Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NGA3

Protein Details
Accession A0A1Y3NGA3    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-188PLKTEETKKTTKRTRVKKEEDEKPSKRKKTATKVKEEKIPKKKKKEEEEVEVFRBasic
657-677EKELEKKKAKLERDNEKRKAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-179KRRKTTPLKTEETKKTTKRTRVKKEEDEKPSKRKKTATKVKEEKIPKKKKK
634-647KKKKPELGRLSRGI
657-679EKELEKKKAKLERDNEKRKAEGK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR018521  TopoI_AS  
IPR025834  TopoI_C_dom  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF14370  Topo_C_assoc  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00176  TOPOISOMERASE_I_EUK  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
cd00660  Topoisomer_IB_N  
Amino Acid Sequences MSNSDQSYIDSEEDIQEQENNPELIKTNEIVEDSDSDSEDDVPISQRRTKLNSTTSSISDVTLTNDKVNLHSSSSSDSDSDQPLSQRMSANNSSQIILDPKKRKIKTESNTTVTNESSSDSEDDVALSKRRKTTPLKTEETKKTTKRTRVKKEEDEKPSKRKKTATKVKEEKIPKKKKKEEEEVEVFRWWDNEKEDDSIKWTTLEHQGPYFPPEYVSHGIKMKYKGEPIDLVPECEEVANFFAQVIGTDWGENPTFRKNFFKDFLKVIKKKQPDCPIKKFEDCDFTPLTEYFAEQKEKRKAMTKEEKEVLKKEKQQIEDKYGWALLDGRKEKVGNFRIEPPGLFRGRGEHPKTGTLKHRVYPESVTINIGENAKIPDPPEGHKWGKIIHDNTVTWLAMWKENVNDSFKYVWLAAGSSLKGQSDFKKFEKARELKKHIGKIRAEYTLELKDKLMATRQRATALYFIDKLALRAGNEKGDDVADTVGCCSLRYEHVTLEPPNRVIFDFLGKDSIRYYNEVEVSKQVYKNIEIFKRPPKKEGDMLFDRLNTTILNKYLQKSMKGLTAKVFLKNSTINEKLLAYNRANRQVAILCNHQRAVSKNHSDQLKRIQDKILTSKYQRYLVSKEILELDPTLKKKKPELGRLSRGITKEFIKNYEEKELEKKKAKLERDNEKRKAEGKELLTLKDVEKSKRQPTMERLEKQYDTLTKRIKAQQLLLIDKDENKTTALGTSKINYIDPRISAAWCYKYNVPIEKIFNKSLRNKFKWAVEVDENFVF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.19
6 0.22
7 0.2
8 0.19
9 0.2
10 0.21
11 0.2
12 0.22
13 0.2
14 0.18
15 0.19
16 0.2
17 0.2
18 0.2
19 0.19
20 0.18
21 0.19
22 0.17
23 0.16
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.12
28 0.11
29 0.14
30 0.17
31 0.21
32 0.25
33 0.3
34 0.35
35 0.42
36 0.47
37 0.52
38 0.57
39 0.58
40 0.59
41 0.59
42 0.54
43 0.52
44 0.45
45 0.37
46 0.3
47 0.24
48 0.23
49 0.24
50 0.23
51 0.2
52 0.22
53 0.23
54 0.23
55 0.26
56 0.23
57 0.21
58 0.21
59 0.21
60 0.23
61 0.25
62 0.24
63 0.21
64 0.21
65 0.22
66 0.23
67 0.25
68 0.22
69 0.22
70 0.24
71 0.25
72 0.26
73 0.26
74 0.26
75 0.31
76 0.33
77 0.35
78 0.37
79 0.36
80 0.34
81 0.3
82 0.3
83 0.29
84 0.31
85 0.36
86 0.38
87 0.46
88 0.55
89 0.58
90 0.62
91 0.65
92 0.71
93 0.7
94 0.74
95 0.74
96 0.69
97 0.71
98 0.66
99 0.6
100 0.49
101 0.41
102 0.31
103 0.23
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.13
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.15
113 0.18
114 0.21
115 0.25
116 0.31
117 0.34
118 0.42
119 0.49
120 0.56
121 0.61
122 0.67
123 0.7
124 0.71
125 0.77
126 0.79
127 0.77
128 0.76
129 0.72
130 0.73
131 0.74
132 0.77
133 0.78
134 0.79
135 0.83
136 0.85
137 0.89
138 0.89
139 0.89
140 0.89
141 0.89
142 0.89
143 0.86
144 0.85
145 0.86
146 0.83
147 0.79
148 0.78
149 0.78
150 0.79
151 0.82
152 0.81
153 0.82
154 0.84
155 0.83
156 0.83
157 0.83
158 0.82
159 0.82
160 0.84
161 0.83
162 0.84
163 0.88
164 0.89
165 0.89
166 0.9
167 0.87
168 0.85
169 0.84
170 0.78
171 0.71
172 0.62
173 0.52
174 0.41
175 0.35
176 0.26
177 0.2
178 0.18
179 0.19
180 0.19
181 0.22
182 0.23
183 0.22
184 0.25
185 0.23
186 0.21
187 0.18
188 0.16
189 0.17
190 0.23
191 0.26
192 0.23
193 0.23
194 0.25
195 0.25
196 0.28
197 0.26
198 0.18
199 0.17
200 0.16
201 0.21
202 0.23
203 0.24
204 0.23
205 0.25
206 0.28
207 0.31
208 0.34
209 0.32
210 0.31
211 0.33
212 0.32
213 0.31
214 0.32
215 0.28
216 0.33
217 0.3
218 0.27
219 0.24
220 0.23
221 0.2
222 0.18
223 0.16
224 0.07
225 0.09
226 0.07
227 0.07
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.08
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.11
241 0.17
242 0.18
243 0.2
244 0.27
245 0.28
246 0.34
247 0.39
248 0.43
249 0.38
250 0.42
251 0.5
252 0.53
253 0.54
254 0.55
255 0.58
256 0.6
257 0.62
258 0.66
259 0.67
260 0.68
261 0.73
262 0.75
263 0.74
264 0.72
265 0.71
266 0.65
267 0.58
268 0.54
269 0.46
270 0.41
271 0.35
272 0.29
273 0.27
274 0.24
275 0.22
276 0.15
277 0.15
278 0.13
279 0.16
280 0.2
281 0.2
282 0.29
283 0.35
284 0.36
285 0.38
286 0.44
287 0.44
288 0.49
289 0.58
290 0.55
291 0.55
292 0.58
293 0.61
294 0.56
295 0.58
296 0.54
297 0.5
298 0.51
299 0.52
300 0.53
301 0.53
302 0.58
303 0.57
304 0.57
305 0.53
306 0.46
307 0.39
308 0.34
309 0.28
310 0.2
311 0.19
312 0.13
313 0.19
314 0.2
315 0.19
316 0.2
317 0.21
318 0.22
319 0.28
320 0.32
321 0.28
322 0.29
323 0.33
324 0.35
325 0.35
326 0.34
327 0.28
328 0.28
329 0.25
330 0.23
331 0.18
332 0.19
333 0.23
334 0.32
335 0.32
336 0.3
337 0.31
338 0.36
339 0.38
340 0.38
341 0.41
342 0.41
343 0.4
344 0.39
345 0.43
346 0.39
347 0.39
348 0.36
349 0.33
350 0.27
351 0.25
352 0.22
353 0.17
354 0.16
355 0.16
356 0.14
357 0.11
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.12
364 0.13
365 0.15
366 0.18
367 0.23
368 0.24
369 0.25
370 0.25
371 0.24
372 0.27
373 0.3
374 0.28
375 0.25
376 0.27
377 0.25
378 0.26
379 0.25
380 0.21
381 0.15
382 0.15
383 0.12
384 0.1
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.11
389 0.13
390 0.14
391 0.13
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.11
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.09
407 0.1
408 0.14
409 0.19
410 0.23
411 0.24
412 0.33
413 0.34
414 0.38
415 0.47
416 0.49
417 0.53
418 0.59
419 0.65
420 0.63
421 0.68
422 0.71
423 0.66
424 0.67
425 0.59
426 0.54
427 0.5
428 0.45
429 0.4
430 0.33
431 0.31
432 0.29
433 0.28
434 0.24
435 0.2
436 0.19
437 0.19
438 0.19
439 0.23
440 0.21
441 0.24
442 0.29
443 0.3
444 0.3
445 0.3
446 0.3
447 0.26
448 0.24
449 0.21
450 0.17
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.15
455 0.14
456 0.13
457 0.11
458 0.14
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.13
464 0.12
465 0.12
466 0.09
467 0.09
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.1
477 0.14
478 0.15
479 0.14
480 0.18
481 0.21
482 0.24
483 0.26
484 0.26
485 0.23
486 0.22
487 0.22
488 0.19
489 0.17
490 0.15
491 0.14
492 0.14
493 0.13
494 0.18
495 0.17
496 0.17
497 0.17
498 0.2
499 0.17
500 0.18
501 0.19
502 0.19
503 0.23
504 0.23
505 0.22
506 0.22
507 0.24
508 0.26
509 0.25
510 0.24
511 0.22
512 0.23
513 0.27
514 0.32
515 0.32
516 0.33
517 0.37
518 0.45
519 0.54
520 0.54
521 0.54
522 0.53
523 0.54
524 0.56
525 0.56
526 0.54
527 0.49
528 0.51
529 0.47
530 0.42
531 0.37
532 0.3
533 0.26
534 0.17
535 0.14
536 0.14
537 0.13
538 0.16
539 0.18
540 0.2
541 0.26
542 0.29
543 0.29
544 0.28
545 0.29
546 0.32
547 0.31
548 0.31
549 0.27
550 0.31
551 0.32
552 0.34
553 0.33
554 0.27
555 0.29
556 0.31
557 0.31
558 0.3
559 0.3
560 0.26
561 0.26
562 0.27
563 0.27
564 0.28
565 0.3
566 0.25
567 0.31
568 0.35
569 0.42
570 0.41
571 0.38
572 0.37
573 0.35
574 0.37
575 0.33
576 0.36
577 0.33
578 0.35
579 0.36
580 0.35
581 0.33
582 0.33
583 0.37
584 0.38
585 0.41
586 0.42
587 0.46
588 0.52
589 0.51
590 0.52
591 0.55
592 0.56
593 0.51
594 0.5
595 0.49
596 0.46
597 0.5
598 0.53
599 0.5
600 0.46
601 0.46
602 0.52
603 0.51
604 0.53
605 0.51
606 0.47
607 0.45
608 0.44
609 0.46
610 0.38
611 0.35
612 0.34
613 0.31
614 0.28
615 0.24
616 0.22
617 0.22
618 0.26
619 0.3
620 0.3
621 0.33
622 0.38
623 0.46
624 0.53
625 0.58
626 0.65
627 0.69
628 0.74
629 0.76
630 0.74
631 0.7
632 0.62
633 0.54
634 0.46
635 0.4
636 0.38
637 0.36
638 0.35
639 0.34
640 0.36
641 0.37
642 0.43
643 0.4
644 0.36
645 0.44
646 0.48
647 0.53
648 0.57
649 0.58
650 0.58
651 0.64
652 0.7
653 0.7
654 0.71
655 0.74
656 0.77
657 0.83
658 0.83
659 0.79
660 0.76
661 0.72
662 0.69
663 0.64
664 0.6
665 0.53
666 0.53
667 0.52
668 0.48
669 0.44
670 0.4
671 0.35
672 0.34
673 0.35
674 0.32
675 0.38
676 0.45
677 0.5
678 0.56
679 0.6
680 0.6
681 0.65
682 0.7
683 0.71
684 0.7
685 0.69
686 0.68
687 0.65
688 0.59
689 0.57
690 0.54
691 0.49
692 0.5
693 0.51
694 0.47
695 0.54
696 0.6
697 0.6
698 0.57
699 0.57
700 0.54
701 0.55
702 0.56
703 0.5
704 0.45
705 0.4
706 0.38
707 0.37
708 0.33
709 0.27
710 0.23
711 0.22
712 0.19
713 0.22
714 0.21
715 0.2
716 0.21
717 0.22
718 0.25
719 0.26
720 0.28
721 0.25
722 0.28
723 0.29
724 0.27
725 0.3
726 0.28
727 0.27
728 0.28
729 0.32
730 0.33
731 0.31
732 0.35
733 0.35
734 0.38
735 0.44
736 0.48
737 0.46
738 0.47
739 0.52
740 0.55
741 0.57
742 0.58
743 0.57
744 0.58
745 0.63
746 0.67
747 0.7
748 0.69
749 0.71
750 0.7
751 0.72
752 0.71
753 0.65
754 0.62
755 0.59
756 0.57