Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3MPA8

Protein Details
Accession A0A1Y3MPA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
208-251IRNKSGKHSSHKSFRKRRRELNKTENHYKRSNFKKNKFNKELLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-241KSGKHSSHKSFRKRRRELNKTENHYKRSNFK
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 5.5, cyto_mito 5.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR045358  Ty3_capsid  
Gene Ontology GO:0043227  C:membrane-bounded organelle  
Pfam View protein in Pfam  
PF19259  Ty3_capsid  
Amino Acid Sequences MDSNSGNSSIPNNNNTASKLLTAITDFLPALFSPGGILLKENEEKNKQGVLEIVIQCEDFFREHPDSFKEDEAKNSFLINKLSGTARRWGLSLLSDGTLRNLQFEEFKKLLLENFDAGKEKKQKYVLMEKLWKLKQQHLGSAAEYTIEFRRLSGRLGWPDKVLVDIIGKGLIDRVREEFDKLDKPDTLFEATNIIIGIDKKCYLESCIRNKSGKHSSHKSFRKRRRELNKTENHYKRSNFKKNKFNKELLSANYTPSGETSMTTSFYIQVNGKNIKANILIDSGSGRSFLCKNFTTANKIPTSEHDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.33
4 0.27
5 0.22
6 0.21
7 0.18
8 0.17
9 0.16
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.13
14 0.12
15 0.13
16 0.11
17 0.13
18 0.11
19 0.1
20 0.09
21 0.11
22 0.12
23 0.1
24 0.12
25 0.1
26 0.15
27 0.2
28 0.22
29 0.27
30 0.3
31 0.32
32 0.34
33 0.35
34 0.3
35 0.27
36 0.26
37 0.22
38 0.27
39 0.26
40 0.24
41 0.21
42 0.21
43 0.2
44 0.19
45 0.17
46 0.1
47 0.1
48 0.15
49 0.18
50 0.19
51 0.22
52 0.25
53 0.28
54 0.29
55 0.32
56 0.31
57 0.28
58 0.34
59 0.35
60 0.33
61 0.3
62 0.29
63 0.26
64 0.24
65 0.25
66 0.19
67 0.16
68 0.16
69 0.18
70 0.2
71 0.21
72 0.24
73 0.24
74 0.24
75 0.23
76 0.22
77 0.2
78 0.18
79 0.17
80 0.13
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.15
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.11
90 0.16
91 0.18
92 0.23
93 0.21
94 0.21
95 0.21
96 0.21
97 0.21
98 0.19
99 0.18
100 0.13
101 0.13
102 0.14
103 0.16
104 0.17
105 0.22
106 0.28
107 0.28
108 0.32
109 0.34
110 0.36
111 0.39
112 0.49
113 0.48
114 0.47
115 0.51
116 0.49
117 0.54
118 0.52
119 0.51
120 0.43
121 0.43
122 0.45
123 0.4
124 0.41
125 0.36
126 0.36
127 0.32
128 0.3
129 0.23
130 0.14
131 0.13
132 0.11
133 0.08
134 0.09
135 0.08
136 0.08
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.18
142 0.22
143 0.25
144 0.26
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.19
149 0.15
150 0.09
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.17
167 0.22
168 0.22
169 0.23
170 0.21
171 0.22
172 0.22
173 0.22
174 0.21
175 0.16
176 0.15
177 0.14
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.09
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.21
192 0.28
193 0.36
194 0.42
195 0.46
196 0.49
197 0.49
198 0.54
199 0.55
200 0.55
201 0.55
202 0.56
203 0.6
204 0.67
205 0.76
206 0.78
207 0.8
208 0.82
209 0.85
210 0.85
211 0.88
212 0.89
213 0.9
214 0.89
215 0.89
216 0.89
217 0.86
218 0.88
219 0.85
220 0.79
221 0.75
222 0.69
223 0.68
224 0.69
225 0.71
226 0.71
227 0.73
228 0.78
229 0.82
230 0.89
231 0.87
232 0.82
233 0.76
234 0.72
235 0.69
236 0.62
237 0.59
238 0.49
239 0.43
240 0.39
241 0.35
242 0.28
243 0.22
244 0.21
245 0.14
246 0.13
247 0.15
248 0.13
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.15
253 0.15
254 0.18
255 0.18
256 0.2
257 0.26
258 0.29
259 0.3
260 0.33
261 0.33
262 0.33
263 0.33
264 0.3
265 0.25
266 0.23
267 0.22
268 0.17
269 0.18
270 0.16
271 0.13
272 0.13
273 0.11
274 0.13
275 0.15
276 0.17
277 0.22
278 0.22
279 0.26
280 0.32
281 0.37
282 0.43
283 0.45
284 0.5
285 0.48
286 0.49
287 0.47