Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NP50

Protein Details
Accession A0A1Y3NP50    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-100ASTIKLEIRKPKKREINNNNSNNQPHydrophilic
139-158EGDVKPKKRKDTSSKPPIYSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 14.333, cyto 9.5, cyto_mito 5.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021648  GLUE_dom  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR037855  Vps36  
IPR001876  Znf_RanBP2  
Gene Ontology GO:0000814  C:ESCRT II complex  
GO:0031902  C:late endosome membrane  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0032266  F:phosphatidylinositol-3-phosphate binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0043328  P:protein transport to vacuole involved in ubiquitin-dependent protein catabolic process via the multivesicular body sorting pathway  
Pfam View protein in Pfam  
PF11605  Vps36_ESCRT-II  
PF00641  zf-RanBP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51495  GLUE  
PS01358  ZF_RANBP2_1  
PS50199  ZF_RANBP2_2  
Amino Acid Sequences MDFDTFELTANNYPVLRNNEKIVSRQNNVTILTKGIVYLTNLRLLWLKSGPSNTKTIAVNLEDILSKEINSNILTASTIKLEIRKPKKREINNNNSNNQPNVALEDWECQICNQMNSGADTVCVLCGVPKIDDKSSVDEGDVKPKKRKDTSSKPPIYSRNSYSKNSYNHNDNLSSLSYTSNSSNKPLPVKPEKAQILQFECPACTYINEGNVDCCKVCMTRLDGIKPLPPPRTKPVVCSICLYSNEPNATVCSICAMPLKYCASKFNSESTNTATTTNNNDLFSFSNNYFDSSSPVHYPNLTETSNISVPNGYDLTNPYSNISMGDTSKESDDDDNISDISPITPSSSVASSYMSSLNNLKEDTVKIKLLFKSGLSAFYNELAATLKEEQWKITVVENKTPKTQRVGVAGVIRNIQENQKNTSELMNQAFQDLNNLMKKASEMVNPF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.31
3 0.34
4 0.33
5 0.37
6 0.42
7 0.44
8 0.48
9 0.52
10 0.51
11 0.5
12 0.52
13 0.52
14 0.49
15 0.49
16 0.47
17 0.38
18 0.32
19 0.29
20 0.23
21 0.19
22 0.16
23 0.15
24 0.14
25 0.2
26 0.19
27 0.24
28 0.23
29 0.24
30 0.27
31 0.26
32 0.28
33 0.24
34 0.24
35 0.23
36 0.31
37 0.36
38 0.35
39 0.38
40 0.36
41 0.38
42 0.37
43 0.35
44 0.32
45 0.28
46 0.26
47 0.23
48 0.22
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.16
68 0.21
69 0.31
70 0.41
71 0.5
72 0.54
73 0.63
74 0.72
75 0.78
76 0.83
77 0.84
78 0.85
79 0.85
80 0.88
81 0.82
82 0.78
83 0.71
84 0.61
85 0.51
86 0.4
87 0.3
88 0.26
89 0.22
90 0.18
91 0.15
92 0.16
93 0.16
94 0.16
95 0.15
96 0.11
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.14
101 0.15
102 0.16
103 0.17
104 0.19
105 0.14
106 0.12
107 0.12
108 0.11
109 0.08
110 0.07
111 0.05
112 0.05
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.12
117 0.16
118 0.17
119 0.21
120 0.22
121 0.26
122 0.27
123 0.26
124 0.23
125 0.24
126 0.24
127 0.31
128 0.35
129 0.34
130 0.39
131 0.43
132 0.51
133 0.53
134 0.62
135 0.62
136 0.67
137 0.75
138 0.79
139 0.81
140 0.76
141 0.76
142 0.73
143 0.7
144 0.64
145 0.58
146 0.57
147 0.55
148 0.54
149 0.53
150 0.53
151 0.5
152 0.5
153 0.49
154 0.45
155 0.44
156 0.44
157 0.39
158 0.33
159 0.31
160 0.26
161 0.22
162 0.16
163 0.13
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.15
169 0.17
170 0.2
171 0.22
172 0.26
173 0.26
174 0.32
175 0.36
176 0.4
177 0.4
178 0.45
179 0.45
180 0.44
181 0.45
182 0.41
183 0.38
184 0.34
185 0.34
186 0.26
187 0.23
188 0.2
189 0.18
190 0.14
191 0.09
192 0.12
193 0.11
194 0.14
195 0.15
196 0.14
197 0.15
198 0.15
199 0.16
200 0.12
201 0.11
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.12
207 0.16
208 0.18
209 0.2
210 0.21
211 0.22
212 0.25
213 0.26
214 0.27
215 0.28
216 0.28
217 0.31
218 0.34
219 0.43
220 0.4
221 0.4
222 0.45
223 0.43
224 0.41
225 0.39
226 0.36
227 0.31
228 0.32
229 0.31
230 0.23
231 0.22
232 0.22
233 0.2
234 0.18
235 0.14
236 0.14
237 0.11
238 0.09
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.13
246 0.16
247 0.17
248 0.18
249 0.21
250 0.23
251 0.26
252 0.28
253 0.28
254 0.29
255 0.29
256 0.29
257 0.3
258 0.28
259 0.24
260 0.25
261 0.21
262 0.19
263 0.22
264 0.25
265 0.23
266 0.21
267 0.21
268 0.2
269 0.21
270 0.21
271 0.2
272 0.15
273 0.17
274 0.17
275 0.18
276 0.18
277 0.17
278 0.18
279 0.16
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.18
284 0.17
285 0.18
286 0.18
287 0.21
288 0.19
289 0.17
290 0.16
291 0.19
292 0.21
293 0.2
294 0.17
295 0.13
296 0.13
297 0.15
298 0.15
299 0.11
300 0.1
301 0.12
302 0.17
303 0.18
304 0.19
305 0.17
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.15
310 0.12
311 0.11
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.13
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.07
330 0.08
331 0.08
332 0.09
333 0.1
334 0.11
335 0.11
336 0.11
337 0.13
338 0.11
339 0.13
340 0.15
341 0.14
342 0.15
343 0.17
344 0.18
345 0.19
346 0.19
347 0.18
348 0.17
349 0.2
350 0.22
351 0.23
352 0.24
353 0.24
354 0.3
355 0.31
356 0.32
357 0.31
358 0.27
359 0.29
360 0.27
361 0.31
362 0.26
363 0.26
364 0.23
365 0.23
366 0.23
367 0.17
368 0.16
369 0.12
370 0.11
371 0.13
372 0.14
373 0.16
374 0.21
375 0.22
376 0.22
377 0.22
378 0.25
379 0.23
380 0.27
381 0.31
382 0.29
383 0.38
384 0.44
385 0.46
386 0.52
387 0.55
388 0.53
389 0.52
390 0.55
391 0.51
392 0.5
393 0.49
394 0.45
395 0.48
396 0.48
397 0.43
398 0.39
399 0.34
400 0.3
401 0.3
402 0.33
403 0.31
404 0.31
405 0.35
406 0.37
407 0.38
408 0.36
409 0.39
410 0.35
411 0.34
412 0.35
413 0.33
414 0.3
415 0.3
416 0.3
417 0.25
418 0.26
419 0.22
420 0.24
421 0.24
422 0.25
423 0.23
424 0.22
425 0.23
426 0.23
427 0.26