Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NSE4

Protein Details
Accession A0A1Y3NSE4    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
490-512EEEKLNQKRDGKRRKNARMADAEBasic
683-712SQDVLNQQKKKNNNDNDNKRKKKNNNDNNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
497-504KRDGKRRK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF17122  zf-C3H2C3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16688  RING-H2_Vps11  
Amino Acid Sequences MSITIYDLKNKYIAYTESFTEEFIREDQNDINSKFVEKKGAIRCICSEWGSLFIFTGDRKMYRLEEIDLSTKLDILFKRNMYTLAINIVNSQQQYSNVSSNPTLNLEGMASKEGQEAGNNVNNSEYDYGTLVEIYKRYGDWLYEKNDFDNAMKQYLHTIGQLEPSYVIRKFLDAQRIHNLTSYLQALHEAGLANSDHTTLLLNCYTKLKSKDALDQFIKSEKNVTFDVDTAINVCRQAGYFEHAIYLAEEYKYYDLYINIQVEDLHHYHDVIAYMQNLPFKIVENNINHYGVELVTNIPEHTTELLIKLCTGWNDENETEESKSGEEITTTKTTAQSLLSHVVTKYRTSTKTGKDSTTTFTITPSSKLNVETKDILPQDNTSQLNSFMINNDEPFEVEEKSRLSVNPNQTHLSSFPPFQSDNILDNEINIIGSINAATALKNEDSFQINASEISNISRSFQSQVNFTLDEDRFNKNNIIDLSMSHSPKLEEEKLNQKRDGKRRKNARMADAESFIYLYINQKEWCITFLETVLEKRLTASDEDDTDTEILDSNDNQIIWNTLLELYLSGTTEAFKKTDDYTEDDSVIKWEPLEGKIMSLLRNPKDTETMRQQIDELKNGNVIFQVSKCEACGRPLELPTIHFLCKHSYHLRCLGENDQACPKCTPEHRMIMDAIRLQESNTLSQDVLNQQKKKNNNDNDNKRKKKNNNDNNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.27
4 0.29
5 0.29
6 0.28
7 0.26
8 0.24
9 0.2
10 0.2
11 0.23
12 0.19
13 0.22
14 0.24
15 0.27
16 0.34
17 0.33
18 0.34
19 0.3
20 0.32
21 0.34
22 0.33
23 0.35
24 0.29
25 0.37
26 0.43
27 0.52
28 0.51
29 0.5
30 0.51
31 0.49
32 0.5
33 0.43
34 0.36
35 0.28
36 0.31
37 0.28
38 0.25
39 0.2
40 0.17
41 0.17
42 0.15
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.18
47 0.21
48 0.23
49 0.26
50 0.29
51 0.27
52 0.28
53 0.31
54 0.33
55 0.3
56 0.3
57 0.25
58 0.23
59 0.2
60 0.21
61 0.19
62 0.21
63 0.27
64 0.27
65 0.3
66 0.3
67 0.31
68 0.29
69 0.29
70 0.25
71 0.24
72 0.23
73 0.21
74 0.21
75 0.22
76 0.21
77 0.19
78 0.2
79 0.16
80 0.16
81 0.2
82 0.22
83 0.24
84 0.23
85 0.25
86 0.26
87 0.26
88 0.26
89 0.24
90 0.22
91 0.18
92 0.17
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.13
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.12
101 0.11
102 0.12
103 0.13
104 0.16
105 0.21
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.19
110 0.2
111 0.2
112 0.15
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.12
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.12
123 0.11
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.19
128 0.24
129 0.29
130 0.33
131 0.34
132 0.33
133 0.33
134 0.32
135 0.28
136 0.29
137 0.25
138 0.23
139 0.22
140 0.21
141 0.22
142 0.23
143 0.22
144 0.17
145 0.17
146 0.14
147 0.19
148 0.19
149 0.17
150 0.16
151 0.17
152 0.19
153 0.18
154 0.19
155 0.15
156 0.16
157 0.19
158 0.24
159 0.32
160 0.3
161 0.34
162 0.4
163 0.42
164 0.41
165 0.39
166 0.35
167 0.26
168 0.27
169 0.23
170 0.15
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.12
176 0.09
177 0.07
178 0.09
179 0.09
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.1
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.16
192 0.17
193 0.22
194 0.26
195 0.27
196 0.29
197 0.32
198 0.4
199 0.42
200 0.48
201 0.45
202 0.42
203 0.4
204 0.4
205 0.38
206 0.28
207 0.29
208 0.22
209 0.23
210 0.22
211 0.23
212 0.19
213 0.19
214 0.2
215 0.15
216 0.14
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.08
235 0.07
236 0.07
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.08
243 0.11
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.13
250 0.16
251 0.14
252 0.12
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.1
263 0.12
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.13
270 0.18
271 0.19
272 0.24
273 0.25
274 0.25
275 0.24
276 0.22
277 0.2
278 0.13
279 0.12
280 0.08
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.11
299 0.11
300 0.11
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.17
305 0.18
306 0.15
307 0.14
308 0.13
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.12
319 0.12
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.11
324 0.11
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.16
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.18
334 0.19
335 0.24
336 0.31
337 0.33
338 0.41
339 0.43
340 0.41
341 0.38
342 0.38
343 0.36
344 0.32
345 0.28
346 0.19
347 0.17
348 0.19
349 0.17
350 0.17
351 0.15
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.18
356 0.17
357 0.19
358 0.2
359 0.19
360 0.23
361 0.23
362 0.21
363 0.18
364 0.18
365 0.16
366 0.19
367 0.19
368 0.14
369 0.14
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.08
375 0.1
376 0.1
377 0.09
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.09
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.14
391 0.19
392 0.28
393 0.31
394 0.33
395 0.34
396 0.34
397 0.35
398 0.31
399 0.3
400 0.22
401 0.19
402 0.17
403 0.18
404 0.18
405 0.17
406 0.19
407 0.17
408 0.17
409 0.18
410 0.2
411 0.16
412 0.16
413 0.16
414 0.12
415 0.1
416 0.08
417 0.06
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.1
431 0.12
432 0.13
433 0.13
434 0.12
435 0.12
436 0.12
437 0.12
438 0.1
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.09
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.13
447 0.16
448 0.16
449 0.16
450 0.19
451 0.2
452 0.2
453 0.19
454 0.24
455 0.21
456 0.24
457 0.25
458 0.27
459 0.25
460 0.26
461 0.28
462 0.21
463 0.26
464 0.22
465 0.22
466 0.18
467 0.17
468 0.21
469 0.24
470 0.24
471 0.2
472 0.2
473 0.18
474 0.19
475 0.25
476 0.24
477 0.22
478 0.26
479 0.37
480 0.45
481 0.5
482 0.52
483 0.53
484 0.57
485 0.65
486 0.72
487 0.71
488 0.72
489 0.79
490 0.85
491 0.88
492 0.85
493 0.82
494 0.79
495 0.74
496 0.67
497 0.58
498 0.48
499 0.38
500 0.32
501 0.24
502 0.15
503 0.11
504 0.11
505 0.12
506 0.14
507 0.14
508 0.15
509 0.16
510 0.16
511 0.17
512 0.16
513 0.14
514 0.13
515 0.13
516 0.15
517 0.15
518 0.16
519 0.18
520 0.16
521 0.15
522 0.15
523 0.15
524 0.14
525 0.14
526 0.16
527 0.15
528 0.16
529 0.18
530 0.17
531 0.17
532 0.15
533 0.14
534 0.11
535 0.1
536 0.09
537 0.08
538 0.09
539 0.1
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.1
544 0.12
545 0.11
546 0.11
547 0.09
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.08
555 0.07
556 0.07
557 0.08
558 0.1
559 0.11
560 0.11
561 0.11
562 0.13
563 0.14
564 0.19
565 0.21
566 0.26
567 0.3
568 0.32
569 0.33
570 0.31
571 0.29
572 0.26
573 0.25
574 0.19
575 0.13
576 0.13
577 0.14
578 0.15
579 0.19
580 0.17
581 0.16
582 0.2
583 0.21
584 0.21
585 0.23
586 0.3
587 0.29
588 0.34
589 0.35
590 0.33
591 0.39
592 0.41
593 0.43
594 0.45
595 0.49
596 0.46
597 0.45
598 0.44
599 0.44
600 0.45
601 0.43
602 0.36
603 0.3
604 0.32
605 0.31
606 0.3
607 0.23
608 0.2
609 0.17
610 0.15
611 0.19
612 0.18
613 0.18
614 0.19
615 0.23
616 0.23
617 0.24
618 0.28
619 0.27
620 0.3
621 0.31
622 0.35
623 0.3
624 0.3
625 0.33
626 0.32
627 0.29
628 0.26
629 0.26
630 0.28
631 0.29
632 0.35
633 0.39
634 0.4
635 0.45
636 0.52
637 0.54
638 0.5
639 0.53
640 0.49
641 0.49
642 0.46
643 0.43
644 0.44
645 0.42
646 0.42
647 0.39
648 0.37
649 0.36
650 0.4
651 0.44
652 0.42
653 0.49
654 0.49
655 0.51
656 0.52
657 0.47
658 0.46
659 0.43
660 0.37
661 0.3
662 0.28
663 0.25
664 0.27
665 0.26
666 0.25
667 0.23
668 0.23
669 0.21
670 0.21
671 0.25
672 0.28
673 0.36
674 0.41
675 0.45
676 0.5
677 0.57
678 0.65
679 0.71
680 0.74
681 0.75
682 0.77
683 0.82
684 0.87
685 0.91
686 0.94
687 0.93
688 0.92
689 0.92
690 0.92
691 0.92
692 0.92