875 0.28
876 0.24
877 0.16
878 0.16
879 0.14
880 0.12
881 0.11
882 0.11
883 0.11
884 0.1
885 0.1
886 0.08
887 0.08
888 0.11
889 0.12
890 0.12
891 0.12
892 0.12
893 0.13
894 0.13
895 0.14
896 0.11
897 0.09
898 0.1
899 0.12
900 0.12
901 0.11
902 0.11
903 0.1
904 0.12
905 0.11
906 0.12
907 0.11
908 0.11
909 0.11
910 0.11
911 0.11
912 0.13
913 0.15
914 0.15
915 0.17
916 0.16
917 0.16
918 0.16
919 0.2
920 0.19
921 0.18
922 0.18
923 0.16
924 0.19
925 0.19
926 0.18
927 0.14
928 0.14
929 0.18
930 0.23
931 0.27
932 0.27
933 0.3
934 0.36