Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NIF9

Protein Details
Accession A0A1Y3NIF9    Localization Confidence Low Confidence Score 8.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-424TTLHNLAFKCRRKKFCIETFNLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 12, mito 10.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008728  Elongator_complex_protein_4  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF05625  PAXNEB  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSKRPILLSNKPSTYNLSNSMLIQNNHEREINMFVSNLPSNITETRLAQEFSNTKYKHINICYNEFTNKPLGYAYVTFANEKAAKAAFNELNNKIEIDDRRLRLLLPLDIMRSGNNRMSNAAKVQGTHEKKNSISSTYTKYDGVLLHYFKKTSPIFAKLDNLKEKAASDPTIDEHYNNVRTQAKSVQPNTAKTLYNLNLVMFKDMVESGGVPMGSLTMVKKDNYTTYADLFGKYFISQGLVSNQDILVISADNKPENIVNNLMGVIEGKSATIIENESEEEDNNNDEQPKKKNSFCSIFDLTKTVDPEYLKSKQENISLINIKEWNQDENVYDKLYKEIENKLKSEKFRRLEHACDCVIRIDSFEGMANPLSKDIIQDFQGFFHVIKLPCINTLTSGIKMSETTLHNLAFKCRRKKFCIETFNLPPEMEETDQREGGSIIRSCSNGKSKLDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.49
3 0.46
4 0.41
5 0.38
6 0.37
7 0.41
8 0.4
9 0.36
10 0.38
11 0.41
12 0.39
13 0.4
14 0.4
15 0.34
16 0.3
17 0.35
18 0.31
19 0.23
20 0.2
21 0.19
22 0.22
23 0.23
24 0.21
25 0.17
26 0.15
27 0.18
28 0.18
29 0.21
30 0.18
31 0.19
32 0.22
33 0.23
34 0.23
35 0.2
36 0.26
37 0.26
38 0.29
39 0.37
40 0.34
41 0.34
42 0.41
43 0.45
44 0.46
45 0.5
46 0.54
47 0.5
48 0.56
49 0.59
50 0.55
51 0.54
52 0.46
53 0.42
54 0.39
55 0.33
56 0.27
57 0.22
58 0.2
59 0.19
60 0.2
61 0.2
62 0.19
63 0.2
64 0.2
65 0.2
66 0.24
67 0.22
68 0.21
69 0.21
70 0.16
71 0.16
72 0.16
73 0.23
74 0.22
75 0.24
76 0.31
77 0.31
78 0.32
79 0.32
80 0.31
81 0.24
82 0.27
83 0.24
84 0.26
85 0.31
86 0.31
87 0.33
88 0.34
89 0.33
90 0.32
91 0.32
92 0.26
93 0.22
94 0.22
95 0.2
96 0.21
97 0.21
98 0.18
99 0.18
100 0.19
101 0.2
102 0.21
103 0.21
104 0.22
105 0.25
106 0.26
107 0.25
108 0.26
109 0.22
110 0.2
111 0.24
112 0.31
113 0.34
114 0.38
115 0.4
116 0.39
117 0.39
118 0.45
119 0.43
120 0.36
121 0.34
122 0.32
123 0.35
124 0.34
125 0.35
126 0.28
127 0.26
128 0.26
129 0.23
130 0.24
131 0.22
132 0.22
133 0.24
134 0.25
135 0.25
136 0.23
137 0.29
138 0.25
139 0.27
140 0.28
141 0.3
142 0.31
143 0.32
144 0.39
145 0.36
146 0.43
147 0.41
148 0.39
149 0.33
150 0.32
151 0.31
152 0.27
153 0.25
154 0.19
155 0.15
156 0.15
157 0.16
158 0.19
159 0.18
160 0.16
161 0.16
162 0.19
163 0.21
164 0.2
165 0.22
166 0.23
167 0.23
168 0.25
169 0.29
170 0.3
171 0.34
172 0.36
173 0.41
174 0.4
175 0.41
176 0.43
177 0.41
178 0.36
179 0.3
180 0.34
181 0.27
182 0.26
183 0.24
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.13
189 0.12
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.06
205 0.08
206 0.08
207 0.09
208 0.1
209 0.12
210 0.14
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.18
215 0.18
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.12
220 0.11
221 0.1
222 0.06
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.09
227 0.1
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.05
236 0.06
237 0.08
238 0.09
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.1
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.1
247 0.1
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.06
264 0.08
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.11
273 0.13
274 0.17
275 0.23
276 0.3
277 0.33
278 0.37
279 0.43
280 0.49
281 0.53
282 0.52
283 0.53
284 0.5
285 0.47
286 0.44
287 0.38
288 0.32
289 0.29
290 0.27
291 0.2
292 0.18
293 0.17
294 0.18
295 0.22
296 0.26
297 0.26
298 0.26
299 0.3
300 0.31
301 0.34
302 0.34
303 0.31
304 0.33
305 0.35
306 0.34
307 0.32
308 0.3
309 0.27
310 0.29
311 0.28
312 0.23
313 0.2
314 0.21
315 0.19
316 0.2
317 0.21
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.17
322 0.17
323 0.19
324 0.2
325 0.28
326 0.35
327 0.38
328 0.4
329 0.46
330 0.5
331 0.54
332 0.58
333 0.59
334 0.57
335 0.59
336 0.66
337 0.63
338 0.65
339 0.63
340 0.6
341 0.52
342 0.46
343 0.41
344 0.35
345 0.31
346 0.24
347 0.2
348 0.15
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.12
353 0.11
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.15
364 0.18
365 0.18
366 0.18
367 0.2
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.21
372 0.18
373 0.21
374 0.23
375 0.23
376 0.24
377 0.26
378 0.23
379 0.19
380 0.24
381 0.23
382 0.22
383 0.23
384 0.21
385 0.2
386 0.2
387 0.19
388 0.2
389 0.2
390 0.22
391 0.24
392 0.25
393 0.28
394 0.29
395 0.35
396 0.39
397 0.46
398 0.52
399 0.59
400 0.66
401 0.7
402 0.79
403 0.81
404 0.82
405 0.83
406 0.8
407 0.79
408 0.79
409 0.77
410 0.69
411 0.58
412 0.48
413 0.4
414 0.37
415 0.3
416 0.26
417 0.26
418 0.28
419 0.29
420 0.28
421 0.27
422 0.23
423 0.23
424 0.26
425 0.22
426 0.21
427 0.23
428 0.25
429 0.26
430 0.33
431 0.39
432 0.39