Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2V8X0

Protein Details
Accession A0A1Y2V8X0    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-61LSLPEPPSKKAKRLLKKGKPLPVKPKSDDHydrophilic
305-330EQGEKEKKFKTRKWWVNRLKGRELKIBasic
349-368PAGGRKTQGKKDPRGHKADVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
39-58PSKKAKRLLKKGKPLPVKPK
74-84GAGKGGKGEKK
311-326KKFKTRKWWVNRLKGR
339-373RYKKRFGKDAPAGGRKTQGKKDPRGHKADVGGGDR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATAVVTEVEQQNPMANDSRKRKSQIEEIEVDLSLPEPPSKKAKRLLKKGKPLPVKPKSDDEAESEDELPVPKGAGKGGKGEKKSQRSEYGIWIGNLPFTLTRVELFKWLVESSGGAIKEENITRVNMPTSKDRRRGEGPEAPKQNKGFAYVDFDGEPATVAALALTETELDGRKVLIKNSNSFEGRPKKENPADSASGANATPTGVRSGGAAATEDKPASRKIYVGNLSFQTDEDDLRAQFDKCGEIEWVKVATFEDSGKCKGFGWIKFKESEAASSAVKGFVKIKEEIETEDDFRDGNDEADEQGEKEKKFKTRKWWVNRLKGRELKIELAEDDHVRYKKRFGKDAPAGGRKTQGKKDPRGHKADVGGGDRRNENKPAFGEKTEGGSKPGYGDAATASYLTGAVVKPQGKKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.25
3 0.28
4 0.36
5 0.44
6 0.53
7 0.56
8 0.61
9 0.65
10 0.64
11 0.68
12 0.69
13 0.68
14 0.63
15 0.58
16 0.54
17 0.48
18 0.41
19 0.31
20 0.21
21 0.15
22 0.13
23 0.13
24 0.13
25 0.17
26 0.27
27 0.33
28 0.4
29 0.48
30 0.57
31 0.64
32 0.74
33 0.82
34 0.82
35 0.88
36 0.89
37 0.9
38 0.9
39 0.88
40 0.88
41 0.86
42 0.85
43 0.78
44 0.77
45 0.71
46 0.65
47 0.58
48 0.52
49 0.48
50 0.42
51 0.39
52 0.32
53 0.29
54 0.25
55 0.23
56 0.19
57 0.13
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.13
62 0.16
63 0.17
64 0.24
65 0.32
66 0.39
67 0.41
68 0.5
69 0.56
70 0.61
71 0.67
72 0.65
73 0.63
74 0.62
75 0.62
76 0.59
77 0.57
78 0.51
79 0.44
80 0.4
81 0.33
82 0.27
83 0.24
84 0.18
85 0.12
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.14
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.15
107 0.15
108 0.16
109 0.13
110 0.14
111 0.15
112 0.17
113 0.19
114 0.17
115 0.19
116 0.27
117 0.35
118 0.43
119 0.51
120 0.51
121 0.54
122 0.57
123 0.6
124 0.58
125 0.58
126 0.55
127 0.55
128 0.62
129 0.58
130 0.57
131 0.52
132 0.49
133 0.41
134 0.39
135 0.31
136 0.24
137 0.29
138 0.25
139 0.25
140 0.21
141 0.2
142 0.16
143 0.14
144 0.13
145 0.06
146 0.05
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.1
162 0.11
163 0.14
164 0.2
165 0.22
166 0.26
167 0.28
168 0.33
169 0.3
170 0.3
171 0.36
172 0.38
173 0.4
174 0.4
175 0.41
176 0.44
177 0.48
178 0.5
179 0.46
180 0.42
181 0.4
182 0.36
183 0.34
184 0.25
185 0.21
186 0.18
187 0.13
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.11
210 0.13
211 0.2
212 0.24
213 0.24
214 0.25
215 0.24
216 0.25
217 0.24
218 0.22
219 0.17
220 0.13
221 0.12
222 0.1
223 0.11
224 0.09
225 0.11
226 0.13
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.11
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.16
249 0.15
250 0.2
251 0.24
252 0.27
253 0.32
254 0.34
255 0.36
256 0.37
257 0.37
258 0.36
259 0.3
260 0.26
261 0.22
262 0.19
263 0.16
264 0.16
265 0.16
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.14
270 0.14
271 0.17
272 0.18
273 0.19
274 0.2
275 0.21
276 0.22
277 0.23
278 0.23
279 0.21
280 0.2
281 0.19
282 0.15
283 0.14
284 0.14
285 0.1
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.08
293 0.14
294 0.18
295 0.18
296 0.22
297 0.27
298 0.34
299 0.44
300 0.5
301 0.55
302 0.61
303 0.72
304 0.78
305 0.84
306 0.85
307 0.87
308 0.89
309 0.86
310 0.85
311 0.81
312 0.75
313 0.72
314 0.65
315 0.58
316 0.52
317 0.46
318 0.36
319 0.32
320 0.3
321 0.23
322 0.22
323 0.24
324 0.24
325 0.26
326 0.27
327 0.33
328 0.39
329 0.45
330 0.51
331 0.5
332 0.58
333 0.63
334 0.71
335 0.72
336 0.72
337 0.68
338 0.61
339 0.63
340 0.6
341 0.59
342 0.57
343 0.57
344 0.59
345 0.67
346 0.75
347 0.78
348 0.79
349 0.8
350 0.76
351 0.72
352 0.67
353 0.63
354 0.58
355 0.53
356 0.49
357 0.44
358 0.43
359 0.42
360 0.42
361 0.41
362 0.42
363 0.38
364 0.38
365 0.4
366 0.44
367 0.44
368 0.42
369 0.42
370 0.37
371 0.41
372 0.4
373 0.37
374 0.31
375 0.28
376 0.27
377 0.25
378 0.25
379 0.19
380 0.15
381 0.14
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.11
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.07
392 0.1
393 0.17
394 0.22
395 0.26
396 0.34
397 0.42