FuNGI

A0A1Y2VDM5

Protein Details

Accession

A0A1Y2VDM5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
57-83	PADTGKARSSKKSKKGPTVQPAPNHEN	Hydrophilic
132-152	LSNFKPSKSNYQRRKDGRIVL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
63-71	ARSSKKSKK

Subcellular Location(s)

mito 13.5, cyto_mito 11, cyto 7.5, nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045116 Clp1/Grc3 IPR032319 CLP1_P IPR027417 P-loop_NTPase
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0051731 F:polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase activity GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF16575 CLP1_P

Amino Acid Sequences

MATNKRRKLNISEPPQAMSAFALRKKLLSQETTTATPTSTAIDTADEVHTVSPSPGPADTGKARSSKKSKKGPTVQPAPNHENDASADVKDSPPTEANNAYDSPSASARSTSPPTSDDEVSVKQAKVLPIQLSNFKPSKSNYQRRKDGRIVLKLFDGDRLVILGSYDLRVTAGEITINGATLRSSDKIHWVDAPYCHALPVVRCSDSATIELLSRQKSDGLRSLERLSPLFRKLWNESNAASDAKYTPSDSSFQILYTSTDGPKKTVLQDLVSPPEWNREVAKLVNSSSSKPSSFMITGPKSSGKSTFGKILTNRLITDQLSDSKSRANRGVAVLDFDPGQPEYCVAGQIALVLLTEPVFSPSFSRPLPGPGIPMIRSHALASISPASDPELYVEAALDLMTHYRNTLARYPLIINTPGWIQGTGLDLLTSLITALRPTEVIYMSESGPAEAVEALQDSCKHTVFSTLPSQASQLTSRTAAHFRSMQTMSYFHAETRSGEADGYLIQWNPKPLTTVPPWQVGYKGPNRGVFGIMCYDYQAPLDLLADAINGTILAVVAVESAKAFRQSSERAELLNDAAADAMDIDGNEDEPASSSFSSLGKKIISTTPEGIPFIDTANVTTLDPKYSHSLGLVLIRGIDVENGVLQVLTPLSAEAIEDVTSKGGEIVLVSGKFDTPSWAYTEELYYRAHDEVDDEADLDESMDDDDDDLNVENDVFAEAVDATQIPWIEVLHGNQKRGAGSKVWRVRRDLGRTGN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.6
3	0.51
4	0.4
5	0.32
6	0.29
7	0.26
8	0.27
9	0.3
10	0.29
11	0.3
12	0.32
13	0.38
14	0.39
15	0.38
16	0.4
17	0.41
18	0.45
19	0.46
20	0.45
21	0.38
22	0.31
23	0.27
24	0.23
25	0.19
26	0.15
27	0.13
28	0.12
29	0.13
30	0.13
31	0.15
32	0.15
33	0.12
34	0.12
35	0.12
36	0.12
37	0.11
38	0.12
39	0.11
40	0.1
41	0.12
42	0.12
43	0.14
44	0.15
45	0.2
46	0.24
47	0.27
48	0.31
49	0.36
50	0.4
51	0.47
52	0.56
53	0.6
54	0.66
55	0.72
56	0.77
57	0.81
58	0.88
59	0.89
60	0.89
61	0.89
62	0.86
63	0.83
64	0.82
65	0.77
66	0.7
67	0.64
68	0.53
69	0.45
70	0.39
71	0.34
72	0.27
73	0.21
74	0.19
75	0.16
76	0.17
77	0.18
78	0.17
79	0.17
80	0.19
81	0.21
82	0.23
83	0.25
84	0.26
85	0.27
86	0.26
87	0.25
88	0.24
89	0.22
90	0.21
91	0.19
92	0.19
93	0.16
94	0.17
95	0.17
96	0.22
97	0.26
98	0.26
99	0.26
100	0.25
101	0.3
102	0.33
103	0.32
104	0.28
105	0.28
106	0.28
107	0.31
108	0.34
109	0.28
110	0.26
111	0.29
112	0.28
113	0.28
114	0.31
115	0.29
116	0.29
117	0.32
118	0.36
119	0.35
120	0.4
121	0.38
122	0.34
123	0.36
124	0.34
125	0.43
126	0.47
127	0.55
128	0.59
129	0.67
130	0.76
131	0.79
132	0.85
133	0.81
134	0.8
135	0.78
136	0.78
137	0.71
138	0.62
139	0.58
140	0.51
141	0.43
142	0.36
143	0.28
144	0.18
145	0.15
146	0.13
147	0.11
148	0.09
149	0.08
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.07
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.06
161	0.06
162	0.08
163	0.08
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.07
169	0.1
170	0.09
171	0.11
172	0.12
173	0.2
174	0.22
175	0.23
176	0.26
177	0.26
178	0.28
179	0.28
180	0.32
181	0.27
182	0.25
183	0.24
184	0.22
185	0.2
186	0.18
187	0.22
188	0.21
189	0.19
190	0.19
191	0.21
192	0.22
193	0.22
194	0.21
195	0.16
196	0.13
197	0.13
198	0.16
199	0.17
200	0.16
201	0.16
202	0.15
203	0.18
204	0.19
205	0.22
206	0.27
207	0.3
208	0.31
209	0.33
210	0.36
211	0.35
212	0.35
213	0.32
214	0.29
215	0.27
216	0.27
217	0.27
218	0.26
219	0.29
220	0.31
221	0.39
222	0.39
223	0.37
224	0.35
225	0.35
226	0.35
227	0.3
228	0.25
229	0.18
230	0.16
231	0.15
232	0.15
233	0.13
234	0.12
235	0.13
236	0.15
237	0.15
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.13
242	0.13
243	0.12
244	0.13
245	0.14
246	0.14
247	0.17
248	0.17
249	0.18
250	0.19
251	0.2
252	0.2
253	0.23
254	0.23
255	0.21
256	0.24
257	0.26
258	0.28
259	0.27
260	0.25
261	0.2
262	0.24
263	0.23
264	0.2
265	0.18
266	0.16
267	0.17
268	0.18
269	0.21
270	0.17
271	0.17
272	0.21
273	0.21
274	0.22
275	0.23
276	0.24
277	0.22
278	0.21
279	0.21
280	0.19
281	0.18
282	0.18
283	0.22
284	0.22
285	0.22
286	0.23
287	0.25
288	0.23
289	0.24
290	0.24
291	0.2
292	0.21
293	0.22
294	0.26
295	0.25
296	0.28
297	0.27
298	0.32
299	0.32
300	0.3
301	0.29
302	0.24
303	0.24
304	0.2
305	0.21
306	0.16
307	0.16
308	0.16
309	0.17
310	0.16
311	0.19
312	0.2
313	0.21
314	0.22
315	0.2
316	0.21
317	0.21
318	0.24
319	0.19
320	0.2
321	0.17
322	0.15
323	0.14
324	0.11
325	0.11
326	0.08
327	0.09
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.06
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.05
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.08
349	0.09
350	0.13
351	0.12
352	0.14
353	0.12
354	0.15
355	0.18
356	0.15
357	0.16
358	0.15
359	0.17
360	0.16
361	0.17
362	0.15
363	0.13
364	0.14
365	0.12
366	0.12
367	0.1
368	0.1
369	0.11
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.07
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.03
387	0.03
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.06
392	0.07
393	0.1
394	0.14
395	0.16
396	0.16
397	0.18
398	0.19
399	0.19
400	0.2
401	0.19
402	0.14
403	0.13
404	0.13
405	0.12
406	0.11
407	0.09
408	0.07
409	0.07
410	0.09
411	0.08
412	0.08
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.03
419	0.03
420	0.03
421	0.03
422	0.04
423	0.04
424	0.04
425	0.05
426	0.07
427	0.07
428	0.08
429	0.09
430	0.1
431	0.1
432	0.12
433	0.11
434	0.09
435	0.09
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.04
443	0.05
444	0.06
445	0.08
446	0.09
447	0.1
448	0.1
449	0.1
450	0.14
451	0.14
452	0.17
453	0.21
454	0.22
455	0.22
456	0.22
457	0.23
458	0.19
459	0.2
460	0.18
461	0.14
462	0.12
463	0.13
464	0.14
465	0.16
466	0.18
467	0.17
468	0.18
469	0.2
470	0.19
471	0.24
472	0.24
473	0.22
474	0.21
475	0.21
476	0.2
477	0.2
478	0.19
479	0.13
480	0.15
481	0.14
482	0.14
483	0.17
484	0.16
485	0.14
486	0.13
487	0.13
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.09
492	0.08
493	0.09
494	0.1
495	0.13
496	0.14
497	0.14
498	0.15
499	0.15
500	0.21
501	0.24
502	0.31
503	0.31
504	0.35
505	0.36
506	0.34
507	0.34
508	0.31
509	0.34
510	0.32
511	0.36
512	0.34
513	0.36
514	0.37
515	0.37
516	0.36
517	0.29
518	0.24
519	0.2
520	0.17
521	0.14
522	0.14
523	0.13
524	0.12
525	0.12
526	0.11
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.06
531	0.06
532	0.06
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.02
542	0.02
543	0.02
544	0.03
545	0.03
546	0.03
547	0.03
548	0.04
549	0.05
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.14
554	0.18
555	0.23
556	0.28
557	0.28
558	0.26
559	0.27
560	0.27
561	0.23
562	0.2
563	0.15
564	0.09
565	0.09
566	0.08
567	0.07
568	0.06
569	0.05
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.05
574	0.05
575	0.05
576	0.05
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.09
581	0.09
582	0.08
583	0.1
584	0.13
585	0.15
586	0.14
587	0.16
588	0.15
589	0.15
590	0.18
591	0.2
592	0.21
593	0.23
594	0.26
595	0.26
596	0.28
597	0.28
598	0.26
599	0.22
600	0.2
601	0.17
602	0.15
603	0.12
604	0.1
605	0.12
606	0.13
607	0.12
608	0.15
609	0.15
610	0.15
611	0.16
612	0.17
613	0.2
614	0.2
615	0.21
616	0.18
617	0.18
618	0.17
619	0.2
620	0.18
621	0.13
622	0.12
623	0.11
624	0.11
625	0.1
626	0.09
627	0.06
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.05
637	0.05
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.05
643	0.06
644	0.06
645	0.07
646	0.07
647	0.08
648	0.08
649	0.08
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.06
654	0.07
655	0.11
656	0.11
657	0.12
658	0.12
659	0.13
660	0.13
661	0.13
662	0.16
663	0.13
664	0.15
665	0.18
666	0.19
667	0.19
668	0.2
669	0.23
670	0.21
671	0.21
672	0.21
673	0.19
674	0.2
675	0.2
676	0.19
677	0.15
678	0.15
679	0.15
680	0.17
681	0.15
682	0.13
683	0.13
684	0.13
685	0.12
686	0.11
687	0.08
688	0.06
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.07
696	0.08
697	0.07
698	0.07
699	0.07
700	0.07
701	0.07
702	0.07
703	0.06
704	0.05
705	0.06
706	0.05
707	0.05
708	0.06
709	0.06
710	0.06
711	0.08
712	0.09
713	0.08
714	0.08
715	0.09
716	0.11
717	0.14
718	0.17
719	0.26
720	0.3
721	0.31
722	0.33
723	0.35
724	0.34
725	0.35
726	0.35
727	0.32
728	0.35
729	0.44
730	0.51
731	0.59
732	0.61
733	0.63
734	0.69
735	0.72
736	0.73

A0A1Y2VDM5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer