Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8ZMJ1

Protein Details
Accession G8ZMJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
442-476IPSNQGSSTRPKRHGNNGRDQRRSNRRQIKKRTEKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
451-476RPKRHGNNGRDQRRSNRRQIKKRTEK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024337  tRNA_splic_suSen54  
IPR024336  tRNA_splic_suSen54_N  
Gene Ontology GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG tdl:TDEL_0A05030  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12928  tRNA_int_end_N2  
Amino Acid Sequences MSKLKTPKNPSEEAEDELVTIKDEEIDEDEESQDWSQAVKLSTKSMISSIPKRGEKDYEPDGTNVQELLLYRARKAMFDTLANSPRGSIVSNQVKAYYDSKLHGAILPHPKGNFLQTMGSVDQEGRCWLDFQEFVYLAERGTVLPFYINEPRDIEIPLSMQDLYSLFRSQAEMDRYFIFAHLKRLGFIITSSYQRRVEKTSFYPPSNPAFGSSIGLRYDSFLSFIDLKGASLMNAFFYTRWNFLLRRYTSTQKIYEGLKNLVPSVRVPKTADELRFERIRCQLNPTAPFSIAFNVWKPQTNFKKKSPGLPDFQVVIHNKNDASQHFPSYSELQEIFHSLDYKFDFLNEIDEEVNWDNDSYTNGVLRSQHISNARSKAASTKPRPVNHLDTKTENKHGMPHVKQFRRLKAGYRSFLLAIMDDGLISFVKISEADFGSENVWYIPSNQGSSTRPKRHGNNGRDQRRSNRRQIKKRTEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.4
3 0.33
4 0.29
5 0.26
6 0.18
7 0.16
8 0.12
9 0.1
10 0.11
11 0.12
12 0.13
13 0.16
14 0.15
15 0.16
16 0.17
17 0.15
18 0.17
19 0.15
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.14
25 0.16
26 0.19
27 0.2
28 0.22
29 0.25
30 0.26
31 0.25
32 0.23
33 0.27
34 0.3
35 0.35
36 0.41
37 0.47
38 0.5
39 0.52
40 0.55
41 0.55
42 0.52
43 0.52
44 0.5
45 0.47
46 0.44
47 0.43
48 0.4
49 0.34
50 0.31
51 0.24
52 0.18
53 0.13
54 0.12
55 0.15
56 0.19
57 0.19
58 0.19
59 0.24
60 0.25
61 0.24
62 0.27
63 0.28
64 0.26
65 0.27
66 0.3
67 0.32
68 0.37
69 0.38
70 0.34
71 0.28
72 0.26
73 0.24
74 0.22
75 0.17
76 0.21
77 0.29
78 0.32
79 0.32
80 0.32
81 0.33
82 0.34
83 0.34
84 0.28
85 0.21
86 0.2
87 0.22
88 0.21
89 0.21
90 0.2
91 0.2
92 0.24
93 0.31
94 0.32
95 0.33
96 0.32
97 0.33
98 0.31
99 0.33
100 0.27
101 0.19
102 0.18
103 0.16
104 0.2
105 0.18
106 0.18
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.17
120 0.16
121 0.17
122 0.18
123 0.17
124 0.14
125 0.14
126 0.13
127 0.08
128 0.08
129 0.08
130 0.06
131 0.07
132 0.07
133 0.11
134 0.17
135 0.17
136 0.18
137 0.19
138 0.2
139 0.21
140 0.21
141 0.18
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.11
157 0.16
158 0.19
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.21
163 0.21
164 0.2
165 0.19
166 0.16
167 0.2
168 0.23
169 0.22
170 0.21
171 0.22
172 0.21
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.11
177 0.16
178 0.17
179 0.21
180 0.25
181 0.26
182 0.28
183 0.29
184 0.3
185 0.31
186 0.34
187 0.4
188 0.41
189 0.41
190 0.42
191 0.39
192 0.4
193 0.37
194 0.32
195 0.24
196 0.21
197 0.19
198 0.18
199 0.15
200 0.13
201 0.12
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.09
207 0.1
208 0.08
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.05
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.13
229 0.13
230 0.17
231 0.26
232 0.25
233 0.29
234 0.32
235 0.35
236 0.38
237 0.41
238 0.39
239 0.31
240 0.33
241 0.3
242 0.29
243 0.27
244 0.24
245 0.22
246 0.21
247 0.2
248 0.18
249 0.15
250 0.14
251 0.18
252 0.18
253 0.19
254 0.19
255 0.2
256 0.24
257 0.29
258 0.29
259 0.27
260 0.27
261 0.29
262 0.32
263 0.31
264 0.29
265 0.3
266 0.33
267 0.3
268 0.35
269 0.35
270 0.37
271 0.4
272 0.4
273 0.35
274 0.31
275 0.3
276 0.24
277 0.21
278 0.17
279 0.14
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.19
284 0.2
285 0.28
286 0.38
287 0.48
288 0.52
289 0.55
290 0.65
291 0.61
292 0.68
293 0.68
294 0.63
295 0.57
296 0.54
297 0.51
298 0.41
299 0.4
300 0.37
301 0.3
302 0.27
303 0.22
304 0.21
305 0.19
306 0.2
307 0.22
308 0.18
309 0.23
310 0.22
311 0.23
312 0.23
313 0.24
314 0.24
315 0.24
316 0.23
317 0.2
318 0.18
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.11
326 0.14
327 0.14
328 0.15
329 0.13
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.16
334 0.12
335 0.13
336 0.12
337 0.12
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.11
346 0.09
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.13
352 0.15
353 0.18
354 0.17
355 0.22
356 0.26
357 0.28
358 0.33
359 0.36
360 0.36
361 0.32
362 0.32
363 0.34
364 0.38
365 0.45
366 0.45
367 0.51
368 0.58
369 0.61
370 0.66
371 0.65
372 0.66
373 0.65
374 0.67
375 0.61
376 0.6
377 0.64
378 0.64
379 0.62
380 0.55
381 0.46
382 0.45
383 0.48
384 0.51
385 0.48
386 0.53
387 0.58
388 0.61
389 0.7
390 0.71
391 0.72
392 0.72
393 0.69
394 0.68
395 0.68
396 0.71
397 0.66
398 0.61
399 0.55
400 0.46
401 0.46
402 0.38
403 0.27
404 0.18
405 0.15
406 0.12
407 0.09
408 0.09
409 0.08
410 0.07
411 0.06
412 0.06
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.06
417 0.1
418 0.11
419 0.13
420 0.14
421 0.14
422 0.14
423 0.15
424 0.14
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.11
429 0.16
430 0.18
431 0.19
432 0.2
433 0.24
434 0.27
435 0.38
436 0.46
437 0.5
438 0.55
439 0.62
440 0.68
441 0.75
442 0.82
443 0.8
444 0.81
445 0.83
446 0.85
447 0.86
448 0.84
449 0.84
450 0.85
451 0.85
452 0.85
453 0.84
454 0.85
455 0.87
456 0.92