Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VH53

Protein Details
Accession A0A1Y2VH53    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
133-180EDKARSARPERSSRKRSRSPEREDGTDSRHRRRERYRSRDRRDKAYDDBasic
337-356QERIRRKDTRPWSKVRQFTCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
136-174ARSARPERSSRKRSRSPEREDGTDSRHRRRERYRSRDRR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 10, cyto 8, mito 3, golg 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR003029  S1_domain  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00575  S1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50126  S1  
CDD cd21691  GH2-like_DHX8  
Amino Acid Sequences MDDDFAELELLSLVSKVTSELQNHLGISEKTLAEFIIAKRLECSNFSEFKSKLAELGGASWPESLIESIDRLVRTMHPKFKAEKEAATEDHHKGRTLEEKETLFKGLSIPDKEFNGGDGDDIDETLALLEGLEDKARSARPERSSRKRSRSPEREDGTDSRHRRRERYRSRDRRDKAYDDDDEYMNGRREHKSRRDERDEYRSYRNGQRERRRKYDDEDNDNRMLRNPPQPEVDDSPILYKVYDGHVTGIREFGAFVNLHGVKGKVDGMVHISNLAQGQRDVDQETGMDLAPQARIQSGANNWSRSCSVTAIPSRLAAATLRKFDKPYAWVSSATQQERIRRKDTRPWSKVRQFTCTRAQHCSESRPNGSSTTRWFSLRRSTCIARRASNPSGSLMLLPRSSRLHLTTSSASARRLRESSRCTTSTRRKTTGDSALSAKLVGLVVAVAPGVNLGRLMFPLKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.1
5 0.16
6 0.18
7 0.22
8 0.26
9 0.28
10 0.28
11 0.27
12 0.28
13 0.23
14 0.24
15 0.25
16 0.21
17 0.19
18 0.19
19 0.19
20 0.15
21 0.19
22 0.17
23 0.21
24 0.21
25 0.21
26 0.23
27 0.27
28 0.28
29 0.26
30 0.31
31 0.29
32 0.33
33 0.36
34 0.41
35 0.38
36 0.39
37 0.42
38 0.36
39 0.31
40 0.27
41 0.26
42 0.19
43 0.22
44 0.22
45 0.18
46 0.18
47 0.16
48 0.15
49 0.13
50 0.13
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.09
55 0.1
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.15
60 0.19
61 0.26
62 0.33
63 0.4
64 0.41
65 0.47
66 0.52
67 0.57
68 0.61
69 0.55
70 0.51
71 0.49
72 0.5
73 0.47
74 0.47
75 0.46
76 0.41
77 0.45
78 0.42
79 0.37
80 0.32
81 0.34
82 0.38
83 0.36
84 0.36
85 0.35
86 0.36
87 0.37
88 0.38
89 0.35
90 0.26
91 0.23
92 0.2
93 0.19
94 0.23
95 0.23
96 0.24
97 0.26
98 0.27
99 0.27
100 0.26
101 0.22
102 0.18
103 0.15
104 0.13
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.09
109 0.08
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.09
123 0.1
124 0.13
125 0.17
126 0.24
127 0.32
128 0.42
129 0.52
130 0.6
131 0.69
132 0.76
133 0.82
134 0.83
135 0.85
136 0.86
137 0.86
138 0.85
139 0.84
140 0.78
141 0.72
142 0.68
143 0.61
144 0.56
145 0.55
146 0.51
147 0.49
148 0.53
149 0.53
150 0.56
151 0.64
152 0.68
153 0.71
154 0.76
155 0.8
156 0.83
157 0.9
158 0.92
159 0.86
160 0.84
161 0.8
162 0.74
163 0.69
164 0.64
165 0.57
166 0.5
167 0.48
168 0.38
169 0.31
170 0.27
171 0.24
172 0.2
173 0.19
174 0.19
175 0.2
176 0.25
177 0.34
178 0.42
179 0.49
180 0.55
181 0.63
182 0.69
183 0.71
184 0.73
185 0.74
186 0.71
187 0.65
188 0.62
189 0.56
190 0.52
191 0.52
192 0.55
193 0.53
194 0.57
195 0.63
196 0.67
197 0.71
198 0.76
199 0.76
200 0.71
201 0.68
202 0.68
203 0.66
204 0.65
205 0.63
206 0.59
207 0.54
208 0.52
209 0.46
210 0.37
211 0.32
212 0.26
213 0.28
214 0.26
215 0.25
216 0.27
217 0.28
218 0.29
219 0.3
220 0.29
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.18
225 0.17
226 0.13
227 0.09
228 0.07
229 0.09
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.08
241 0.08
242 0.07
243 0.07
244 0.13
245 0.13
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.12
251 0.12
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.11
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.07
283 0.07
284 0.1
285 0.11
286 0.19
287 0.22
288 0.24
289 0.24
290 0.25
291 0.26
292 0.24
293 0.24
294 0.18
295 0.15
296 0.2
297 0.23
298 0.23
299 0.23
300 0.22
301 0.21
302 0.19
303 0.18
304 0.13
305 0.17
306 0.18
307 0.23
308 0.26
309 0.27
310 0.28
311 0.29
312 0.32
313 0.29
314 0.3
315 0.31
316 0.3
317 0.3
318 0.3
319 0.35
320 0.38
321 0.36
322 0.37
323 0.35
324 0.41
325 0.49
326 0.53
327 0.53
328 0.53
329 0.57
330 0.61
331 0.69
332 0.72
333 0.71
334 0.74
335 0.78
336 0.79
337 0.81
338 0.75
339 0.73
340 0.67
341 0.65
342 0.67
343 0.64
344 0.59
345 0.58
346 0.58
347 0.56
348 0.55
349 0.58
350 0.56
351 0.55
352 0.55
353 0.51
354 0.49
355 0.46
356 0.44
357 0.39
358 0.37
359 0.37
360 0.35
361 0.36
362 0.36
363 0.36
364 0.44
365 0.47
366 0.45
367 0.46
368 0.5
369 0.53
370 0.59
371 0.6
372 0.54
373 0.54
374 0.57
375 0.56
376 0.54
377 0.49
378 0.43
379 0.4
380 0.35
381 0.31
382 0.25
383 0.23
384 0.21
385 0.2
386 0.21
387 0.22
388 0.23
389 0.25
390 0.25
391 0.26
392 0.26
393 0.31
394 0.3
395 0.32
396 0.36
397 0.35
398 0.36
399 0.38
400 0.39
401 0.4
402 0.41
403 0.42
404 0.45
405 0.5
406 0.54
407 0.56
408 0.56
409 0.55
410 0.62
411 0.67
412 0.69
413 0.71
414 0.69
415 0.64
416 0.68
417 0.72
418 0.71
419 0.64
420 0.57
421 0.52
422 0.48
423 0.45
424 0.38
425 0.29
426 0.21
427 0.16
428 0.13
429 0.09
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.04
435 0.04
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.06
441 0.07
442 0.08