FuNGI

A0A1Y2VAJ1

Protein Details

Accession

A0A1Y2VAJ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
93-112	ATPSRATGRFRPKNVRRDAA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
5-23	GSRGAGARGRGRGSARAGR
101-150	RFRPKNVRRDAAERARLEAERNRDLAVKIKEEERELRAEERRSRRGRGRG
354-359	KKRKEK

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito 12, cyto_nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRGSRGAGARGRGRGSARAGRSGATSRPSVDETESQPTETPSQTQNSRDGSDLVMQDVPARETPAASSSTSDVQPDQQTIASSRSSQTPSATPSRATGRFRPKNVRRDAAERARLEAERNRDLAVKIKEEERELRAEERRSRRGRGRGDTSRGGFIRRTVTATGPFSAIPQENVKEGGRGWGRGAGGASSVPEYSTSRYKPRRENEDRLNIDLLNGFTGSVEDSTPSRYNQRSTGTLPVGLLRTEHEEEEVKVKTTAELEAEEQQATDDEELFVSQAAKDLRDVGMQDDSEVWHAAPKSQVKVKTEPGTEPEAMDIDMSDIPEAAQVKAPPSPEAKKKPVASEDNAAVIAQKKRKEKAAKDPEILQTVQDLQCQLETLRFKLPLYREEDEEPEPGVIPKPKGQHLQDKDDQVFLFQLPPILPPLAKPTKDANGEAGAAGPPSQQNKGETTKVKTEDGVKKEDEWNPFATIPTEGALVGKINVRKSGKVEFDWGGTILSLGMGAETEFLTTAMLIEQNIDLQNPEASTGIACSMGEVVNKFVLAPVWDEEEDWDPSLEGIDGLDQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.48
3	0.44
4	0.47
5	0.48
6	0.46
7	0.47
8	0.46
9	0.42
10	0.44
11	0.42
12	0.39
13	0.34
14	0.32
15	0.28
16	0.31
17	0.31
18	0.3
19	0.3
20	0.3
21	0.31
22	0.37
23	0.36
24	0.34
25	0.33
26	0.33
27	0.33
28	0.29
29	0.29
30	0.24
31	0.3
32	0.34
33	0.36
34	0.4
35	0.4
36	0.41
37	0.39
38	0.36
39	0.31
40	0.32
41	0.29
42	0.24
43	0.21
44	0.19
45	0.2
46	0.21
47	0.21
48	0.16
49	0.18
50	0.16
51	0.15
52	0.17
53	0.16
54	0.17
55	0.15
56	0.16
57	0.16
58	0.19
59	0.2
60	0.2
61	0.18
62	0.21
63	0.23
64	0.23
65	0.22
66	0.19
67	0.2
68	0.21
69	0.22
70	0.19
71	0.18
72	0.18
73	0.23
74	0.25
75	0.25
76	0.26
77	0.26
78	0.3
79	0.36
80	0.36
81	0.31
82	0.32
83	0.38
84	0.42
85	0.43
86	0.47
87	0.52
88	0.58
89	0.65
90	0.72
91	0.73
92	0.77
93	0.8
94	0.79
95	0.72
96	0.71
97	0.73
98	0.72
99	0.71
100	0.62
101	0.57
102	0.53
103	0.48
104	0.46
105	0.42
106	0.39
107	0.35
108	0.35
109	0.33
110	0.31
111	0.32
112	0.35
113	0.34
114	0.31
115	0.28
116	0.31
117	0.32
118	0.33
119	0.37
120	0.32
121	0.31
122	0.3
123	0.34
124	0.36
125	0.41
126	0.46
127	0.5
128	0.58
129	0.59
130	0.64
131	0.67
132	0.7
133	0.72
134	0.72
135	0.73
136	0.71
137	0.73
138	0.72
139	0.65
140	0.62
141	0.54
142	0.48
143	0.39
144	0.33
145	0.31
146	0.25
147	0.26
148	0.21
149	0.23
150	0.25
151	0.27
152	0.24
153	0.21
154	0.2
155	0.17
156	0.19
157	0.17
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.15
162	0.18
163	0.18
164	0.15
165	0.14
166	0.2
167	0.18
168	0.18
169	0.18
170	0.19
171	0.19
172	0.19
173	0.19
174	0.11
175	0.1
176	0.1
177	0.09
178	0.07
179	0.07
180	0.06
181	0.07
182	0.08
183	0.11
184	0.16
185	0.19
186	0.28
187	0.36
188	0.43
189	0.51
190	0.58
191	0.66
192	0.69
193	0.75
194	0.75
195	0.78
196	0.73
197	0.66
198	0.59
199	0.48
200	0.4
201	0.32
202	0.23
203	0.13
204	0.1
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.05
211	0.05
212	0.06
213	0.1
214	0.11
215	0.13
216	0.18
217	0.19
218	0.21
219	0.25
220	0.28
221	0.27
222	0.28
223	0.33
224	0.29
225	0.27
226	0.25
227	0.23
228	0.2
229	0.16
230	0.14
231	0.09
232	0.13
233	0.13
234	0.13
235	0.12
236	0.12
237	0.13
238	0.17
239	0.16
240	0.13
241	0.12
242	0.12
243	0.12
244	0.12
245	0.12
246	0.09
247	0.09
248	0.1
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.11
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.08
257	0.05
258	0.04
259	0.04
260	0.04
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.07
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.08
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.08
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.07
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.12
286	0.14
287	0.16
288	0.2
289	0.24
290	0.26
291	0.3
292	0.35
293	0.37
294	0.36
295	0.34
296	0.33
297	0.33
298	0.3
299	0.26
300	0.2
301	0.15
302	0.14
303	0.12
304	0.09
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.08
315	0.08
316	0.1
317	0.12
318	0.12
319	0.13
320	0.17
321	0.22
322	0.29
323	0.36
324	0.4
325	0.45
326	0.47
327	0.5
328	0.53
329	0.52
330	0.47
331	0.43
332	0.39
333	0.33
334	0.3
335	0.26
336	0.19
337	0.17
338	0.19
339	0.2
340	0.25
341	0.29
342	0.32
343	0.4
344	0.49
345	0.52
346	0.58
347	0.65
348	0.66
349	0.64
350	0.66
351	0.61
352	0.55
353	0.48
354	0.36
355	0.26
356	0.23
357	0.22
358	0.18
359	0.15
360	0.12
361	0.12
362	0.12
363	0.11
364	0.12
365	0.13
366	0.14
367	0.17
368	0.18
369	0.18
370	0.23
371	0.25
372	0.26
373	0.32
374	0.32
375	0.31
376	0.32
377	0.36
378	0.32
379	0.31
380	0.25
381	0.18
382	0.17
383	0.15
384	0.16
385	0.16
386	0.16
387	0.2
388	0.23
389	0.28
390	0.35
391	0.38
392	0.46
393	0.48
394	0.55
395	0.55
396	0.57
397	0.53
398	0.49
399	0.44
400	0.34
401	0.29
402	0.21
403	0.17
404	0.11
405	0.12
406	0.1
407	0.11
408	0.12
409	0.12
410	0.12
411	0.11
412	0.2
413	0.26
414	0.26
415	0.28
416	0.31
417	0.37
418	0.4
419	0.4
420	0.35
421	0.29
422	0.29
423	0.26
424	0.22
425	0.15
426	0.12
427	0.11
428	0.09
429	0.1
430	0.12
431	0.15
432	0.16
433	0.18
434	0.23
435	0.28
436	0.34
437	0.37
438	0.4
439	0.45
440	0.46
441	0.45
442	0.42
443	0.47
444	0.48
445	0.47
446	0.47
447	0.41
448	0.41
449	0.46
450	0.49
451	0.44
452	0.39
453	0.37
454	0.35
455	0.34
456	0.31
457	0.26
458	0.21
459	0.17
460	0.15
461	0.13
462	0.09
463	0.09
464	0.09
465	0.08
466	0.09
467	0.13
468	0.15
469	0.16
470	0.24
471	0.26
472	0.28
473	0.32
474	0.38
475	0.39
476	0.38
477	0.42
478	0.36
479	0.35
480	0.34
481	0.3
482	0.23
483	0.17
484	0.15
485	0.1
486	0.08
487	0.06
488	0.04
489	0.04
490	0.03
491	0.03
492	0.04
493	0.04
494	0.05
495	0.05
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.07
502	0.06
503	0.07
504	0.08
505	0.1
506	0.11
507	0.11
508	0.1
509	0.11
510	0.13
511	0.11
512	0.12
513	0.1
514	0.1
515	0.1
516	0.1
517	0.1
518	0.09
519	0.08
520	0.08
521	0.09
522	0.1
523	0.12
524	0.12
525	0.13
526	0.14
527	0.14
528	0.13
529	0.13
530	0.13
531	0.12
532	0.14
533	0.14
534	0.18
535	0.18
536	0.18
537	0.2
538	0.22
539	0.23
540	0.22
541	0.2
542	0.15
543	0.15
544	0.16
545	0.13
546	0.09

A0A1Y2VAJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer