Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NBA0

Protein Details
Accession A0A1Y3NBA0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-52GSSAVKEQVKKRKKDMKIDLINAQHydrophilic
242-268RMMLRKLRTKTQKEKNIKNNNNNNKSIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
IPR022783  GCFC_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF07842  GCFC  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MMEDKKDNEEEDDDDEVFEDYENNRILFGSSAVKEQVKKRKKDMKIDLINAQENESEEEDKDELNKWESELIKQGRAAPEIMKVAKKKSEMAKNQIPEICEIPSLDEVMRDFAASLYHIELKHSENVNEEAYLVEEIDKSKKNTENLQSDLKLSSDKYTYFQELRNYIIDLAEFLDEKFTDFNKISDDYLNLKKEKELFISNRIQSDLNDCFYDFVTGWNGLVFDKEGNNIYKYDLDQKENRMMLRKLRTKTQKEKNIKNNNNNNKSIPDINDIEGYISNDDFDEKDQEVYDTKKDEILKKYNDFFSDTNENFKDLSIIKKNFEDWKEKYAKEYNQGFGGLSMPGVFELFVKYELFFWEPLEKYREFEDMIWHQEASTYGTTNMMELDNYDPEDEDNKLLIRLVEKFAIPKVKELVKLWNVFSINQTRNLLRILMLLQDYIKSKDTFFIGVIEEIENKFKNTIEKILSHNPIQRVTPQKNISPYLYEQINYWFWKIFKVYNNMFMFEKYISKESLQVIAIDQLLNQLLVPCLDIIRIVYLDSSDYPSLLKEHEQEELLKFEKICHLIPEKWLKDDYSVPNYLKPLELSLKEFSKICHSNKSSRHTFEIIVKLLVKLRSYDEASKLGKLYKIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.19
4 0.16
5 0.13
6 0.12
7 0.09
8 0.14
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.16
14 0.15
15 0.17
16 0.18
17 0.17
18 0.2
19 0.23
20 0.26
21 0.31
22 0.39
23 0.48
24 0.51
25 0.57
26 0.65
27 0.72
28 0.78
29 0.83
30 0.85
31 0.85
32 0.85
33 0.83
34 0.79
35 0.75
36 0.71
37 0.61
38 0.51
39 0.41
40 0.33
41 0.3
42 0.26
43 0.22
44 0.17
45 0.2
46 0.19
47 0.18
48 0.18
49 0.19
50 0.19
51 0.21
52 0.21
53 0.19
54 0.24
55 0.25
56 0.26
57 0.31
58 0.32
59 0.32
60 0.34
61 0.38
62 0.36
63 0.36
64 0.35
65 0.27
66 0.28
67 0.3
68 0.32
69 0.33
70 0.33
71 0.36
72 0.4
73 0.41
74 0.43
75 0.47
76 0.54
77 0.57
78 0.63
79 0.66
80 0.64
81 0.68
82 0.63
83 0.55
84 0.47
85 0.4
86 0.32
87 0.24
88 0.21
89 0.17
90 0.16
91 0.16
92 0.14
93 0.13
94 0.12
95 0.14
96 0.14
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.1
101 0.09
102 0.1
103 0.1
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.17
108 0.19
109 0.25
110 0.26
111 0.25
112 0.24
113 0.27
114 0.26
115 0.24
116 0.21
117 0.14
118 0.13
119 0.13
120 0.09
121 0.08
122 0.07
123 0.09
124 0.14
125 0.18
126 0.19
127 0.25
128 0.3
129 0.33
130 0.41
131 0.48
132 0.5
133 0.5
134 0.54
135 0.49
136 0.45
137 0.42
138 0.35
139 0.28
140 0.22
141 0.21
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.21
146 0.25
147 0.26
148 0.28
149 0.31
150 0.3
151 0.32
152 0.31
153 0.28
154 0.23
155 0.21
156 0.17
157 0.12
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.08
164 0.09
165 0.1
166 0.09
167 0.12
168 0.13
169 0.13
170 0.15
171 0.17
172 0.17
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.26
177 0.3
178 0.28
179 0.27
180 0.28
181 0.31
182 0.31
183 0.29
184 0.3
185 0.29
186 0.35
187 0.42
188 0.41
189 0.39
190 0.38
191 0.35
192 0.28
193 0.3
194 0.26
195 0.2
196 0.19
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.17
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.08
210 0.08
211 0.06
212 0.07
213 0.08
214 0.1
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.23
222 0.23
223 0.26
224 0.28
225 0.32
226 0.37
227 0.37
228 0.37
229 0.34
230 0.33
231 0.36
232 0.42
233 0.46
234 0.42
235 0.49
236 0.58
237 0.61
238 0.69
239 0.72
240 0.73
241 0.75
242 0.83
243 0.85
244 0.86
245 0.86
246 0.86
247 0.86
248 0.86
249 0.84
250 0.77
251 0.67
252 0.57
253 0.51
254 0.43
255 0.35
256 0.29
257 0.23
258 0.22
259 0.21
260 0.19
261 0.17
262 0.15
263 0.13
264 0.09
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.18
283 0.23
284 0.28
285 0.33
286 0.36
287 0.38
288 0.41
289 0.39
290 0.37
291 0.35
292 0.29
293 0.27
294 0.29
295 0.26
296 0.28
297 0.26
298 0.26
299 0.22
300 0.22
301 0.19
302 0.12
303 0.17
304 0.2
305 0.22
306 0.22
307 0.23
308 0.25
309 0.29
310 0.31
311 0.33
312 0.28
313 0.34
314 0.39
315 0.38
316 0.4
317 0.41
318 0.41
319 0.42
320 0.43
321 0.36
322 0.31
323 0.32
324 0.27
325 0.21
326 0.19
327 0.11
328 0.07
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.03
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.19
349 0.18
350 0.18
351 0.19
352 0.2
353 0.16
354 0.16
355 0.2
356 0.18
357 0.21
358 0.21
359 0.19
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.15
364 0.13
365 0.1
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.1
370 0.1
371 0.07
372 0.06
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.1
390 0.12
391 0.12
392 0.12
393 0.13
394 0.16
395 0.22
396 0.21
397 0.21
398 0.24
399 0.26
400 0.29
401 0.29
402 0.34
403 0.33
404 0.36
405 0.34
406 0.35
407 0.32
408 0.29
409 0.32
410 0.31
411 0.27
412 0.29
413 0.31
414 0.26
415 0.27
416 0.27
417 0.24
418 0.16
419 0.15
420 0.12
421 0.12
422 0.12
423 0.11
424 0.1
425 0.11
426 0.13
427 0.14
428 0.16
429 0.14
430 0.14
431 0.16
432 0.18
433 0.17
434 0.15
435 0.15
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.11
442 0.14
443 0.13
444 0.13
445 0.13
446 0.13
447 0.17
448 0.18
449 0.23
450 0.23
451 0.26
452 0.31
453 0.38
454 0.41
455 0.4
456 0.43
457 0.4
458 0.39
459 0.37
460 0.38
461 0.4
462 0.4
463 0.45
464 0.44
465 0.45
466 0.49
467 0.51
468 0.46
469 0.41
470 0.39
471 0.34
472 0.32
473 0.28
474 0.23
475 0.24
476 0.27
477 0.24
478 0.23
479 0.21
480 0.2
481 0.23
482 0.25
483 0.26
484 0.28
485 0.35
486 0.36
487 0.43
488 0.44
489 0.43
490 0.41
491 0.36
492 0.32
493 0.25
494 0.25
495 0.19
496 0.2
497 0.2
498 0.2
499 0.23
500 0.23
501 0.25
502 0.23
503 0.2
504 0.19
505 0.19
506 0.19
507 0.14
508 0.13
509 0.1
510 0.1
511 0.09
512 0.08
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.08
517 0.06
518 0.06
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.1
528 0.1
529 0.14
530 0.12
531 0.13
532 0.13
533 0.13
534 0.15
535 0.15
536 0.17
537 0.16
538 0.18
539 0.2
540 0.22
541 0.23
542 0.24
543 0.27
544 0.25
545 0.24
546 0.23
547 0.22
548 0.27
549 0.27
550 0.26
551 0.28
552 0.32
553 0.32
554 0.41
555 0.49
556 0.45
557 0.45
558 0.46
559 0.41
560 0.39
561 0.44
562 0.43
563 0.4
564 0.43
565 0.41
566 0.43
567 0.44
568 0.41
569 0.35
570 0.29
571 0.27
572 0.28
573 0.29
574 0.29
575 0.33
576 0.34
577 0.35
578 0.35
579 0.31
580 0.34
581 0.39
582 0.39
583 0.44
584 0.47
585 0.55
586 0.62
587 0.69
588 0.69
589 0.66
590 0.68
591 0.61
592 0.59
593 0.58
594 0.57
595 0.5
596 0.44
597 0.4
598 0.36
599 0.38
600 0.37
601 0.3
602 0.25
603 0.27
604 0.3
605 0.34
606 0.38
607 0.37
608 0.41
609 0.42
610 0.43
611 0.42
612 0.39