Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NBE6

Protein Details
Accession A0A1Y3NBE6    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31LHLFKNDKKEDKKERKKKGKKNLNDDERVIKBasic
399-437STRISERRKGEKKGIKKGEKKGIKKGEKRGKRKGVIEVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-21KKEDKKERKKKGKK
404-432ERRKGEKKGIKKGEKKGIKKGEKRGKRKG
510-520KDKKRKKRKTQ
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010106  RpnA  
Pfam View protein in Pfam  
PF12784  PDDEXK_2  
Amino Acid Sequences LHLFKNDKKEDKKERKKKGKKNLNDDERVIKIKPTLDIVFKRLFGYEINKEILVHFLNSILKYYGNFNFAISNVRFLDKELMVEDINEKFPRVDILVTQNTEEKVEELVNIEIQVSNKGNMYNRSEFYASRLMSHSVLKGQQYEDIPEIILINILDYNMFKDKIGYRYFPRNEVAFYKGKFYHSVNGKLFDEEMNVLKDKKGNKITLDTDKCNRKLSTIHFIELPKFKVNNKNDKNNNKDDDNNNEVNDENDKNDEKDEKDETDETDSNYEIDSNEENEENDNNDETDETDNNNENDENDENNNNENNNDENNNDENNNDENNNDENNNDENNNDNDINDESIKLWIKFLNNPNDQLFRNENTKNVFKKARSQLLLLQDDDNFKQEYNRRINSLIIENSTRISERRKGEKKGIKKGEKKGIKKGEKRGKRKGVIEVAFQCCEEKFDLPMIKKLTKLSEKEIKIIDKFLKESESDRDVDNLAKELKINSQYINEICNSLKRSYDDSDENGKDKKRKKRKTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.93
3 0.95
4 0.95
5 0.95
6 0.95
7 0.94
8 0.95
9 0.94
10 0.93
11 0.9
12 0.83
13 0.78
14 0.72
15 0.65
16 0.55
17 0.46
18 0.4
19 0.36
20 0.34
21 0.33
22 0.32
23 0.36
24 0.39
25 0.42
26 0.42
27 0.4
28 0.39
29 0.33
30 0.31
31 0.26
32 0.29
33 0.29
34 0.29
35 0.31
36 0.3
37 0.3
38 0.29
39 0.3
40 0.24
41 0.19
42 0.15
43 0.15
44 0.19
45 0.19
46 0.2
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.21
51 0.22
52 0.21
53 0.2
54 0.19
55 0.2
56 0.19
57 0.26
58 0.21
59 0.22
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.22
64 0.28
65 0.21
66 0.22
67 0.18
68 0.19
69 0.17
70 0.18
71 0.18
72 0.14
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.15
77 0.16
78 0.17
79 0.16
80 0.15
81 0.14
82 0.21
83 0.26
84 0.27
85 0.28
86 0.28
87 0.27
88 0.27
89 0.24
90 0.17
91 0.13
92 0.13
93 0.12
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.17
106 0.2
107 0.24
108 0.3
109 0.31
110 0.31
111 0.34
112 0.34
113 0.32
114 0.33
115 0.35
116 0.28
117 0.25
118 0.26
119 0.24
120 0.24
121 0.26
122 0.23
123 0.19
124 0.22
125 0.21
126 0.21
127 0.2
128 0.23
129 0.22
130 0.23
131 0.21
132 0.18
133 0.17
134 0.15
135 0.14
136 0.09
137 0.09
138 0.06
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.08
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.13
149 0.17
150 0.23
151 0.26
152 0.28
153 0.3
154 0.4
155 0.42
156 0.42
157 0.41
158 0.36
159 0.35
160 0.34
161 0.34
162 0.29
163 0.28
164 0.29
165 0.28
166 0.29
167 0.29
168 0.28
169 0.31
170 0.32
171 0.39
172 0.36
173 0.38
174 0.37
175 0.35
176 0.34
177 0.26
178 0.22
179 0.15
180 0.14
181 0.12
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.16
186 0.17
187 0.24
188 0.28
189 0.29
190 0.31
191 0.35
192 0.4
193 0.46
194 0.48
195 0.44
196 0.46
197 0.5
198 0.5
199 0.5
200 0.45
201 0.37
202 0.37
203 0.38
204 0.41
205 0.35
206 0.34
207 0.32
208 0.33
209 0.35
210 0.34
211 0.31
212 0.25
213 0.24
214 0.27
215 0.33
216 0.39
217 0.46
218 0.49
219 0.57
220 0.62
221 0.7
222 0.73
223 0.71
224 0.68
225 0.59
226 0.58
227 0.52
228 0.49
229 0.46
230 0.41
231 0.33
232 0.3
233 0.28
234 0.23
235 0.23
236 0.16
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.15
243 0.13
244 0.16
245 0.18
246 0.16
247 0.18
248 0.18
249 0.17
250 0.2
251 0.2
252 0.17
253 0.16
254 0.15
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.06
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.13
282 0.11
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.15
290 0.16
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.11
298 0.14
299 0.15
300 0.16
301 0.15
302 0.13
303 0.14
304 0.15
305 0.16
306 0.13
307 0.11
308 0.12
309 0.14
310 0.15
311 0.13
312 0.11
313 0.12
314 0.14
315 0.15
316 0.13
317 0.11
318 0.13
319 0.15
320 0.18
321 0.16
322 0.14
323 0.14
324 0.15
325 0.16
326 0.13
327 0.12
328 0.09
329 0.12
330 0.15
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.16
335 0.23
336 0.3
337 0.36
338 0.36
339 0.39
340 0.41
341 0.42
342 0.41
343 0.38
344 0.35
345 0.28
346 0.32
347 0.3
348 0.31
349 0.32
350 0.39
351 0.37
352 0.4
353 0.44
354 0.39
355 0.48
356 0.54
357 0.57
358 0.52
359 0.52
360 0.51
361 0.53
362 0.54
363 0.45
364 0.38
365 0.31
366 0.31
367 0.29
368 0.26
369 0.18
370 0.15
371 0.19
372 0.23
373 0.31
374 0.37
375 0.39
376 0.4
377 0.41
378 0.43
379 0.4
380 0.41
381 0.34
382 0.28
383 0.27
384 0.25
385 0.24
386 0.23
387 0.21
388 0.17
389 0.21
390 0.25
391 0.31
392 0.41
393 0.49
394 0.54
395 0.63
396 0.71
397 0.75
398 0.78
399 0.82
400 0.82
401 0.82
402 0.86
403 0.86
404 0.86
405 0.83
406 0.82
407 0.82
408 0.82
409 0.82
410 0.83
411 0.84
412 0.84
413 0.88
414 0.88
415 0.88
416 0.85
417 0.82
418 0.8
419 0.79
420 0.72
421 0.7
422 0.66
423 0.61
424 0.54
425 0.48
426 0.4
427 0.3
428 0.29
429 0.24
430 0.17
431 0.14
432 0.2
433 0.26
434 0.27
435 0.34
436 0.37
437 0.37
438 0.38
439 0.4
440 0.43
441 0.45
442 0.47
443 0.49
444 0.53
445 0.52
446 0.55
447 0.57
448 0.54
449 0.47
450 0.49
451 0.46
452 0.41
453 0.41
454 0.38
455 0.35
456 0.31
457 0.32
458 0.33
459 0.31
460 0.28
461 0.27
462 0.27
463 0.26
464 0.27
465 0.26
466 0.23
467 0.21
468 0.2
469 0.2
470 0.2
471 0.26
472 0.27
473 0.28
474 0.26
475 0.28
476 0.32
477 0.32
478 0.33
479 0.27
480 0.25
481 0.24
482 0.28
483 0.29
484 0.26
485 0.3
486 0.3
487 0.34
488 0.36
489 0.42
490 0.4
491 0.41
492 0.49
493 0.49
494 0.49
495 0.5
496 0.53
497 0.55
498 0.6
499 0.65
500 0.67