Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NYN0

Protein Details
Accession A0A1Y3NYN0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-36LDEQILKSKRENRNSFRRSNRSSRYSNKHydrophilic
173-205LGQGKGFKNRQNRRINNNRNSRKRDTREHLTKEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.833, cyto 5.5, cyto_pero 3.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025715  FoP_C  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13865  FoP_duplication  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12418  RRM_Aly_REF_like  
Amino Acid Sequences MTSKLDMSLDEQILKSKRENRNSFRRSNRSSRYSNKGINDQWKHDKYDDGYGGNERKQIFSRIGNRNNNGSYAISISNLHWEVSENDLKSLFEEVADVSKVRIKFDKAGRSEGQATVVFNSRSDAQKAIEKFDGVELDGMEMKIKMDDSYSRRNNNGNNNDSKRNRSSVFNRLGQGKGFKNRQNRRINNNRNSRKRDTREHLTKEMLDEEMDKYMSNEMDVEITETKDGNNEVISTVRNVISYDDEDEPVKGDINA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.38
4 0.46
5 0.54
6 0.64
7 0.67
8 0.75
9 0.81
10 0.84
11 0.85
12 0.85
13 0.83
14 0.83
15 0.83
16 0.8
17 0.81
18 0.79
19 0.77
20 0.75
21 0.74
22 0.68
23 0.67
24 0.66
25 0.67
26 0.65
27 0.63
28 0.65
29 0.62
30 0.62
31 0.55
32 0.53
33 0.45
34 0.48
35 0.44
36 0.35
37 0.33
38 0.34
39 0.37
40 0.33
41 0.34
42 0.26
43 0.26
44 0.27
45 0.29
46 0.27
47 0.31
48 0.39
49 0.45
50 0.54
51 0.59
52 0.59
53 0.62
54 0.58
55 0.52
56 0.44
57 0.34
58 0.26
59 0.2
60 0.18
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.15
65 0.15
66 0.14
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.17
71 0.21
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.17
76 0.16
77 0.16
78 0.11
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.15
91 0.22
92 0.28
93 0.36
94 0.35
95 0.4
96 0.39
97 0.4
98 0.39
99 0.33
100 0.29
101 0.22
102 0.2
103 0.15
104 0.17
105 0.14
106 0.12
107 0.13
108 0.12
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.12
113 0.16
114 0.17
115 0.18
116 0.17
117 0.16
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.09
122 0.09
123 0.06
124 0.06
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.11
135 0.15
136 0.25
137 0.31
138 0.33
139 0.35
140 0.39
141 0.43
142 0.48
143 0.52
144 0.48
145 0.51
146 0.53
147 0.6
148 0.59
149 0.59
150 0.53
151 0.49
152 0.45
153 0.44
154 0.45
155 0.46
156 0.49
157 0.47
158 0.46
159 0.45
160 0.44
161 0.39
162 0.39
163 0.34
164 0.36
165 0.39
166 0.42
167 0.5
168 0.58
169 0.66
170 0.71
171 0.74
172 0.76
173 0.81
174 0.86
175 0.85
176 0.87
177 0.88
178 0.87
179 0.87
180 0.86
181 0.85
182 0.82
183 0.82
184 0.8
185 0.8
186 0.8
187 0.79
188 0.75
189 0.68
190 0.62
191 0.54
192 0.47
193 0.36
194 0.26
195 0.21
196 0.17
197 0.15
198 0.14
199 0.12
200 0.11
201 0.13
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.13
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.15
227 0.16
228 0.18
229 0.19
230 0.21
231 0.21
232 0.22
233 0.22
234 0.22
235 0.22
236 0.18