Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2VG51

Protein Details
Accession A0A1Y2VG51    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-28AAVPPPPTPKIKRPPPPGIQTNGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
397-408AEPPPKPKARKR
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 10.5, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPVVAAVPPPPTPKIKRPPPPGIQTNGVSSSQSSPSPNMSAKRPPPAVAKQQQQQTSNSTTMNGANGNTHRPGPARSRRDTSNHGSGRNQRNNASLRSATLAPDISLHQSFEPRPEMVTDAYILKKYAGQPPSLIVHLHPTHFRFDQQDSVFPYKSPMKLFLDHVRSRTIPHEILHDLNDSGVTFYEGCLIVQLHDHKTPAQSKDVARPASKSSSEKPSSIHNYNPYITPSPYVPFPKDSAENGLTGGDEKPVENDSGDKENMPAPPAPGDGQKSKTPPKAKVFTVVLHPTPQSLYMDLMIKALTPRGSGDAKSGADSSAVPPTPMSAVPPTPGATSMPPPAKKQKREKMELDGSNIYVAEAQILLATSAPLHLEPCKTKEDVITLLEKMADPKHAEPPPKPKARKRTVAERAADEALAAEQEKYMLTYDERRSANNGSAQASADTADSNGQSGATAFEPRFERFKVLADIKSQHAAKKEQEKIRQAENERKLQLQKQEQAALLQQRQQAEQEKLRREEAQRQAQMRQQQQEAQRRAMAQQQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAQAAQSPQNTPMNQMPQSSHGHPAQNGLPNGVMSAQAAHRFPQQVSQPPVSSPVVRQNTPQNMSSPMVGNAPMQQTNSGMGGSPPRSSSVAQAHGPMSAPMAVSMSARGSQQSHPSNTPRMPSATPQMPHGTPINRPMATPRMTQASPPPGMIAQNSHMGQMMMSNQNMAQVMPNQMIAAHIAQQQRQQQQLQAMQNANMMNRPNPQMHNPMLQQQLMRQQMMNMQNPNVMSAAQQAQLAQRYQQQLNSMQQQQMQGQMPNQQMGGQNFMNVTNGMNQAQIAAMQQMQHQMQQQGQLQGNQPNALAIQVRTRQQQIYRQNIPQFAERFGGLQNIPPELHDQFKQTCFKRAQESVQREIIQRRQMAAQNMQNGMQNGMGNGMPNGMQGAMQNGMNGINMMQQGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.55
3 0.64
4 0.71
5 0.77
6 0.84
7 0.85
8 0.87
9 0.84
10 0.79
11 0.75
12 0.67
13 0.62
14 0.55
15 0.46
16 0.37
17 0.32
18 0.3
19 0.26
20 0.26
21 0.25
22 0.23
23 0.27
24 0.31
25 0.35
26 0.35
27 0.38
28 0.45
29 0.49
30 0.56
31 0.55
32 0.54
33 0.57
34 0.61
35 0.66
36 0.65
37 0.68
38 0.65
39 0.7
40 0.73
41 0.68
42 0.63
43 0.58
44 0.55
45 0.49
46 0.43
47 0.36
48 0.31
49 0.29
50 0.28
51 0.23
52 0.18
53 0.21
54 0.23
55 0.26
56 0.26
57 0.26
58 0.26
59 0.27
60 0.32
61 0.36
62 0.45
63 0.48
64 0.53
65 0.58
66 0.61
67 0.66
68 0.69
69 0.66
70 0.66
71 0.63
72 0.6
73 0.62
74 0.65
75 0.69
76 0.71
77 0.67
78 0.59
79 0.61
80 0.63
81 0.59
82 0.56
83 0.46
84 0.38
85 0.38
86 0.36
87 0.3
88 0.27
89 0.24
90 0.18
91 0.18
92 0.18
93 0.18
94 0.18
95 0.18
96 0.17
97 0.21
98 0.22
99 0.25
100 0.27
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.25
105 0.21
106 0.21
107 0.18
108 0.18
109 0.19
110 0.2
111 0.18
112 0.17
113 0.19
114 0.22
115 0.29
116 0.28
117 0.27
118 0.27
119 0.3
120 0.33
121 0.3
122 0.27
123 0.19
124 0.25
125 0.25
126 0.27
127 0.29
128 0.27
129 0.31
130 0.32
131 0.34
132 0.3
133 0.31
134 0.37
135 0.34
136 0.38
137 0.39
138 0.43
139 0.41
140 0.36
141 0.38
142 0.36
143 0.37
144 0.35
145 0.34
146 0.33
147 0.36
148 0.41
149 0.45
150 0.48
151 0.48
152 0.47
153 0.46
154 0.42
155 0.42
156 0.4
157 0.37
158 0.3
159 0.28
160 0.31
161 0.29
162 0.3
163 0.3
164 0.27
165 0.21
166 0.18
167 0.18
168 0.13
169 0.11
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.1
179 0.09
180 0.14
181 0.18
182 0.18
183 0.2
184 0.21
185 0.21
186 0.27
187 0.34
188 0.32
189 0.33
190 0.35
191 0.36
192 0.44
193 0.5
194 0.48
195 0.43
196 0.43
197 0.42
198 0.43
199 0.45
200 0.4
201 0.38
202 0.44
203 0.45
204 0.44
205 0.4
206 0.43
207 0.47
208 0.46
209 0.46
210 0.42
211 0.43
212 0.44
213 0.44
214 0.39
215 0.35
216 0.32
217 0.28
218 0.24
219 0.21
220 0.25
221 0.27
222 0.25
223 0.25
224 0.26
225 0.28
226 0.3
227 0.29
228 0.31
229 0.28
230 0.26
231 0.23
232 0.21
233 0.17
234 0.16
235 0.14
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.1
243 0.11
244 0.13
245 0.17
246 0.17
247 0.16
248 0.16
249 0.18
250 0.19
251 0.2
252 0.17
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.2
259 0.22
260 0.25
261 0.28
262 0.33
263 0.39
264 0.46
265 0.48
266 0.53
267 0.57
268 0.59
269 0.56
270 0.58
271 0.53
272 0.47
273 0.48
274 0.44
275 0.37
276 0.33
277 0.32
278 0.25
279 0.22
280 0.22
281 0.16
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.09
293 0.08
294 0.08
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.15
299 0.18
300 0.18
301 0.18
302 0.18
303 0.14
304 0.13
305 0.13
306 0.12
307 0.14
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.13
314 0.13
315 0.1
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.14
320 0.12
321 0.13
322 0.12
323 0.12
324 0.13
325 0.18
326 0.23
327 0.24
328 0.28
329 0.38
330 0.46
331 0.54
332 0.62
333 0.65
334 0.68
335 0.74
336 0.74
337 0.73
338 0.73
339 0.66
340 0.6
341 0.52
342 0.43
343 0.36
344 0.31
345 0.22
346 0.13
347 0.1
348 0.06
349 0.04
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.03
355 0.04
356 0.03
357 0.03
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.06
362 0.1
363 0.12
364 0.15
365 0.18
366 0.18
367 0.18
368 0.19
369 0.2
370 0.19
371 0.19
372 0.18
373 0.16
374 0.16
375 0.15
376 0.14
377 0.13
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.13
382 0.21
383 0.24
384 0.28
385 0.31
386 0.4
387 0.47
388 0.54
389 0.59
390 0.59
391 0.66
392 0.71
393 0.77
394 0.72
395 0.74
396 0.74
397 0.74
398 0.69
399 0.6
400 0.55
401 0.45
402 0.4
403 0.28
404 0.19
405 0.11
406 0.09
407 0.07
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.06
416 0.13
417 0.15
418 0.22
419 0.22
420 0.22
421 0.25
422 0.26
423 0.28
424 0.25
425 0.25
426 0.19
427 0.2
428 0.19
429 0.17
430 0.15
431 0.12
432 0.09
433 0.07
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.04
441 0.04
442 0.05
443 0.05
444 0.07
445 0.07
446 0.1
447 0.12
448 0.13
449 0.16
450 0.15
451 0.18
452 0.17
453 0.19
454 0.21
455 0.22
456 0.23
457 0.23
458 0.25
459 0.23
460 0.26
461 0.25
462 0.22
463 0.22
464 0.23
465 0.25
466 0.32
467 0.39
468 0.41
469 0.47
470 0.51
471 0.5
472 0.53
473 0.54
474 0.49
475 0.5
476 0.49
477 0.48
478 0.43
479 0.43
480 0.4
481 0.38
482 0.42
483 0.39
484 0.38
485 0.35
486 0.36
487 0.34
488 0.32
489 0.31
490 0.28
491 0.23
492 0.22
493 0.22
494 0.2
495 0.2
496 0.22
497 0.24
498 0.24
499 0.28
500 0.31
501 0.35
502 0.36
503 0.37
504 0.39
505 0.37
506 0.43
507 0.45
508 0.47
509 0.47
510 0.47
511 0.48
512 0.47
513 0.51
514 0.47
515 0.42
516 0.34
517 0.35
518 0.41
519 0.48
520 0.47
521 0.42
522 0.39
523 0.36
524 0.35
525 0.36
526 0.31
527 0.23
528 0.24
529 0.26
530 0.27
531 0.26
532 0.25
533 0.2
534 0.2
535 0.18
536 0.16
537 0.13
538 0.12
539 0.12
540 0.14
541 0.14
542 0.13
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.12
547 0.12
548 0.12
549 0.12
550 0.12
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.12
556 0.11
557 0.14
558 0.17
559 0.17
560 0.19
561 0.22
562 0.25
563 0.26
564 0.26
565 0.23
566 0.23
567 0.28
568 0.27
569 0.27
570 0.25
571 0.26
572 0.25
573 0.27
574 0.26
575 0.27
576 0.26
577 0.22
578 0.19
579 0.17
580 0.17
581 0.14
582 0.11
583 0.05
584 0.06
585 0.07
586 0.09
587 0.1
588 0.11
589 0.13
590 0.15
591 0.15
592 0.19
593 0.22
594 0.28
595 0.32
596 0.34
597 0.32
598 0.3
599 0.34
600 0.3
601 0.27
602 0.21
603 0.26
604 0.27
605 0.27
606 0.3
607 0.33
608 0.39
609 0.41
610 0.4
611 0.32
612 0.32
613 0.32
614 0.31
615 0.24
616 0.17
617 0.16
618 0.15
619 0.14
620 0.13
621 0.15
622 0.14
623 0.14
624 0.13
625 0.13
626 0.13
627 0.13
628 0.1
629 0.08
630 0.08
631 0.12
632 0.13
633 0.13
634 0.13
635 0.14
636 0.16
637 0.16
638 0.21
639 0.22
640 0.25
641 0.25
642 0.26
643 0.25
644 0.24
645 0.23
646 0.18
647 0.13
648 0.1
649 0.09
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.07
655 0.07
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.11
660 0.13
661 0.22
662 0.27
663 0.3
664 0.33
665 0.37
666 0.42
667 0.42
668 0.42
669 0.36
670 0.34
671 0.32
672 0.3
673 0.33
674 0.33
675 0.32
676 0.33
677 0.35
678 0.31
679 0.32
680 0.33
681 0.28
682 0.24
683 0.3
684 0.33
685 0.29
686 0.29
687 0.31
688 0.33
689 0.34
690 0.33
691 0.29
692 0.28
693 0.28
694 0.29
695 0.32
696 0.32
697 0.3
698 0.29
699 0.28
700 0.23
701 0.23
702 0.23
703 0.19
704 0.14
705 0.18
706 0.18
707 0.18
708 0.17
709 0.16
710 0.15
711 0.14
712 0.16
713 0.13
714 0.13
715 0.13
716 0.13
717 0.15
718 0.15
719 0.14
720 0.11
721 0.11
722 0.13
723 0.13
724 0.13
725 0.11
726 0.11
727 0.11
728 0.11
729 0.09
730 0.1
731 0.14
732 0.17
733 0.19
734 0.24
735 0.31
736 0.34
737 0.38
738 0.37
739 0.35
740 0.4
741 0.45
742 0.45
743 0.43
744 0.4
745 0.36
746 0.38
747 0.35
748 0.29
749 0.25
750 0.22
751 0.19
752 0.21
753 0.24
754 0.25
755 0.28
756 0.32
757 0.36
758 0.37
759 0.41
760 0.39
761 0.42
762 0.41
763 0.4
764 0.35
765 0.32
766 0.37
767 0.34
768 0.34
769 0.27
770 0.25
771 0.3
772 0.37
773 0.39
774 0.33
775 0.31
776 0.32
777 0.32
778 0.31
779 0.25
780 0.18
781 0.12
782 0.14
783 0.15
784 0.14
785 0.14
786 0.14
787 0.17
788 0.2
789 0.21
790 0.19
791 0.22
792 0.27
793 0.29
794 0.3
795 0.31
796 0.34
797 0.39
798 0.44
799 0.43
800 0.4
801 0.41
802 0.41
803 0.38
804 0.39
805 0.36
806 0.3
807 0.28
808 0.33
809 0.32
810 0.3
811 0.29
812 0.25
813 0.27
814 0.26
815 0.3
816 0.22
817 0.22
818 0.21
819 0.22
820 0.2
821 0.15
822 0.14
823 0.13
824 0.15
825 0.15
826 0.14
827 0.14
828 0.13
829 0.12
830 0.12
831 0.09
832 0.08
833 0.08
834 0.09
835 0.11
836 0.16
837 0.17
838 0.19
839 0.23
840 0.24
841 0.25
842 0.31
843 0.34
844 0.35
845 0.37
846 0.37
847 0.38
848 0.41
849 0.41
850 0.35
851 0.3
852 0.24
853 0.22
854 0.19
855 0.17
856 0.13
857 0.18
858 0.23
859 0.27
860 0.3
861 0.34
862 0.38
863 0.42
864 0.5
865 0.53
866 0.57
867 0.61
868 0.64
869 0.66
870 0.66
871 0.63
872 0.61
873 0.53
874 0.46
875 0.4
876 0.33
877 0.28
878 0.24
879 0.26
880 0.19
881 0.22
882 0.21
883 0.22
884 0.21
885 0.21
886 0.25
887 0.22
888 0.26
889 0.23
890 0.27
891 0.29
892 0.36
893 0.44
894 0.42
895 0.49
896 0.5
897 0.53
898 0.57
899 0.58
900 0.61
901 0.63
902 0.67
903 0.65
904 0.67
905 0.64
906 0.6
907 0.62
908 0.6
909 0.57
910 0.53
911 0.49
912 0.48
913 0.5
914 0.52
915 0.53
916 0.52
917 0.5
918 0.49
919 0.48
920 0.45
921 0.4
922 0.35
923 0.29
924 0.23
925 0.17
926 0.17
927 0.16
928 0.13
929 0.12
930 0.12
931 0.09
932 0.09
933 0.1
934 0.08
935 0.08
936 0.08
937 0.1
938 0.11
939 0.11
940 0.12
941 0.11
942 0.12
943 0.11
944 0.11
945 0.08
946 0.1