Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NE05

Protein Details
Accession A0A1Y3NE05    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-231LLKTGRLTKKEKQRIKREKIRQRQKQSKGNNSISKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
201-248RLTKKEKQRIKREKIRQRQKQSKGNNSISKGDKSKLKSSILSSRSGAK
252-252K
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08777  RRM_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MEVEFESVPLRILELFKFYLSDQEIKSVLASCPKTDWTLNGWLPVDTLFSFKRVKAITTDKNAILNVLVNQGSDFVEFTSDYQYLRRKSPFTPANIPQKNPLNCSLEVQAFEQYAQVSFVDFDYGNKFGYVKFKQSVAKELVNIVFRNGGITVRGMEEKLDFHPLEGDEEYVYWQLEKIKKEKNLYSQERTINPLLLKTGRLTKKEKQRIKREKIRQRQKQSKGNNSISKGDKSKLKSSILSSRSGAKDSFKRKIRMESIDEMFKSLSVVKKDGNEMKQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.16
4 0.18
5 0.17
6 0.21
7 0.23
8 0.27
9 0.23
10 0.26
11 0.26
12 0.25
13 0.26
14 0.22
15 0.2
16 0.23
17 0.24
18 0.21
19 0.23
20 0.25
21 0.27
22 0.26
23 0.27
24 0.24
25 0.31
26 0.31
27 0.32
28 0.31
29 0.28
30 0.27
31 0.24
32 0.22
33 0.14
34 0.16
35 0.13
36 0.15
37 0.17
38 0.17
39 0.23
40 0.22
41 0.23
42 0.26
43 0.35
44 0.39
45 0.44
46 0.49
47 0.44
48 0.45
49 0.43
50 0.37
51 0.28
52 0.22
53 0.15
54 0.14
55 0.13
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.1
68 0.1
69 0.14
70 0.2
71 0.22
72 0.27
73 0.3
74 0.3
75 0.31
76 0.41
77 0.43
78 0.43
79 0.48
80 0.5
81 0.57
82 0.58
83 0.57
84 0.53
85 0.56
86 0.52
87 0.47
88 0.45
89 0.39
90 0.35
91 0.37
92 0.33
93 0.26
94 0.25
95 0.23
96 0.19
97 0.14
98 0.14
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.07
104 0.05
105 0.06
106 0.05
107 0.06
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.16
117 0.17
118 0.19
119 0.19
120 0.22
121 0.26
122 0.27
123 0.31
124 0.28
125 0.27
126 0.23
127 0.24
128 0.23
129 0.21
130 0.2
131 0.16
132 0.12
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.09
147 0.13
148 0.12
149 0.11
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.13
154 0.13
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.06
161 0.06
162 0.11
163 0.16
164 0.19
165 0.24
166 0.31
167 0.36
168 0.42
169 0.46
170 0.51
171 0.57
172 0.61
173 0.61
174 0.6
175 0.59
176 0.55
177 0.55
178 0.47
179 0.4
180 0.33
181 0.27
182 0.24
183 0.2
184 0.2
185 0.17
186 0.25
187 0.27
188 0.31
189 0.37
190 0.42
191 0.52
192 0.62
193 0.69
194 0.7
195 0.77
196 0.83
197 0.87
198 0.9
199 0.9
200 0.9
201 0.92
202 0.93
203 0.93
204 0.93
205 0.93
206 0.92
207 0.9
208 0.9
209 0.89
210 0.88
211 0.87
212 0.83
213 0.76
214 0.74
215 0.68
216 0.64
217 0.57
218 0.52
219 0.49
220 0.48
221 0.51
222 0.5
223 0.5
224 0.47
225 0.5
226 0.55
227 0.51
228 0.49
229 0.43
230 0.44
231 0.42
232 0.41
233 0.36
234 0.34
235 0.4
236 0.45
237 0.53
238 0.53
239 0.58
240 0.61
241 0.69
242 0.7
243 0.69
244 0.67
245 0.65
246 0.62
247 0.62
248 0.58
249 0.49
250 0.42
251 0.33
252 0.28
253 0.24
254 0.25
255 0.22
256 0.25
257 0.27
258 0.3
259 0.39