Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3MSN5

Protein Details
Accession A0A1Y3MSN5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-101NITNKKWNYFRKYYKSRMKTFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045867  DNA-dir_RpoC_beta_prime  
IPR007066  RNA_pol_Rpb1_3  
IPR042102  RNA_pol_Rpb1_3_sf  
IPR038120  Rpb1_funnel_sf  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003899  F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04983  RNA_pol_Rpb1_3  
Amino Acid Sequences NSRTIQINPLIASVFQADFDGKEAKKELLSNLNISYNIRSYKNSSLMIKFIQDTLTGLYNMTRDKNIADAYIVKRICNKLNITNKKWNYFRKYYKSRMKTFDIPYSHLLSLLLPRTLTIKHKNKIIVDHGILLGVINGDNQTILLNSIINYGNEFYLKFMWNVQRMVHVYNLFHTITISVADCFPSDNIKNSSASVLNDIPDDLNTLSISNLDTTIMNQNKPGNQSNIRENVFQNYYSLTKLVENIQSNLTNIVNSGSKGNKDNVHTLKDCRQRSYLYIQKSDVQELYQRP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.11
3 0.12
4 0.11
5 0.11
6 0.14
7 0.19
8 0.16
9 0.19
10 0.21
11 0.22
12 0.24
13 0.26
14 0.28
15 0.3
16 0.33
17 0.33
18 0.33
19 0.34
20 0.32
21 0.32
22 0.29
23 0.25
24 0.26
25 0.25
26 0.25
27 0.28
28 0.34
29 0.38
30 0.4
31 0.41
32 0.39
33 0.4
34 0.39
35 0.36
36 0.3
37 0.25
38 0.21
39 0.17
40 0.15
41 0.14
42 0.15
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.15
48 0.16
49 0.15
50 0.13
51 0.14
52 0.17
53 0.17
54 0.15
55 0.14
56 0.18
57 0.2
58 0.26
59 0.26
60 0.23
61 0.28
62 0.31
63 0.33
64 0.33
65 0.35
66 0.37
67 0.48
68 0.56
69 0.58
70 0.65
71 0.65
72 0.67
73 0.7
74 0.7
75 0.67
76 0.68
77 0.7
78 0.7
79 0.75
80 0.78
81 0.81
82 0.81
83 0.8
84 0.76
85 0.73
86 0.71
87 0.67
88 0.65
89 0.57
90 0.51
91 0.47
92 0.45
93 0.38
94 0.3
95 0.25
96 0.18
97 0.18
98 0.16
99 0.14
100 0.1
101 0.1
102 0.11
103 0.13
104 0.18
105 0.25
106 0.32
107 0.35
108 0.39
109 0.43
110 0.43
111 0.46
112 0.44
113 0.38
114 0.31
115 0.29
116 0.24
117 0.2
118 0.18
119 0.14
120 0.09
121 0.05
122 0.04
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.16
148 0.18
149 0.19
150 0.19
151 0.21
152 0.21
153 0.22
154 0.22
155 0.19
156 0.16
157 0.16
158 0.19
159 0.15
160 0.13
161 0.12
162 0.09
163 0.08
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.11
173 0.11
174 0.15
175 0.18
176 0.19
177 0.2
178 0.2
179 0.21
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.12
188 0.1
189 0.11
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.08
202 0.17
203 0.19
204 0.19
205 0.21
206 0.24
207 0.27
208 0.32
209 0.34
210 0.32
211 0.36
212 0.4
213 0.44
214 0.49
215 0.48
216 0.46
217 0.42
218 0.42
219 0.38
220 0.34
221 0.27
222 0.23
223 0.22
224 0.2
225 0.19
226 0.14
227 0.13
228 0.15
229 0.18
230 0.22
231 0.23
232 0.24
233 0.27
234 0.27
235 0.27
236 0.28
237 0.24
238 0.17
239 0.15
240 0.15
241 0.13
242 0.12
243 0.16
244 0.17
245 0.2
246 0.24
247 0.28
248 0.31
249 0.34
250 0.43
251 0.44
252 0.48
253 0.48
254 0.5
255 0.55
256 0.59
257 0.59
258 0.55
259 0.54
260 0.5
261 0.52
262 0.56
263 0.54
264 0.53
265 0.54
266 0.52
267 0.54
268 0.53
269 0.53
270 0.43
271 0.38