Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

G8ZTX5

Protein Details
Accession G8ZTX5    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
116-137QLKKLRRSGKITNDSNKKRRADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-125RRSGK
130-137SNKKRRAD
141-148NPSKRIRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027141  LSm4/Sm_D1/D3  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0120114  C:Sm-like protein family complex  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG tdl:TDEL_0D04850  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
Amino Acid Sequences MKLVYFLKKLRNEQVTVELKNGTTVWGTLQTVSPQMNVTLTDVQLSLPRSTFNNAGSNALAGVYLADGQTSTNSAGGGMAKTTTSLQYINIRGNTIRQIILPDSLNLDALLVDEDQLKKLRRSGKITNDSNKKRRADFVSNPSKRIRRGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.56
3 0.49
4 0.45
5 0.37
6 0.31
7 0.31
8 0.27
9 0.19
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.13
14 0.13
15 0.13
16 0.14
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.11
25 0.13
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.11
31 0.13
32 0.15
33 0.13
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.16
38 0.17
39 0.17
40 0.19
41 0.19
42 0.2
43 0.19
44 0.18
45 0.15
46 0.13
47 0.1
48 0.05
49 0.04
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.08
74 0.13
75 0.15
76 0.18
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.19
81 0.2
82 0.17
83 0.15
84 0.12
85 0.14
86 0.14
87 0.16
88 0.15
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.1
94 0.09
95 0.07
96 0.06
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.08
101 0.08
102 0.1
103 0.15
104 0.18
105 0.19
106 0.25
107 0.32
108 0.37
109 0.45
110 0.52
111 0.58
112 0.66
113 0.72
114 0.76
115 0.79
116 0.82
117 0.83
118 0.82
119 0.76
120 0.69
121 0.69
122 0.68
123 0.67
124 0.66
125 0.68
126 0.71
127 0.7
128 0.7
129 0.71
130 0.68