FuNGI

A0A1Y3MZV2

Protein Details

Accession

A0A1Y3MZV2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
421-441	NIPNKKWNYFRKYYKSRMKSS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 12, cyto 7.5, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045867 DNA-dir_RpoC_beta_prime IPR000722 RNA_pol_asu IPR006592 RNA_pol_N IPR007066 RNA_pol_Rpb1_3 IPR044893 RNA_pol_Rpb1_clamp_domain
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF00623 RNA_pol_Rpb1_2 PF04983 RNA_pol_Rpb1_3

Amino Acid Sequences

MLLKFNLYNEEELEKHSVLISNKSELIDNTTSYILDPIMSCKQCKKYSECPGHLGRIKLKQRIVHSLFVNILCEEITHICPICKVYKISNDIKSICCSQKISATTFGLHKINYSNLNSHKNKSYRKMKSEYAFSFGKEWISINEMYNIIYNSDFSNDPNLKIKLLNIFIRNIPVLPINIRPSIVDSSNIVIHNNITSMYIRLLDLNSQYQNEMDNFNNSYALKIYNLFKKILGINSSTDVSENFDKAFIKQLLSGKTGIFRSMCLAKRQNFCLRSVIVPNIDTPLDRILIPKEFTDQLTPYGYKPNDFVIINRQPTLQTTSLLSVRSFPSTSRTIQINPLIASVFQADFDGDEMNIFWLPGKEAKKELLSNLNISNNIRSYKNSSLMIKFIQDTLTGLYNMTRDKNIADTYVVKRICNKLNIPNKKWNYFRKYYKSRMKSSDIPYSHLLSLLLPRTLTIKHKNKIIVDHGILLGVINGDNQTILFNSIINYGNEYYLKFMWDVQRMVHVYNLFHTITISVADCFPSDNMKNYSVSVLNNIPDDLSTLPISNLDTTIMNQNKPGNQSNIRENVFQNYYSLTKLVENLQSNLTNIVNSGSKGVIYTFKIGTSRNYINVLEYVIYGILAKGAC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.23
3	0.23
4	0.25
5	0.23
6	0.3
7	0.29
8	0.28
9	0.3
10	0.31
11	0.31
12	0.27
13	0.32
14	0.27
15	0.25
16	0.23
17	0.22
18	0.21
19	0.19
20	0.2
21	0.13
22	0.11
23	0.11
24	0.14
25	0.22
26	0.25
27	0.27
28	0.34
29	0.43
30	0.48
31	0.54
32	0.57
33	0.59
34	0.67
35	0.75
36	0.72
37	0.71
38	0.7
39	0.72
40	0.69
41	0.64
42	0.6
43	0.59
44	0.62
45	0.62
46	0.62
47	0.59
48	0.6
49	0.65
50	0.63
51	0.59
52	0.53
53	0.49
54	0.47
55	0.42
56	0.38
57	0.27
58	0.22
59	0.16
60	0.14
61	0.13
62	0.12
63	0.13
64	0.14
65	0.15
66	0.15
67	0.16
68	0.2
69	0.2
70	0.22
71	0.24
72	0.27
73	0.35
74	0.42
75	0.49
76	0.52
77	0.55
78	0.53
79	0.53
80	0.51
81	0.49
82	0.44
83	0.41
84	0.36
85	0.32
86	0.36
87	0.37
88	0.37
89	0.36
90	0.35
91	0.33
92	0.33
93	0.35
94	0.3
95	0.27
96	0.25
97	0.21
98	0.24
99	0.27
100	0.28
101	0.3
102	0.34
103	0.45
104	0.46
105	0.48
106	0.53
107	0.56
108	0.61
109	0.65
110	0.69
111	0.69
112	0.74
113	0.76
114	0.75
115	0.73
116	0.75
117	0.66
118	0.61
119	0.52
120	0.45
121	0.41
122	0.33
123	0.28
124	0.19
125	0.17
126	0.14
127	0.16
128	0.16
129	0.15
130	0.17
131	0.16
132	0.16
133	0.17
134	0.16
135	0.13
136	0.12
137	0.11
138	0.09
139	0.11
140	0.11
141	0.1
142	0.19
143	0.19
144	0.21
145	0.27
146	0.27
147	0.26
148	0.26
149	0.27
150	0.24
151	0.28
152	0.31
153	0.27
154	0.28
155	0.28
156	0.29
157	0.28
158	0.22
159	0.18
160	0.15
161	0.14
162	0.14
163	0.17
164	0.19
165	0.19
166	0.19
167	0.18
168	0.2
169	0.22
170	0.2
171	0.17
172	0.15
173	0.16
174	0.19
175	0.19
176	0.16
177	0.13
178	0.13
179	0.12
180	0.11
181	0.09
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.09
189	0.1
190	0.1
191	0.12
192	0.14
193	0.15
194	0.15
195	0.15
196	0.14
197	0.15
198	0.14
199	0.15
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.15
204	0.17
205	0.15
206	0.14
207	0.13
208	0.12
209	0.1
210	0.12
211	0.16
212	0.2
213	0.22
214	0.22
215	0.21
216	0.23
217	0.24
218	0.25
219	0.23
220	0.19
221	0.18
222	0.19
223	0.2
224	0.17
225	0.15
226	0.12
227	0.13
228	0.13
229	0.12
230	0.1
231	0.11
232	0.11
233	0.12
234	0.18
235	0.15
236	0.15
237	0.18
238	0.22
239	0.23
240	0.25
241	0.25
242	0.19
243	0.22
244	0.21
245	0.19
246	0.15
247	0.13
248	0.14
249	0.19
250	0.21
251	0.24
252	0.3
253	0.35
254	0.39
255	0.44
256	0.49
257	0.44
258	0.44
259	0.41
260	0.36
261	0.32
262	0.3
263	0.27
264	0.2
265	0.19
266	0.17
267	0.15
268	0.14
269	0.12
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.12
277	0.13
278	0.12
279	0.13
280	0.13
281	0.14
282	0.15
283	0.14
284	0.13
285	0.15
286	0.16
287	0.14
288	0.2
289	0.19
290	0.18
291	0.18
292	0.17
293	0.18
294	0.17
295	0.17
296	0.19
297	0.25
298	0.25
299	0.25
300	0.24
301	0.21
302	0.22
303	0.26
304	0.18
305	0.13
306	0.13
307	0.14
308	0.15
309	0.16
310	0.15
311	0.12
312	0.13
313	0.13
314	0.13
315	0.11
316	0.14
317	0.16
318	0.17
319	0.18
320	0.19
321	0.19
322	0.22
323	0.25
324	0.22
325	0.2
326	0.19
327	0.16
328	0.14
329	0.13
330	0.1
331	0.08
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.06
337	0.05
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.05
347	0.11
348	0.13
349	0.14
350	0.16
351	0.18
352	0.21
353	0.21
354	0.23
355	0.25
356	0.24
357	0.25
358	0.26
359	0.26
360	0.24
361	0.24
362	0.23
363	0.18
364	0.18
365	0.17
366	0.16
367	0.21
368	0.23
369	0.27
370	0.28
371	0.29
372	0.28
373	0.29
374	0.28
375	0.24
376	0.2
377	0.17
378	0.15
379	0.11
380	0.11
381	0.1
382	0.11
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.1
387	0.12
388	0.12
389	0.11
390	0.1
391	0.11
392	0.14
393	0.14
394	0.13
395	0.13
396	0.17
397	0.19
398	0.26
399	0.26
400	0.23
401	0.27
402	0.32
403	0.35
404	0.36
405	0.37
406	0.4
407	0.5
408	0.59
409	0.61
410	0.65
411	0.66
412	0.67
413	0.71
414	0.71
415	0.69
416	0.68
417	0.72
418	0.72
419	0.76
420	0.79
421	0.82
422	0.8
423	0.79
424	0.77
425	0.74
426	0.72
427	0.69
428	0.69
429	0.59
430	0.55
431	0.5
432	0.46
433	0.4
434	0.32
435	0.26
436	0.17
437	0.2
438	0.18
439	0.16
440	0.12
441	0.12
442	0.14
443	0.16
444	0.22
445	0.28
446	0.36
447	0.39
448	0.44
449	0.49
450	0.5
451	0.53
452	0.52
453	0.48
454	0.4
455	0.38
456	0.33
457	0.28
458	0.25
459	0.19
460	0.13
461	0.07
462	0.06
463	0.04
464	0.04
465	0.04
466	0.04
467	0.04
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.11
475	0.13
476	0.12
477	0.15
478	0.14
479	0.16
480	0.16
481	0.16
482	0.16
483	0.14
484	0.15
485	0.12
486	0.15
487	0.2
488	0.24
489	0.25
490	0.23
491	0.29
492	0.29
493	0.29
494	0.29
495	0.25
496	0.2
497	0.21
498	0.24
499	0.18
500	0.17
501	0.16
502	0.13
503	0.12
504	0.12
505	0.11
506	0.08
507	0.08
508	0.09
509	0.09
510	0.1
511	0.1
512	0.15
513	0.16
514	0.21
515	0.24
516	0.26
517	0.27
518	0.26
519	0.29
520	0.25
521	0.24
522	0.23
523	0.22
524	0.21
525	0.21
526	0.2
527	0.17
528	0.15
529	0.16
530	0.12
531	0.12
532	0.11
533	0.11
534	0.11
535	0.12
536	0.14
537	0.12
538	0.12
539	0.11
540	0.11
541	0.12
542	0.21
543	0.24
544	0.23
545	0.26
546	0.3
547	0.33
548	0.38
549	0.42
550	0.4
551	0.44
552	0.48
553	0.53
554	0.57
555	0.55
556	0.53
557	0.49
558	0.48
559	0.44
560	0.39
561	0.32
562	0.27
563	0.26
564	0.24
565	0.23
566	0.17
567	0.16
568	0.18
569	0.22
570	0.26
571	0.27
572	0.28
573	0.32
574	0.32
575	0.31
576	0.32
577	0.27
578	0.2
579	0.17
580	0.17
581	0.15
582	0.14
583	0.15
584	0.13
585	0.12
586	0.13
587	0.14
588	0.17
589	0.17
590	0.21
591	0.2
592	0.22
593	0.25
594	0.26
595	0.29
596	0.32
597	0.33
598	0.33
599	0.36
600	0.34
601	0.34
602	0.34
603	0.3
604	0.23
605	0.19
606	0.16
607	0.12
608	0.12
609	0.09
610	0.08

A0A1Y3MZV2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer