Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NTA6

Protein Details
Accession A0A1Y3NTA6    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-52RQIAREKLKLKLKKMEKNKKAEEEIBasic
91-112GKDTSNTKKGRKRKLIYCDYNLHydrophilic
253-281DEFDRRETEKRQRKEKKFNAKLKELRRATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
32-47REKLKLKLKKMEKNKK
99-103KGRKR
261-292EKRQRKEKKFNAKLKELRRATRTSIWLKEKKK
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MADSENSSSSSKKIIFTEEQRQYMLRNRQIAREKLKLKLKKMEKNKKAEEEIIVVDDDNVPSKNTETKDTGSSSQPNIIKDIINSTIIDNGKDTSNTKKGRKRKLIYCDYNLSEIVDTKGGFLIEKNEDENEQHGPEREIKHPRPINLDLDKNPKCKECDSLDIDYNYLDNFNVLVCRSCKNKMPEKYSLLTKTECKEDYLLTDSELRDRELLPCWERPNPHKSTWNNMMLFVRYQVEEYAFKKWGSEQGLDDEFDRRETEKRQRKEKKFNAKLKELRRATRTSIWLKEKKKAHVHEFGETSVDKETGDSFRRCKTCGFLEEFEEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.37
3 0.43
4 0.53
5 0.54
6 0.54
7 0.52
8 0.5
9 0.47
10 0.49
11 0.51
12 0.47
13 0.49
14 0.48
15 0.56
16 0.64
17 0.69
18 0.67
19 0.67
20 0.64
21 0.64
22 0.72
23 0.71
24 0.69
25 0.71
26 0.73
27 0.73
28 0.8
29 0.83
30 0.82
31 0.85
32 0.86
33 0.85
34 0.8
35 0.74
36 0.65
37 0.57
38 0.49
39 0.41
40 0.32
41 0.23
42 0.19
43 0.16
44 0.13
45 0.11
46 0.11
47 0.1
48 0.1
49 0.12
50 0.17
51 0.18
52 0.23
53 0.25
54 0.27
55 0.3
56 0.33
57 0.34
58 0.33
59 0.35
60 0.32
61 0.35
62 0.35
63 0.32
64 0.3
65 0.29
66 0.25
67 0.21
68 0.23
69 0.18
70 0.17
71 0.16
72 0.14
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.26
83 0.33
84 0.41
85 0.49
86 0.57
87 0.66
88 0.76
89 0.77
90 0.77
91 0.81
92 0.83
93 0.82
94 0.78
95 0.73
96 0.64
97 0.58
98 0.49
99 0.39
100 0.29
101 0.22
102 0.17
103 0.12
104 0.1
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.12
122 0.13
123 0.17
124 0.2
125 0.25
126 0.32
127 0.33
128 0.41
129 0.44
130 0.44
131 0.46
132 0.45
133 0.46
134 0.41
135 0.44
136 0.38
137 0.44
138 0.46
139 0.43
140 0.41
141 0.37
142 0.35
143 0.32
144 0.34
145 0.28
146 0.31
147 0.32
148 0.33
149 0.33
150 0.31
151 0.3
152 0.24
153 0.21
154 0.14
155 0.1
156 0.06
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.04
162 0.06
163 0.07
164 0.1
165 0.13
166 0.15
167 0.22
168 0.28
169 0.37
170 0.43
171 0.48
172 0.52
173 0.54
174 0.55
175 0.54
176 0.51
177 0.45
178 0.39
179 0.36
180 0.31
181 0.31
182 0.29
183 0.25
184 0.22
185 0.2
186 0.2
187 0.21
188 0.19
189 0.15
190 0.18
191 0.16
192 0.19
193 0.19
194 0.17
195 0.14
196 0.15
197 0.16
198 0.16
199 0.21
200 0.21
201 0.24
202 0.27
203 0.3
204 0.33
205 0.37
206 0.41
207 0.41
208 0.43
209 0.48
210 0.47
211 0.52
212 0.56
213 0.58
214 0.51
215 0.48
216 0.44
217 0.37
218 0.35
219 0.28
220 0.21
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.13
225 0.16
226 0.17
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.2
231 0.21
232 0.24
233 0.25
234 0.26
235 0.23
236 0.26
237 0.28
238 0.28
239 0.27
240 0.24
241 0.2
242 0.19
243 0.19
244 0.15
245 0.18
246 0.25
247 0.36
248 0.43
249 0.51
250 0.61
251 0.71
252 0.79
253 0.87
254 0.89
255 0.9
256 0.9
257 0.91
258 0.89
259 0.89
260 0.87
261 0.85
262 0.85
263 0.8
264 0.77
265 0.73
266 0.69
267 0.65
268 0.64
269 0.63
270 0.6
271 0.62
272 0.65
273 0.68
274 0.67
275 0.69
276 0.69
277 0.7
278 0.73
279 0.72
280 0.71
281 0.72
282 0.71
283 0.7
284 0.65
285 0.56
286 0.5
287 0.41
288 0.34
289 0.26
290 0.22
291 0.15
292 0.13
293 0.16
294 0.18
295 0.25
296 0.29
297 0.31
298 0.4
299 0.43
300 0.44
301 0.44
302 0.44
303 0.46
304 0.49
305 0.52
306 0.46