Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VDT4

Protein Details
Accession A0A1Y2VDT4    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-82SPEPRTDADGPRRRKKRNRWGDASENKAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-72KRGRSPEPRTDADGPRRRKKRNR
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045071  BBP-like  
IPR004087  KH_dom  
IPR004088  KH_dom_type_1  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR032570  SF1-HH  
IPR047086  SF1-HH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0045131  F:pre-mRNA branch point binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00013  KH_1  
PF16275  SF1-HH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50084  KH_TYPE_1  
CDD cd02395  KH-I_BBP  
Amino Acid Sequences MSWRNQGITGSNNIPLGKTRRFGAEGEDAPVHRENGSDGYSASNGDRDLKRGRSPEPRTDADGPRRRKKRNRWGDASENKAAGLMGLPTAIVANMTSEQLEAYTLHLRIEEISQKLRINDVVPADGDRSPSPPPQYDNHGRRVNTREYRYRKRLEDERHKLVEKAMKTIPNYHPPQDYRRPTKTQEKVYVPVNDYPEINFIGLLIGPRGNTLKKMESESGAKIAIRGKGSVKEGKGRSDAAHASNQEEDLHCLIMADTEEKVNKAKKLIHNVIETVSFPQDFVILNTC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.29
3 0.32
4 0.31
5 0.31
6 0.31
7 0.34
8 0.36
9 0.36
10 0.35
11 0.37
12 0.34
13 0.35
14 0.36
15 0.3
16 0.32
17 0.33
18 0.27
19 0.19
20 0.18
21 0.16
22 0.17
23 0.19
24 0.16
25 0.14
26 0.16
27 0.16
28 0.17
29 0.15
30 0.13
31 0.12
32 0.18
33 0.19
34 0.21
35 0.27
36 0.31
37 0.37
38 0.39
39 0.45
40 0.49
41 0.55
42 0.61
43 0.61
44 0.59
45 0.6
46 0.63
47 0.64
48 0.64
49 0.66
50 0.65
51 0.69
52 0.75
53 0.78
54 0.82
55 0.85
56 0.86
57 0.88
58 0.89
59 0.88
60 0.86
61 0.87
62 0.84
63 0.8
64 0.72
65 0.6
66 0.5
67 0.41
68 0.33
69 0.22
70 0.14
71 0.08
72 0.05
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.05
89 0.07
90 0.1
91 0.1
92 0.1
93 0.1
94 0.1
95 0.1
96 0.13
97 0.14
98 0.13
99 0.15
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.15
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.12
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.15
118 0.17
119 0.17
120 0.2
121 0.2
122 0.27
123 0.35
124 0.37
125 0.43
126 0.45
127 0.44
128 0.46
129 0.49
130 0.5
131 0.47
132 0.49
133 0.5
134 0.53
135 0.62
136 0.65
137 0.66
138 0.6
139 0.6
140 0.63
141 0.64
142 0.67
143 0.65
144 0.65
145 0.63
146 0.6
147 0.54
148 0.49
149 0.44
150 0.34
151 0.3
152 0.26
153 0.26
154 0.26
155 0.33
156 0.34
157 0.38
158 0.4
159 0.38
160 0.41
161 0.4
162 0.46
163 0.49
164 0.53
165 0.52
166 0.55
167 0.58
168 0.58
169 0.66
170 0.67
171 0.65
172 0.65
173 0.61
174 0.58
175 0.59
176 0.58
177 0.5
178 0.46
179 0.41
180 0.33
181 0.29
182 0.26
183 0.23
184 0.18
185 0.15
186 0.11
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.16
199 0.19
200 0.21
201 0.26
202 0.27
203 0.28
204 0.3
205 0.29
206 0.28
207 0.24
208 0.22
209 0.19
210 0.21
211 0.22
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.24
216 0.29
217 0.33
218 0.33
219 0.37
220 0.39
221 0.42
222 0.42
223 0.39
224 0.36
225 0.35
226 0.36
227 0.31
228 0.34
229 0.3
230 0.3
231 0.29
232 0.28
233 0.24
234 0.22
235 0.22
236 0.17
237 0.16
238 0.14
239 0.13
240 0.12
241 0.11
242 0.11
243 0.1
244 0.09
245 0.12
246 0.13
247 0.14
248 0.2
249 0.24
250 0.26
251 0.3
252 0.38
253 0.43
254 0.52
255 0.6
256 0.61
257 0.6
258 0.59
259 0.55
260 0.49
261 0.42
262 0.34
263 0.28
264 0.21
265 0.17
266 0.16
267 0.15
268 0.14