Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3N3U1

Protein Details
Accession A0A1Y3N3U1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-64ELQSIKAKKRAKERERREQEQNARKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-55KAKKRAKERERR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034261  CNOT4_RRM  
IPR039780  Mot2  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0030014  C:CCR4-NOT complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0004842  F:ubiquitin-protein transferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF14570  zf-RING_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12438  RRM_CNOT4  
Amino Acid Sequences KICRFCWNHILEECNGLCPACRRPYSKETVEFTPIPQEELQSIKAKKRAKERERREQEQNARKHLSNVRVVQKNLVYVIGIPAKLATEETLRQYDYFGKYGKITKVVINKKTHNTPQGTSTNISIYITYAKKEDATKAIIAVDGTLCEGRTIKASYGTTKYCTNYLKGQQCQNPNCMYLHEPGEEADSYSKEKDETLNQGKHNIQKELTSAKASFPYKEVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.23
4 0.22
5 0.21
6 0.28
7 0.29
8 0.34
9 0.37
10 0.44
11 0.52
12 0.59
13 0.63
14 0.63
15 0.6
16 0.59
17 0.6
18 0.53
19 0.46
20 0.46
21 0.38
22 0.33
23 0.29
24 0.25
25 0.21
26 0.23
27 0.25
28 0.24
29 0.27
30 0.29
31 0.36
32 0.41
33 0.45
34 0.53
35 0.61
36 0.64
37 0.73
38 0.77
39 0.81
40 0.85
41 0.86
42 0.84
43 0.82
44 0.82
45 0.8
46 0.77
47 0.73
48 0.68
49 0.62
50 0.6
51 0.55
52 0.51
53 0.49
54 0.5
55 0.51
56 0.52
57 0.52
58 0.49
59 0.44
60 0.39
61 0.32
62 0.25
63 0.16
64 0.11
65 0.13
66 0.12
67 0.1
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.08
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.21
88 0.21
89 0.2
90 0.19
91 0.2
92 0.29
93 0.35
94 0.4
95 0.41
96 0.44
97 0.45
98 0.49
99 0.5
100 0.47
101 0.43
102 0.37
103 0.38
104 0.36
105 0.34
106 0.3
107 0.26
108 0.21
109 0.18
110 0.17
111 0.11
112 0.09
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.15
120 0.16
121 0.14
122 0.16
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.14
127 0.12
128 0.11
129 0.08
130 0.05
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.09
138 0.11
139 0.1
140 0.16
141 0.17
142 0.2
143 0.25
144 0.26
145 0.26
146 0.28
147 0.29
148 0.28
149 0.29
150 0.29
151 0.31
152 0.38
153 0.44
154 0.46
155 0.52
156 0.53
157 0.61
158 0.61
159 0.59
160 0.53
161 0.46
162 0.42
163 0.37
164 0.33
165 0.27
166 0.27
167 0.22
168 0.2
169 0.19
170 0.21
171 0.18
172 0.17
173 0.15
174 0.14
175 0.16
176 0.16
177 0.17
178 0.14
179 0.15
180 0.18
181 0.21
182 0.3
183 0.37
184 0.42
185 0.43
186 0.48
187 0.52
188 0.55
189 0.55
190 0.5
191 0.42
192 0.38
193 0.41
194 0.4
195 0.39
196 0.36
197 0.32
198 0.3
199 0.37
200 0.36
201 0.33