FuNGI

A0A1Y2V401

Protein Details

Accession

A0A1Y2V401

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
415-436	DQKEYIKKSTEQKKARQRDLMD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
461-470	GRNVNSRKRR

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039907 NOB1 IPR017117 Nob1_euk IPR036283 NOB1_Zf-like_sf IPR014881 NOB1_Zn-bd IPR033411 Ribonuclease_PIN
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0046872 F:metal ion binding GO:0004521 F:RNA endonuclease activity GO:0000469 P:cleavage involved in rRNA processing GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF08772 NOB1_Zn_bind PF17146 PIN_6
CDD	cd09876 PIN_Nob1-like

Amino Acid Sequences

MATTEPQKSAEVVSSETAQAETESAPSKPIHSLVVDTGPLVKNDPPISTLLAQAHELYTVPSVLTEIRDAATRARVETTLIPFLKLRNPRPESIKFVTDFARRTGDLEVLSKPDLHLIALTYELECERNGGDWRLRKMPGQKGLNGKTPAQQDKEHDATEQKDGEDVKGTKREEVVGDQDETEQVPSEVNTSEDTPKEDTEAQEEPTIRQETVTQALDSLSLEPSAPPTVDTPVDTTADTATSETNTPTQEEDEEDDDDGEGWITPSNLKKHQAKDQLSAPEQPIQKFLQVALLTSDFAMQNVLLRINLNLVSPSLARITRVKTWVQRCHGCFTITRNMSKQFCPNCGQGTLTRVSCSTDSSGNFTVHLKKNFQWNNRGNVYSVPKPVHGTASGKARGPGGGKNGWGRELIFAEDQKEYIKKSTEQKKARQRDLMDEDYLPSILTGDRSGGGSGRIKVGAGRNVNSRKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.21
3	0.21
4	0.19
5	0.15
6	0.13
7	0.12
8	0.11
9	0.12
10	0.13
11	0.13
12	0.16
13	0.16
14	0.18
15	0.19
16	0.2
17	0.2
18	0.19
19	0.21
20	0.22
21	0.25
22	0.23
23	0.2
24	0.24
25	0.22
26	0.21
27	0.21
28	0.2
29	0.23
30	0.24
31	0.25
32	0.21
33	0.22
34	0.25
35	0.24
36	0.26
37	0.22
38	0.22
39	0.22
40	0.21
41	0.19
42	0.16
43	0.15
44	0.12
45	0.11
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.08
50	0.09
51	0.1
52	0.1
53	0.1
54	0.1
55	0.12
56	0.13
57	0.15
58	0.2
59	0.19
60	0.2
61	0.21
62	0.2
63	0.21
64	0.25
65	0.27
66	0.29
67	0.29
68	0.29
69	0.28
70	0.3
71	0.35
72	0.38
73	0.41
74	0.43
75	0.48
76	0.51
77	0.58
78	0.61
79	0.62
80	0.58
81	0.57
82	0.47
83	0.45
84	0.46
85	0.43
86	0.39
87	0.33
88	0.32
89	0.27
90	0.28
91	0.27
92	0.23
93	0.2
94	0.2
95	0.19
96	0.18
97	0.18
98	0.17
99	0.15
100	0.15
101	0.14
102	0.12
103	0.11
104	0.09
105	0.09
106	0.1
107	0.1
108	0.07
109	0.08
110	0.08
111	0.09
112	0.08
113	0.08
114	0.07
115	0.1
116	0.12
117	0.15
118	0.2
119	0.25
120	0.3
121	0.34
122	0.35
123	0.37
124	0.43
125	0.48
126	0.52
127	0.5
128	0.51
129	0.55
130	0.58
131	0.61
132	0.56
133	0.49
134	0.45
135	0.47
136	0.48
137	0.42
138	0.41
139	0.37
140	0.42
141	0.44
142	0.39
143	0.33
144	0.31
145	0.29
146	0.3
147	0.27
148	0.19
149	0.18
150	0.18
151	0.18
152	0.21
153	0.2
154	0.2
155	0.25
156	0.26
157	0.25
158	0.25
159	0.26
160	0.21
161	0.23
162	0.23
163	0.19
164	0.19
165	0.18
166	0.17
167	0.16
168	0.15
169	0.13
170	0.08
171	0.06
172	0.06
173	0.05
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.09
179	0.12
180	0.12
181	0.14
182	0.14
183	0.14
184	0.16
185	0.16
186	0.15
187	0.16
188	0.17
189	0.16
190	0.18
191	0.18
192	0.16
193	0.2
194	0.2
195	0.16
196	0.15
197	0.15
198	0.14
199	0.17
200	0.17
201	0.13
202	0.11
203	0.12
204	0.12
205	0.11
206	0.1
207	0.06
208	0.05
209	0.06
210	0.05
211	0.06
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.07
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.1
220	0.1
221	0.11
222	0.1
223	0.1
224	0.08
225	0.08
226	0.08
227	0.07
228	0.06
229	0.06
230	0.06
231	0.07
232	0.08
233	0.08
234	0.09
235	0.09
236	0.09
237	0.09
238	0.1
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.11
243	0.1
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.06
248	0.04
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.06
253	0.1
254	0.14
255	0.17
256	0.23
257	0.29
258	0.33
259	0.42
260	0.5
261	0.49
262	0.5
263	0.52
264	0.52
265	0.48
266	0.46
267	0.39
268	0.35
269	0.34
270	0.3
271	0.28
272	0.22
273	0.21
274	0.19
275	0.18
276	0.18
277	0.15
278	0.15
279	0.14
280	0.14
281	0.13
282	0.13
283	0.14
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.06
288	0.07
289	0.08
290	0.08
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.09
295	0.09
296	0.08
297	0.07
298	0.07
299	0.08
300	0.08
301	0.09
302	0.1
303	0.1
304	0.11
305	0.14
306	0.18
307	0.22
308	0.25
309	0.29
310	0.35
311	0.44
312	0.5
313	0.54
314	0.58
315	0.56
316	0.58
317	0.55
318	0.49
319	0.42
320	0.39
321	0.42
322	0.38
323	0.38
324	0.36
325	0.41
326	0.42
327	0.43
328	0.46
329	0.39
330	0.41
331	0.42
332	0.42
333	0.38
334	0.36
335	0.35
336	0.29
337	0.29
338	0.29
339	0.25
340	0.23
341	0.2
342	0.22
343	0.2
344	0.2
345	0.18
346	0.18
347	0.19
348	0.23
349	0.26
350	0.24
351	0.24
352	0.24
353	0.31
354	0.34
355	0.37
356	0.35
357	0.35
358	0.45
359	0.53
360	0.56
361	0.58
362	0.58
363	0.62
364	0.63
365	0.61
366	0.52
367	0.5
368	0.5
369	0.45
370	0.44
371	0.38
372	0.35
373	0.37
374	0.37
375	0.34
376	0.31
377	0.29
378	0.28
379	0.34
380	0.35
381	0.34
382	0.34
383	0.31
384	0.3
385	0.29
386	0.29
387	0.26
388	0.26
389	0.28
390	0.33
391	0.33
392	0.32
393	0.31
394	0.27
395	0.24
396	0.23
397	0.23
398	0.21
399	0.21
400	0.22
401	0.21
402	0.21
403	0.21
404	0.22
405	0.21
406	0.22
407	0.26
408	0.29
409	0.38
410	0.48
411	0.56
412	0.62
413	0.7
414	0.77
415	0.83
416	0.85
417	0.84
418	0.77
419	0.77
420	0.76
421	0.71
422	0.63
423	0.54
424	0.47
425	0.39
426	0.36
427	0.25
428	0.17
429	0.12
430	0.1
431	0.11
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.12
436	0.12
437	0.12
438	0.16
439	0.19
440	0.21
441	0.22
442	0.22
443	0.21
444	0.25
445	0.31
446	0.35
447	0.35
448	0.37
449	0.44
450	0.54

A0A1Y2V401

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer