Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3MSH9

Protein Details
Accession A0A1Y3MSH9    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
206-234RSNSIKKEWLKEKLKKLKQKQLKSSSSSQHydrophilic
340-360IFDIIPKKKNDKKQEKEDDNMHydrophilic
702-722DLYKTKKRTGKEKKKIKSIEEBasic
799-838IMNIKEKKLLHKLSRKRKLLKKRYKSSKDKKKNYLTNLVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-225KKEWLKEKLKKLKQK
705-718KTKKRTGKEKKKIK
803-830KEKKLLHKLSRKRKLLKKRYKSSKDKKK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR046360  T-box_DNA-bd  
IPR036960  T-box_sf  
IPR001699  TF_T-box  
IPR018186  TF_T-box_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
GO:0045893  P:positive regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00907  T-box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01264  TBOX_2  
PS50252  TBOX_3  
Amino Acid Sequences MTNMKMPYQSNLLLNKPSYIYDYSIPTSNEIFNSNMSHGNSNIFNEESASNSLYNSLNYNLKSKIFPDSSYNHNGSDNVLGKNISKTILDQDLMTLCNQNNYNVDDLPTKNFINNNFDNSYLLNMNLFNDNNLSWNDQLLLNTSKGMLLNNDKPSTSSILLDQVKDEKSPNSSQSFSSNKISDDDLSSIIKVNKYLEKKSPFNNGRSNSIKKEWLKEKLKKLKQKQLKSSSSSQSALTVGTFEKESPEKMSSISDPLLSLSSMSPTKNDLDYDHKGITSSHLSLGSLSTHNNSISKIFDIKNNSEGVLKERPRSLSHLGLKNTLKKNGIDDTNFYDNMDIFDIIPKKKNDKKQEKEDDNMNDESYSYNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNKDKNSNNNNNSSKNNNNNNNSNNNNNNNNNGSNNNNNHSNINNEMVLSSHIKNNEKLNSTLIKSSIENDPDVIYDNSSSYLIVLEDADLWKKFNSVVNEMIITKSGRCLFPILKFQPINLEPKVQYSFAIDILQASPYKYKYRDKKWISGGIKFFAPPTQKKEYYHPDSPQSGHFWMTHGISFSKIKLTNHIKSISENGMSTKKSAMLEEYKDSIDVDENETMARHKSTKFNVINSIARLPENHFYLSSFFMYEPCLYLIRHEDNKKYVSTIKFHETKFLAVTHYQNEKVNQLKKNYNPHAKGFKDDLYKTKKRTGKEKKKIKSIEEEEEGEEEEEEDKKSSHESIFIGKPSHDNDNYCLKSTMKEPTVEKNYNIPTSQKNNRINMSEKYCKENENETTSNHSIMNIKEKKLLHKLSRKRKLLKKRYKSSKDKKKNYLTNLVGNLMSDNYIQAKTENQNQNIVEGIDHSHYPMNELVIEKDKNVDVKNKNGIWFNNNNNNNNNNNNNNHEIVPTKPPSSIMVTSSNFSSLNPSTNHINSDFDYSSILFHGQDSLANTSLNYNNPPNHSLSLDNIKFDSLLKTPIPSISLFIDSNHTNSLINSSYKTINIINNNTDGVNNNQPYYQNFSNDDYQTNLNINDTFLLNKDNTFTLINDTKSDKGKIEDLSSFNSLLNMENYSSNNVDSFPKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.34
4 0.32
5 0.3
6 0.28
7 0.27
8 0.24
9 0.29
10 0.29
11 0.32
12 0.32
13 0.3
14 0.3
15 0.29
16 0.27
17 0.25
18 0.23
19 0.21
20 0.23
21 0.23
22 0.25
23 0.25
24 0.26
25 0.24
26 0.27
27 0.27
28 0.26
29 0.26
30 0.22
31 0.2
32 0.2
33 0.2
34 0.19
35 0.2
36 0.19
37 0.17
38 0.16
39 0.19
40 0.17
41 0.18
42 0.17
43 0.18
44 0.22
45 0.23
46 0.27
47 0.28
48 0.29
49 0.3
50 0.3
51 0.35
52 0.32
53 0.33
54 0.35
55 0.36
56 0.4
57 0.46
58 0.46
59 0.39
60 0.37
61 0.35
62 0.31
63 0.35
64 0.32
65 0.26
66 0.25
67 0.24
68 0.25
69 0.27
70 0.26
71 0.2
72 0.16
73 0.17
74 0.21
75 0.25
76 0.23
77 0.21
78 0.22
79 0.22
80 0.22
81 0.22
82 0.2
83 0.16
84 0.21
85 0.22
86 0.22
87 0.23
88 0.25
89 0.27
90 0.24
91 0.26
92 0.25
93 0.26
94 0.28
95 0.28
96 0.27
97 0.27
98 0.3
99 0.31
100 0.35
101 0.36
102 0.37
103 0.35
104 0.35
105 0.33
106 0.3
107 0.3
108 0.22
109 0.19
110 0.15
111 0.13
112 0.14
113 0.17
114 0.17
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.16
119 0.17
120 0.19
121 0.15
122 0.15
123 0.16
124 0.15
125 0.16
126 0.17
127 0.19
128 0.16
129 0.16
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.21
136 0.28
137 0.34
138 0.36
139 0.34
140 0.35
141 0.37
142 0.37
143 0.31
144 0.24
145 0.19
146 0.26
147 0.28
148 0.27
149 0.27
150 0.26
151 0.26
152 0.27
153 0.27
154 0.21
155 0.25
156 0.29
157 0.32
158 0.32
159 0.33
160 0.33
161 0.38
162 0.41
163 0.39
164 0.41
165 0.37
166 0.34
167 0.34
168 0.34
169 0.28
170 0.26
171 0.24
172 0.2
173 0.19
174 0.18
175 0.2
176 0.21
177 0.2
178 0.19
179 0.21
180 0.26
181 0.31
182 0.35
183 0.4
184 0.46
185 0.5
186 0.54
187 0.61
188 0.6
189 0.62
190 0.66
191 0.6
192 0.6
193 0.63
194 0.63
195 0.58
196 0.56
197 0.58
198 0.53
199 0.59
200 0.59
201 0.62
202 0.66
203 0.69
204 0.75
205 0.78
206 0.83
207 0.84
208 0.86
209 0.87
210 0.87
211 0.88
212 0.88
213 0.88
214 0.86
215 0.82
216 0.79
217 0.75
218 0.7
219 0.61
220 0.5
221 0.42
222 0.34
223 0.28
224 0.2
225 0.15
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.17
234 0.19
235 0.18
236 0.18
237 0.21
238 0.19
239 0.21
240 0.2
241 0.17
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.12
246 0.12
247 0.08
248 0.11
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.14
253 0.16
254 0.17
255 0.17
256 0.17
257 0.23
258 0.27
259 0.3
260 0.29
261 0.27
262 0.26
263 0.25
264 0.26
265 0.22
266 0.19
267 0.16
268 0.16
269 0.16
270 0.16
271 0.16
272 0.15
273 0.12
274 0.12
275 0.12
276 0.13
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.15
283 0.18
284 0.17
285 0.21
286 0.27
287 0.28
288 0.3
289 0.29
290 0.28
291 0.25
292 0.24
293 0.25
294 0.28
295 0.28
296 0.28
297 0.31
298 0.33
299 0.33
300 0.39
301 0.38
302 0.38
303 0.43
304 0.47
305 0.45
306 0.49
307 0.51
308 0.54
309 0.53
310 0.49
311 0.43
312 0.37
313 0.39
314 0.38
315 0.39
316 0.32
317 0.3
318 0.32
319 0.33
320 0.32
321 0.29
322 0.24
323 0.19
324 0.19
325 0.17
326 0.11
327 0.08
328 0.12
329 0.16
330 0.17
331 0.23
332 0.24
333 0.32
334 0.39
335 0.48
336 0.54
337 0.62
338 0.7
339 0.75
340 0.84
341 0.81
342 0.77
343 0.76
344 0.69
345 0.62
346 0.54
347 0.43
348 0.32
349 0.27
350 0.23
351 0.16
352 0.15
353 0.12
354 0.17
355 0.21
356 0.26
357 0.31
358 0.36
359 0.41
360 0.43
361 0.46
362 0.46
363 0.47
364 0.47
365 0.46
366 0.46
367 0.45
368 0.45
369 0.45
370 0.45
371 0.45
372 0.45
373 0.45
374 0.45
375 0.45
376 0.45
377 0.46
378 0.47
379 0.47
380 0.49
381 0.48
382 0.45
383 0.45
384 0.44
385 0.48
386 0.52
387 0.57
388 0.55
389 0.61
390 0.63
391 0.62
392 0.61
393 0.57
394 0.54
395 0.53
396 0.58
397 0.56
398 0.57
399 0.59
400 0.6
401 0.61
402 0.56
403 0.53
404 0.5
405 0.47
406 0.48
407 0.43
408 0.42
409 0.39
410 0.37
411 0.33
412 0.29
413 0.27
414 0.27
415 0.29
416 0.29
417 0.29
418 0.28
419 0.28
420 0.27
421 0.26
422 0.21
423 0.19
424 0.16
425 0.13
426 0.12
427 0.11
428 0.12
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.16
433 0.18
434 0.21
435 0.25
436 0.28
437 0.28
438 0.28
439 0.29
440 0.28
441 0.28
442 0.27
443 0.23
444 0.19
445 0.17
446 0.18
447 0.18
448 0.16
449 0.15
450 0.14
451 0.14
452 0.12
453 0.15
454 0.13
455 0.09
456 0.08
457 0.08
458 0.09
459 0.08
460 0.08
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.07
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.12
476 0.14
477 0.16
478 0.17
479 0.17
480 0.18
481 0.18
482 0.17
483 0.15
484 0.12
485 0.09
486 0.1
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.14
491 0.15
492 0.18
493 0.27
494 0.25
495 0.3
496 0.3
497 0.29
498 0.32
499 0.32
500 0.33
501 0.25
502 0.27
503 0.2
504 0.23
505 0.25
506 0.19
507 0.18
508 0.15
509 0.15
510 0.12
511 0.13
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.1
520 0.14
521 0.17
522 0.25
523 0.32
524 0.4
525 0.5
526 0.54
527 0.59
528 0.61
529 0.67
530 0.62
531 0.59
532 0.52
533 0.43
534 0.39
535 0.31
536 0.26
537 0.2
538 0.22
539 0.19
540 0.23
541 0.29
542 0.31
543 0.33
544 0.4
545 0.45
546 0.48
547 0.51
548 0.47
549 0.44
550 0.44
551 0.43
552 0.38
553 0.32
554 0.26
555 0.22
556 0.2
557 0.16
558 0.15
559 0.15
560 0.13
561 0.11
562 0.11
563 0.11
564 0.11
565 0.11
566 0.14
567 0.16
568 0.15
569 0.23
570 0.3
571 0.32
572 0.35
573 0.37
574 0.33
575 0.31
576 0.35
577 0.28
578 0.22
579 0.18
580 0.17
581 0.18
582 0.18
583 0.17
584 0.15
585 0.15
586 0.15
587 0.15
588 0.16
589 0.16
590 0.18
591 0.2
592 0.21
593 0.18
594 0.18
595 0.17
596 0.14
597 0.12
598 0.1
599 0.11
600 0.1
601 0.1
602 0.1
603 0.1
604 0.1
605 0.09
606 0.1
607 0.09
608 0.11
609 0.17
610 0.2
611 0.3
612 0.32
613 0.34
614 0.38
615 0.39
616 0.39
617 0.35
618 0.34
619 0.25
620 0.22
621 0.21
622 0.19
623 0.18
624 0.18
625 0.16
626 0.15
627 0.15
628 0.16
629 0.17
630 0.14
631 0.12
632 0.1
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.1
637 0.09
638 0.1
639 0.09
640 0.11
641 0.15
642 0.18
643 0.25
644 0.27
645 0.29
646 0.32
647 0.34
648 0.33
649 0.31
650 0.32
651 0.28
652 0.28
653 0.29
654 0.32
655 0.36
656 0.35
657 0.39
658 0.34
659 0.32
660 0.3
661 0.27
662 0.22
663 0.19
664 0.21
665 0.2
666 0.22
667 0.23
668 0.24
669 0.24
670 0.26
671 0.31
672 0.36
673 0.36
674 0.39
675 0.43
676 0.47
677 0.57
678 0.61
679 0.64
680 0.6
681 0.62
682 0.65
683 0.59
684 0.57
685 0.5
686 0.46
687 0.43
688 0.42
689 0.43
690 0.44
691 0.49
692 0.49
693 0.54
694 0.53
695 0.51
696 0.6
697 0.64
698 0.66
699 0.71
700 0.78
701 0.77
702 0.83
703 0.85
704 0.78
705 0.77
706 0.72
707 0.68
708 0.61
709 0.54
710 0.45
711 0.39
712 0.35
713 0.25
714 0.18
715 0.12
716 0.09
717 0.09
718 0.08
719 0.08
720 0.08
721 0.08
722 0.1
723 0.12
724 0.11
725 0.13
726 0.13
727 0.18
728 0.21
729 0.23
730 0.23
731 0.21
732 0.23
733 0.23
734 0.29
735 0.26
736 0.24
737 0.26
738 0.34
739 0.35
740 0.35
741 0.34
742 0.27
743 0.27
744 0.28
745 0.32
746 0.25
747 0.28
748 0.28
749 0.35
750 0.44
751 0.44
752 0.43
753 0.42
754 0.43
755 0.42
756 0.41
757 0.35
758 0.33
759 0.39
760 0.46
761 0.49
762 0.51
763 0.54
764 0.56
765 0.57
766 0.55
767 0.53
768 0.54
769 0.53
770 0.48
771 0.49
772 0.47
773 0.45
774 0.44
775 0.44
776 0.41
777 0.4
778 0.4
779 0.35
780 0.41
781 0.4
782 0.38
783 0.31
784 0.27
785 0.22
786 0.22
787 0.31
788 0.28
789 0.29
790 0.33
791 0.35
792 0.41
793 0.47
794 0.54
795 0.53
796 0.58
797 0.67
798 0.72
799 0.81
800 0.83
801 0.84
802 0.85
803 0.87
804 0.88
805 0.9
806 0.89
807 0.9
808 0.92
809 0.93
810 0.94
811 0.94
812 0.94
813 0.94
814 0.94
815 0.93
816 0.92
817 0.91
818 0.87
819 0.86
820 0.79
821 0.74
822 0.66
823 0.57
824 0.47
825 0.38
826 0.31
827 0.21
828 0.17
829 0.1
830 0.09
831 0.09
832 0.09
833 0.1
834 0.1
835 0.14
836 0.17
837 0.27
838 0.34
839 0.33
840 0.39
841 0.39
842 0.39
843 0.35
844 0.32
845 0.22
846 0.15
847 0.15
848 0.11
849 0.11
850 0.12
851 0.13
852 0.12
853 0.15
854 0.15
855 0.14
856 0.14
857 0.15
858 0.16
859 0.2
860 0.21
861 0.19
862 0.2
863 0.21
864 0.23
865 0.25
866 0.32
867 0.3
868 0.37
869 0.45
870 0.45
871 0.47
872 0.48
873 0.48
874 0.46
875 0.5
876 0.5
877 0.52
878 0.56
879 0.56
880 0.56
881 0.58
882 0.56
883 0.53
884 0.5
885 0.46
886 0.44
887 0.45
888 0.44
889 0.41
890 0.38
891 0.34
892 0.31
893 0.28
894 0.32
895 0.3
896 0.27
897 0.26
898 0.26
899 0.27
900 0.31
901 0.3
902 0.25
903 0.29
904 0.29
905 0.3
906 0.29
907 0.28
908 0.22
909 0.2
910 0.23
911 0.17
912 0.21
913 0.21
914 0.23
915 0.27
916 0.28
917 0.31
918 0.27
919 0.28
920 0.24
921 0.29
922 0.26
923 0.21
924 0.21
925 0.19
926 0.18
927 0.16
928 0.16
929 0.1
930 0.1
931 0.11
932 0.1
933 0.12
934 0.14
935 0.16
936 0.16
937 0.16
938 0.16
939 0.18
940 0.21
941 0.21
942 0.23
943 0.25
944 0.29
945 0.33
946 0.35
947 0.35
948 0.34
949 0.34
950 0.31
951 0.31
952 0.37
953 0.34
954 0.33
955 0.3
956 0.28
957 0.26
958 0.26
959 0.24
960 0.16
961 0.19
962 0.18
963 0.2
964 0.21
965 0.22
966 0.23
967 0.19
968 0.2
969 0.18
970 0.21
971 0.19
972 0.19
973 0.22
974 0.21
975 0.23
976 0.22
977 0.2
978 0.17
979 0.16
980 0.2
981 0.18
982 0.19
983 0.19
984 0.21
985 0.22
986 0.22
987 0.24
988 0.24
989 0.27
990 0.33
991 0.36
992 0.36
993 0.36
994 0.37
995 0.35
996 0.32
997 0.28
998 0.26
999 0.3
1000 0.28
1001 0.27
1002 0.28
1003 0.3
1004 0.32
1005 0.38
1006 0.36
1007 0.31
1008 0.33
1009 0.37
1010 0.42
1011 0.42
1012 0.41
1013 0.35
1014 0.34
1015 0.31
1016 0.3
1017 0.26
1018 0.22
1019 0.2
1020 0.19
1021 0.18
1022 0.16
1023 0.15
1024 0.14
1025 0.17
1026 0.15
1027 0.16
1028 0.17
1029 0.17
1030 0.18
1031 0.19
1032 0.18
1033 0.22
1034 0.27
1035 0.28
1036 0.29
1037 0.32
1038 0.34
1039 0.37
1040 0.4
1041 0.34
1042 0.33
1043 0.37
1044 0.37
1045 0.38
1046 0.4
1047 0.38
1048 0.4
1049 0.39
1050 0.36
1051 0.31
1052 0.28
1053 0.24
1054 0.2
1055 0.19
1056 0.16
1057 0.15
1058 0.17
1059 0.19
1060 0.22
1061 0.22
1062 0.21
1063 0.2
1064 0.19