Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VJC0

Protein Details
Accession A0A1Y2VJC0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-64ARARSGLLRSSRRRFRNRRRERGLLRDAARBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-60RSGLLRSSRRRFRNRRRERGLLR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Amino Acid Sequences MVKIPMQPLVRVRQRVQREALPIVSEDRYNEAGSARARSGLLRSSRRRFRNRRRERGLLRDAARPAGLPSQHPPPQSESLAQQLLRYASSIQPSEEDDVLQSDGNRSLLLDENTLVVRGRMDGLQNLFNDLLSILDAEGGVVFLIQFDHPIPALSDCANYGQRGHCLGDYLTTWSLSGDVNGCYLCNSIDHTIDDCPEHPNVQDSTRYEYEVVRRSGRPPLRSRRGWNELAVRMEQDAPGPINRQRMIMVQRQQFVGWDYRRPSTEQEHLLLIDPATENLEAIRVLEDQGYRSLRRPSLSGEYEETTSSDESTESYEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.65
3 0.65
4 0.61
5 0.59
6 0.57
7 0.54
8 0.46
9 0.39
10 0.35
11 0.31
12 0.26
13 0.21
14 0.21
15 0.21
16 0.2
17 0.2
18 0.17
19 0.19
20 0.21
21 0.23
22 0.19
23 0.19
24 0.19
25 0.2
26 0.22
27 0.25
28 0.31
29 0.37
30 0.46
31 0.54
32 0.63
33 0.72
34 0.8
35 0.84
36 0.87
37 0.89
38 0.91
39 0.92
40 0.92
41 0.92
42 0.9
43 0.89
44 0.86
45 0.83
46 0.74
47 0.69
48 0.62
49 0.53
50 0.45
51 0.35
52 0.28
53 0.25
54 0.23
55 0.19
56 0.21
57 0.28
58 0.32
59 0.33
60 0.33
61 0.33
62 0.37
63 0.36
64 0.35
65 0.29
66 0.3
67 0.32
68 0.3
69 0.25
70 0.22
71 0.21
72 0.19
73 0.17
74 0.14
75 0.13
76 0.16
77 0.17
78 0.15
79 0.15
80 0.17
81 0.19
82 0.17
83 0.15
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.1
103 0.07
104 0.06
105 0.06
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.1
110 0.12
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.15
115 0.13
116 0.13
117 0.1
118 0.08
119 0.05
120 0.05
121 0.03
122 0.03
123 0.03
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.05
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.12
151 0.13
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.19
191 0.18
192 0.24
193 0.24
194 0.25
195 0.23
196 0.24
197 0.28
198 0.3
199 0.32
200 0.29
201 0.3
202 0.31
203 0.39
204 0.43
205 0.44
206 0.47
207 0.55
208 0.6
209 0.65
210 0.7
211 0.7
212 0.71
213 0.66
214 0.62
215 0.59
216 0.54
217 0.5
218 0.44
219 0.35
220 0.29
221 0.27
222 0.22
223 0.15
224 0.13
225 0.12
226 0.13
227 0.15
228 0.17
229 0.23
230 0.24
231 0.24
232 0.24
233 0.28
234 0.32
235 0.37
236 0.42
237 0.41
238 0.42
239 0.42
240 0.41
241 0.36
242 0.34
243 0.34
244 0.29
245 0.3
246 0.31
247 0.34
248 0.35
249 0.37
250 0.39
251 0.37
252 0.42
253 0.39
254 0.38
255 0.36
256 0.35
257 0.34
258 0.29
259 0.22
260 0.17
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.19
277 0.23
278 0.23
279 0.27
280 0.34
281 0.35
282 0.36
283 0.37
284 0.37
285 0.42
286 0.44
287 0.44
288 0.41
289 0.4
290 0.39
291 0.37
292 0.31
293 0.25
294 0.22
295 0.18
296 0.14
297 0.11
298 0.11