Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H8ZED0

Protein Details
Accession H8ZED0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44MQSASLKERRRPKKIISKKKISLYKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-38KERRRPKKIISKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045877  ZFP36-like  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003729  F:mRNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MEKKELVNIQVNPCDYEEMQSASLKERRRPKKIISKKKISLYKTEICKSFENSNFCTYGDKCQFAHSLNELRDIERHPRYKTELCKTYTTTGECTYGKRCCFIHTGPSEDAHTDLQDARNMPGDWKIPGMHCPEINMCEIAEDEELKNIRSLLSTEELEKIKTLAVFKVKPSQTQSTRHASTHLNIPPSIYVGPRHSTSNVWVKPYFCFVFVDSTFKVTEKIALGKSPGSVSLLKDYGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.29
3 0.27
4 0.24
5 0.21
6 0.22
7 0.22
8 0.22
9 0.25
10 0.29
11 0.31
12 0.36
13 0.44
14 0.53
15 0.59
16 0.66
17 0.7
18 0.76
19 0.82
20 0.86
21 0.86
22 0.87
23 0.86
24 0.88
25 0.86
26 0.78
27 0.76
28 0.72
29 0.7
30 0.67
31 0.65
32 0.6
33 0.55
34 0.54
35 0.5
36 0.51
37 0.49
38 0.46
39 0.43
40 0.43
41 0.4
42 0.37
43 0.37
44 0.29
45 0.33
46 0.31
47 0.31
48 0.28
49 0.3
50 0.32
51 0.3
52 0.32
53 0.27
54 0.29
55 0.27
56 0.33
57 0.3
58 0.28
59 0.29
60 0.28
61 0.32
62 0.33
63 0.37
64 0.33
65 0.36
66 0.42
67 0.46
68 0.52
69 0.53
70 0.53
71 0.52
72 0.53
73 0.53
74 0.5
75 0.47
76 0.4
77 0.33
78 0.27
79 0.27
80 0.25
81 0.24
82 0.25
83 0.26
84 0.25
85 0.25
86 0.24
87 0.23
88 0.27
89 0.26
90 0.29
91 0.26
92 0.31
93 0.29
94 0.29
95 0.27
96 0.23
97 0.23
98 0.15
99 0.13
100 0.09
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.14
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.11
115 0.14
116 0.18
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.18
123 0.15
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.06
131 0.09
132 0.1
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.12
141 0.12
142 0.13
143 0.17
144 0.17
145 0.17
146 0.17
147 0.14
148 0.12
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.19
153 0.2
154 0.22
155 0.31
156 0.31
157 0.34
158 0.38
159 0.44
160 0.43
161 0.49
162 0.52
163 0.51
164 0.53
165 0.49
166 0.47
167 0.4
168 0.37
169 0.38
170 0.37
171 0.31
172 0.28
173 0.28
174 0.26
175 0.25
176 0.24
177 0.17
178 0.17
179 0.18
180 0.21
181 0.22
182 0.24
183 0.24
184 0.24
185 0.29
186 0.36
187 0.35
188 0.36
189 0.37
190 0.35
191 0.36
192 0.41
193 0.36
194 0.27
195 0.26
196 0.22
197 0.27
198 0.27
199 0.3
200 0.24
201 0.25
202 0.25
203 0.24
204 0.24
205 0.17
206 0.2
207 0.18
208 0.23
209 0.23
210 0.24
211 0.26
212 0.26
213 0.27
214 0.24
215 0.22
216 0.19
217 0.19
218 0.2
219 0.24