FuNGI

A0A1Y2UQ46

Protein Details

Accession

A0A1Y2UQ46

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-52	GAPPLRRPRNTANPLVPRKKLTPRPIPGRGAP	Hydrophilic
198-220	APVAKDPPKKQQKEQKKTGLQVH	Hydrophilic
422-445	ERERRKFGRSLKKALRRRDKQFQY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-50	GAPPLRRPRNTANPLVPRKKLTPRPIPGRG
423-440	RERRKFGRSLKKALRRRD
493-512	QGKKAAPEAAKKGKSLKRPG
525-540	TRKRKKTAHGSRGGSR
575-591	KKRLGPSGTGSKRGTPA

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSPSGGTNGLKPTPPPGAPPLRRPRNTANPLVPRKKLTPRPIPGRGAPSAVTRPVGRPQQRPTQGNQGPVDFEKIRAQNDGWSRPMPNGAVDYPLYVTKKSLKEGLRFHVMRFAPHGGKLAQPGGPGVDPTNQEEFTRPVTLHRRDPRQPPPGREVKEETPVEENPVETAESERLAQLKAQREAQRAAADAQKAPVAKDPPKKQQKEQKKTGLQVHYAPRTEEQKKQAEIRYEEALPWHLEDADGKNVWVGQYEAPLSDCKVALKIHNNGFRMIPLEKWYKFTSKRGSFKSMSVEEAEKAMNKKVALGRWALRDSQRQEAEKAMAESRAIVNGRVPVKQESGTFKQASRTEKMDHDDIDMSGDEFQDDDETAGYEPDRDEDTKTANNKIRRDQLNANLFGEADEIKVEKEEEDEQKEERERRKFGRSLKKALRRRDKQFQYESDSDKERDPFASSEDESDSDLDNEKEDDEKKADKDAGTPSKGTSTPQGKKAAPEAAKKGKSLKRPGSPMVSDSSGTESTRKRKKTAHGSRGGSRGNSPLRGGQLTKTGAGFTSDGEATGGEMSDGAGGKKRLGPSGTGSKRGTPAGSRAGSPAPPQGAAGKGSSAGARANSPSAPSQSPTQEYIDPITPQEIIDALPPRPEGITIGGLLRVFQHRLDKPGYMYRRDWLKLVKENAEFSTAEKLLRRKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.32
3	0.34
4	0.37
5	0.34
6	0.33
7	0.37
8	0.45
9	0.49
10	0.59
11	0.65
12	0.69
13	0.72
14	0.74
15	0.75
16	0.76
17	0.77
18	0.76
19	0.75
20	0.75
21	0.82
22	0.83
23	0.78
24	0.72
25	0.72
26	0.74
27	0.74
28	0.73
29	0.73
30	0.75
31	0.8
32	0.83
33	0.82
34	0.77
35	0.74
36	0.66
37	0.58
38	0.5
39	0.46
40	0.42
41	0.38
42	0.34
43	0.29
44	0.31
45	0.36
46	0.44
47	0.46
48	0.49
49	0.54
50	0.62
51	0.69
52	0.69
53	0.67
54	0.68
55	0.64
56	0.64
57	0.6
58	0.51
59	0.45
60	0.43
61	0.44
62	0.33
63	0.32
64	0.32
65	0.33
66	0.33
67	0.32
68	0.32
69	0.32
70	0.39
71	0.42
72	0.38
73	0.37
74	0.36
75	0.35
76	0.37
77	0.31
78	0.25
79	0.24
80	0.21
81	0.22
82	0.21
83	0.2
84	0.18
85	0.22
86	0.21
87	0.18
88	0.2
89	0.24
90	0.28
91	0.29
92	0.36
93	0.38
94	0.44
95	0.5
96	0.53
97	0.56
98	0.53
99	0.5
100	0.51
101	0.45
102	0.39
103	0.38
104	0.38
105	0.3
106	0.3
107	0.33
108	0.25
109	0.27
110	0.28
111	0.26
112	0.21
113	0.19
114	0.19
115	0.17
116	0.17
117	0.15
118	0.14
119	0.16
120	0.16
121	0.2
122	0.23
123	0.22
124	0.22
125	0.23
126	0.24
127	0.23
128	0.24
129	0.2
130	0.24
131	0.33
132	0.37
133	0.45
134	0.51
135	0.56
136	0.61
137	0.7
138	0.73
139	0.74
140	0.76
141	0.73
142	0.73
143	0.73
144	0.7
145	0.67
146	0.63
147	0.57
148	0.58
149	0.53
150	0.46
151	0.41
152	0.37
153	0.36
154	0.29
155	0.26
156	0.17
157	0.17
158	0.15
159	0.11
160	0.13
161	0.1
162	0.1
163	0.1
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.13
168	0.17
169	0.24
170	0.26
171	0.33
172	0.38
173	0.41
174	0.42
175	0.43
176	0.39
177	0.33
178	0.32
179	0.29
180	0.25
181	0.22
182	0.21
183	0.19
184	0.18
185	0.17
186	0.2
187	0.22
188	0.28
189	0.36
190	0.43
191	0.51
192	0.62
193	0.66
194	0.7
195	0.75
196	0.79
197	0.8
198	0.82
199	0.82
200	0.78
201	0.8
202	0.8
203	0.75
204	0.66
205	0.62
206	0.6
207	0.55
208	0.49
209	0.44
210	0.38
211	0.41
212	0.42
213	0.42
214	0.41
215	0.42
216	0.44
217	0.49
218	0.5
219	0.5
220	0.48
221	0.45
222	0.41
223	0.35
224	0.32
225	0.27
226	0.25
227	0.18
228	0.16
229	0.13
230	0.09
231	0.09
232	0.1
233	0.12
234	0.13
235	0.13
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.11
241	0.1
242	0.07
243	0.08
244	0.09
245	0.09
246	0.09
247	0.1
248	0.1
249	0.1
250	0.1
251	0.08
252	0.11
253	0.11
254	0.15
255	0.21
256	0.26
257	0.31
258	0.36
259	0.37
260	0.36
261	0.35
262	0.31
263	0.28
264	0.22
265	0.17
266	0.16
267	0.21
268	0.21
269	0.24
270	0.26
271	0.3
272	0.33
273	0.39
274	0.44
275	0.47
276	0.54
277	0.55
278	0.6
279	0.54
280	0.53
281	0.53
282	0.44
283	0.37
284	0.31
285	0.27
286	0.21
287	0.2
288	0.18
289	0.13
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.12
294	0.15
295	0.17
296	0.19
297	0.19
298	0.21
299	0.22
300	0.24
301	0.26
302	0.24
303	0.24
304	0.29
305	0.3
306	0.34
307	0.35
308	0.32
309	0.32
310	0.32
311	0.3
312	0.25
313	0.23
314	0.17
315	0.13
316	0.12
317	0.11
318	0.1
319	0.11
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.13
324	0.15
325	0.15
326	0.16
327	0.15
328	0.17
329	0.18
330	0.19
331	0.21
332	0.24
333	0.27
334	0.27
335	0.26
336	0.3
337	0.32
338	0.34
339	0.31
340	0.29
341	0.27
342	0.29
343	0.31
344	0.28
345	0.24
346	0.22
347	0.2
348	0.17
349	0.15
350	0.12
351	0.1
352	0.08
353	0.08
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.08
369	0.08
370	0.09
371	0.1
372	0.14
373	0.18
374	0.2
375	0.25
376	0.29
377	0.34
378	0.37
379	0.41
380	0.47
381	0.46
382	0.49
383	0.48
384	0.5
385	0.52
386	0.5
387	0.45
388	0.36
389	0.33
390	0.27
391	0.22
392	0.14
393	0.07
394	0.06
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.05
400	0.07
401	0.11
402	0.14
403	0.17
404	0.19
405	0.19
406	0.23
407	0.27
408	0.31
409	0.34
410	0.37
411	0.39
412	0.43
413	0.5
414	0.53
415	0.58
416	0.63
417	0.63
418	0.66
419	0.71
420	0.76
421	0.76
422	0.8
423	0.82
424	0.79
425	0.81
426	0.81
427	0.8
428	0.78
429	0.77
430	0.72
431	0.68
432	0.64
433	0.6
434	0.53
435	0.48
436	0.41
437	0.36
438	0.33
439	0.26
440	0.23
441	0.22
442	0.19
443	0.18
444	0.2
445	0.18
446	0.18
447	0.18
448	0.18
449	0.16
450	0.16
451	0.14
452	0.11
453	0.12
454	0.1
455	0.1
456	0.09
457	0.09
458	0.11
459	0.12
460	0.13
461	0.15
462	0.19
463	0.19
464	0.22
465	0.24
466	0.22
467	0.24
468	0.31
469	0.35
470	0.33
471	0.33
472	0.3
473	0.31
474	0.31
475	0.29
476	0.29
477	0.31
478	0.34
479	0.4
480	0.46
481	0.43
482	0.45
483	0.48
484	0.48
485	0.43
486	0.44
487	0.46
488	0.49
489	0.51
490	0.5
491	0.55
492	0.53
493	0.56
494	0.61
495	0.61
496	0.6
497	0.64
498	0.67
499	0.64
500	0.6
501	0.53
502	0.46
503	0.39
504	0.32
505	0.26
506	0.26
507	0.2
508	0.19
509	0.22
510	0.24
511	0.32
512	0.41
513	0.44
514	0.45
515	0.51
516	0.6
517	0.67
518	0.72
519	0.74
520	0.74
521	0.76
522	0.77
523	0.77
524	0.69
525	0.59
526	0.5
527	0.47
528	0.41
529	0.38
530	0.33
531	0.29
532	0.3
533	0.31
534	0.31
535	0.25
536	0.27
537	0.27
538	0.26
539	0.23
540	0.2
541	0.18
542	0.19
543	0.17
544	0.11
545	0.13
546	0.11
547	0.11
548	0.11
549	0.1
550	0.09
551	0.09
552	0.08
553	0.05
554	0.05
555	0.04
556	0.06
557	0.07
558	0.07
559	0.11
560	0.12
561	0.13
562	0.17
563	0.19
564	0.22
565	0.23
566	0.25
567	0.27
568	0.38
569	0.4
570	0.44
571	0.44
572	0.43
573	0.45
574	0.44
575	0.4
576	0.32
577	0.33
578	0.34
579	0.34
580	0.31
581	0.31
582	0.32
583	0.32
584	0.31
585	0.31
586	0.24
587	0.23
588	0.23
589	0.22
590	0.21
591	0.21
592	0.2
593	0.15
594	0.14
595	0.14
596	0.14
597	0.13
598	0.12
599	0.12
600	0.13
601	0.14
602	0.16
603	0.16
604	0.18
605	0.2
606	0.23
607	0.24
608	0.24
609	0.28
610	0.31
611	0.34
612	0.34
613	0.35
614	0.32
615	0.32
616	0.34
617	0.32
618	0.28
619	0.26
620	0.24
621	0.21
622	0.19
623	0.17
624	0.14
625	0.1
626	0.15
627	0.17
628	0.16
629	0.19
630	0.19
631	0.2
632	0.19
633	0.19
634	0.16
635	0.16
636	0.17
637	0.15
638	0.16
639	0.17
640	0.16
641	0.16
642	0.17
643	0.17
644	0.17
645	0.19
646	0.27
647	0.28
648	0.34
649	0.37
650	0.37
651	0.39
652	0.47
653	0.51
654	0.48
655	0.48
656	0.49
657	0.54
658	0.53
659	0.52
660	0.51
661	0.53
662	0.55
663	0.6
664	0.61
665	0.56
666	0.58
667	0.55
668	0.5
669	0.41
670	0.34
671	0.36
672	0.29
673	0.28
674	0.3

A0A1Y2UQ46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer