FuNGI

A0A1Y3MP08

Protein Details

Accession

A0A1Y3MP08

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
466-491	VARNRNETKEEKKARKEMVKNAKKVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
472-489	ETKEEKKARKEMVKNAKK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MFQHLSYYIGRKYKLRPEDDEIGYVEDFPENEVNYDYESVDEEFSENDIFDVSTDEEGNEKEELTDAKGNVLKREAGVAALYGIDFDDTKYDYMQHLKVIGEDPTAVFIPSKEEEKKEAKNKKGIKFLDESIDLDEKPNQKKRVTFQLPEEALPSKYEEEVGLMNREDSDILTANPYVREVLYSLDDPTTIDEDMEDDFVLQLNAEPGSDEEEFDMEKAMYGGYDEESDDDDEWAAVRKFKKEQKNEKKEEYYDDDDDEFEDRRTALTGFSMSSSAMFRNKHLTLLDDRFERVINQYDDDNIGELDPEAPNVRGNIDDTALPEHYDKLFDEFLDSKDVLGKKVIEKFAGGVPEDQVAELREELKTEGFDILKYEEEESKKKEKVQMIERELSKNEKRERNNWDCETIITTYTNIYNHPKVIRDNTIKKIHVTRKGLPIVEKEIQEDDEEEYEEEEEEEEVRVNKGVARNRNETKEEKKARKEMVKNAKKVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.6
3	0.6
4	0.63
5	0.69
6	0.66
7	0.61
8	0.52
9	0.45
10	0.39
11	0.32
12	0.25
13	0.17
14	0.14
15	0.14
16	0.16
17	0.13
18	0.14
19	0.15
20	0.15
21	0.16
22	0.17
23	0.15
24	0.12
25	0.14
26	0.14
27	0.13
28	0.13
29	0.11
30	0.1
31	0.12
32	0.11
33	0.09
34	0.08
35	0.08
36	0.08
37	0.07
38	0.09
39	0.09
40	0.1
41	0.1
42	0.11
43	0.11
44	0.12
45	0.14
46	0.12
47	0.11
48	0.1
49	0.11
50	0.12
51	0.15
52	0.19
53	0.17
54	0.22
55	0.25
56	0.26
57	0.27
58	0.29
59	0.26
60	0.21
61	0.24
62	0.19
63	0.17
64	0.16
65	0.13
66	0.1
67	0.09
68	0.09
69	0.06
70	0.06
71	0.05
72	0.05
73	0.05
74	0.07
75	0.08
76	0.09
77	0.09
78	0.11
79	0.13
80	0.18
81	0.19
82	0.19
83	0.2
84	0.19
85	0.2
86	0.21
87	0.19
88	0.15
89	0.14
90	0.13
91	0.13
92	0.13
93	0.11
94	0.1
95	0.09
96	0.12
97	0.14
98	0.19
99	0.2
100	0.22
101	0.28
102	0.34
103	0.43
104	0.49
105	0.57
106	0.58
107	0.64
108	0.71
109	0.72
110	0.75
111	0.68
112	0.63
113	0.58
114	0.53
115	0.49
116	0.42
117	0.35
118	0.29
119	0.29
120	0.24
121	0.21
122	0.24
123	0.25
124	0.32
125	0.39
126	0.4
127	0.42
128	0.47
129	0.51
130	0.58
131	0.59
132	0.55
133	0.53
134	0.57
135	0.55
136	0.5
137	0.47
138	0.37
139	0.3
140	0.27
141	0.23
142	0.14
143	0.13
144	0.13
145	0.11
146	0.1
147	0.11
148	0.12
149	0.12
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.08
156	0.08
157	0.07
158	0.07
159	0.08
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.1
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.07
168	0.08
169	0.09
170	0.1
171	0.1
172	0.1
173	0.1
174	0.09
175	0.1
176	0.1
177	0.08
178	0.07
179	0.06
180	0.07
181	0.08
182	0.08
183	0.06
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.08
196	0.08
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.05
204	0.05
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.06
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.06
219	0.06
220	0.06
221	0.08
222	0.07
223	0.1
224	0.11
225	0.14
226	0.2
227	0.28
228	0.37
229	0.45
230	0.57
231	0.65
232	0.74
233	0.78
234	0.78
235	0.75
236	0.67
237	0.62
238	0.56
239	0.49
240	0.4
241	0.35
242	0.28
243	0.24
244	0.23
245	0.19
246	0.13
247	0.09
248	0.08
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.08
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.12
264	0.12
265	0.12
266	0.18
267	0.18
268	0.2
269	0.19
270	0.21
271	0.22
272	0.25
273	0.27
274	0.22
275	0.22
276	0.21
277	0.21
278	0.19
279	0.15
280	0.18
281	0.16
282	0.16
283	0.16
284	0.16
285	0.17
286	0.16
287	0.14
288	0.08
289	0.07
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.06
295	0.06
296	0.07
297	0.07
298	0.08
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.1
306	0.12
307	0.12
308	0.12
309	0.11
310	0.12
311	0.12
312	0.12
313	0.12
314	0.12
315	0.13
316	0.12
317	0.15
318	0.14
319	0.15
320	0.18
321	0.17
322	0.14
323	0.19
324	0.2
325	0.17
326	0.18
327	0.19
328	0.19
329	0.26
330	0.27
331	0.23
332	0.22
333	0.23
334	0.23
335	0.24
336	0.2
337	0.14
338	0.14
339	0.15
340	0.14
341	0.13
342	0.11
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.09
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.12
354	0.11
355	0.11
356	0.12
357	0.13
358	0.13
359	0.14
360	0.15
361	0.17
362	0.21
363	0.26
364	0.3
365	0.36
366	0.38
367	0.41
368	0.46
369	0.48
370	0.52
371	0.57
372	0.62
373	0.61
374	0.65
375	0.64
376	0.6
377	0.56
378	0.55
379	0.51
380	0.5
381	0.52
382	0.53
383	0.57
384	0.61
385	0.7
386	0.71
387	0.75
388	0.7
389	0.64
390	0.56
391	0.51
392	0.46
393	0.37
394	0.3
395	0.21
396	0.18
397	0.16
398	0.17
399	0.17
400	0.17
401	0.22
402	0.23
403	0.27
404	0.29
405	0.31
406	0.34
407	0.4
408	0.46
409	0.5
410	0.55
411	0.59
412	0.65
413	0.63
414	0.62
415	0.66
416	0.65
417	0.65
418	0.64
419	0.62
420	0.63
421	0.68
422	0.66
423	0.6
424	0.56
425	0.54
426	0.52
427	0.46
428	0.39
429	0.35
430	0.33
431	0.3
432	0.26
433	0.21
434	0.17
435	0.18
436	0.16
437	0.14
438	0.14
439	0.13
440	0.12
441	0.1
442	0.09
443	0.08
444	0.08
445	0.1
446	0.1
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.15
451	0.21
452	0.29
453	0.36
454	0.42
455	0.51
456	0.58
457	0.65
458	0.67
459	0.68
460	0.68
461	0.7
462	0.73
463	0.74
464	0.76
465	0.77
466	0.81
467	0.84
468	0.84
469	0.84
470	0.85
471	0.85

A0A1Y3MP08

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer