Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VHC4

Protein Details
Accession A0A1Y2VHC4    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
57-85ALRFQPHPQIRRPQPKTQKPKASFPKAPPHydrophilic
120-147YGTGEKRARGGRRKKKKKTEEIPAETDWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-137KRARGGRRKKKKK
363-366RKKK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MRMAAQQPPRTGLSLYANLLEPEGDSAASISRAPVVSQEALEAVKEQEAGRKHIDSALRFQPHPQIRRPQPKTQKPKASFPKAPPAPANASNVPGIAAAQAPPKSRLADWAPTEEDEYMYGTGEKRARGGRRKKKKKTEEIPAETDWDEIYDPSRPTNVDEYLRSDERIREVREWKDLLYKHRRRDDERRGSWSSEEDDSRPAQNQFAPPDSYSFAPPPPSPPRASLPDDKTGDDAYARRLAMSQGTVPPPPREPIPPPPPPPSAAPGPESATISRAPVRYTQPEPPSEPSAPPDPDAMDEDEDDYVPPESTNEETPETRTNRPGQKGFAARLMAKYGWSKGQGLGAESSGILQPLRVQVEKRKKKSDAEGGGWAEPGGRGRIIGSKTGTGTQSESSGGKFGPMSNIVVLRNMLEGMEDLQGEIESGLGQEIGEECGEKYGRVERLYIDIEGRQVYIKFTDQVSALRAVNALDGRIFAGNTIQPQFYDVDKFEQKIYE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.3
4 0.29
5 0.27
6 0.26
7 0.21
8 0.15
9 0.12
10 0.11
11 0.09
12 0.08
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.09
17 0.08
18 0.11
19 0.11
20 0.11
21 0.13
22 0.17
23 0.18
24 0.18
25 0.18
26 0.16
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.11
31 0.1
32 0.12
33 0.12
34 0.16
35 0.19
36 0.23
37 0.26
38 0.27
39 0.27
40 0.31
41 0.36
42 0.33
43 0.37
44 0.42
45 0.42
46 0.41
47 0.42
48 0.47
49 0.5
50 0.54
51 0.55
52 0.56
53 0.62
54 0.73
55 0.78
56 0.79
57 0.81
58 0.86
59 0.89
60 0.89
61 0.89
62 0.83
63 0.87
64 0.87
65 0.86
66 0.83
67 0.78
68 0.79
69 0.72
70 0.71
71 0.63
72 0.58
73 0.54
74 0.5
75 0.49
76 0.39
77 0.38
78 0.33
79 0.31
80 0.25
81 0.19
82 0.15
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.12
87 0.15
88 0.17
89 0.19
90 0.21
91 0.22
92 0.22
93 0.27
94 0.28
95 0.33
96 0.33
97 0.36
98 0.35
99 0.34
100 0.35
101 0.29
102 0.24
103 0.17
104 0.16
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.14
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.25
114 0.33
115 0.43
116 0.53
117 0.59
118 0.68
119 0.79
120 0.86
121 0.91
122 0.93
123 0.94
124 0.93
125 0.93
126 0.92
127 0.88
128 0.83
129 0.72
130 0.65
131 0.54
132 0.44
133 0.33
134 0.22
135 0.15
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.14
142 0.13
143 0.16
144 0.2
145 0.22
146 0.21
147 0.22
148 0.26
149 0.3
150 0.31
151 0.29
152 0.27
153 0.25
154 0.28
155 0.32
156 0.3
157 0.31
158 0.36
159 0.38
160 0.41
161 0.41
162 0.36
163 0.37
164 0.37
165 0.4
166 0.46
167 0.5
168 0.53
169 0.6
170 0.65
171 0.65
172 0.73
173 0.75
174 0.75
175 0.72
176 0.71
177 0.67
178 0.63
179 0.56
180 0.47
181 0.39
182 0.31
183 0.27
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.2
189 0.18
190 0.16
191 0.18
192 0.2
193 0.2
194 0.21
195 0.22
196 0.19
197 0.21
198 0.2
199 0.19
200 0.17
201 0.16
202 0.14
203 0.16
204 0.15
205 0.2
206 0.25
207 0.27
208 0.27
209 0.29
210 0.32
211 0.35
212 0.39
213 0.4
214 0.38
215 0.42
216 0.42
217 0.39
218 0.36
219 0.31
220 0.26
221 0.2
222 0.17
223 0.12
224 0.14
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.14
235 0.15
236 0.16
237 0.17
238 0.17
239 0.17
240 0.17
241 0.21
242 0.29
243 0.35
244 0.4
245 0.43
246 0.47
247 0.47
248 0.46
249 0.43
250 0.37
251 0.32
252 0.27
253 0.24
254 0.21
255 0.21
256 0.2
257 0.2
258 0.16
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.13
265 0.16
266 0.2
267 0.23
268 0.27
269 0.32
270 0.33
271 0.35
272 0.38
273 0.37
274 0.38
275 0.35
276 0.32
277 0.28
278 0.29
279 0.27
280 0.25
281 0.22
282 0.17
283 0.17
284 0.18
285 0.17
286 0.12
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.07
298 0.08
299 0.1
300 0.12
301 0.13
302 0.14
303 0.17
304 0.24
305 0.26
306 0.27
307 0.3
308 0.36
309 0.4
310 0.46
311 0.46
312 0.42
313 0.45
314 0.47
315 0.44
316 0.41
317 0.36
318 0.31
319 0.29
320 0.29
321 0.22
322 0.2
323 0.2
324 0.18
325 0.18
326 0.19
327 0.19
328 0.17
329 0.2
330 0.19
331 0.18
332 0.17
333 0.15
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.08
338 0.08
339 0.06
340 0.05
341 0.07
342 0.1
343 0.13
344 0.14
345 0.16
346 0.26
347 0.38
348 0.48
349 0.54
350 0.59
351 0.61
352 0.66
353 0.72
354 0.73
355 0.69
356 0.63
357 0.62
358 0.56
359 0.51
360 0.45
361 0.36
362 0.26
363 0.19
364 0.16
365 0.11
366 0.08
367 0.08
368 0.09
369 0.15
370 0.16
371 0.19
372 0.2
373 0.21
374 0.22
375 0.25
376 0.25
377 0.2
378 0.21
379 0.18
380 0.17
381 0.17
382 0.16
383 0.14
384 0.15
385 0.13
386 0.12
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.15
391 0.16
392 0.16
393 0.19
394 0.18
395 0.19
396 0.18
397 0.15
398 0.13
399 0.12
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.08
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.07
411 0.05
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.06
420 0.06
421 0.07
422 0.07
423 0.11
424 0.12
425 0.11
426 0.13
427 0.19
428 0.24
429 0.24
430 0.26
431 0.23
432 0.28
433 0.31
434 0.3
435 0.25
436 0.22
437 0.23
438 0.22
439 0.21
440 0.18
441 0.16
442 0.17
443 0.17
444 0.19
445 0.19
446 0.19
447 0.21
448 0.2
449 0.21
450 0.22
451 0.24
452 0.22
453 0.2
454 0.19
455 0.17
456 0.2
457 0.19
458 0.16
459 0.12
460 0.12
461 0.13
462 0.14
463 0.13
464 0.1
465 0.13
466 0.14
467 0.18
468 0.21
469 0.2
470 0.19
471 0.21
472 0.22
473 0.21
474 0.24
475 0.21
476 0.26
477 0.3
478 0.32