Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VDF7

Protein Details
Accession A0A1Y2VDF7    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-73HCRTLSTTPSYKKKSKKNRMEGETFETHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
575-638ERKARGPPAPEPGNNQGGGSRGGGGGRGGGRGGGRGGGGRGGRGGRGGSRGGNRGGGRGKGRGG
Subcellular Location(s) mito 19, cyto 3, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004843  Calcineurin-like_PHP_ApaH  
IPR007708  DBR1_C  
IPR041816  Dbr1_N  
IPR029052  Metallo-depent_PP-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0008419  F:RNA lariat debranching enzyme activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05011  DBR1  
PF00149  Metallophos  
CDD cd00844  MPP_Dbr1_N  
Amino Acid Sequences MRTPKSVLILAGRCTLQRSSTTSVFATIGAKAPSYLNPIIFATTPLHCRTLSTTPSYKKKSKKNRMEGETFETDGVRVAIEGCGHGTLDAIYSSVAAACKRRKWDRVDLLIIGGDFQAARNAADLSVMAVPQKYRQLGDFPAYYRGDKKAPYLTIFIAGNHEASSHLWELYYGGWVAPNIYYLGAANVLRFGPLRIAGMSGIWKGYDYRKPHYERLPFSRDDVKSFYHVREIDVRKLLLLREQVDIGLSHDWPRAIEKHGDSNELWRMKPDFRRESLDGTLGNPAAAYVMDRLRPAYWFSAHLHCKYTAIKTYEAPSSAEAGQPSMATIAASALSVMPAEAAANPDEIDLDMEDDGDAQPSANPNNEEANAAPPTNDATTSGGVSDELRAQLPASFARPTPNEPELNPGQPVPPTITNTTTRFLALDKCLPKRKFFQLCYCTPVDPAQITAYPPSSNKKHRYRLQYDPEWLAITRVFAPYLSIGDPTAETPPDLGEEAYRPMIDGERAWVEENIVRPGKLDVPMKFTITAPPHRPGDPQTVNYQPDEYTNPQTVAFCELVGVPNLWDASPEERAERKARGPPAPEPGNNQGGGSRGGGGGRGGGRGGGRGGGGRGGRGGRGGSRGGNRGGGRGKGRGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.31
3 0.26
4 0.26
5 0.29
6 0.32
7 0.33
8 0.36
9 0.33
10 0.34
11 0.31
12 0.28
13 0.24
14 0.18
15 0.19
16 0.17
17 0.17
18 0.15
19 0.17
20 0.18
21 0.23
22 0.24
23 0.21
24 0.22
25 0.23
26 0.24
27 0.22
28 0.22
29 0.18
30 0.19
31 0.23
32 0.24
33 0.26
34 0.23
35 0.25
36 0.29
37 0.33
38 0.35
39 0.37
40 0.43
41 0.5
42 0.6
43 0.66
44 0.69
45 0.71
46 0.77
47 0.81
48 0.84
49 0.86
50 0.88
51 0.9
52 0.9
53 0.88
54 0.83
55 0.79
56 0.72
57 0.62
58 0.51
59 0.41
60 0.32
61 0.25
62 0.2
63 0.12
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.17
85 0.23
86 0.28
87 0.38
88 0.46
89 0.52
90 0.59
91 0.68
92 0.7
93 0.73
94 0.72
95 0.64
96 0.56
97 0.5
98 0.42
99 0.31
100 0.21
101 0.13
102 0.08
103 0.07
104 0.08
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.13
119 0.18
120 0.17
121 0.18
122 0.19
123 0.23
124 0.25
125 0.29
126 0.29
127 0.25
128 0.3
129 0.31
130 0.31
131 0.3
132 0.3
133 0.29
134 0.28
135 0.3
136 0.31
137 0.32
138 0.33
139 0.33
140 0.3
141 0.3
142 0.29
143 0.25
144 0.21
145 0.19
146 0.17
147 0.14
148 0.13
149 0.1
150 0.1
151 0.13
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.11
159 0.07
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.08
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.09
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.14
193 0.2
194 0.23
195 0.29
196 0.37
197 0.43
198 0.49
199 0.56
200 0.58
201 0.58
202 0.62
203 0.61
204 0.54
205 0.52
206 0.55
207 0.47
208 0.42
209 0.38
210 0.32
211 0.31
212 0.32
213 0.29
214 0.27
215 0.26
216 0.25
217 0.31
218 0.33
219 0.34
220 0.34
221 0.33
222 0.28
223 0.29
224 0.27
225 0.21
226 0.21
227 0.18
228 0.16
229 0.16
230 0.16
231 0.15
232 0.15
233 0.12
234 0.1
235 0.09
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.12
241 0.13
242 0.14
243 0.18
244 0.18
245 0.25
246 0.26
247 0.28
248 0.26
249 0.28
250 0.32
251 0.29
252 0.28
253 0.22
254 0.24
255 0.27
256 0.33
257 0.38
258 0.37
259 0.38
260 0.44
261 0.44
262 0.45
263 0.41
264 0.37
265 0.28
266 0.23
267 0.23
268 0.16
269 0.14
270 0.1
271 0.08
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.12
284 0.12
285 0.13
286 0.16
287 0.23
288 0.26
289 0.26
290 0.27
291 0.25
292 0.26
293 0.25
294 0.25
295 0.23
296 0.22
297 0.22
298 0.21
299 0.23
300 0.23
301 0.22
302 0.2
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.02
326 0.03
327 0.03
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.06
348 0.07
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.12
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.11
360 0.1
361 0.11
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.09
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.15
385 0.17
386 0.18
387 0.23
388 0.26
389 0.26
390 0.25
391 0.31
392 0.29
393 0.29
394 0.27
395 0.22
396 0.19
397 0.17
398 0.18
399 0.16
400 0.15
401 0.17
402 0.18
403 0.22
404 0.25
405 0.27
406 0.28
407 0.24
408 0.22
409 0.19
410 0.18
411 0.19
412 0.17
413 0.22
414 0.26
415 0.32
416 0.41
417 0.43
418 0.46
419 0.48
420 0.55
421 0.57
422 0.57
423 0.61
424 0.59
425 0.6
426 0.61
427 0.57
428 0.47
429 0.39
430 0.36
431 0.28
432 0.21
433 0.19
434 0.16
435 0.15
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.14
440 0.16
441 0.21
442 0.26
443 0.35
444 0.44
445 0.52
446 0.6
447 0.67
448 0.76
449 0.76
450 0.79
451 0.8
452 0.77
453 0.72
454 0.64
455 0.58
456 0.49
457 0.42
458 0.32
459 0.23
460 0.18
461 0.14
462 0.13
463 0.11
464 0.1
465 0.11
466 0.1
467 0.12
468 0.11
469 0.1
470 0.09
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.12
475 0.1
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.1
480 0.1
481 0.09
482 0.08
483 0.1
484 0.12
485 0.13
486 0.12
487 0.11
488 0.11
489 0.13
490 0.12
491 0.11
492 0.12
493 0.13
494 0.15
495 0.16
496 0.15
497 0.15
498 0.17
499 0.18
500 0.22
501 0.21
502 0.2
503 0.19
504 0.21
505 0.23
506 0.26
507 0.3
508 0.25
509 0.31
510 0.33
511 0.34
512 0.33
513 0.3
514 0.32
515 0.32
516 0.38
517 0.36
518 0.4
519 0.41
520 0.42
521 0.44
522 0.41
523 0.46
524 0.44
525 0.42
526 0.42
527 0.45
528 0.46
529 0.44
530 0.41
531 0.31
532 0.28
533 0.31
534 0.3
535 0.28
536 0.29
537 0.29
538 0.28
539 0.29
540 0.27
541 0.25
542 0.21
543 0.15
544 0.14
545 0.13
546 0.14
547 0.14
548 0.14
549 0.09
550 0.11
551 0.11
552 0.1
553 0.11
554 0.12
555 0.14
556 0.18
557 0.19
558 0.22
559 0.24
560 0.3
561 0.34
562 0.36
563 0.39
564 0.43
565 0.49
566 0.52
567 0.54
568 0.55
569 0.6
570 0.63
571 0.59
572 0.58
573 0.56
574 0.54
575 0.49
576 0.43
577 0.34
578 0.29
579 0.28
580 0.22
581 0.17
582 0.13
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.14
587 0.13
588 0.13
589 0.12
590 0.13
591 0.13
592 0.14
593 0.14
594 0.11
595 0.11
596 0.12
597 0.13
598 0.16
599 0.16
600 0.15
601 0.18
602 0.19
603 0.19
604 0.19
605 0.21
606 0.19
607 0.22
608 0.24
609 0.26
610 0.31
611 0.35
612 0.35
613 0.4
614 0.38
615 0.41
616 0.43
617 0.44
618 0.42