Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NXA6

Protein Details
Accession A0A1Y3NXA6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
779-802YEEQEEKSRNKKRMDNRRYYRDWKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
IPR039762  Nmd2/UPF2  
IPR007193  Upf2/Nmd2_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF04050  Upf2  
Amino Acid Sequences MNAKRKELRALNEAAWDKRIDLSKEKLDSSIKKNTSFVKKLKVSLTSEKKNELLKDIKSLKLEKYIAEVVSAIAEAKLKNQADIAAAVEICSLLHQRFADFSPLLQDALLKQLAPGSYSSNNLTSEQKEKEDNARITRQKAVLPLFIELYLVNVFRDVSLNKDKDMLVYSVLRKLLAIDKNMHVNIPLAVIVMSNYGRELTGIIPQKQEEEKSEDNEKNEGEAKEEDASKKEPKKTEQEEEDVIQVPKEVQDKLRVHMLEYSKTVENQLNKAFENLKKMEKSNHENNIAHGKINEERKEKYQKFQKIFENYYSSAKILFKYVNRKIPEFKDEEEDSLGVSFKISLNDKKMDSFQSDIWEDEDSKVFYEQTIDLKLMIPAALLKGKKDKKSDKDDSKDSEKSSNENLDQNLTFTMSDPELDKILKEKSEKMEKNEDVVEAEPEDEPMTVEDKRGINLFALDSILDRLPYALNRDAIDQIAVDFCFVNNKSSMKKLIKTLLGVPRQRLDLLPYYSRLVATLNKCFPEIGDTTINELENEFHRLQKKGDQMFHEEKIKNIRFIEACIELDRLIMEDRKRNEPKVIYDGTSKNDADNDNDDADNDADNDNDNDDDDDDDDDDENDDDDENIIEGEDEDNEDEDNENNDDGKLVDGDDEDVIVYNQDDLKPTEEEEEEYKREFHQIMQESLDSRKNERKIQQFDIPIPMGIKKDLRDNNSDSQEDDSEEEKNNVEFVLLTKKGNKQQAKSLSVPNDCLFAVSARNQREIERKEQMKLKKLVLNYEEQEEKSRNKKRMDNRRYYRDWK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.43
3 0.38
4 0.32
5 0.32
6 0.36
7 0.33
8 0.35
9 0.4
10 0.46
11 0.49
12 0.49
13 0.49
14 0.5
15 0.53
16 0.53
17 0.56
18 0.53
19 0.52
20 0.55
21 0.59
22 0.62
23 0.63
24 0.62
25 0.62
26 0.63
27 0.66
28 0.67
29 0.65
30 0.62
31 0.64
32 0.68
33 0.66
34 0.65
35 0.64
36 0.62
37 0.61
38 0.57
39 0.54
40 0.5
41 0.43
42 0.49
43 0.49
44 0.5
45 0.49
46 0.51
47 0.46
48 0.48
49 0.47
50 0.38
51 0.39
52 0.39
53 0.34
54 0.3
55 0.27
56 0.18
57 0.17
58 0.17
59 0.11
60 0.07
61 0.09
62 0.09
63 0.11
64 0.18
65 0.18
66 0.19
67 0.19
68 0.2
69 0.19
70 0.2
71 0.19
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.12
76 0.1
77 0.08
78 0.09
79 0.1
80 0.08
81 0.12
82 0.12
83 0.13
84 0.16
85 0.17
86 0.22
87 0.2
88 0.2
89 0.21
90 0.21
91 0.21
92 0.18
93 0.17
94 0.12
95 0.17
96 0.17
97 0.12
98 0.11
99 0.14
100 0.14
101 0.15
102 0.15
103 0.15
104 0.16
105 0.19
106 0.21
107 0.21
108 0.23
109 0.24
110 0.27
111 0.25
112 0.3
113 0.3
114 0.31
115 0.32
116 0.33
117 0.39
118 0.45
119 0.47
120 0.47
121 0.54
122 0.56
123 0.56
124 0.59
125 0.53
126 0.46
127 0.47
128 0.44
129 0.38
130 0.35
131 0.33
132 0.28
133 0.25
134 0.23
135 0.16
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.11
144 0.1
145 0.15
146 0.24
147 0.25
148 0.25
149 0.28
150 0.27
151 0.26
152 0.29
153 0.23
154 0.17
155 0.21
156 0.22
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.19
161 0.2
162 0.25
163 0.24
164 0.26
165 0.26
166 0.28
167 0.33
168 0.34
169 0.32
170 0.24
171 0.21
172 0.18
173 0.15
174 0.13
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.06
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.06
188 0.13
189 0.19
190 0.21
191 0.22
192 0.22
193 0.26
194 0.27
195 0.28
196 0.25
197 0.27
198 0.28
199 0.31
200 0.38
201 0.38
202 0.37
203 0.38
204 0.34
205 0.29
206 0.32
207 0.28
208 0.23
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.23
213 0.22
214 0.2
215 0.24
216 0.29
217 0.35
218 0.4
219 0.42
220 0.46
221 0.55
222 0.59
223 0.64
224 0.61
225 0.59
226 0.55
227 0.5
228 0.46
229 0.39
230 0.32
231 0.23
232 0.18
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.23
239 0.24
240 0.26
241 0.32
242 0.29
243 0.28
244 0.32
245 0.33
246 0.26
247 0.26
248 0.28
249 0.23
250 0.23
251 0.25
252 0.22
253 0.23
254 0.24
255 0.27
256 0.25
257 0.24
258 0.27
259 0.29
260 0.27
261 0.31
262 0.3
263 0.32
264 0.32
265 0.34
266 0.38
267 0.41
268 0.46
269 0.48
270 0.52
271 0.53
272 0.51
273 0.51
274 0.53
275 0.46
276 0.39
277 0.3
278 0.25
279 0.24
280 0.31
281 0.34
282 0.29
283 0.31
284 0.38
285 0.49
286 0.48
287 0.52
288 0.55
289 0.58
290 0.59
291 0.64
292 0.64
293 0.61
294 0.62
295 0.57
296 0.53
297 0.45
298 0.44
299 0.38
300 0.3
301 0.25
302 0.23
303 0.19
304 0.16
305 0.17
306 0.19
307 0.28
308 0.34
309 0.38
310 0.4
311 0.42
312 0.45
313 0.46
314 0.47
315 0.41
316 0.36
317 0.35
318 0.34
319 0.32
320 0.28
321 0.24
322 0.18
323 0.15
324 0.14
325 0.07
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.08
330 0.11
331 0.13
332 0.17
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.23
337 0.22
338 0.22
339 0.21
340 0.18
341 0.19
342 0.19
343 0.18
344 0.17
345 0.15
346 0.14
347 0.13
348 0.13
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.09
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.07
364 0.05
365 0.04
366 0.05
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.18
371 0.23
372 0.29
373 0.37
374 0.44
375 0.49
376 0.59
377 0.68
378 0.68
379 0.69
380 0.7
381 0.67
382 0.65
383 0.59
384 0.51
385 0.46
386 0.38
387 0.34
388 0.31
389 0.3
390 0.25
391 0.24
392 0.23
393 0.2
394 0.19
395 0.17
396 0.15
397 0.12
398 0.1
399 0.08
400 0.09
401 0.07
402 0.07
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.1
410 0.13
411 0.14
412 0.17
413 0.22
414 0.32
415 0.35
416 0.37
417 0.45
418 0.43
419 0.43
420 0.4
421 0.35
422 0.26
423 0.23
424 0.19
425 0.1
426 0.1
427 0.08
428 0.07
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.11
437 0.11
438 0.11
439 0.12
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.07
445 0.07
446 0.06
447 0.06
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.11
456 0.12
457 0.13
458 0.14
459 0.15
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.1
464 0.08
465 0.08
466 0.07
467 0.06
468 0.05
469 0.05
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.12
474 0.14
475 0.16
476 0.18
477 0.26
478 0.26
479 0.28
480 0.31
481 0.35
482 0.35
483 0.35
484 0.39
485 0.4
486 0.43
487 0.42
488 0.4
489 0.37
490 0.36
491 0.34
492 0.28
493 0.23
494 0.22
495 0.24
496 0.23
497 0.23
498 0.24
499 0.23
500 0.23
501 0.19
502 0.15
503 0.17
504 0.19
505 0.24
506 0.25
507 0.25
508 0.26
509 0.25
510 0.24
511 0.22
512 0.19
513 0.17
514 0.17
515 0.17
516 0.19
517 0.21
518 0.21
519 0.16
520 0.15
521 0.13
522 0.11
523 0.16
524 0.14
525 0.17
526 0.2
527 0.22
528 0.24
529 0.29
530 0.36
531 0.37
532 0.41
533 0.4
534 0.45
535 0.49
536 0.5
537 0.52
538 0.44
539 0.4
540 0.46
541 0.44
542 0.4
543 0.35
544 0.36
545 0.29
546 0.3
547 0.31
548 0.23
549 0.22
550 0.2
551 0.2
552 0.15
553 0.15
554 0.13
555 0.1
556 0.1
557 0.13
558 0.14
559 0.2
560 0.23
561 0.33
562 0.38
563 0.39
564 0.44
565 0.44
566 0.46
567 0.47
568 0.46
569 0.38
570 0.4
571 0.41
572 0.37
573 0.38
574 0.33
575 0.26
576 0.27
577 0.26
578 0.23
579 0.23
580 0.23
581 0.2
582 0.2
583 0.19
584 0.17
585 0.17
586 0.14
587 0.12
588 0.1
589 0.08
590 0.09
591 0.09
592 0.08
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.08
599 0.09
600 0.08
601 0.09
602 0.09
603 0.08
604 0.09
605 0.08
606 0.08
607 0.07
608 0.07
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.06
613 0.05
614 0.05
615 0.05
616 0.05
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.07
623 0.07
624 0.07
625 0.08
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.1
632 0.1
633 0.1
634 0.08
635 0.07
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.08
640 0.08
641 0.07
642 0.07
643 0.07
644 0.06
645 0.06
646 0.06
647 0.08
648 0.09
649 0.11
650 0.12
651 0.15
652 0.16
653 0.16
654 0.19
655 0.18
656 0.19
657 0.22
658 0.26
659 0.25
660 0.26
661 0.26
662 0.23
663 0.26
664 0.25
665 0.23
666 0.27
667 0.29
668 0.3
669 0.32
670 0.33
671 0.3
672 0.33
673 0.37
674 0.29
675 0.31
676 0.37
677 0.4
678 0.47
679 0.53
680 0.6
681 0.61
682 0.66
683 0.68
684 0.65
685 0.62
686 0.61
687 0.53
688 0.44
689 0.38
690 0.34
691 0.28
692 0.26
693 0.26
694 0.21
695 0.29
696 0.35
697 0.38
698 0.42
699 0.47
700 0.52
701 0.54
702 0.53
703 0.45
704 0.42
705 0.38
706 0.34
707 0.3
708 0.23
709 0.2
710 0.21
711 0.21
712 0.18
713 0.17
714 0.16
715 0.14
716 0.13
717 0.1
718 0.11
719 0.18
720 0.19
721 0.21
722 0.26
723 0.34
724 0.41
725 0.51
726 0.56
727 0.52
728 0.6
729 0.67
730 0.68
731 0.66
732 0.66
733 0.65
734 0.61
735 0.61
736 0.51
737 0.44
738 0.37
739 0.33
740 0.26
741 0.18
742 0.19
743 0.22
744 0.29
745 0.3
746 0.35
747 0.35
748 0.39
749 0.48
750 0.49
751 0.51
752 0.54
753 0.54
754 0.57
755 0.64
756 0.67
757 0.67
758 0.68
759 0.66
760 0.62
761 0.61
762 0.63
763 0.58
764 0.58
765 0.51
766 0.51
767 0.48
768 0.44
769 0.47
770 0.42
771 0.46
772 0.48
773 0.54
774 0.56
775 0.6
776 0.68
777 0.73
778 0.8
779 0.84
780 0.85
781 0.86
782 0.89