Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NGV4

Protein Details
Accession A0A1Y3NGV4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-171KTEFAKAKYIKRKERKFTKIFTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-164KRKER
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 14, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSNIKEQKKTAEDFNVVDKDNYMAPNAYIYVLLPSGNSKIVQLKPNCNISLGKFGSFKANSIIGKPYGITYEIVNKNDVKLYKNYTFFDDFDIDGEVTSINNKDLNDTQTSQKLSHQEIEQLKKELLKGEKNSEHVIQTVLDNSVTFEAKTEFAKAKYIKRKERKFTKIFTPLKPTAKLLCEYYLEIKPSKIRELRIDTLSQMMTLANVHAQSNYIVVEDIQGLLLGAVLERTGRIGKVLAVHEYSQFNGNILPSFNFDEKEFNESVMTYPWERLLNPDPFKQEKLELERVKKYLETTPKEEINEKLVMKKERYIKRITEGENIQKFINENKFDGLLIASGFNTIDVIEKLKPYIGGSRAIVAYSPYKETLLETYNYLRNSPEFVNAQITESWMREHQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.5
3 0.44
4 0.41
5 0.34
6 0.28
7 0.27
8 0.26
9 0.2
10 0.16
11 0.15
12 0.17
13 0.17
14 0.15
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.11
20 0.09
21 0.1
22 0.12
23 0.14
24 0.14
25 0.14
26 0.21
27 0.26
28 0.34
29 0.39
30 0.45
31 0.5
32 0.57
33 0.55
34 0.5
35 0.47
36 0.42
37 0.45
38 0.38
39 0.35
40 0.3
41 0.3
42 0.36
43 0.34
44 0.32
45 0.26
46 0.29
47 0.26
48 0.27
49 0.31
50 0.23
51 0.23
52 0.23
53 0.2
54 0.16
55 0.17
56 0.15
57 0.12
58 0.22
59 0.26
60 0.27
61 0.28
62 0.27
63 0.27
64 0.32
65 0.32
66 0.26
67 0.26
68 0.33
69 0.37
70 0.41
71 0.41
72 0.41
73 0.43
74 0.39
75 0.38
76 0.33
77 0.26
78 0.22
79 0.23
80 0.17
81 0.13
82 0.13
83 0.09
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.09
89 0.1
90 0.13
91 0.16
92 0.19
93 0.22
94 0.23
95 0.26
96 0.29
97 0.31
98 0.28
99 0.29
100 0.31
101 0.29
102 0.32
103 0.29
104 0.32
105 0.37
106 0.42
107 0.41
108 0.39
109 0.37
110 0.34
111 0.34
112 0.32
113 0.31
114 0.32
115 0.32
116 0.38
117 0.41
118 0.42
119 0.44
120 0.4
121 0.35
122 0.28
123 0.25
124 0.18
125 0.15
126 0.13
127 0.11
128 0.09
129 0.08
130 0.08
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.12
139 0.13
140 0.13
141 0.2
142 0.23
143 0.31
144 0.39
145 0.48
146 0.56
147 0.64
148 0.73
149 0.76
150 0.83
151 0.85
152 0.81
153 0.77
154 0.76
155 0.76
156 0.73
157 0.67
158 0.65
159 0.61
160 0.59
161 0.55
162 0.47
163 0.4
164 0.36
165 0.34
166 0.27
167 0.23
168 0.19
169 0.19
170 0.21
171 0.19
172 0.18
173 0.18
174 0.17
175 0.18
176 0.19
177 0.24
178 0.23
179 0.24
180 0.28
181 0.35
182 0.37
183 0.36
184 0.35
185 0.29
186 0.28
187 0.26
188 0.19
189 0.12
190 0.09
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.04
213 0.03
214 0.02
215 0.02
216 0.02
217 0.02
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.11
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.15
230 0.17
231 0.17
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.12
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.16
247 0.17
248 0.21
249 0.19
250 0.16
251 0.16
252 0.15
253 0.16
254 0.14
255 0.15
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.14
260 0.13
261 0.18
262 0.23
263 0.29
264 0.32
265 0.35
266 0.39
267 0.4
268 0.42
269 0.39
270 0.36
271 0.34
272 0.39
273 0.45
274 0.45
275 0.48
276 0.52
277 0.51
278 0.48
279 0.43
280 0.38
281 0.37
282 0.4
283 0.4
284 0.4
285 0.44
286 0.46
287 0.47
288 0.47
289 0.41
290 0.36
291 0.35
292 0.31
293 0.3
294 0.33
295 0.37
296 0.36
297 0.4
298 0.46
299 0.49
300 0.53
301 0.54
302 0.52
303 0.54
304 0.6
305 0.57
306 0.56
307 0.53
308 0.58
309 0.56
310 0.54
311 0.46
312 0.39
313 0.37
314 0.36
315 0.39
316 0.31
317 0.28
318 0.29
319 0.29
320 0.28
321 0.27
322 0.21
323 0.13
324 0.11
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.06
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.1
335 0.12
336 0.13
337 0.14
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.22
342 0.21
343 0.24
344 0.24
345 0.27
346 0.26
347 0.25
348 0.24
349 0.19
350 0.22
351 0.2
352 0.22
353 0.2
354 0.2
355 0.2
356 0.22
357 0.24
358 0.23
359 0.22
360 0.22
361 0.26
362 0.31
363 0.31
364 0.3
365 0.27
366 0.25
367 0.28
368 0.27
369 0.28
370 0.25
371 0.26
372 0.32
373 0.3
374 0.31
375 0.27
376 0.29
377 0.25
378 0.24