Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NHI3

Protein Details
Accession A0A1Y3NHI3    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
85-108LISSNLIDKRKKKRNMIKIGHGGTHydrophilic
252-277DTDDKEDKNNKNKKQQQNNVNSNGKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-98KRKKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
IPR032819  TruB_C  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF16198  TruB_C_2  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02573  PseudoU_synth_EcTruB  
Amino Acid Sequences MSDSTPKSEILENKKESLTNNSDDVRNRNKIETVNELKTEEKISIKKYSGKILEQLNGVFCVNKPIGLSSSDVVTILKHKVTHQLISSNLIDKRKKKRNMIKIGHGGTLDPLASGCLVIGLFKGTKMLNTLLSGSKVYEAIGRFGCSTETYDCLGEKVEEKPYQHITKEKLEEVLKSFVGEIEQYPPIYSALKVNGKPMYEYAKTGEELPKEIKSRKITIHSIELLEFNNEPSKTIEIEVDNENEDFAFQMDTDDKEDKNNKNKKQQQNNVNSNGKKKFQFKNKAVANTKLPEGPIFRFKVECGGGTYIRSLIHDIGQKLDSAAHMVALIRSKQGPFKVEEALSIKDCDDLNTIKNAMKHV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.51
3 0.47
4 0.48
5 0.45
6 0.39
7 0.4
8 0.39
9 0.42
10 0.44
11 0.49
12 0.49
13 0.5
14 0.49
15 0.47
16 0.48
17 0.48
18 0.49
19 0.51
20 0.5
21 0.47
22 0.47
23 0.45
24 0.42
25 0.4
26 0.36
27 0.29
28 0.28
29 0.27
30 0.29
31 0.34
32 0.37
33 0.43
34 0.44
35 0.51
36 0.5
37 0.48
38 0.49
39 0.47
40 0.47
41 0.42
42 0.4
43 0.32
44 0.28
45 0.25
46 0.21
47 0.16
48 0.18
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.17
54 0.17
55 0.19
56 0.13
57 0.14
58 0.13
59 0.13
60 0.11
61 0.11
62 0.12
63 0.13
64 0.14
65 0.14
66 0.16
67 0.25
68 0.28
69 0.3
70 0.3
71 0.31
72 0.3
73 0.34
74 0.34
75 0.3
76 0.31
77 0.34
78 0.38
79 0.42
80 0.51
81 0.57
82 0.64
83 0.7
84 0.77
85 0.81
86 0.86
87 0.85
88 0.84
89 0.83
90 0.77
91 0.69
92 0.58
93 0.47
94 0.37
95 0.3
96 0.2
97 0.1
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.08
111 0.07
112 0.08
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.14
118 0.13
119 0.14
120 0.14
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.1
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.12
131 0.13
132 0.13
133 0.1
134 0.12
135 0.11
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.12
141 0.12
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.15
146 0.17
147 0.18
148 0.21
149 0.26
150 0.28
151 0.28
152 0.31
153 0.29
154 0.33
155 0.35
156 0.32
157 0.31
158 0.29
159 0.29
160 0.27
161 0.25
162 0.19
163 0.16
164 0.15
165 0.11
166 0.11
167 0.09
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.13
179 0.17
180 0.18
181 0.21
182 0.22
183 0.22
184 0.22
185 0.22
186 0.23
187 0.19
188 0.19
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.2
193 0.21
194 0.16
195 0.18
196 0.19
197 0.21
198 0.23
199 0.24
200 0.29
201 0.3
202 0.33
203 0.35
204 0.39
205 0.39
206 0.39
207 0.42
208 0.37
209 0.33
210 0.3
211 0.27
212 0.21
213 0.18
214 0.15
215 0.11
216 0.14
217 0.13
218 0.13
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.16
224 0.12
225 0.15
226 0.16
227 0.15
228 0.15
229 0.14
230 0.13
231 0.11
232 0.1
233 0.07
234 0.06
235 0.05
236 0.04
237 0.06
238 0.07
239 0.08
240 0.12
241 0.14
242 0.13
243 0.2
244 0.27
245 0.33
246 0.42
247 0.51
248 0.55
249 0.64
250 0.74
251 0.78
252 0.82
253 0.84
254 0.85
255 0.86
256 0.87
257 0.85
258 0.84
259 0.77
260 0.74
261 0.7
262 0.64
263 0.6
264 0.59
265 0.59
266 0.62
267 0.69
268 0.66
269 0.71
270 0.72
271 0.76
272 0.73
273 0.7
274 0.65
275 0.57
276 0.54
277 0.46
278 0.39
279 0.32
280 0.31
281 0.29
282 0.3
283 0.3
284 0.3
285 0.29
286 0.28
287 0.32
288 0.29
289 0.27
290 0.23
291 0.25
292 0.24
293 0.24
294 0.25
295 0.2
296 0.19
297 0.19
298 0.17
299 0.14
300 0.18
301 0.22
302 0.22
303 0.24
304 0.24
305 0.23
306 0.21
307 0.21
308 0.16
309 0.14
310 0.13
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.12
315 0.15
316 0.16
317 0.16
318 0.18
319 0.2
320 0.25
321 0.29
322 0.31
323 0.31
324 0.33
325 0.37
326 0.34
327 0.38
328 0.36
329 0.35
330 0.34
331 0.31
332 0.28
333 0.25
334 0.25
335 0.22
336 0.22
337 0.21
338 0.22
339 0.25
340 0.27
341 0.27