FuNGI

A0A1Y3NFM0

Protein Details

Accession

A0A1Y3NFM0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
42-61	SNKYHPYKSNSDKNQFQNPF	Hydrophilic
75-103	SSFLSKLPIHKNHSPKKNKSNSVNNIPYG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR007846 RRM_NUP35_dom
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0051028 P:mRNA transport
Pfam	View protein in Pfam PF05172 Nup35_RRM
PROSITE	View protein in PROSITE PS51472 RRM_NUP35

Amino Acid Sequences

MSHTAIPLPVAGGKVSFSDWPKNNQDNEHRVSNKEKIFSRISNKYHPYKSNSDKNQFQNPFSVEGINDKNNEYVSSFLSKLPIHKNHSPKKNKSNSVNNIPYGESYYKGADGKLLYDGPPHVTLDELSSSPEKQPFSSKLKTMSFLPNFNNQDNSLLNSSLNNNNSNNKVNSLFGSKIQSLNNNANNNSMFNPTPLNMNSNSLNSSPNRNNMLSTVTSNGINKNLNSVVIYGYPLYLENDILNHFKSYGEISSYESLNDNNWIIITYRNSYSTKNAMKNKNPFIFKNNIIGILAHYDYIKLMKSNQSNIPNNSTNSIFQNNKTLSTLNNTNNLNNNNTNNNINNNSIFSNKVNNLNSNNNNNNTNTNVINNNNMSVWNKNTMGNTSGSTTSPWRGNSFNNSPGRFSNSSEMNIDSDNRLNNVGSSPLKTPNVQNSSNLLFKKNSLLNSHESPNRNSHLSNGILNHSNSMNSNTSFHTTSSNLSLDHRLLNSNSNNNTINNNTNIEKFLFKNSFSPERNNTNNVASSGTNPKVSFAMDINKETTQDKPVFNKNNPFINLLNDEKKEKEKEERTSSFNKRTSLFHNSHHSSTSSVNSSSSLTIPKIGSNRISKPNTSSSNVKDNNSGILGKMVELVFGW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.12
2	0.13
3	0.17
4	0.19
5	0.28
6	0.32
7	0.39
8	0.48
9	0.54
10	0.57
11	0.61
12	0.66
13	0.65
14	0.67
15	0.69
16	0.63
17	0.59
18	0.62
19	0.61
20	0.57
21	0.56
22	0.53
23	0.5
24	0.54
25	0.57
26	0.6
27	0.61
28	0.61
29	0.64
30	0.68
31	0.71
32	0.73
33	0.72
34	0.71
35	0.71
36	0.75
37	0.75
38	0.78
39	0.77
40	0.77
41	0.77
42	0.81
43	0.75
44	0.68
45	0.64
46	0.56
47	0.51
48	0.44
49	0.38
50	0.28
51	0.29
52	0.33
53	0.29
54	0.29
55	0.26
56	0.26
57	0.26
58	0.26
59	0.21
60	0.17
61	0.17
62	0.19
63	0.19
64	0.19
65	0.22
66	0.22
67	0.28
68	0.36
69	0.41
70	0.44
71	0.51
72	0.61
73	0.67
74	0.76
75	0.8
76	0.81
77	0.84
78	0.87
79	0.88
80	0.87
81	0.88
82	0.86
83	0.86
84	0.83
85	0.74
86	0.66
87	0.57
88	0.48
89	0.43
90	0.35
91	0.25
92	0.2
93	0.19
94	0.2
95	0.2
96	0.19
97	0.17
98	0.16
99	0.16
100	0.17
101	0.17
102	0.15
103	0.16
104	0.17
105	0.18
106	0.19
107	0.18
108	0.15
109	0.14
110	0.14
111	0.14
112	0.15
113	0.12
114	0.13
115	0.14
116	0.16
117	0.18
118	0.22
119	0.21
120	0.2
121	0.27
122	0.31
123	0.37
124	0.41
125	0.41
126	0.45
127	0.46
128	0.47
129	0.45
130	0.48
131	0.44
132	0.44
133	0.44
134	0.45
135	0.47
136	0.46
137	0.44
138	0.34
139	0.34
140	0.29
141	0.29
142	0.22
143	0.19
144	0.18
145	0.16
146	0.19
147	0.22
148	0.23
149	0.23
150	0.24
151	0.27
152	0.31
153	0.35
154	0.32
155	0.3
156	0.28
157	0.26
158	0.26
159	0.26
160	0.23
161	0.2
162	0.24
163	0.23
164	0.25
165	0.26
166	0.28
167	0.28
168	0.35
169	0.39
170	0.38
171	0.37
172	0.36
173	0.35
174	0.33
175	0.29
176	0.25
177	0.19
178	0.16
179	0.17
180	0.14
181	0.18
182	0.17
183	0.18
184	0.16
185	0.18
186	0.19
187	0.19
188	0.2
189	0.17
190	0.2
191	0.18
192	0.25
193	0.25
194	0.29
195	0.32
196	0.3
197	0.3
198	0.28
199	0.3
200	0.24
201	0.22
202	0.19
203	0.16
204	0.16
205	0.17
206	0.17
207	0.17
208	0.17
209	0.16
210	0.17
211	0.16
212	0.15
213	0.15
214	0.14
215	0.12
216	0.1
217	0.11
218	0.08
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.07
227	0.09
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.09
232	0.09
233	0.09
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.12
239	0.14
240	0.14
241	0.14
242	0.13
243	0.12
244	0.11
245	0.12
246	0.09
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.09
252	0.1
253	0.11
254	0.12
255	0.15
256	0.17
257	0.18
258	0.21
259	0.26
260	0.31
261	0.36
262	0.43
263	0.48
264	0.54
265	0.61
266	0.66
267	0.64
268	0.61
269	0.55
270	0.52
271	0.49
272	0.44
273	0.41
274	0.33
275	0.28
276	0.24
277	0.23
278	0.18
279	0.15
280	0.13
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.07
285	0.07
286	0.07
287	0.05
288	0.07
289	0.13
290	0.15
291	0.19
292	0.25
293	0.32
294	0.36
295	0.38
296	0.42
297	0.39
298	0.38
299	0.35
300	0.3
301	0.24
302	0.21
303	0.24
304	0.19
305	0.17
306	0.24
307	0.22
308	0.22
309	0.22
310	0.2
311	0.16
312	0.19
313	0.25
314	0.2
315	0.25
316	0.25
317	0.26
318	0.3
319	0.31
320	0.29
321	0.25
322	0.25
323	0.22
324	0.23
325	0.23
326	0.2
327	0.21
328	0.2
329	0.19
330	0.17
331	0.17
332	0.16
333	0.15
334	0.16
335	0.13
336	0.16
337	0.16
338	0.22
339	0.22
340	0.24
341	0.27
342	0.33
343	0.36
344	0.39
345	0.41
346	0.37
347	0.38
348	0.36
349	0.33
350	0.28
351	0.25
352	0.19
353	0.17
354	0.18
355	0.16
356	0.19
357	0.17
358	0.17
359	0.15
360	0.15
361	0.15
362	0.14
363	0.15
364	0.15
365	0.16
366	0.17
367	0.17
368	0.18
369	0.18
370	0.17
371	0.16
372	0.15
373	0.15
374	0.13
375	0.14
376	0.14
377	0.15
378	0.17
379	0.18
380	0.18
381	0.19
382	0.21
383	0.28
384	0.3
385	0.36
386	0.39
387	0.39
388	0.38
389	0.37
390	0.42
391	0.35
392	0.33
393	0.3
394	0.26
395	0.27
396	0.26
397	0.26
398	0.2
399	0.19
400	0.18
401	0.15
402	0.14
403	0.14
404	0.13
405	0.13
406	0.12
407	0.12
408	0.12
409	0.14
410	0.13
411	0.14
412	0.16
413	0.2
414	0.21
415	0.22
416	0.25
417	0.3
418	0.35
419	0.34
420	0.33
421	0.33
422	0.35
423	0.38
424	0.36
425	0.29
426	0.24
427	0.24
428	0.28
429	0.28
430	0.28
431	0.26
432	0.29
433	0.32
434	0.34
435	0.38
436	0.38
437	0.38
438	0.37
439	0.39
440	0.39
441	0.36
442	0.32
443	0.3
444	0.3
445	0.28
446	0.28
447	0.24
448	0.24
449	0.26
450	0.26
451	0.25
452	0.2
453	0.19
454	0.17
455	0.19
456	0.19
457	0.16
458	0.18
459	0.18
460	0.21
461	0.21
462	0.21
463	0.2
464	0.18
465	0.19
466	0.21
467	0.2
468	0.18
469	0.19
470	0.21
471	0.19
472	0.21
473	0.2
474	0.19
475	0.19
476	0.25
477	0.27
478	0.31
479	0.32
480	0.33
481	0.34
482	0.33
483	0.35
484	0.31
485	0.31
486	0.27
487	0.28
488	0.26
489	0.25
490	0.26
491	0.24
492	0.24
493	0.21
494	0.27
495	0.26
496	0.26
497	0.29
498	0.34
499	0.41
500	0.41
501	0.47
502	0.46
503	0.51
504	0.55
505	0.53
506	0.5
507	0.45
508	0.44
509	0.38
510	0.34
511	0.26
512	0.25
513	0.29
514	0.28
515	0.28
516	0.26
517	0.26
518	0.24
519	0.24
520	0.23
521	0.18
522	0.24
523	0.23
524	0.26
525	0.28
526	0.27
527	0.28
528	0.27
529	0.27
530	0.26
531	0.28
532	0.3
533	0.34
534	0.43
535	0.5
536	0.55
537	0.63
538	0.61
539	0.65
540	0.62
541	0.6
542	0.51
543	0.47
544	0.47
545	0.43
546	0.44
547	0.38
548	0.39
549	0.39
550	0.44
551	0.44
552	0.44
553	0.48
554	0.51
555	0.58
556	0.64
557	0.66
558	0.65
559	0.7
560	0.74
561	0.73
562	0.7
563	0.64
564	0.56
565	0.56
566	0.56
567	0.56
568	0.51
569	0.48
570	0.53
571	0.54
572	0.54
573	0.52
574	0.46
575	0.39
576	0.38
577	0.36
578	0.3
579	0.26
580	0.24
581	0.23
582	0.24
583	0.23
584	0.22
585	0.21
586	0.18
587	0.21
588	0.21
589	0.25
590	0.28
591	0.31
592	0.36
593	0.4
594	0.46
595	0.52
596	0.56
597	0.54
598	0.56
599	0.61
600	0.59
601	0.57
602	0.57
603	0.53
604	0.59
605	0.61
606	0.57
607	0.52
608	0.48
609	0.46
610	0.41
611	0.36
612	0.26
613	0.25
614	0.23
615	0.18
616	0.21
617	0.17

A0A1Y3NFM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer