Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H8ZFD9

Protein Details
Accession H8ZFD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-220DDPSRVKGRKKIRMDFIKDKGRRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
202-234RVKGRKKIRMDFIKDKGRRGVTFSKRKKGIMKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
CDD cd00120  MADS  
Amino Acid Sequences MAEPRYSRDDSSPRISPSYERNERHKQKGAFHNGVDEKYHTPGYREYQEKPEYEERASEDYRYNQNKDYQYRRNEEYAHMYDRPYPEERSPIMETSSQTRKENERREGRMYAQPFPSRQFRSNSISGASLLSIGQEIERDKMLGFHSPPSHPAHSPVTTHLASPQEVHPSDRQKSAAAMSSLRFFRKEDNEDSAESDDDPSRVKGRKKIRMDFIKDKGRRGVTFSKRKKGIMKKAYELNVLTSVKFFWWWPLKQDMYIHSLRLSCSPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.44
4 0.45
5 0.5
6 0.52
7 0.52
8 0.57
9 0.66
10 0.73
11 0.78
12 0.78
13 0.72
14 0.72
15 0.78
16 0.79
17 0.74
18 0.65
19 0.66
20 0.59
21 0.56
22 0.48
23 0.41
24 0.33
25 0.3
26 0.33
27 0.25
28 0.24
29 0.28
30 0.32
31 0.37
32 0.39
33 0.39
34 0.44
35 0.49
36 0.47
37 0.49
38 0.49
39 0.45
40 0.42
41 0.4
42 0.35
43 0.36
44 0.36
45 0.31
46 0.28
47 0.3
48 0.38
49 0.41
50 0.4
51 0.38
52 0.45
53 0.5
54 0.54
55 0.58
56 0.57
57 0.6
58 0.63
59 0.62
60 0.59
61 0.54
62 0.49
63 0.48
64 0.44
65 0.4
66 0.36
67 0.33
68 0.33
69 0.32
70 0.33
71 0.28
72 0.27
73 0.24
74 0.28
75 0.28
76 0.3
77 0.3
78 0.27
79 0.26
80 0.25
81 0.24
82 0.25
83 0.31
84 0.28
85 0.27
86 0.3
87 0.36
88 0.43
89 0.51
90 0.55
91 0.57
92 0.58
93 0.62
94 0.61
95 0.56
96 0.54
97 0.48
98 0.43
99 0.39
100 0.37
101 0.33
102 0.34
103 0.38
104 0.35
105 0.36
106 0.35
107 0.35
108 0.38
109 0.38
110 0.36
111 0.29
112 0.26
113 0.23
114 0.19
115 0.14
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.08
129 0.09
130 0.11
131 0.11
132 0.14
133 0.16
134 0.17
135 0.2
136 0.23
137 0.24
138 0.21
139 0.24
140 0.25
141 0.24
142 0.25
143 0.24
144 0.25
145 0.22
146 0.22
147 0.21
148 0.19
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.19
154 0.21
155 0.24
156 0.28
157 0.3
158 0.31
159 0.31
160 0.25
161 0.26
162 0.25
163 0.24
164 0.19
165 0.18
166 0.17
167 0.2
168 0.21
169 0.21
170 0.21
171 0.17
172 0.22
173 0.28
174 0.33
175 0.32
176 0.36
177 0.38
178 0.37
179 0.39
180 0.34
181 0.27
182 0.22
183 0.2
184 0.14
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.17
189 0.22
190 0.27
191 0.33
192 0.43
193 0.53
194 0.6
195 0.67
196 0.72
197 0.77
198 0.81
199 0.82
200 0.8
201 0.81
202 0.75
203 0.7
204 0.67
205 0.63
206 0.55
207 0.52
208 0.54
209 0.54
210 0.62
211 0.67
212 0.7
213 0.68
214 0.73
215 0.75
216 0.76
217 0.76
218 0.75
219 0.74
220 0.7
221 0.74
222 0.73
223 0.67
224 0.57
225 0.5
226 0.47
227 0.4
228 0.34
229 0.26
230 0.23
231 0.19
232 0.2
233 0.17
234 0.19
235 0.26
236 0.28
237 0.32
238 0.39
239 0.41
240 0.43
241 0.47
242 0.41
243 0.4
244 0.4
245 0.37
246 0.31
247 0.31
248 0.29