Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NR42

Protein Details
Accession A0A1Y3NR42    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-384IIKQKIPSKEIKKEHQKLIDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR000048  IQ_motif_EF-hand-BS  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF13299  CPSF100_C  
PF00612  IQ  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50096  IQ  
Amino Acid Sequences ILIHGNEEQTLHLQEFCKSVISNGVEAPHVGECINVSAATNIYQIKLTDTLVDSLDMAKMDDYELAFIQGQIELNDMNQNPVLDIIPPEEKNRNNDYIPSIIIGDLKLSEFKRLLQHEGYNAEFIPSGLLVNESILIQKHCNENAIKIQALYRGYATRKAYKVNKDLYSKKKHLDNSLIKHEKYLKTKLEELQKLRQLSNNKYYEYKKENKKNAAIKIQRMWRGHYTRKNIDKIKQMKSLSSLYEDKENNDIIDLSYIEGNSTQSLINDKVWLKKKFEDISNNMQKYRRESKMKKYLKENSPEDKKKALMEKLKDAQKIIDSYYENYFHFFQLKKKIYENKNALDVLSLNLNCKKLNELKPLPIIKQKIPSKEIKKEHQKLIDEVKIPWWKVLKNNYDLNQIDFDYINEVISSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.21
3 0.2
4 0.2
5 0.18
6 0.18
7 0.23
8 0.24
9 0.24
10 0.23
11 0.24
12 0.22
13 0.22
14 0.23
15 0.16
16 0.14
17 0.12
18 0.1
19 0.09
20 0.11
21 0.12
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.11
27 0.14
28 0.12
29 0.12
30 0.14
31 0.14
32 0.16
33 0.17
34 0.16
35 0.16
36 0.17
37 0.18
38 0.17
39 0.17
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.11
44 0.1
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.1
60 0.08
61 0.09
62 0.14
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.09
71 0.1
72 0.11
73 0.16
74 0.17
75 0.21
76 0.26
77 0.29
78 0.35
79 0.4
80 0.41
81 0.37
82 0.39
83 0.39
84 0.34
85 0.32
86 0.26
87 0.21
88 0.16
89 0.16
90 0.13
91 0.1
92 0.08
93 0.08
94 0.12
95 0.12
96 0.15
97 0.15
98 0.17
99 0.24
100 0.26
101 0.3
102 0.3
103 0.32
104 0.32
105 0.34
106 0.32
107 0.26
108 0.23
109 0.19
110 0.15
111 0.13
112 0.1
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.06
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.05
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.15
127 0.15
128 0.19
129 0.19
130 0.21
131 0.25
132 0.27
133 0.24
134 0.21
135 0.21
136 0.21
137 0.21
138 0.19
139 0.15
140 0.17
141 0.18
142 0.23
143 0.26
144 0.29
145 0.3
146 0.36
147 0.42
148 0.46
149 0.51
150 0.52
151 0.55
152 0.56
153 0.63
154 0.65
155 0.67
156 0.63
157 0.6
158 0.59
159 0.57
160 0.56
161 0.57
162 0.56
163 0.53
164 0.6
165 0.6
166 0.54
167 0.53
168 0.54
169 0.49
170 0.46
171 0.47
172 0.4
173 0.39
174 0.43
175 0.45
176 0.48
177 0.48
178 0.47
179 0.48
180 0.48
181 0.47
182 0.43
183 0.43
184 0.39
185 0.39
186 0.44
187 0.39
188 0.36
189 0.39
190 0.4
191 0.42
192 0.44
193 0.47
194 0.47
195 0.54
196 0.6
197 0.62
198 0.67
199 0.67
200 0.66
201 0.67
202 0.62
203 0.57
204 0.55
205 0.55
206 0.55
207 0.49
208 0.47
209 0.45
210 0.47
211 0.51
212 0.53
213 0.55
214 0.56
215 0.62
216 0.66
217 0.63
218 0.62
219 0.63
220 0.63
221 0.62
222 0.61
223 0.54
224 0.48
225 0.46
226 0.43
227 0.35
228 0.32
229 0.28
230 0.21
231 0.27
232 0.26
233 0.24
234 0.24
235 0.23
236 0.18
237 0.16
238 0.16
239 0.09
240 0.1
241 0.08
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.09
253 0.11
254 0.11
255 0.15
256 0.16
257 0.23
258 0.32
259 0.35
260 0.36
261 0.39
262 0.46
263 0.46
264 0.51
265 0.52
266 0.5
267 0.57
268 0.63
269 0.6
270 0.56
271 0.55
272 0.51
273 0.5
274 0.52
275 0.5
276 0.51
277 0.56
278 0.64
279 0.71
280 0.77
281 0.76
282 0.77
283 0.79
284 0.76
285 0.79
286 0.75
287 0.74
288 0.76
289 0.76
290 0.7
291 0.64
292 0.57
293 0.53
294 0.54
295 0.52
296 0.5
297 0.48
298 0.53
299 0.58
300 0.62
301 0.58
302 0.51
303 0.46
304 0.41
305 0.38
306 0.31
307 0.29
308 0.24
309 0.25
310 0.28
311 0.28
312 0.24
313 0.25
314 0.25
315 0.21
316 0.24
317 0.24
318 0.26
319 0.34
320 0.4
321 0.41
322 0.47
323 0.56
324 0.58
325 0.67
326 0.68
327 0.62
328 0.61
329 0.58
330 0.5
331 0.42
332 0.35
333 0.26
334 0.25
335 0.21
336 0.19
337 0.22
338 0.23
339 0.22
340 0.23
341 0.28
342 0.31
343 0.39
344 0.46
345 0.47
346 0.52
347 0.61
348 0.64
349 0.62
350 0.6
351 0.57
352 0.52
353 0.57
354 0.57
355 0.56
356 0.58
357 0.64
358 0.65
359 0.7
360 0.74
361 0.74
362 0.79
363 0.8
364 0.83
365 0.81
366 0.76
367 0.73
368 0.73
369 0.7
370 0.61
371 0.53
372 0.54
373 0.52
374 0.48
375 0.46
376 0.42
377 0.39
378 0.45
379 0.54
380 0.53
381 0.53
382 0.6
383 0.59
384 0.63
385 0.61
386 0.56
387 0.49
388 0.42
389 0.37
390 0.29
391 0.26
392 0.2
393 0.19
394 0.16