FuNGI

A0A1Y2V8C7

Protein Details

Accession

A0A1Y2V8C7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
372-391	KNGFNDRRGRHDHRGRGRGR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
377-401	DRRGRHDHRGRGRGRGNNRGRGGDR

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 8, pero 2, mito 1, extr 1, cysk 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045180 La_dom_prot IPR006630 La_HTH IPR002344 Lupus_La IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:1990904 C:ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF05383 La
PROSITE	View protein in PROSITE PS50961 HTH_LA
CDD	cd08029 LA_like_fungal cd12291 RRM1_La

Amino Acid Sequences

MSDQDTKPVEGVEVAVENPEANTIESNTTTDDVAVTRQETVEAEVEQNTESKDSAQDAAQDAAQDAAQNGDHDAPSADGKETTDAPEAPKDELEEIRKERTNKKWPSVKNLPKDLLRVNRKGCPDREKSDPSVLPDSDDPKAIRWQVEFYFSDSNLPKDKFLWDKTGGPKNKPVPLSLICSFSRMRRFKPYSAVVEALKTSKLLVVEGAEGEETVRRKEPCKPSKDIERQIEERTTYIKGFGEETKTSQFDIEEFLFQYGEVNAVRLRRDDQGEEKVFKGSVLVEWADLPTAWKFETLEPRPRWKDHPLIIMPKFIYDLQSKEEEREKSFRGHNNYGHSQRGKSGRGSHQSRDNRRGSDAGDWKQRREDDQKNGFNDRRGRHDHRGRGRGRGNNRGRGGDRAQHGNGEQKPVSHENGKPQIHTSKEGQKIIDEDAKRNAEAKANGKRARDDDGGADSPPAKKVDNKEAVVA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.11
4	0.1
5	0.1
6	0.11
7	0.09
8	0.09
9	0.1
10	0.11
11	0.14
12	0.15
13	0.16
14	0.16
15	0.17
16	0.16
17	0.15
18	0.14
19	0.12
20	0.13
21	0.14
22	0.13
23	0.13
24	0.13
25	0.14
26	0.13
27	0.16
28	0.16
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.16
33	0.16
34	0.16
35	0.14
36	0.13
37	0.12
38	0.12
39	0.13
40	0.14
41	0.16
42	0.15
43	0.17
44	0.18
45	0.19
46	0.19
47	0.17
48	0.15
49	0.14
50	0.13
51	0.1
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.09
57	0.11
58	0.1
59	0.11
60	0.11
61	0.11
62	0.12
63	0.13
64	0.12
65	0.11
66	0.12
67	0.14
68	0.14
69	0.16
70	0.18
71	0.17
72	0.19
73	0.23
74	0.24
75	0.23
76	0.22
77	0.21
78	0.2
79	0.24
80	0.26
81	0.28
82	0.29
83	0.34
84	0.39
85	0.42
86	0.48
87	0.54
88	0.6
89	0.62
90	0.68
91	0.71
92	0.72
93	0.77
94	0.79
95	0.79
96	0.77
97	0.77
98	0.72
99	0.65
100	0.65
101	0.62
102	0.61
103	0.59
104	0.58
105	0.54
106	0.55
107	0.59
108	0.62
109	0.61
110	0.6
111	0.59
112	0.56
113	0.6
114	0.6
115	0.57
116	0.59
117	0.54
118	0.5
119	0.48
120	0.44
121	0.38
122	0.35
123	0.33
124	0.26
125	0.27
126	0.23
127	0.19
128	0.24
129	0.24
130	0.24
131	0.21
132	0.24
133	0.22
134	0.27
135	0.25
136	0.24
137	0.25
138	0.23
139	0.28
140	0.25
141	0.26
142	0.27
143	0.27
144	0.24
145	0.22
146	0.27
147	0.27
148	0.29
149	0.32
150	0.29
151	0.35
152	0.42
153	0.5
154	0.5
155	0.47
156	0.52
157	0.51
158	0.53
159	0.48
160	0.42
161	0.38
162	0.36
163	0.4
164	0.33
165	0.33
166	0.27
167	0.29
168	0.29
169	0.27
170	0.35
171	0.32
172	0.34
173	0.4
174	0.45
175	0.45
176	0.52
177	0.53
178	0.47
179	0.47
180	0.45
181	0.35
182	0.31
183	0.29
184	0.22
185	0.17
186	0.12
187	0.09
188	0.09
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.05
197	0.05
198	0.05
199	0.07
200	0.07
201	0.08
202	0.11
203	0.12
204	0.14
205	0.23
206	0.34
207	0.41
208	0.46
209	0.5
210	0.51
211	0.61
212	0.69
213	0.68
214	0.63
215	0.6
216	0.56
217	0.54
218	0.51
219	0.41
220	0.32
221	0.26
222	0.21
223	0.15
224	0.14
225	0.12
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.15
230	0.14
231	0.16
232	0.18
233	0.18
234	0.17
235	0.16
236	0.14
237	0.1
238	0.12
239	0.11
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.06
247	0.07
248	0.06
249	0.06
250	0.07
251	0.09
252	0.1
253	0.1
254	0.12
255	0.14
256	0.16
257	0.18
258	0.21
259	0.29
260	0.31
261	0.32
262	0.3
263	0.28
264	0.26
265	0.23
266	0.19
267	0.11
268	0.08
269	0.09
270	0.08
271	0.07
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.07
276	0.08
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.12
283	0.22
284	0.26
285	0.36
286	0.38
287	0.48
288	0.52
289	0.54
290	0.55
291	0.51
292	0.54
293	0.49
294	0.54
295	0.5
296	0.54
297	0.52
298	0.51
299	0.44
300	0.36
301	0.33
302	0.25
303	0.23
304	0.17
305	0.17
306	0.16
307	0.22
308	0.22
309	0.23
310	0.29
311	0.29
312	0.31
313	0.34
314	0.33
315	0.33
316	0.4
317	0.44
318	0.46
319	0.5
320	0.5
321	0.52
322	0.58
323	0.56
324	0.57
325	0.53
326	0.45
327	0.44
328	0.47
329	0.42
330	0.39
331	0.44
332	0.45
333	0.52
334	0.57
335	0.56
336	0.59
337	0.66
338	0.7
339	0.71
340	0.68
341	0.61
342	0.58
343	0.55
344	0.47
345	0.47
346	0.46
347	0.43
348	0.49
349	0.48
350	0.48
351	0.52
352	0.52
353	0.49
354	0.5
355	0.53
356	0.53
357	0.61
358	0.66
359	0.64
360	0.71
361	0.67
362	0.65
363	0.64
364	0.57
365	0.55
366	0.57
367	0.6
368	0.63
369	0.7
370	0.73
371	0.75
372	0.81
373	0.76
374	0.76
375	0.76
376	0.74
377	0.73
378	0.74
379	0.72
380	0.71
381	0.72
382	0.69
383	0.63
384	0.61
385	0.58
386	0.54
387	0.5
388	0.47
389	0.45
390	0.41
391	0.4
392	0.42
393	0.39
394	0.39
395	0.35
396	0.3
397	0.35
398	0.36
399	0.39
400	0.37
401	0.38
402	0.41
403	0.5
404	0.51
405	0.46
406	0.48
407	0.5
408	0.48
409	0.49
410	0.46
411	0.46
412	0.52
413	0.54
414	0.49
415	0.45
416	0.43
417	0.44
418	0.45
419	0.38
420	0.34
421	0.38
422	0.4
423	0.38
424	0.38
425	0.35
426	0.34
427	0.38
428	0.43
429	0.45
430	0.53
431	0.57
432	0.59
433	0.62
434	0.58
435	0.59
436	0.53
437	0.45
438	0.39
439	0.41
440	0.39
441	0.33
442	0.32
443	0.28
444	0.26
445	0.28
446	0.26
447	0.21
448	0.26
449	0.33
450	0.42
451	0.49

A0A1Y2V8C7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer