Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NPD3

Protein Details
Accession A0A1Y3NPD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
409-433ENVGNKKRLVPKFVRKKRNIVSIKNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
419-425PKFVRKK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006638  Elp3/MiaA/NifB-like_rSAM  
IPR013848  Methylthiotransferase_N  
IPR006466  MiaB-like_B  
IPR007197  rSAM  
IPR023404  rSAM_horseshoe  
IPR002792  TRAM_dom  
Gene Ontology GO:0051539  F:4 iron, 4 sulfur cluster binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0035598  F:N6-threonylcarbomyladenosine methylthiotransferase activity  
GO:0061712  F:tRNA (N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))-methylthiotransferase  
Pfam View protein in Pfam  
PF04055  Radical_SAM  
PF01938  TRAM  
PF00919  UPF0004  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51449  MTTASE_N  
PS51918  RADICAL_SAM  
PS50926  TRAM  
Amino Acid Sequences MDIGHNDNVDIEDLHVEEVVNKREEVGVAEINSVVLNKDNVKNDNEKATDNKFSTQHFLPGNATIYIRSWGCSHNNSDSEYMAGLLRDRGYTIIFESAKKYDADLCCLNECTYCKTKAARGGLGSYPIEMIVERVKSILKQGVVEIWITSEDVGAYGIDIGVTIVDLLWEVVKAIEENHPYARLRVGMTNPPYILEHVEEMAKILSHPRVYSFIHIPVQSGSDSVLDAMKRKYTVNEFKKVVYALREGTKDIGGVTIATDIICGFPTETEEDFEKTMELMRECRFPITHISQFYPRPGTPAAKMTRVPTDIVKNRSRKITTFFESYETYGEEIIGTEQDILVTEVNSGSGDLYVGHNRFYNQVLVPRQKNLLGKMCRVKITKKGKYFLMGEVVEILKYEGFENEEIIEENVGNKKRLVPKFVRKKRNIVSIKNIEGEETQEDDTEAKTENKDDNTHITLEESLNNFHFPRTNVGDVCCGGNGETCDCHKNKDSNVTTLDQKTNRVLLNLDDDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.1
4 0.12
5 0.17
6 0.21
7 0.22
8 0.21
9 0.22
10 0.23
11 0.24
12 0.23
13 0.22
14 0.21
15 0.19
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.15
21 0.11
22 0.09
23 0.11
24 0.15
25 0.21
26 0.27
27 0.3
28 0.35
29 0.4
30 0.42
31 0.48
32 0.45
33 0.42
34 0.43
35 0.45
36 0.48
37 0.44
38 0.46
39 0.4
40 0.41
41 0.44
42 0.39
43 0.4
44 0.34
45 0.34
46 0.31
47 0.31
48 0.31
49 0.26
50 0.25
51 0.19
52 0.19
53 0.2
54 0.18
55 0.16
56 0.16
57 0.19
58 0.24
59 0.27
60 0.31
61 0.35
62 0.37
63 0.38
64 0.38
65 0.33
66 0.29
67 0.25
68 0.21
69 0.14
70 0.12
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.17
81 0.17
82 0.18
83 0.21
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.21
88 0.22
89 0.22
90 0.27
91 0.27
92 0.28
93 0.28
94 0.3
95 0.29
96 0.25
97 0.25
98 0.26
99 0.28
100 0.27
101 0.29
102 0.3
103 0.35
104 0.39
105 0.43
106 0.4
107 0.37
108 0.39
109 0.37
110 0.38
111 0.33
112 0.26
113 0.2
114 0.16
115 0.14
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.15
125 0.18
126 0.15
127 0.15
128 0.16
129 0.17
130 0.17
131 0.17
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.1
163 0.12
164 0.14
165 0.15
166 0.18
167 0.18
168 0.19
169 0.18
170 0.16
171 0.15
172 0.17
173 0.19
174 0.23
175 0.25
176 0.27
177 0.26
178 0.25
179 0.24
180 0.21
181 0.19
182 0.14
183 0.11
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.1
195 0.11
196 0.15
197 0.15
198 0.19
199 0.19
200 0.2
201 0.22
202 0.22
203 0.21
204 0.18
205 0.19
206 0.15
207 0.13
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.08
213 0.07
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.12
219 0.14
220 0.21
221 0.31
222 0.35
223 0.42
224 0.42
225 0.41
226 0.42
227 0.4
228 0.33
229 0.25
230 0.21
231 0.16
232 0.18
233 0.18
234 0.17
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.12
239 0.09
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.05
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.1
262 0.08
263 0.09
264 0.1
265 0.09
266 0.12
267 0.13
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.15
272 0.15
273 0.21
274 0.23
275 0.26
276 0.25
277 0.27
278 0.3
279 0.31
280 0.32
281 0.3
282 0.24
283 0.23
284 0.24
285 0.24
286 0.22
287 0.28
288 0.28
289 0.27
290 0.28
291 0.27
292 0.29
293 0.28
294 0.27
295 0.23
296 0.29
297 0.32
298 0.37
299 0.43
300 0.44
301 0.46
302 0.51
303 0.51
304 0.44
305 0.44
306 0.45
307 0.42
308 0.41
309 0.38
310 0.35
311 0.34
312 0.32
313 0.27
314 0.2
315 0.16
316 0.12
317 0.11
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.07
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.16
346 0.17
347 0.18
348 0.15
349 0.21
350 0.28
351 0.35
352 0.36
353 0.37
354 0.37
355 0.38
356 0.4
357 0.39
358 0.42
359 0.38
360 0.43
361 0.48
362 0.5
363 0.51
364 0.51
365 0.5
366 0.51
367 0.58
368 0.6
369 0.59
370 0.6
371 0.56
372 0.59
373 0.57
374 0.49
375 0.45
376 0.36
377 0.29
378 0.27
379 0.25
380 0.19
381 0.17
382 0.14
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.07
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.11
393 0.1
394 0.1
395 0.08
396 0.1
397 0.16
398 0.17
399 0.18
400 0.18
401 0.25
402 0.34
403 0.38
404 0.45
405 0.48
406 0.57
407 0.68
408 0.77
409 0.81
410 0.78
411 0.83
412 0.83
413 0.84
414 0.81
415 0.78
416 0.78
417 0.75
418 0.74
419 0.67
420 0.59
421 0.5
422 0.41
423 0.36
424 0.28
425 0.22
426 0.19
427 0.15
428 0.16
429 0.15
430 0.15
431 0.13
432 0.13
433 0.13
434 0.14
435 0.17
436 0.22
437 0.25
438 0.28
439 0.3
440 0.34
441 0.34
442 0.34
443 0.3
444 0.27
445 0.25
446 0.24
447 0.25
448 0.2
449 0.2
450 0.2
451 0.23
452 0.21
453 0.21
454 0.23
455 0.2
456 0.26
457 0.3
458 0.34
459 0.33
460 0.35
461 0.37
462 0.34
463 0.34
464 0.27
465 0.21
466 0.16
467 0.18
468 0.18
469 0.16
470 0.18
471 0.2
472 0.27
473 0.28
474 0.33
475 0.37
476 0.42
477 0.46
478 0.54
479 0.55
480 0.55
481 0.58
482 0.56
483 0.55
484 0.55
485 0.57
486 0.49
487 0.48
488 0.46
489 0.47
490 0.45
491 0.4
492 0.35
493 0.3