Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3N890

Protein Details
Accession A0A1Y3N890    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
462-485QPNNLRQPRQQPPRQPGNRPPQMPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 15.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036053  PABP-dom  
IPR006515  PABP_1234  
IPR002004  PABP_HYD  
IPR034364  PABP_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR045305  RRM2_I_PABPs  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006417  P:regulation of translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00658  PABP  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51309  PABC  
PS50102  RRM  
CDD cd12378  RRM1_I_PABPs  
cd12379  RRM2_I_PABPs  
cd12380  RRM3_I_PABPs  
cd12381  RRM4_I_PABPs  
Amino Acid Sequences MATTEPIAEVPTAESSAPMTSPNASLYVGELDQSITEAILFELFNQVGPVDSIRVCRDAVTRRSLGYAYVNFHSITDCERALETLNYTEVRGRPIRIMWSQRDPSLRKSGAGNIFIKNLDPSIDNKALHDTFSAFGNILSCKVAMEDGVSKGYGFVHYENAESAEAAIKGVNGMLLNDKKVYVGHHIPKKERINKIEEQMKKYTNIYIKNLDESVDDKTLEKDFSKFGKITSCVVQRDENGKSRGFGFINFENSDEAHLAVESMHEKEYHGKQLYVSRAQKKNEREEELRKQYERLREEKLNKYQGVNLYIKNLDDSIDDEKLRQEFSPYGTITSAKVMRDEKTNVSKGFGFVCFSSPDEATKAVSEMNGRMLLSKPIYVALAQRKEVRKAHLEAQINQRTQLRNMQVAAAQVQSAPMFNGVPFMYPNNMQQNGRGGMYFQQQQMMNRRNWPNQQNQVPPFQPNNLRQPRQQPPRQPGNRPPQMPVSQPMPAPGQPMANPAMQNRRPGNFKYPQPNPRNGPMGPKPVGPAINANALLAMSPEDQKSALGEALYPLIQAQYPQYAGKITGMLLEMDKIELLNMLENPEALDIKIKEAITVLEEYKRKTEGDNE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.13
4 0.13
5 0.12
6 0.12
7 0.13
8 0.14
9 0.15
10 0.15
11 0.14
12 0.14
13 0.14
14 0.16
15 0.14
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.1
22 0.06
23 0.06
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.1
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.12
39 0.15
40 0.17
41 0.19
42 0.19
43 0.2
44 0.26
45 0.32
46 0.36
47 0.4
48 0.4
49 0.39
50 0.41
51 0.39
52 0.35
53 0.33
54 0.31
55 0.28
56 0.27
57 0.28
58 0.26
59 0.25
60 0.24
61 0.18
62 0.17
63 0.17
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.16
68 0.17
69 0.18
70 0.17
71 0.15
72 0.18
73 0.17
74 0.17
75 0.21
76 0.2
77 0.25
78 0.26
79 0.26
80 0.26
81 0.29
82 0.34
83 0.37
84 0.44
85 0.44
86 0.5
87 0.52
88 0.53
89 0.59
90 0.56
91 0.54
92 0.56
93 0.51
94 0.43
95 0.43
96 0.47
97 0.44
98 0.47
99 0.44
100 0.36
101 0.37
102 0.35
103 0.33
104 0.25
105 0.19
106 0.15
107 0.13
108 0.14
109 0.2
110 0.24
111 0.23
112 0.23
113 0.29
114 0.28
115 0.28
116 0.26
117 0.2
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.11
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.1
126 0.1
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.08
133 0.1
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.15
148 0.14
149 0.12
150 0.12
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.05
160 0.05
161 0.11
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.14
168 0.16
169 0.16
170 0.23
171 0.31
172 0.37
173 0.42
174 0.45
175 0.54
176 0.61
177 0.63
178 0.63
179 0.6
180 0.61
181 0.6
182 0.64
183 0.64
184 0.6
185 0.57
186 0.54
187 0.51
188 0.46
189 0.42
190 0.41
191 0.38
192 0.37
193 0.35
194 0.36
195 0.35
196 0.35
197 0.34
198 0.29
199 0.24
200 0.2
201 0.2
202 0.15
203 0.15
204 0.13
205 0.15
206 0.15
207 0.16
208 0.15
209 0.13
210 0.15
211 0.17
212 0.21
213 0.19
214 0.19
215 0.23
216 0.24
217 0.25
218 0.28
219 0.31
220 0.28
221 0.3
222 0.31
223 0.28
224 0.31
225 0.33
226 0.33
227 0.3
228 0.29
229 0.28
230 0.27
231 0.28
232 0.23
233 0.2
234 0.18
235 0.18
236 0.22
237 0.21
238 0.21
239 0.18
240 0.17
241 0.17
242 0.13
243 0.11
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.13
255 0.15
256 0.22
257 0.22
258 0.21
259 0.23
260 0.28
261 0.32
262 0.35
263 0.39
264 0.41
265 0.45
266 0.48
267 0.53
268 0.54
269 0.59
270 0.57
271 0.57
272 0.54
273 0.56
274 0.63
275 0.64
276 0.62
277 0.53
278 0.5
279 0.48
280 0.5
281 0.46
282 0.4
283 0.38
284 0.41
285 0.47
286 0.52
287 0.55
288 0.53
289 0.5
290 0.47
291 0.44
292 0.4
293 0.38
294 0.32
295 0.25
296 0.22
297 0.21
298 0.2
299 0.17
300 0.14
301 0.1
302 0.08
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.13
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.13
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.15
321 0.17
322 0.17
323 0.12
324 0.15
325 0.16
326 0.17
327 0.2
328 0.23
329 0.24
330 0.29
331 0.33
332 0.3
333 0.3
334 0.29
335 0.26
336 0.25
337 0.21
338 0.15
339 0.11
340 0.13
341 0.12
342 0.12
343 0.13
344 0.11
345 0.12
346 0.12
347 0.12
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.08
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.11
364 0.1
365 0.11
366 0.1
367 0.14
368 0.2
369 0.22
370 0.23
371 0.29
372 0.32
373 0.37
374 0.4
375 0.39
376 0.37
377 0.37
378 0.42
379 0.43
380 0.44
381 0.43
382 0.5
383 0.53
384 0.48
385 0.46
386 0.44
387 0.38
388 0.37
389 0.38
390 0.31
391 0.27
392 0.27
393 0.26
394 0.24
395 0.23
396 0.22
397 0.15
398 0.12
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.08
408 0.07
409 0.08
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.12
414 0.17
415 0.21
416 0.24
417 0.23
418 0.24
419 0.29
420 0.29
421 0.28
422 0.23
423 0.18
424 0.18
425 0.22
426 0.24
427 0.19
428 0.22
429 0.23
430 0.28
431 0.36
432 0.4
433 0.38
434 0.43
435 0.49
436 0.52
437 0.58
438 0.61
439 0.61
440 0.64
441 0.69
442 0.69
443 0.65
444 0.65
445 0.59
446 0.56
447 0.49
448 0.46
449 0.46
450 0.43
451 0.51
452 0.54
453 0.56
454 0.56
455 0.63
456 0.68
457 0.7
458 0.73
459 0.72
460 0.71
461 0.79
462 0.81
463 0.8
464 0.8
465 0.8
466 0.8
467 0.73
468 0.67
469 0.65
470 0.61
471 0.55
472 0.49
473 0.42
474 0.37
475 0.35
476 0.34
477 0.29
478 0.26
479 0.26
480 0.23
481 0.22
482 0.19
483 0.22
484 0.22
485 0.21
486 0.22
487 0.23
488 0.32
489 0.32
490 0.4
491 0.41
492 0.43
493 0.45
494 0.48
495 0.53
496 0.51
497 0.56
498 0.58
499 0.64
500 0.7
501 0.72
502 0.76
503 0.72
504 0.71
505 0.69
506 0.6
507 0.6
508 0.57
509 0.58
510 0.51
511 0.47
512 0.43
513 0.41
514 0.42
515 0.34
516 0.31
517 0.25
518 0.29
519 0.27
520 0.25
521 0.2
522 0.19
523 0.17
524 0.13
525 0.12
526 0.08
527 0.1
528 0.11
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.13
533 0.13
534 0.12
535 0.1
536 0.1
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.11
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.11
546 0.12
547 0.14
548 0.15
549 0.16
550 0.16
551 0.17
552 0.18
553 0.17
554 0.13
555 0.14
556 0.14
557 0.14
558 0.13
559 0.13
560 0.12
561 0.11
562 0.11
563 0.08
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.1
568 0.11
569 0.13
570 0.13
571 0.13
572 0.14
573 0.14
574 0.14
575 0.11
576 0.17
577 0.15
578 0.18
579 0.23
580 0.22
581 0.21
582 0.21
583 0.22
584 0.18
585 0.21
586 0.2
587 0.23
588 0.26
589 0.29
590 0.32
591 0.33
592 0.31