Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y3NNF5

Protein Details
Accession A0A1Y3NNF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
62-85DDDYVSKKHKTKKQLYTFIKREISHydrophilic
381-400NIPIKLEKIRRTPKVQKYFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-410IRRTPKVQKYFGSGRKEPKKAP
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12.833, cyto 5.5, cyto_pero 3.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010736  SHIPPO-rpt  
Pfam View protein in Pfam  
PF07004  SHIPPO-rpt  
Amino Acid Sequences MSSKQINGDENNVKENEEVKLNHSFSKLSVKDIDDGSNYKSDDFNNKYTSVLDKYEDNDDDDDDYVSKKHKTKKQLYTFIKREISGYRTGMGEYIPTNHTLPLTNLAIPTPGPSDYQCNLGKSGYEYTMLGKAQEKINNIGPGPASVNTRLKEKYPYWTMGQKLNYPKNKFDNGVPGPYYSLPDIQFDGQKVTLKSRHYTKSEIQPSPSDYNCRKEKPDGPMYSFGRKYSKTIQDYPGVGEYYVLYDYLSTLKQSPKYSFHSKPGIGLFDKKAVENGNPGANKYDIKMKPSNIYASVKGKYKDDKGNGIPAPNNFEIPSSIQNQNNFTFTGKPLNEYEKKANEPGPVNYKPQYDEVLRKSKAKVKIPKTPGPSDYFKDLMNIPIKLEKIRRTPKVQKYFGSGRKEPKKAPPTPGPASYDNNKIIKYHSSPTYTMGKKLNDKNNTCHTEYDYNITEKPKEGIKFKGRMSNYVLTFPSNRVNTIKSKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.33
3 0.28
4 0.26
5 0.26
6 0.24
7 0.32
8 0.33
9 0.35
10 0.35
11 0.33
12 0.29
13 0.38
14 0.35
15 0.32
16 0.35
17 0.33
18 0.36
19 0.37
20 0.38
21 0.3
22 0.32
23 0.3
24 0.3
25 0.28
26 0.25
27 0.25
28 0.25
29 0.32
30 0.35
31 0.38
32 0.37
33 0.38
34 0.37
35 0.37
36 0.38
37 0.33
38 0.3
39 0.25
40 0.24
41 0.26
42 0.32
43 0.31
44 0.29
45 0.26
46 0.24
47 0.24
48 0.22
49 0.2
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.16
54 0.21
55 0.26
56 0.35
57 0.42
58 0.53
59 0.62
60 0.72
61 0.79
62 0.83
63 0.86
64 0.88
65 0.86
66 0.84
67 0.77
68 0.66
69 0.58
70 0.53
71 0.47
72 0.41
73 0.36
74 0.29
75 0.26
76 0.25
77 0.23
78 0.18
79 0.16
80 0.11
81 0.14
82 0.13
83 0.14
84 0.15
85 0.15
86 0.16
87 0.15
88 0.16
89 0.18
90 0.19
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.15
96 0.15
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.12
101 0.18
102 0.18
103 0.25
104 0.26
105 0.25
106 0.26
107 0.25
108 0.24
109 0.21
110 0.23
111 0.18
112 0.16
113 0.15
114 0.16
115 0.19
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.18
120 0.21
121 0.25
122 0.25
123 0.25
124 0.3
125 0.31
126 0.29
127 0.28
128 0.23
129 0.21
130 0.21
131 0.19
132 0.16
133 0.18
134 0.23
135 0.22
136 0.26
137 0.26
138 0.26
139 0.31
140 0.31
141 0.34
142 0.34
143 0.37
144 0.36
145 0.41
146 0.41
147 0.4
148 0.41
149 0.39
150 0.44
151 0.49
152 0.54
153 0.52
154 0.55
155 0.56
156 0.57
157 0.52
158 0.45
159 0.47
160 0.41
161 0.41
162 0.36
163 0.3
164 0.28
165 0.27
166 0.26
167 0.17
168 0.17
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.16
176 0.14
177 0.17
178 0.16
179 0.2
180 0.23
181 0.23
182 0.27
183 0.32
184 0.37
185 0.37
186 0.42
187 0.42
188 0.48
189 0.54
190 0.52
191 0.47
192 0.43
193 0.45
194 0.44
195 0.4
196 0.36
197 0.3
198 0.35
199 0.39
200 0.4
201 0.38
202 0.4
203 0.44
204 0.46
205 0.52
206 0.48
207 0.46
208 0.51
209 0.51
210 0.51
211 0.46
212 0.4
213 0.35
214 0.32
215 0.32
216 0.32
217 0.38
218 0.37
219 0.4
220 0.42
221 0.42
222 0.41
223 0.39
224 0.33
225 0.24
226 0.19
227 0.15
228 0.12
229 0.09
230 0.08
231 0.07
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.08
239 0.11
240 0.16
241 0.18
242 0.21
243 0.25
244 0.31
245 0.39
246 0.39
247 0.42
248 0.44
249 0.42
250 0.42
251 0.39
252 0.35
253 0.29
254 0.29
255 0.24
256 0.23
257 0.23
258 0.2
259 0.2
260 0.18
261 0.18
262 0.17
263 0.17
264 0.18
265 0.17
266 0.18
267 0.18
268 0.18
269 0.17
270 0.15
271 0.23
272 0.19
273 0.25
274 0.29
275 0.29
276 0.31
277 0.33
278 0.35
279 0.29
280 0.31
281 0.29
282 0.29
283 0.31
284 0.31
285 0.3
286 0.31
287 0.32
288 0.35
289 0.39
290 0.38
291 0.41
292 0.39
293 0.46
294 0.44
295 0.42
296 0.38
297 0.31
298 0.34
299 0.28
300 0.27
301 0.19
302 0.18
303 0.17
304 0.17
305 0.19
306 0.18
307 0.22
308 0.24
309 0.26
310 0.29
311 0.29
312 0.28
313 0.25
314 0.22
315 0.2
316 0.18
317 0.24
318 0.21
319 0.22
320 0.24
321 0.31
322 0.35
323 0.37
324 0.42
325 0.39
326 0.42
327 0.42
328 0.43
329 0.4
330 0.39
331 0.39
332 0.4
333 0.38
334 0.39
335 0.39
336 0.38
337 0.34
338 0.33
339 0.33
340 0.29
341 0.34
342 0.37
343 0.43
344 0.43
345 0.44
346 0.47
347 0.5
348 0.55
349 0.57
350 0.6
351 0.58
352 0.66
353 0.71
354 0.74
355 0.74
356 0.71
357 0.66
358 0.62
359 0.59
360 0.52
361 0.49
362 0.42
363 0.36
364 0.32
365 0.28
366 0.29
367 0.28
368 0.25
369 0.22
370 0.24
371 0.25
372 0.28
373 0.33
374 0.34
375 0.4
376 0.49
377 0.54
378 0.6
379 0.7
380 0.76
381 0.81
382 0.79
383 0.72
384 0.71
385 0.74
386 0.72
387 0.7
388 0.66
389 0.66
390 0.7
391 0.73
392 0.7
393 0.7
394 0.73
395 0.71
396 0.73
397 0.72
398 0.71
399 0.7
400 0.7
401 0.65
402 0.6
403 0.59
404 0.55
405 0.52
406 0.5
407 0.47
408 0.42
409 0.38
410 0.36
411 0.38
412 0.38
413 0.37
414 0.37
415 0.39
416 0.4
417 0.43
418 0.5
419 0.45
420 0.46
421 0.46
422 0.46
423 0.5
424 0.59
425 0.64
426 0.64
427 0.67
428 0.69
429 0.73
430 0.73
431 0.66
432 0.59
433 0.56
434 0.52
435 0.49
436 0.47
437 0.42
438 0.38
439 0.4
440 0.41
441 0.36
442 0.32
443 0.33
444 0.33
445 0.35
446 0.36
447 0.43
448 0.48
449 0.54
450 0.56
451 0.63
452 0.58
453 0.58
454 0.61
455 0.59
456 0.52
457 0.5
458 0.46
459 0.41
460 0.41
461 0.39
462 0.4
463 0.33
464 0.34
465 0.32
466 0.36