Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1Y3MSM2

Protein Details
Accession A0A1Y3MSM2   
Localization Confidence Low
Confidence Score 8.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
203-222KNVSRNRKNNNYNYNNKNKKHydrophilic
261-288HNNNKNHVNNKYNKNKDKKGNNYLNSNYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 8, mito 8, cyto 8, cyto_nucl 8, cyto_mito 8, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
Pfam View protein in Pfam  
PF14223  Retrotran_gag_2  
Amino Acid Sequences MSKINNINSDKILSGSDNYFLWYDYITWYLRKEGLIEYIIKDKIKDIDIDNTDNKVEIKNVMKNGEARTIIVDSITSQIHNEIAGINSAFDIMEALKVKYGESNDYSYWTSKLNKLHTDKESEIMTILNQMKDIFFYMNKYQLNMSEDEKIKCIYDSLLRDYLRKYVLEKGETFESLYEKINNDISKINDPMEIDYVKKNISKNVSRNRKNNNYNYNNKNKKYCDICKMNNHNTDECWYNIKNRNFKNSHNNNNSYNKNNHNNNKNHVNNKYNKNKDKKGNNYLNSNYKRSNFVGNISKHNINDYYNANIGFNEIKAMYFDNNDKNKYVNENKNFNKYNIKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.19
4 0.17
5 0.18
6 0.17
7 0.16
8 0.14
9 0.12
10 0.11
11 0.11
12 0.15
13 0.15
14 0.16
15 0.17
16 0.2
17 0.21
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.23
22 0.23
23 0.24
24 0.22
25 0.26
26 0.29
27 0.27
28 0.26
29 0.24
30 0.25
31 0.25
32 0.26
33 0.23
34 0.29
35 0.32
36 0.37
37 0.37
38 0.35
39 0.33
40 0.31
41 0.29
42 0.21
43 0.18
44 0.18
45 0.22
46 0.26
47 0.29
48 0.3
49 0.32
50 0.35
51 0.36
52 0.37
53 0.32
54 0.27
55 0.25
56 0.24
57 0.22
58 0.18
59 0.15
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.09
64 0.08
65 0.09
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.06
77 0.05
78 0.05
79 0.04
80 0.07
81 0.08
82 0.09
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.2
91 0.19
92 0.22
93 0.23
94 0.22
95 0.21
96 0.2
97 0.21
98 0.22
99 0.27
100 0.3
101 0.37
102 0.4
103 0.46
104 0.46
105 0.5
106 0.46
107 0.42
108 0.38
109 0.29
110 0.25
111 0.18
112 0.15
113 0.15
114 0.16
115 0.13
116 0.13
117 0.13
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.09
122 0.07
123 0.11
124 0.13
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.18
129 0.2
130 0.22
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.23
135 0.23
136 0.23
137 0.21
138 0.19
139 0.17
140 0.16
141 0.11
142 0.13
143 0.15
144 0.18
145 0.23
146 0.23
147 0.24
148 0.24
149 0.26
150 0.23
151 0.21
152 0.18
153 0.19
154 0.22
155 0.24
156 0.23
157 0.22
158 0.22
159 0.22
160 0.2
161 0.14
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.11
168 0.14
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.17
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.16
180 0.14
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.15
187 0.18
188 0.24
189 0.3
190 0.38
191 0.48
192 0.57
193 0.62
194 0.69
195 0.74
196 0.77
197 0.79
198 0.79
199 0.79
200 0.77
201 0.78
202 0.79
203 0.8
204 0.79
205 0.74
206 0.72
207 0.65
208 0.63
209 0.63
210 0.61
211 0.6
212 0.6
213 0.63
214 0.66
215 0.72
216 0.74
217 0.72
218 0.69
219 0.6
220 0.53
221 0.49
222 0.4
223 0.32
224 0.29
225 0.23
226 0.27
227 0.35
228 0.41
229 0.47
230 0.49
231 0.58
232 0.57
233 0.62
234 0.65
235 0.66
236 0.7
237 0.7
238 0.71
239 0.68
240 0.72
241 0.7
242 0.65
243 0.61
244 0.58
245 0.59
246 0.64
247 0.66
248 0.67
249 0.69
250 0.7
251 0.74
252 0.73
253 0.71
254 0.7
255 0.7
256 0.69
257 0.73
258 0.77
259 0.77
260 0.79
261 0.81
262 0.83
263 0.84
264 0.85
265 0.86
266 0.86
267 0.86
268 0.82
269 0.8
270 0.78
271 0.79
272 0.73
273 0.69
274 0.63
275 0.55
276 0.54
277 0.48
278 0.5
279 0.41
280 0.42
281 0.46
282 0.44
283 0.49
284 0.5
285 0.52
286 0.44
287 0.46
288 0.41
289 0.34
290 0.35
291 0.3
292 0.29
293 0.28
294 0.28
295 0.24
296 0.21
297 0.22
298 0.19
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.11
303 0.12
304 0.14
305 0.14
306 0.16
307 0.22
308 0.29
309 0.36
310 0.38
311 0.38
312 0.39
313 0.4
314 0.46
315 0.51
316 0.52
317 0.54
318 0.62
319 0.67
320 0.75
321 0.76
322 0.7