Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NDA2

Protein Details
Accession A0A1Y3NDA2    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-91AEEYYSGSKKKKKDKKINDSPKKDKGKKKEKDDDKSEKQNVNBasic
98-125DDEKEVKLSKRQQKKLNAKKKKGGMSLEHydrophilic
403-432KQEKEKPKSIIEKKNEQKEKEKAAREKAKKBasic
447-475AATSSNKKEKKPVSKKGGKNRIRRIQYDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-80SKKKKKDKKINDSPKKDKGKKKEK
106-120SKRQQKKLNAKKKKG
404-439QEKEKPKSIIEKKNEQKEKEKAAREKAKKEAAKASN
452-470NKKEKKPVSKKGGKNRIRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences NIIGNSVSTNLFINDFVSRRKLKSNSNHSSNANLEFDGRNSPFEYHKNQAEEYYSGSKKKKKDKKINDSPKKDKGKKKEKDDDKSEKQNVNDTDDTDDDEKEVKLSKRQQKKLNAKKKKGGMSLEEWDKEDRSYVTKGKNGRPLCPCQAAKHGLVANCLNCGKIVCKLEGPGPCPFCGEEVVDSEQQVRVYQQRQREKLREEKTILIKSSNSNNQEGSSSSGSKVNASSSSSSPLRPSQEQIDQQRSEKLAIKLEVQMEMEKREKSYEKALMMRERLLDFDKNSTERTKIYDTATDFDPNMTAANNKWLTPEERLRAIKKEQALREYEKNKKKNVRIAIDLKTKQVIELPADPFEYKDDEPATPSSKSKEQEEEEATGTGYYINPFIKEIPKYVKVNIYDKQKQEKEKPKSIIEKKNEQKEKEKAAREKAKKEAAKASNKDNQNTEAATSSNKKEKKPVSKKGGKNRIRRIQYDPEDDDMYGVDFAFSDDEEETEDAGICNTDNISRPKDTQLCCYVLLLYIKDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.18
3 0.21
4 0.28
5 0.31
6 0.34
7 0.43
8 0.47
9 0.52
10 0.61
11 0.68
12 0.71
13 0.74
14 0.77
15 0.69
16 0.69
17 0.63
18 0.57
19 0.47
20 0.37
21 0.33
22 0.28
23 0.27
24 0.29
25 0.26
26 0.23
27 0.24
28 0.26
29 0.28
30 0.33
31 0.38
32 0.37
33 0.42
34 0.44
35 0.43
36 0.44
37 0.42
38 0.37
39 0.36
40 0.38
41 0.35
42 0.38
43 0.45
44 0.49
45 0.54
46 0.64
47 0.69
48 0.71
49 0.79
50 0.84
51 0.88
52 0.92
53 0.95
54 0.95
55 0.96
56 0.94
57 0.92
58 0.92
59 0.9
60 0.88
61 0.88
62 0.88
63 0.87
64 0.89
65 0.9
66 0.89
67 0.9
68 0.9
69 0.9
70 0.88
71 0.88
72 0.85
73 0.79
74 0.7
75 0.68
76 0.61
77 0.57
78 0.5
79 0.41
80 0.36
81 0.32
82 0.34
83 0.27
84 0.24
85 0.18
86 0.18
87 0.17
88 0.14
89 0.2
90 0.18
91 0.25
92 0.35
93 0.44
94 0.53
95 0.62
96 0.69
97 0.74
98 0.83
99 0.86
100 0.88
101 0.89
102 0.88
103 0.88
104 0.87
105 0.85
106 0.8
107 0.74
108 0.69
109 0.64
110 0.62
111 0.59
112 0.52
113 0.45
114 0.4
115 0.35
116 0.3
117 0.26
118 0.19
119 0.17
120 0.2
121 0.25
122 0.28
123 0.32
124 0.39
125 0.44
126 0.52
127 0.5
128 0.53
129 0.53
130 0.55
131 0.57
132 0.58
133 0.53
134 0.47
135 0.53
136 0.49
137 0.44
138 0.42
139 0.39
140 0.31
141 0.33
142 0.32
143 0.25
144 0.24
145 0.23
146 0.18
147 0.15
148 0.15
149 0.13
150 0.16
151 0.18
152 0.16
153 0.17
154 0.18
155 0.23
156 0.26
157 0.27
158 0.27
159 0.27
160 0.26
161 0.26
162 0.25
163 0.21
164 0.19
165 0.17
166 0.12
167 0.13
168 0.16
169 0.16
170 0.16
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.12
176 0.14
177 0.19
178 0.23
179 0.31
180 0.39
181 0.46
182 0.53
183 0.59
184 0.6
185 0.65
186 0.66
187 0.64
188 0.58
189 0.57
190 0.56
191 0.54
192 0.48
193 0.4
194 0.36
195 0.32
196 0.35
197 0.36
198 0.31
199 0.28
200 0.28
201 0.27
202 0.26
203 0.24
204 0.21
205 0.17
206 0.15
207 0.15
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.12
214 0.13
215 0.15
216 0.13
217 0.17
218 0.17
219 0.18
220 0.18
221 0.21
222 0.23
223 0.22
224 0.23
225 0.23
226 0.28
227 0.33
228 0.37
229 0.41
230 0.38
231 0.38
232 0.39
233 0.35
234 0.31
235 0.31
236 0.27
237 0.23
238 0.23
239 0.23
240 0.23
241 0.23
242 0.21
243 0.16
244 0.16
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.16
251 0.17
252 0.17
253 0.22
254 0.24
255 0.24
256 0.27
257 0.3
258 0.31
259 0.31
260 0.31
261 0.26
262 0.22
263 0.21
264 0.2
265 0.18
266 0.15
267 0.16
268 0.17
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.18
273 0.17
274 0.2
275 0.2
276 0.2
277 0.21
278 0.23
279 0.23
280 0.24
281 0.25
282 0.22
283 0.19
284 0.16
285 0.15
286 0.11
287 0.1
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.13
292 0.14
293 0.13
294 0.14
295 0.16
296 0.18
297 0.23
298 0.28
299 0.24
300 0.29
301 0.33
302 0.34
303 0.37
304 0.37
305 0.36
306 0.36
307 0.4
308 0.37
309 0.39
310 0.41
311 0.42
312 0.47
313 0.5
314 0.55
315 0.57
316 0.59
317 0.63
318 0.67
319 0.69
320 0.69
321 0.7
322 0.66
323 0.64
324 0.65
325 0.64
326 0.65
327 0.59
328 0.52
329 0.46
330 0.4
331 0.33
332 0.29
333 0.23
334 0.17
335 0.21
336 0.22
337 0.2
338 0.22
339 0.21
340 0.19
341 0.18
342 0.19
343 0.14
344 0.15
345 0.16
346 0.15
347 0.18
348 0.2
349 0.22
350 0.2
351 0.21
352 0.22
353 0.26
354 0.28
355 0.29
356 0.34
357 0.33
358 0.38
359 0.4
360 0.38
361 0.34
362 0.32
363 0.28
364 0.21
365 0.18
366 0.12
367 0.09
368 0.07
369 0.08
370 0.09
371 0.09
372 0.1
373 0.12
374 0.17
375 0.18
376 0.22
377 0.26
378 0.33
379 0.34
380 0.37
381 0.4
382 0.39
383 0.43
384 0.45
385 0.48
386 0.49
387 0.53
388 0.6
389 0.6
390 0.64
391 0.69
392 0.73
393 0.73
394 0.75
395 0.75
396 0.73
397 0.77
398 0.79
399 0.79
400 0.75
401 0.77
402 0.76
403 0.81
404 0.81
405 0.75
406 0.74
407 0.72
408 0.76
409 0.74
410 0.74
411 0.72
412 0.74
413 0.8
414 0.79
415 0.78
416 0.76
417 0.77
418 0.71
419 0.69
420 0.68
421 0.67
422 0.69
423 0.65
424 0.65
425 0.63
426 0.65
427 0.64
428 0.57
429 0.51
430 0.44
431 0.41
432 0.34
433 0.27
434 0.23
435 0.24
436 0.25
437 0.27
438 0.33
439 0.37
440 0.38
441 0.46
442 0.55
443 0.62
444 0.68
445 0.74
446 0.76
447 0.82
448 0.89
449 0.91
450 0.92
451 0.89
452 0.89
453 0.89
454 0.88
455 0.86
456 0.81
457 0.78
458 0.78
459 0.77
460 0.75
461 0.67
462 0.61
463 0.55
464 0.5
465 0.43
466 0.32
467 0.25
468 0.16
469 0.13
470 0.08
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.08
476 0.07
477 0.08
478 0.1
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.11
483 0.09
484 0.09
485 0.1
486 0.07
487 0.08
488 0.08
489 0.1
490 0.16
491 0.21
492 0.26
493 0.3
494 0.33
495 0.41
496 0.49
497 0.49
498 0.51
499 0.52
500 0.5
501 0.47
502 0.45
503 0.37
504 0.33
505 0.33