Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Y2V7Y4

Protein Details
Accession A0A1Y2V7Y4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1062-1084HLLGIVKSKKPEKKPEPVTAKTEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1070-1076KKPEKKP
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 10.5, mito 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MFSNPGARKSVDSLPPLSPNARSEFPFHRQGSATSHPTARRGSTASSIASSIQSIGGHLDTSSSWSQSIHETGRNAISTLLQPPIVRTGLLPHTSAPASSAHKPPTARDIPPVTLTNIPHVDSAEFKPYLTQVGALYEQLRRVKESEDDGSDHVFGRGRTEDHSSVVDDSHLKPNSRPSSSRKVSGSSIRSTSPMESPTVRPIRRRSSSGFSRKAAAHGPPPLSTIPNVYFDEDFHLENPRTFDVVSERSEVIRPPPGSAEEKNAANGSAPPPRKALATNAILQEKLSWYMDTIEMHLISSISTASTTFFTALGSLRELHSEAAESVEKIKTLRKELETLDREIAASGLEIVQKQQRRDNLQQLNDAVKQLKEIVESLAECEALVDSGELQKALSSIDALEKLIAGERIAGSNKTESHGPRLRDLRDAVALQGVNGDISTLRFRIGKAFESKFIDVLLEDLRHHVDTVSTQEVLLRWSSAAMRSRGAHSREPSAYPAYLAGTEDLRSQLLPILDGLHRSKHVTIAIASYREVVLREIRNLIKRPLPTSNDDDNESMMSASTMNSKRLTQQEKSSILARNLRALDERDAEELFVKIYISVTETLRRLGTQVKVLFDVASSLGEQPITDSGLKSPNPLKSPPLNSANRDLQEDIHLTMDMANLLGQAVDTSQERIVKLLKVRSDQSSHLPLVWFLRYFTLNLYFATECEAISGRSGTSLKNIVNSQIKEFIQLHGDAEKQKLAQGMESDQWSAKDFTEENTVLLNRILESSTKDCEAWLEGSKIWIPIEEEEETKGGTNGRPRSESTAGSKEKTRSAVIDGETFILPNSAILCLEGMSHFLHLISGIPSMASDVSSSLIAYLQLFNSRCTQLILGAGATRSAGLKNITTRHLALASQALAFISTLIPHVREFVRRHAGSGHNVNNANVAALMGEFDKVKRLFQEHQNSIYDKLVEIMSGRAATHAKNMKALDWDAETEATVNLYMETLVKETVTLHRVLTKHLPEGTVRLIMTPVFDSYKSQLGRTLEGLESKSETAVKRMESDIEYLTSRLGKIDGFGDTGDHLLGIVKSKKPEKKPEPVTAKTENKEEPAKRDSEESKEKSSDNADEAPKEEAKEKEKEAAEGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.45
3 0.46
4 0.43
5 0.38
6 0.35
7 0.37
8 0.36
9 0.34
10 0.36
11 0.4
12 0.43
13 0.49
14 0.47
15 0.46
16 0.44
17 0.45
18 0.46
19 0.47
20 0.46
21 0.4
22 0.45
23 0.43
24 0.46
25 0.48
26 0.42
27 0.39
28 0.37
29 0.36
30 0.36
31 0.36
32 0.34
33 0.31
34 0.29
35 0.26
36 0.24
37 0.2
38 0.16
39 0.14
40 0.12
41 0.11
42 0.12
43 0.11
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.16
54 0.19
55 0.24
56 0.23
57 0.26
58 0.27
59 0.29
60 0.33
61 0.33
62 0.29
63 0.24
64 0.23
65 0.2
66 0.22
67 0.21
68 0.18
69 0.18
70 0.19
71 0.23
72 0.22
73 0.19
74 0.17
75 0.21
76 0.26
77 0.28
78 0.27
79 0.23
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.21
84 0.19
85 0.22
86 0.26
87 0.32
88 0.32
89 0.36
90 0.38
91 0.39
92 0.45
93 0.46
94 0.42
95 0.43
96 0.45
97 0.43
98 0.47
99 0.46
100 0.39
101 0.38
102 0.37
103 0.36
104 0.33
105 0.31
106 0.27
107 0.26
108 0.24
109 0.23
110 0.25
111 0.25
112 0.23
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.24
117 0.2
118 0.19
119 0.12
120 0.16
121 0.17
122 0.16
123 0.18
124 0.17
125 0.22
126 0.25
127 0.26
128 0.25
129 0.25
130 0.27
131 0.29
132 0.33
133 0.33
134 0.32
135 0.33
136 0.32
137 0.32
138 0.3
139 0.26
140 0.22
141 0.19
142 0.16
143 0.18
144 0.19
145 0.18
146 0.2
147 0.26
148 0.26
149 0.26
150 0.28
151 0.25
152 0.23
153 0.22
154 0.22
155 0.18
156 0.19
157 0.26
158 0.28
159 0.28
160 0.29
161 0.39
162 0.45
163 0.48
164 0.5
165 0.49
166 0.56
167 0.6
168 0.64
169 0.57
170 0.53
171 0.53
172 0.56
173 0.54
174 0.48
175 0.46
176 0.4
177 0.39
178 0.37
179 0.34
180 0.29
181 0.25
182 0.23
183 0.24
184 0.25
185 0.33
186 0.4
187 0.41
188 0.44
189 0.51
190 0.58
191 0.6
192 0.63
193 0.59
194 0.6
195 0.67
196 0.71
197 0.69
198 0.61
199 0.6
200 0.55
201 0.52
202 0.47
203 0.4
204 0.36
205 0.35
206 0.36
207 0.31
208 0.33
209 0.31
210 0.29
211 0.25
212 0.24
213 0.2
214 0.23
215 0.23
216 0.23
217 0.22
218 0.21
219 0.26
220 0.23
221 0.21
222 0.17
223 0.22
224 0.21
225 0.22
226 0.25
227 0.2
228 0.2
229 0.19
230 0.19
231 0.19
232 0.22
233 0.23
234 0.23
235 0.22
236 0.23
237 0.24
238 0.24
239 0.21
240 0.25
241 0.24
242 0.22
243 0.24
244 0.26
245 0.3
246 0.31
247 0.34
248 0.29
249 0.3
250 0.3
251 0.28
252 0.24
253 0.2
254 0.21
255 0.18
256 0.23
257 0.24
258 0.24
259 0.25
260 0.26
261 0.27
262 0.26
263 0.28
264 0.27
265 0.29
266 0.31
267 0.34
268 0.34
269 0.32
270 0.31
271 0.26
272 0.2
273 0.19
274 0.15
275 0.11
276 0.11
277 0.13
278 0.15
279 0.14
280 0.14
281 0.14
282 0.12
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.08
287 0.08
288 0.06
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.07
297 0.07
298 0.08
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.1
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.1
311 0.11
312 0.1
313 0.11
314 0.12
315 0.12
316 0.12
317 0.17
318 0.18
319 0.23
320 0.29
321 0.29
322 0.32
323 0.35
324 0.44
325 0.42
326 0.41
327 0.37
328 0.31
329 0.29
330 0.25
331 0.22
332 0.12
333 0.08
334 0.06
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.08
339 0.13
340 0.17
341 0.2
342 0.24
343 0.29
344 0.36
345 0.43
346 0.52
347 0.54
348 0.53
349 0.55
350 0.52
351 0.5
352 0.43
353 0.38
354 0.29
355 0.21
356 0.19
357 0.17
358 0.15
359 0.12
360 0.12
361 0.11
362 0.11
363 0.11
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.06
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.04
383 0.05
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.08
391 0.07
392 0.05
393 0.06
394 0.06
395 0.08
396 0.09
397 0.09
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.13
402 0.16
403 0.16
404 0.23
405 0.28
406 0.29
407 0.33
408 0.38
409 0.38
410 0.38
411 0.38
412 0.32
413 0.29
414 0.28
415 0.22
416 0.19
417 0.17
418 0.13
419 0.12
420 0.1
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.03
425 0.05
426 0.06
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.08
431 0.13
432 0.15
433 0.19
434 0.24
435 0.26
436 0.28
437 0.32
438 0.32
439 0.27
440 0.25
441 0.21
442 0.14
443 0.14
444 0.11
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.1
449 0.1
450 0.1
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.11
455 0.12
456 0.1
457 0.1
458 0.11
459 0.11
460 0.12
461 0.11
462 0.08
463 0.06
464 0.07
465 0.07
466 0.1
467 0.14
468 0.15
469 0.16
470 0.17
471 0.2
472 0.26
473 0.29
474 0.3
475 0.28
476 0.32
477 0.31
478 0.32
479 0.31
480 0.27
481 0.23
482 0.19
483 0.17
484 0.12
485 0.11
486 0.1
487 0.08
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.06
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.11
502 0.12
503 0.11
504 0.12
505 0.13
506 0.13
507 0.13
508 0.13
509 0.12
510 0.12
511 0.13
512 0.14
513 0.14
514 0.13
515 0.12
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.09
520 0.11
521 0.12
522 0.13
523 0.16
524 0.18
525 0.23
526 0.24
527 0.26
528 0.25
529 0.26
530 0.28
531 0.3
532 0.31
533 0.3
534 0.35
535 0.37
536 0.34
537 0.35
538 0.32
539 0.26
540 0.23
541 0.19
542 0.12
543 0.08
544 0.06
545 0.04
546 0.04
547 0.1
548 0.11
549 0.13
550 0.14
551 0.15
552 0.19
553 0.26
554 0.31
555 0.27
556 0.31
557 0.36
558 0.37
559 0.38
560 0.38
561 0.34
562 0.32
563 0.34
564 0.29
565 0.27
566 0.25
567 0.25
568 0.22
569 0.21
570 0.21
571 0.18
572 0.18
573 0.15
574 0.14
575 0.14
576 0.13
577 0.11
578 0.08
579 0.06
580 0.05
581 0.04
582 0.04
583 0.04
584 0.05
585 0.07
586 0.08
587 0.11
588 0.11
589 0.12
590 0.12
591 0.12
592 0.12
593 0.14
594 0.15
595 0.18
596 0.19
597 0.19
598 0.19
599 0.2
600 0.18
601 0.14
602 0.13
603 0.08
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.05
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.05
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.08
616 0.13
617 0.13
618 0.15
619 0.19
620 0.22
621 0.24
622 0.25
623 0.28
624 0.3
625 0.33
626 0.36
627 0.41
628 0.4
629 0.39
630 0.44
631 0.44
632 0.39
633 0.37
634 0.32
635 0.24
636 0.23
637 0.22
638 0.17
639 0.12
640 0.11
641 0.09
642 0.09
643 0.09
644 0.06
645 0.05
646 0.04
647 0.04
648 0.04
649 0.03
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.04
654 0.04
655 0.06
656 0.07
657 0.09
658 0.09
659 0.1
660 0.12
661 0.14
662 0.18
663 0.21
664 0.23
665 0.24
666 0.27
667 0.29
668 0.3
669 0.3
670 0.3
671 0.31
672 0.28
673 0.26
674 0.24
675 0.21
676 0.2
677 0.2
678 0.15
679 0.11
680 0.12
681 0.12
682 0.12
683 0.13
684 0.14
685 0.13
686 0.13
687 0.16
688 0.14
689 0.13
690 0.17
691 0.15
692 0.11
693 0.12
694 0.12
695 0.09
696 0.1
697 0.1
698 0.06
699 0.09
700 0.09
701 0.09
702 0.11
703 0.14
704 0.14
705 0.17
706 0.17
707 0.2
708 0.26
709 0.27
710 0.26
711 0.28
712 0.28
713 0.28
714 0.28
715 0.24
716 0.2
717 0.2
718 0.19
719 0.15
720 0.17
721 0.14
722 0.15
723 0.15
724 0.13
725 0.14
726 0.16
727 0.14
728 0.14
729 0.14
730 0.15
731 0.16
732 0.17
733 0.16
734 0.14
735 0.14
736 0.15
737 0.15
738 0.12
739 0.13
740 0.12
741 0.13
742 0.19
743 0.19
744 0.17
745 0.18
746 0.18
747 0.16
748 0.16
749 0.15
750 0.08
751 0.09
752 0.09
753 0.08
754 0.11
755 0.13
756 0.15
757 0.16
758 0.15
759 0.15
760 0.15
761 0.16
762 0.15
763 0.15
764 0.14
765 0.13
766 0.15
767 0.16
768 0.16
769 0.14
770 0.12
771 0.11
772 0.11
773 0.14
774 0.14
775 0.14
776 0.14
777 0.14
778 0.13
779 0.12
780 0.12
781 0.1
782 0.11
783 0.18
784 0.23
785 0.26
786 0.28
787 0.29
788 0.36
789 0.37
790 0.37
791 0.36
792 0.4
793 0.4
794 0.4
795 0.43
796 0.38
797 0.39
798 0.39
799 0.34
800 0.26
801 0.27
802 0.29
803 0.26
804 0.26
805 0.22
806 0.21
807 0.2
808 0.18
809 0.15
810 0.1
811 0.09
812 0.07
813 0.07
814 0.05
815 0.05
816 0.05
817 0.06
818 0.05
819 0.06
820 0.06
821 0.07
822 0.07
823 0.07
824 0.07
825 0.07
826 0.07
827 0.06
828 0.07
829 0.06
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.06
834 0.07
835 0.07
836 0.06
837 0.05
838 0.05
839 0.06
840 0.06
841 0.06
842 0.06
843 0.06
844 0.06
845 0.07
846 0.08
847 0.07
848 0.13
849 0.14
850 0.15
851 0.19
852 0.2
853 0.19
854 0.2
855 0.19
856 0.15
857 0.16
858 0.15
859 0.12
860 0.12
861 0.11
862 0.1
863 0.09
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.08
868 0.09
869 0.12
870 0.17
871 0.2
872 0.22
873 0.24
874 0.25
875 0.25
876 0.25
877 0.22
878 0.19
879 0.18
880 0.17
881 0.14
882 0.13
883 0.11
884 0.1
885 0.1
886 0.09
887 0.06
888 0.05
889 0.06
890 0.07
891 0.09
892 0.08
893 0.12
894 0.14
895 0.21
896 0.24
897 0.31
898 0.4
899 0.39
900 0.4
901 0.43
902 0.45
903 0.45
904 0.51
905 0.47
906 0.43
907 0.44
908 0.43
909 0.39
910 0.34
911 0.27
912 0.19
913 0.14
914 0.07
915 0.06
916 0.07
917 0.05
918 0.06
919 0.06
920 0.06
921 0.13
922 0.14
923 0.16
924 0.19
925 0.24
926 0.3
927 0.39
928 0.5
929 0.48
930 0.52
931 0.55
932 0.53
933 0.5
934 0.46
935 0.37
936 0.26
937 0.23
938 0.17
939 0.14
940 0.13
941 0.11
942 0.1
943 0.1
944 0.1
945 0.11
946 0.12
947 0.13
948 0.2
949 0.26
950 0.26
951 0.3
952 0.31
953 0.31
954 0.34
955 0.34
956 0.28
957 0.24
958 0.24
959 0.2
960 0.2
961 0.18
962 0.14
963 0.13
964 0.11
965 0.09
966 0.08
967 0.06
968 0.06
969 0.06
970 0.07
971 0.07
972 0.08
973 0.08
974 0.08
975 0.08
976 0.1
977 0.15
978 0.17
979 0.17
980 0.17
981 0.22
982 0.23
983 0.27
984 0.34
985 0.32
986 0.35
987 0.36
988 0.37
989 0.32
990 0.36
991 0.34
992 0.29
993 0.25
994 0.21
995 0.2
996 0.18
997 0.19
998 0.16
999 0.15
1000 0.14
1001 0.14
1002 0.17
1003 0.18
1004 0.26
1005 0.25
1006 0.25
1007 0.28
1008 0.28
1009 0.31
1010 0.3
1011 0.31
1012 0.25
1013 0.27
1014 0.28
1015 0.24
1016 0.24
1017 0.22
1018 0.21
1019 0.21
1020 0.2
1021 0.22
1022 0.24
1023 0.24
1024 0.25
1025 0.26
1026 0.29
1027 0.26
1028 0.28
1029 0.26
1030 0.24
1031 0.24
1032 0.21
1033 0.21
1034 0.19
1035 0.17
1036 0.15
1037 0.14
1038 0.12
1039 0.12
1040 0.14
1041 0.14
1042 0.13
1043 0.13
1044 0.13
1045 0.13
1046 0.13
1047 0.11
1048 0.09
1049 0.07
1050 0.08
1051 0.09
1052 0.15
1053 0.19
1054 0.22
1055 0.3
1056 0.39
1057 0.48
1058 0.56
1059 0.66
1060 0.69
1061 0.75
1062 0.8
1063 0.84
1064 0.85
1065 0.82
1066 0.8
1067 0.78
1068 0.78
1069 0.71
1070 0.68
1071 0.61
1072 0.57
1073 0.61
1074 0.58
1075 0.55
1076 0.52
1077 0.51
1078 0.46
1079 0.5
1080 0.49
1081 0.49
1082 0.55
1083 0.54
1084 0.55
1085 0.56
1086 0.54
1087 0.51
1088 0.51
1089 0.46
1090 0.4
1091 0.42
1092 0.39
1093 0.37
1094 0.38
1095 0.39
1096 0.36
1097 0.34
1098 0.35
1099 0.34
1100 0.36
1101 0.4
1102 0.42
1103 0.45
1104 0.44