FuNGI

A0A1Y3NIC0

Protein Details

Accession

A0A1Y3NIC0

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-40	YDENRPNIRKVPKKSSDRLRVPKHSKKTKEQIEKTSVI	Hydrophilic
92-111	GYPLCSKKTQQLKGKYRLSS	Hydrophilic
464-492	EMNKAYQASNKKRRSNKKKGKKEDVFYSY	Hydrophilic
563-587	ITEMTKEEAKKKQKKKLVPNLSLFG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-31	RKVPKKSSDRLRVPKHSKKTK
473-485	NKKRRSNKKKGKK
572-578	KKKQKKK

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 12.833, cyto 4, cyto_mito 2.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039693 Rtr1/RPAP2 IPR007308 Rtr1/RPAP2_dom IPR038534 Rtr1/RPAP2_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0017018 F:myosin phosphatase activity GO:0043175 F:RNA polymerase core enzyme binding GO:0008420 F:RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity
Pfam	View protein in Pfam PF04181 RPAP2_Rtr1
PROSITE	View protein in PROSITE PS51479 ZF_RTR1

Amino Acid Sequences

MLYDENRPNIRKVPKKSSDRLRVPKHSKKTKEQIEKTSVIEKAKWELKIMELQEKMFETPVTIKYMKYIAKYFQPAHYEEVVLERKSLNICGYPLCSKKTQQLKGKYRLSSSKKKIFDITELKSYCGSDCMISSRYFASQLLDEPIYLRNLEKIKEVDVIPLGVNIEKWISRENEKLNTFTERSIDSYVKNMMKSLPNLNQNLVIHEHFDNNKNDSKSNELIIEKSSFQYDSIEGFQYKPQNSNQNYINKPSTIILDKELINSYTNSSLKANNKDDNTNKNSLKKNKSKEKIVSSVIMNKEDADKFNELYEQYSRKMKMEKELSDQHELNNSNKIEEIEADETEIDKDFKKLTIDKEITEKNEKLSEHDKIDFSEIKDEEIIDKFNDLNINKDNEIDISTNIIDNKKEEILSSNEEINKDNSKEKLTRKKSVGILKKSNSISKENLKVRFNDDPSVKIIENKEEMNKAYQASNKKRRSNKKKGKKEDVFYSYDVIEKSGVQKDVKETNVNETKKENNENEDNHNKNNDKELDNENENIEENDPEKKIKTLFEMNKDLEKIIKITEMTKEEAKKKQKKKLVPNLSLFGKIWTNISRMITNETRLYLNNKIDEDELNELLLVDDEVMNTRKDILITNIMKSYSSIKLEHEIVSPIEDELILLIKSFIVNESMVVLSSVEYWVLTVVFLKALTKRNKSLKEEIHEEKWNQMMEAVDIPSYQLNEFVNLFK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.78
3	0.84
4	0.87
5	0.87
6	0.89
7	0.9
8	0.89
9	0.9
10	0.91
11	0.91
12	0.91
13	0.91
14	0.89
15	0.89
16	0.9
17	0.89
18	0.9
19	0.89
20	0.87
21	0.85
22	0.79
23	0.72
24	0.68
25	0.61
26	0.53
27	0.47
28	0.4
29	0.39
30	0.42
31	0.39
32	0.36
33	0.33
34	0.33
35	0.38
36	0.39
37	0.39
38	0.35
39	0.34
40	0.34
41	0.34
42	0.32
43	0.26
44	0.22
45	0.17
46	0.2
47	0.22
48	0.26
49	0.25
50	0.24
51	0.25
52	0.32
53	0.33
54	0.32
55	0.34
56	0.31
57	0.39
58	0.46
59	0.46
60	0.46
61	0.47
62	0.44
63	0.45
64	0.43
65	0.36
66	0.29
67	0.33
68	0.32
69	0.28
70	0.27
71	0.22
72	0.23
73	0.24
74	0.26
75	0.21
76	0.18
77	0.19
78	0.2
79	0.24
80	0.29
81	0.31
82	0.33
83	0.35
84	0.35
85	0.43
86	0.5
87	0.55
88	0.58
89	0.65
90	0.71
91	0.77
92	0.82
93	0.78
94	0.74
95	0.75
96	0.74
97	0.74
98	0.74
99	0.73
100	0.69
101	0.68
102	0.68
103	0.61
104	0.62
105	0.59
106	0.54
107	0.54
108	0.51
109	0.49
110	0.44
111	0.41
112	0.32
113	0.25
114	0.21
115	0.12
116	0.13
117	0.16
118	0.17
119	0.17
120	0.18
121	0.17
122	0.18
123	0.18
124	0.17
125	0.16
126	0.14
127	0.15
128	0.18
129	0.17
130	0.16
131	0.15
132	0.17
133	0.16
134	0.15
135	0.14
136	0.15
137	0.18
138	0.19
139	0.22
140	0.22
141	0.22
142	0.26
143	0.26
144	0.23
145	0.21
146	0.21
147	0.17
148	0.16
149	0.15
150	0.11
151	0.11
152	0.08
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.13
157	0.16
158	0.19
159	0.26
160	0.3
161	0.37
162	0.38
163	0.39
164	0.37
165	0.4
166	0.37
167	0.32
168	0.29
169	0.22
170	0.23
171	0.25
172	0.24
173	0.19
174	0.21
175	0.26
176	0.26
177	0.25
178	0.23
179	0.24
180	0.26
181	0.29
182	0.32
183	0.32
184	0.36
185	0.38
186	0.38
187	0.39
188	0.35
189	0.34
190	0.3
191	0.24
192	0.2
193	0.2
194	0.22
195	0.2
196	0.26
197	0.26
198	0.27
199	0.33
200	0.31
201	0.32
202	0.3
203	0.34
204	0.3
205	0.29
206	0.29
207	0.24
208	0.23
209	0.24
210	0.24
211	0.19
212	0.18
213	0.17
214	0.13
215	0.13
216	0.14
217	0.12
218	0.12
219	0.13
220	0.15
221	0.14
222	0.15
223	0.18
224	0.22
225	0.23
226	0.24
227	0.27
228	0.34
229	0.36
230	0.4
231	0.43
232	0.46
233	0.47
234	0.48
235	0.46
236	0.37
237	0.36
238	0.31
239	0.28
240	0.22
241	0.21
242	0.17
243	0.18
244	0.18
245	0.19
246	0.19
247	0.17
248	0.15
249	0.14
250	0.14
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.16
255	0.21
256	0.26
257	0.33
258	0.36
259	0.36
260	0.38
261	0.43
262	0.47
263	0.49
264	0.49
265	0.48
266	0.47
267	0.49
268	0.55
269	0.58
270	0.63
271	0.64
272	0.68
273	0.71
274	0.75
275	0.76
276	0.75
277	0.73
278	0.69
279	0.63
280	0.56
281	0.47
282	0.47
283	0.4
284	0.34
285	0.27
286	0.21
287	0.22
288	0.2
289	0.2
290	0.17
291	0.16
292	0.15
293	0.16
294	0.17
295	0.13
296	0.15
297	0.17
298	0.16
299	0.17
300	0.21
301	0.22
302	0.22
303	0.27
304	0.26
305	0.31
306	0.36
307	0.37
308	0.38
309	0.45
310	0.46
311	0.47
312	0.45
313	0.37
314	0.36
315	0.34
316	0.29
317	0.28
318	0.25
319	0.2
320	0.2
321	0.2
322	0.14
323	0.13
324	0.15
325	0.11
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.1
330	0.09
331	0.1
332	0.07
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.11
338	0.13
339	0.16
340	0.24
341	0.25
342	0.25
343	0.29
344	0.31
345	0.32
346	0.34
347	0.31
348	0.24
349	0.26
350	0.25
351	0.24
352	0.26
353	0.26
354	0.24
355	0.25
356	0.24
357	0.21
358	0.24
359	0.22
360	0.19
361	0.21
362	0.19
363	0.17
364	0.17
365	0.16
366	0.14
367	0.13
368	0.13
369	0.08
370	0.08
371	0.08
372	0.09
373	0.12
374	0.11
375	0.13
376	0.15
377	0.18
378	0.17
379	0.18
380	0.17
381	0.13
382	0.15
383	0.12
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.09
388	0.1
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.1
396	0.12
397	0.14
398	0.17
399	0.17
400	0.19
401	0.19
402	0.2
403	0.21
404	0.21
405	0.21
406	0.2
407	0.21
408	0.2
409	0.23
410	0.28
411	0.36
412	0.44
413	0.48
414	0.54
415	0.54
416	0.58
417	0.61
418	0.64
419	0.65
420	0.62
421	0.63
422	0.58
423	0.61
424	0.57
425	0.54
426	0.48
427	0.43
428	0.39
429	0.38
430	0.44
431	0.43
432	0.47
433	0.46
434	0.44
435	0.46
436	0.48
437	0.43
438	0.4
439	0.35
440	0.31
441	0.31
442	0.33
443	0.28
444	0.25
445	0.24
446	0.22
447	0.23
448	0.22
449	0.22
450	0.21
451	0.22
452	0.21
453	0.21
454	0.18
455	0.19
456	0.23
457	0.3
458	0.38
459	0.48
460	0.54
461	0.61
462	0.7
463	0.78
464	0.85
465	0.87
466	0.88
467	0.88
468	0.91
469	0.93
470	0.94
471	0.91
472	0.87
473	0.85
474	0.79
475	0.72
476	0.62
477	0.53
478	0.42
479	0.36
480	0.29
481	0.2
482	0.15
483	0.11
484	0.14
485	0.17
486	0.19
487	0.17
488	0.19
489	0.23
490	0.28
491	0.3
492	0.3
493	0.27
494	0.33
495	0.41
496	0.41
497	0.38
498	0.36
499	0.39
500	0.4
501	0.47
502	0.4
503	0.38
504	0.43
505	0.45
506	0.5
507	0.53
508	0.51
509	0.46
510	0.5
511	0.46
512	0.41
513	0.45
514	0.41
515	0.33
516	0.35
517	0.37
518	0.36
519	0.37
520	0.37
521	0.3
522	0.26
523	0.25
524	0.22
525	0.17
526	0.13
527	0.11
528	0.14
529	0.15
530	0.15
531	0.16
532	0.17
533	0.19
534	0.19
535	0.24
536	0.3
537	0.35
538	0.41
539	0.47
540	0.47
541	0.49
542	0.48
543	0.43
544	0.35
545	0.29
546	0.23
547	0.17
548	0.18
549	0.15
550	0.16
551	0.21
552	0.21
553	0.23
554	0.28
555	0.33
556	0.37
557	0.45
558	0.54
559	0.59
560	0.66
561	0.73
562	0.76
563	0.8
564	0.85
565	0.87
566	0.87
567	0.86
568	0.82
569	0.79
570	0.72
571	0.65
572	0.54
573	0.45
574	0.36
575	0.27
576	0.25
577	0.21
578	0.2
579	0.21
580	0.23
581	0.22
582	0.22
583	0.28
584	0.28
585	0.28
586	0.28
587	0.27
588	0.26
589	0.26
590	0.29
591	0.3
592	0.32
593	0.32
594	0.31
595	0.31
596	0.31
597	0.3
598	0.28
599	0.25
600	0.21
601	0.17
602	0.16
603	0.14
604	0.13
605	0.12
606	0.09
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.08
611	0.1
612	0.1
613	0.1
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.14
618	0.16
619	0.24
620	0.26
621	0.28
622	0.3
623	0.29
624	0.28
625	0.28
626	0.28
627	0.23
628	0.25
629	0.23
630	0.23
631	0.28
632	0.3
633	0.31
634	0.28
635	0.25
636	0.22
637	0.22
638	0.2
639	0.15
640	0.13
641	0.11
642	0.09
643	0.07
644	0.09
645	0.07
646	0.07
647	0.07
648	0.07
649	0.07
650	0.08
651	0.08
652	0.08
653	0.08
654	0.08
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.1
659	0.09
660	0.08
661	0.08
662	0.08
663	0.07
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.06
669	0.06
670	0.07
671	0.08
672	0.08
673	0.11
674	0.15
675	0.24
676	0.33
677	0.39
678	0.47
679	0.56
680	0.65
681	0.7
682	0.75
683	0.75
684	0.74
685	0.76
686	0.74
687	0.71
688	0.7
689	0.63
690	0.58
691	0.53
692	0.46
693	0.38
694	0.33
695	0.27
696	0.22
697	0.24
698	0.2
699	0.16
700	0.15
701	0.16
702	0.16
703	0.16
704	0.14
705	0.14
706	0.14
707	0.16

A0A1Y3NIC0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer